微生物源追踪论文-马文

微生物源追踪论文-马文

导读:本文包含了微生物源追踪论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:岩溶地下水,微生物源追踪,PCR,抗生素污染

微生物源追踪论文文献综述

马文[1](2018)在《西南岩溶地下水微生物群落解析及源追踪技术研究》一文中研究指出我国西南地区具有广袤的岩溶地貌特征,岩溶水是该地区工业及居民生活的主要用水来源。然而由于垃圾堆放,废水乱排现象突出,严重污染了该地区的地下水系统,岩溶地区由于复杂的地形条件,如何快速高效的检测该地区的地下水污染,探索其污染源头,成为保护和控制该地区污染的重点。本文通过现场调查,采样检测,结合高通量测序及微生物多样性和引物特异性分析等方法,探索微生物源示踪技术的实用性,从而为后续的污染水域利用、微生物源追踪方法进行污染源的快速追踪奠定一定基础。本文的主要研究内容和结果如下:(1)研究区域存在明显的抗生素污染,抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes,ARGs)的丰度较高,且与抗生素浓度具有正相关性。(2)岩溶水系统中,微生物群落的分布和环境因子密切相关,其中变形菌(Proteobacteria),拟杆菌(Bacteroidetes)作为优势菌群,可以从中筛选微生物源追踪的主要指示菌,从而设计更加高效敏感的引物进行污染源追踪。(3)通过PCR的敏感性和特异性实验,筛选出了能够有效利用SulⅡ、ermF、BlaOXA-1、rpoC的基因来进行微生物源追踪研究,通过对岩溶地下水河流流向、环境因子、微生物群落分析和微生物源追踪来判断,研究区域的污染源(主要研究抗生素污染)来自于污水处理厂的排放。(本文来源于《中国地质大学(北京)》期刊2018-05-01)

陈逊,刘凡[2](2011)在《基于分离培养的微生物源追踪方法的研究进展》一文中研究指出微生物源追踪是从水体粪便污染研究开始发展起来,该文对基于分离培养的微生物源追踪部分方法的原理、应用及进展进行了综述。随着研究技术的不断发展,微生物源追踪的研究范围也逐渐扩大,包括食物、空气等。众多的方法中,基因型方法在未来微生物源追踪研究中会有更广阔的应用前景。(本文来源于《环境与健康杂志》期刊2011年04期)

李伟伟,陈晓东[3](2011)在《微生物源追踪研究方法探讨》一文中研究指出粪便污染水体是一个世界范围的问题,粪便中致病性细菌、病毒和原虫的介水传播,引起水源性疾病。固定污水排放点的点源污染,如下水道、废水处理厂及工业水的排泄等,或者无固定污水排放点的非点源污染,如农、林、野生动物和城市污水泄流等,均可以造成(本文来源于《江苏预防医学》期刊2011年01期)

顾玲,李伟伟,丁震,汪华,周璐[4](2010)在《水库水非点源粪便污染微生物源追踪法鉴定》一文中研究指出目的应用细菌基因组重复序列PCR技术(rep-PCR)微生物源追踪方法对江苏省盱眙县桂五水库中粪便污染来源进行追踪。方法分别采集不同季节水库周边已知来源粪便标本,分离大肠埃希菌作为指示菌,建立已知污染源指示菌rep-PCR特征指纹库,用基因聚类分析软件计算平均正确归类率,进行判别分析和多元方差分析;同期采集水库水样,分离并确认指示菌,进行rep-PCR扩增,与已知污染源数据库进行对比,判断水样中指示菌污染来源。结果将已知源数据库分为2,3,4,5和9类时,平均正确归类率分别为89.19%,77.58%,76.69%,75.25%和70.92%;已知源数据库可区分指示菌的不同来源。对534株水库水样指示菌微生物源追踪结果显示,人、鸡、鸭、鹅、狗、猪、牛、羊和野生动物各占26.49%,14.74%,7.77%,5.78%,3.98%,7.97%,10.96%,8.76%和8.57%。结论桂五水库粪便污染来源种类繁多,其中人、鸡和牛为主要污染源;该方法为查找水体粪便污染来源及污染整改效果评估提供了新技术。(本文来源于《中国公共卫生》期刊2010年05期)

于洋[5](2010)在《微生物源追踪技术应用于工业、生活双重污染水体的效果评价》一文中研究指出目的:建立南京秦淮河上游中山河微生物源追踪抗生素敏感性分析(Antibiotic Resistance Analysis, ARA)数据库,追踪水体中的污染来源,为水污染预防控制和整改提供科学依据,探讨该方法在工业、生活双重污染水体中追踪微生物污染源的应用价值。方法:采集南京秦淮河上游中山河周边自然村中人、家畜、家禽等的新鲜粪便标本及生活、工业污水排放口直接排放的污水,分离并确认指示菌E.coli。配制含不同浓度抗生素的TSA平板,将E.coli印至含抗生素的TSA平板,根据E.coli在不同浓度TSA平板上的生长情况,记录其生长得分,建立已知源微生物源追踪数据库,并利用正确归类率对已知源数据库进行评价。按计划采集未知源水样,膜过滤法分离指示菌,进行抗生素敏感性实验,并使用判别分析的方法,通过JMP7.0软件进行污染源追踪及效果评价。结果:(1)本次研究建立的已知源数据库包含指示菌E.coli共2792株,其中人来源菌株865株,猪来源菌株315株,牛来源菌株237株,羊来源菌株117株,鸡来源菌株331株,鸭来源菌株305株,鹅来源菌株48株,狗来源菌株360株及生活、工业污水来源菌株214株。(2)本次研究建立的已知源数据库以春、夏、秋、冬四季为准,分别进行分析讨论:春季数据库叁分类平均正确归类率(Average Rates of Correct Classification, ARCC)为70.61%,五分类ARCC值为60.27%;夏季数据库叁分类ARCC值为68.75%,五分类ARCC值为52.47%;秋季数据库叁分类ARCC值为62.52%,五分类ARCC值为48.21%;冬季数据库叁分类ARCC值为69.57%,五分类ARCC值为62.77%。(3)秦淮河上游中山河水体污染源追踪结果:春季的主要水体污染来源为生活、工业污水,夏季的主要水体污染来源为狗的粪便,秋季的主要水体污染来源为人的粪便和生活、工业污水,冬季的主要水体污染来源为人和狗的粪便。(4)与同样使用微生物源追踪ARA方法在原生态封闭型水体淮河流域桂五水库环境水得出的研究结果相比,本次研究中得到的ARCC值均比较低。结论:微生物源追踪ARA方法不仅可以应用于原生态水体,也可以应用于受生活、工业污染双重污染水体的污染源追踪。(本文来源于《南京医科大学》期刊2010-05-01)

于洋,顾玲,张婷婷,王毓,丁震[6](2010)在《微生物源追踪技术在不同污染水体中的应用评价》一文中研究指出目的建立南京秦淮河上游中山河和淮河流域桂五水库的微生物源追踪抗生素敏感性分析(antibiotic resistance analysis,ARA)数据库,追踪水体中的污染来源,探讨该方法在不同水体中追踪微生物污染源的应用价值。方法采集目标水体周边自然村中人、家畜、家禽等的粪便标本及生活和工业污水排放口直接排放的污水,分离并确认指示菌,建立已知源微生物源追踪数据库。按计划采集未知源水样,分离指示菌并使用J MP7.0软件进行污染源追踪及效果评价。结果秦淮河上游中山河水体污染源主要为工业及生活污水和狗的粪便污染。淮河流域桂五水库环境水污染源则主要为人和羊的粪便污染。结论微生物源追踪方法不仅可以应用于原生态水体,而且可以应用于受生活、工业双重污染水体的微生物污染源追踪,均能取得较好的效果。(本文来源于《中华疾病控制杂志》期刊2010年03期)

顾玲,丁震,汪华,陈晓东,李伟伟[7](2010)在《应用不同微生物源追踪方法追踪水库中粪便污染来源》一文中研究指出目的:用两种不同的微生物源追踪(Microbial source tracking,MST)方法对江苏省盱眙县桂五水库粪便污染来源进行追踪。方法:于春、夏、秋、冬4季分别采集水库周边已知来源粪便标本,分离大肠埃希菌并作为指示菌,分别建立已知源指示菌细菌基因组重复序列PCR(repetitive Extragenic Palindromic-Polymerase chain reaction,rep-PCR)特征指纹库和已知源指示菌抗生素敏感性(Antibiotic Resistance Analysis,ARA)数据库,并分别用统计分析及试验设计软件(JMP7.0软件)和基因聚类分析软件(Bionumerics 4.0软件)计算平均正确归类率(Average Rate of Correct Classification,ARCC),以检验各自的宿主来源区分效果。同期采集水样,膜过滤法分离并确认指示菌,分别进行rep-PCR扩增和ARA试验,并分别与已知源指示菌rep-PCR特征指纹库和ARA数据库进行统计学比对,判断桂五水库中粪便污染来源。结果:将已知源指示菌rep-PCR特征指纹库和ARA数据库分别分为2、3、4、5和9类时,平均正确归类率分别为:89.19%、77.58%、76.69%、75.25%、70.92%和88.59%、84.98%、80.81%、79.58%、76.71%。两个已知源指示菌数据库均可较好地区分指示菌的不同来源。rep-PCR微生物源追踪和ARA微生物源追踪分别对534和547株水样指示菌进行了分析,判别分析结果分别显示人、鸡、鸭、鹅、狗、猪、牛、羊和野生动物各占26.49%、14.74%、7.77%、5.78%、3.98%、7.97%、10.96%、8.76%、8.57%和32.72%、8.78%、1.28%、2.01%、9.51%、12.98%、1.83%、28.34%、1.83%。结论:水体标本监测结果显示桂五水库粪便污染来源种类繁多,两种方法追踪结果不尽相同,rep-PCR法提示人、鸡和牛为主要污染源,ARA法结果显示人、羊和猪是最主要的污染贡献者,这可能与两法所选指示菌不完全相同有关,也可能是方法本身的差异导致源追踪结果有差异。(本文来源于《中国卫生检验杂志》期刊2010年02期)

李伟伟,顾玲,叶珣,陈晓东,丁震[8](2009)在《rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法建立的研究》一文中研究指出[目的]建立重复序列聚合酶链反应(rep-PCR)微生物源追踪方法,应用于淮河流域某水库的粪便污染来源追踪。[方法]采集已知来源的人和动物粪便标本以及水样标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增;用Bionumerics 4.0软件对rep-PCR基因指纹图进行判别分析和多元方差分析并计算各源种类的正确归类率。[结果]2分类、4分类和10分类的正确归类率分别为:85.60%、79.20%和70.98%。判别分析和多元方差分析结果显示rep-PCR基因指纹图能将已知源不同来源指示菌区分开。水样中主要粪便污染来源为猪、鸡和人。[结论]建立的rep-PCR微生物源追踪方法能较好地区分水体中指示菌的不同来源,该方法的建立为查找水体中粪便污染来源以及水体治理提供了新技术。(本文来源于《现代预防医学》期刊2009年17期)

李伟伟[9](2009)在《Rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法研究与应用》一文中研究指出水源性病原体危害人类健康,而粪便污染是造成水中病原体污染的最主要原因,确定粪便污染来源对于健康危害评估及对污染水体的整改和管理至关重要。传统的监测方法只能对水体做出卫生学评价,而无法查找水体中污染物的来源。Rep-PCR基因指纹图微生物源追踪技术则可以通过不同来源指示菌的源特征性基因指纹图,结合统计学分析来查找水体中粪便污染来源。目的本研究旨在建立桂五水库地区已知源特征性rep-PCR基因指纹库,并用正确归类率等统计学方法对其进行评价,检测桂五水库水样标本,追踪其为期一年的粪便污染来源。方法春、夏、秋和冬四季分别采集桂五水库周边村落已知来源的人和动物(家禽、家畜和野生动物)新鲜粪便标本,分离并确认指示菌大肠杆菌,以BOXA1R为引物进行PCR扩增。用Bionumerics 4.0软件对rep-PCR基因指纹图进行判别分析和多元方差分析并计算正确归类率,以评价该方法对不同种属来源指示菌的区分效果。按月采集水样标本,膜过滤法分离指示菌,进行rep-PCR扩增,将水样中指示菌rep-PCR基因指纹图与已知源特征性rep-PCR基因指纹库进行统计学比对,判断桂五水库中粪便污染来源。结果1.从650份已知源粪便标本中分离2705株指示菌,筛选并建立已知源特征性rep-PCR基因指纹库。2.将已知源库分为10类、5类、3类和2类统计分析,各种属平均正确归类率分别为:68.13%、74.76%、82.36%和86.03%。判别分析和多元方差分析结果显示rep-PCR基因指纹图能将已知源不同来源指示菌区分开。3. 84份未知源水样分离到534株指示菌,rep-PCR实验得到502条特征指纹图,指其中477条(95.02%)指纹图可判别污染来源。判别分析结果显示:桂五水库中粪便污染来源种类多,人、鸡、牛、羊、猪、鸭、鹅、野生动物、狗和鸽各占27.88%、15.51 %、11.53%、9.22%、8.39%、8.18%、6.01%、5.66%、4.19%和3.35%,其中人、鸡和牛3类共占54.92%。结论筛选并建立的已知源特征性rep-PCR基因指纹库具有宿主特异性,能较好地区分水体中指示菌的不同来源;水体标本监测显示桂五水库粪便污染来源种类多,其中人、鸡和牛相对较多,提示应对桂五水库地区加强人、家禽和家畜动物粪便的无害化管理。(本文来源于《南京医科大学》期刊2009-05-01)

叶珣,顾玲,李伟伟,陈晓东,丁震[10](2009)在《抗生素敏感性微生物源追踪方法建立》一文中研究指出目的建立抗生素敏感性微生物源追踪方法,以分析淮河流域某水库粪便污染来源。方法采集水库周边已知来源粪便标本,分离指示菌,接种至含抗生素的培养基,筛选能区分不同来源指示菌的抗生素浓度,用JMP7.0软件进行判别分析检验效果。同时采集水样进行粪便污染来源追踪。结果筛选的不同抗生素及其浓度能将已知来源指示菌正确归类率分别为93.05%(2分类)、85.75%(3分类)和78.53%(9分类)。100株指示菌中有58株来自家畜,25株来自家禽,11株来自狗,4株来自人,2株来自野生动物。水样标本中主要的粪便污染来源为猪、牛、鸡,分别占水样分离指示菌总数的36%,17%和15%。结论所筛选的抗生素浓度均能较好地区分指示菌的不同来源,该方法的建立可以为查找水体粪便污染来源以及水体治理提供参考与帮助。(本文来源于《中国公共卫生》期刊2009年04期)

微生物源追踪论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

微生物源追踪是从水体粪便污染研究开始发展起来,该文对基于分离培养的微生物源追踪部分方法的原理、应用及进展进行了综述。随着研究技术的不断发展,微生物源追踪的研究范围也逐渐扩大,包括食物、空气等。众多的方法中,基因型方法在未来微生物源追踪研究中会有更广阔的应用前景。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

微生物源追踪论文参考文献

[1].马文.西南岩溶地下水微生物群落解析及源追踪技术研究[D].中国地质大学(北京).2018

[2].陈逊,刘凡.基于分离培养的微生物源追踪方法的研究进展[J].环境与健康杂志.2011

[3].李伟伟,陈晓东.微生物源追踪研究方法探讨[J].江苏预防医学.2011

[4].顾玲,李伟伟,丁震,汪华,周璐.水库水非点源粪便污染微生物源追踪法鉴定[J].中国公共卫生.2010

[5].于洋.微生物源追踪技术应用于工业、生活双重污染水体的效果评价[D].南京医科大学.2010

[6].于洋,顾玲,张婷婷,王毓,丁震.微生物源追踪技术在不同污染水体中的应用评价[J].中华疾病控制杂志.2010

[7].顾玲,丁震,汪华,陈晓东,李伟伟.应用不同微生物源追踪方法追踪水库中粪便污染来源[J].中国卫生检验杂志.2010

[8].李伟伟,顾玲,叶珣,陈晓东,丁震.rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法建立的研究[J].现代预防医学.2009

[9].李伟伟.Rep-PCR基因指纹图微生物源追踪方法研究与应用[D].南京医科大学.2009

[10].叶珣,顾玲,李伟伟,陈晓东,丁震.抗生素敏感性微生物源追踪方法建立[J].中国公共卫生.2009

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