导读:本文包含了番茄基因芯片论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:番茄,储藏,短波紫外线,基因表达
番茄基因芯片论文文献综述
刘长虹,蔡路昀,韩晓旭,应铁进[1]（2012）在《UV-C照射后番茄差异表达基因的基因芯片检测》一文中研究指出应用Affymetrix基因芯片研究了4 kJ/m2短波紫外线(UV-C)照射后7 d番茄总基因表达谱的变化情况。结果表明,UV-C照射后7 d,5 177个基因在杂交后发生变化,差异表达变化倍数值在大于2和小于-2范围内基因共481个,其中上调基因331个,下调基因150个。上调基因主要包括细胞壁相关基因、信号转导基因、胁迫相关基因和抗性基因等;下调基因主要包括乙烯相关基因和初级代谢基因等。研究结果为探索采后UV-C照射诱导番茄抗性反应、抑制乙烯合成,从而推迟成熟、延长番茄采后寿命的分子机制提供了基础。(本文来源于《农业机械学报》期刊2012年01期）
徐科[2]（2009）在《用MicroRNA基因芯片分析菌根和供磷水平对番茄体内MicroRNA表达的影响》一文中研究指出磷是植物生长的必需营养元素,由于磷在土壤中不易移动,因此有效性比较低,是造成植物缺磷的主要原因。植物可以通过扩大根系生长,分泌有机酸等一系列生理机制来提高对土壤中磷的利用率。除此之外,植物根系与菌根菌共生是植物适应土壤缺磷的另一个重要机制。植物通过菌根菌大量伸展到土壤中的菌丝体吸收磷等矿质营养和水分,同时以光合产物作为交换输送给菌根菌。研究发现,在植物根系与菌根菌识别并共生的过程中,包括了一系列的信号转导过程以及生理与分子变化,有些变化与缺磷植物相似,而有些变化又与植物与微生物共生类似。而引起这些变化的调控过程及机理则还不清楚。MicroRNAs (miRNAs)是一类新鉴定的、非编码蛋白、长度约为22 nt的单链小RNA分子。最近的研究发现microRNA(miRNA)作为调控基因表达的调控因子参与了植物生长和发育的各个方面,同时在一些非生物因子造成的胁迫,如养分缺乏过程中,甚至在豆科植物与固氮菌共生过程中都涉及到miRNA的变化等。但是有关miRNA是否参与植物与菌根菌共生,以及与缺磷胁迫过程中miRNA的异同之处,则还未见报导。miRNA基因芯片是近几年迅速发展起来的一种研究植物miRNA差异表达的技术手段,随着植物中新miRNA不断被发现,运用基因芯片可以更加迅速地为我们提供有关miRNA在植物生理变化过程中的信息。在本研究中我们利用miRNA基因芯片分析了在缺磷、正常供磷和菌根菌侵染叁种处理下番茄体内miRNA的表达,从中筛选到35个可能与菌根侵染特异相关的miRNA。其中miR158、miR394、miR414、miR418、miR779.1、miR824、miR846、miR847、miR855在根中上调,miR404在根中下调,miR158、miR164、miR172、miR173、miR319、miR396、miR398、miR407、miR415、miR420、miR771、miR775、miR778、miR829.1、miR832-3p、miR837-3p、miR840、miR843、miR847、miR860、miR862-5p、miR865-5p、miR867在叶中上调,miR168和miR851-3p在叶中下调。再通过植物miRNA靶基因搜索服务器miRU (http://bioinfo3.noble.org/ miRNA/miRU.htm)我们寻找到了其中14个miRNA的靶基因,进一步通过与拟南芥数据库进行BLAST,预测到14个编码已知功能蛋白质的靶基因和7个编码未知功能蛋白质的靶基因,经分析后发现这14个蛋白质中有5个是与代谢相关的蛋白质,5个是与转录因子相关的蛋白质,4个是与环境胁迫相关的蛋白质,1个是与细胞生长相关的蛋白质,1个是与DNA加工相关的蛋白质,其中有2个蛋白质与代谢和环境胁迫都相关。同时,通过基因芯片我们还在根内找到了14个与磷相关的miRNA,其中miR395、miR415、miR862-5p和miR866-5p上调,miR159、miR162、miR166、miR167、miR168、miR396、miR399、miR834、miR840、miR862-3p下调。在叶中筛选到了12个相关的miRNA,其中miR163、miR404、miR414、miR418、miR472和miR855上调,miR417、miR823、miR825、miR844*、miR845和miR853下调。经预测发现了16个编码已知功能蛋白质的靶基因和6个编码未知功能蛋白质的靶基因,经分析后发现这16个蛋白质中有9个是与代谢相关的蛋白质,3个是与转录因子相关的蛋白质,5个是与环境胁迫相关的蛋白质,2个是与DNA加工相关的蛋白质,其中有3个蛋白质与代谢和环境胁迫都相关。以上这些发现还有待进一步通过RT-PCR和Northern Blot手段和方法进行验证,但表明植物中的确有众多的microRNA参与磷素营养和菌根调控的基因表达。(本文来源于《南京农业大学》期刊2009-06-01）
番茄基因芯片论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
磷是植物生长的必需营养元素,由于磷在土壤中不易移动,因此有效性比较低,是造成植物缺磷的主要原因。植物可以通过扩大根系生长,分泌有机酸等一系列生理机制来提高对土壤中磷的利用率。除此之外,植物根系与菌根菌共生是植物适应土壤缺磷的另一个重要机制。植物通过菌根菌大量伸展到土壤中的菌丝体吸收磷等矿质营养和水分,同时以光合产物作为交换输送给菌根菌。研究发现,在植物根系与菌根菌识别并共生的过程中,包括了一系列的信号转导过程以及生理与分子变化,有些变化与缺磷植物相似,而有些变化又与植物与微生物共生类似。而引起这些变化的调控过程及机理则还不清楚。MicroRNAs (miRNAs)是一类新鉴定的、非编码蛋白、长度约为22 nt的单链小RNA分子。最近的研究发现microRNA(miRNA)作为调控基因表达的调控因子参与了植物生长和发育的各个方面,同时在一些非生物因子造成的胁迫,如养分缺乏过程中,甚至在豆科植物与固氮菌共生过程中都涉及到miRNA的变化等。但是有关miRNA是否参与植物与菌根菌共生,以及与缺磷胁迫过程中miRNA的异同之处,则还未见报导。miRNA基因芯片是近几年迅速发展起来的一种研究植物miRNA差异表达的技术手段,随着植物中新miRNA不断被发现,运用基因芯片可以更加迅速地为我们提供有关miRNA在植物生理变化过程中的信息。在本研究中我们利用miRNA基因芯片分析了在缺磷、正常供磷和菌根菌侵染叁种处理下番茄体内miRNA的表达,从中筛选到35个可能与菌根侵染特异相关的miRNA。其中miR158、miR394、miR414、miR418、miR779.1、miR824、miR846、miR847、miR855在根中上调,miR404在根中下调,miR158、miR164、miR172、miR173、miR319、miR396、miR398、miR407、miR415、miR420、miR771、miR775、miR778、miR829.1、miR832-3p、miR837-3p、miR840、miR843、miR847、miR860、miR862-5p、miR865-5p、miR867在叶中上调,miR168和miR851-3p在叶中下调。再通过植物miRNA靶基因搜索服务器miRU (http://bioinfo3.noble.org/ miRNA/miRU.htm)我们寻找到了其中14个miRNA的靶基因,进一步通过与拟南芥数据库进行BLAST,预测到14个编码已知功能蛋白质的靶基因和7个编码未知功能蛋白质的靶基因,经分析后发现这14个蛋白质中有5个是与代谢相关的蛋白质,5个是与转录因子相关的蛋白质,4个是与环境胁迫相关的蛋白质,1个是与细胞生长相关的蛋白质,1个是与DNA加工相关的蛋白质,其中有2个蛋白质与代谢和环境胁迫都相关。同时,通过基因芯片我们还在根内找到了14个与磷相关的miRNA,其中miR395、miR415、miR862-5p和miR866-5p上调,miR159、miR162、miR166、miR167、miR168、miR396、miR399、miR834、miR840、miR862-3p下调。在叶中筛选到了12个相关的miRNA,其中miR163、miR404、miR414、miR418、miR472和miR855上调,miR417、miR823、miR825、miR844*、miR845和miR853下调。经预测发现了16个编码已知功能蛋白质的靶基因和6个编码未知功能蛋白质的靶基因,经分析后发现这16个蛋白质中有9个是与代谢相关的蛋白质,3个是与转录因子相关的蛋白质,5个是与环境胁迫相关的蛋白质,2个是与DNA加工相关的蛋白质,其中有3个蛋白质与代谢和环境胁迫都相关。以上这些发现还有待进一步通过RT-PCR和Northern Blot手段和方法进行验证,但表明植物中的确有众多的microRNA参与磷素营养和菌根调控的基因表达。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
番茄基因芯片论文参考文献
[1].刘长虹,蔡路昀,韩晓旭,应铁进.UV-C照射后番茄差异表达基因的基因芯片检测[J].农业机械学报.2012
[2].徐科.用MicroRNA基因芯片分析菌根和供磷水平对番茄体内MicroRNA表达的影响[D].南京农业大学.2009