麦冬凝集素论文-戴蕾,金辉,叶松华,王维,鲍锦库

麦冬凝集素论文-戴蕾,金辉,叶松华,王维,鲍锦库

导读:本文包含了麦冬凝集素论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:麦冬凝集素(OJL),化学修饰,荧光光谱,荧光淬灭

麦冬凝集素论文文献综述

戴蕾,金辉,叶松华,王维,鲍锦库[1](2008)在《麦冬凝集素的氨基酸修饰和荧光光谱研究》一文中研究指出通过对麦冬凝集素(OJL)进行特殊氨基酸的化学修饰,揭示了OJL所含的6个Trp残基只有1个位于蛋白表面,Trp、Tyr和Ser/Thr不是OJL凝集活性所必需的氨基酸,而Arg是维持其活性的必需基团.OJL在天然状态下荧光发射峰在328 nm处,Trp周围的极性较弱,处于疏水的微环境或Trp的吲哚环有特殊的构象.丙烯酰胺可以淬灭93.46%的色氨酸荧光,而CsCl和KI淬灭的程度较小,分别为41.25%和55.56%,证明Trp主要位于疏水环境.(本文来源于《四川大学学报(自然科学版)》期刊2008年06期)

刘金枝[2](2007)在《麦冬凝集素与蜘蛛抱蛋凝集素的基因克隆及序列分析》一文中研究指出麦冬凝集素(Ophiopogon japonicus Lectin,OJL)是来源于百合科的具有多重生物学活性的甘露糖结合蛋白,属于单子叶甘露糖结合凝集素。蜘蛛抱蛋凝集素也是具有多种生物学活性的甘露糖结合蛋白,在抗虫抗肿瘤方面显示了良好的活性,具有广阔的运用前景。这类凝集素由于具有独特的糖结合特异性、逆转录病毒抑制活性和保护农作物免受昆虫和线虫攻击而引起人们浓厚的兴趣。本文采用同源克隆的方法,通过对麦冬与蜘蛛抱蛋球茎RNA的提取,反转录成cDNA,从Genbank上比较已登录的百合科凝集素的序列,找出其保守序列,并结合软件设计了简并引物,进行3’RACE末端快速扩增,得到了3’端的部分序列,然后根据已得到的序列设计特异性引物,应用在cDNA的3’端随机添加若干PolyA的方法,在cDNA模板3’端加上PolyA,再以此为模板进行PCR,从而克隆得到了麦冬凝集素5’端的部分序列。将3’与5’序列合并,就能获得其cDNA全长序列。以获得的全长cDNA序列和推导出的氨基酸序列与百合科其他植物凝集素在Genbank中的Blast上进行比较,可知麦冬凝集素的全长cDNA序列由704个核苷酸组成,开放阅读框长513bp,编码170个氨基酸,起始密码子位于第46~48bp,终止密码子位于在556~558bp处,在起始密码子上游有一个由45个碱基组成的5’非编码区;在终止密码子下游有一个由146个碱基组成的3’非编码区,包括两个加poly(A)信号和一段真核生物mRNA所特有的poly(A)序列。通过序列的测定,发现OJL基因均编码前体蛋白:含有信号肽序列、成熟蛋白序列和C-末端剪切序列。该成熟蛋白由109个氨基酸组成,分子量为12.1KD。成熟蛋白在氨基酸水平上与雪花莲凝集素同源性达70.4%,与囊丝黄精凝集素同源性为81.1%,与多花黄精凝集素同源性为83.5%与蜘蛛抱蛋凝集素第一个亚基的同源性为66.4%,与蜘蛛抱蛋凝集素第二个亚基的同源性为73.2%。在blocks数据库(www.blocks.fhcrc.org)中检索OJL蛋白氨基酸序列的结构域,发现OJL氨基酸序列中存在一个凝集素功能结构域区,并具有2个典型的甘露糖专一结合位点盒(QDNY)。成熟蛋白氨基酸中极性氨基酸占44.04%,疏水性氨基酸占30.28%,酸性氨基酸占7.34%,碱性氨基酸占2.75%。OJL的信号肽包括27个氨基酸。此基因的克隆,为深入研究OJL结构基因,剪切机制,表达和调控机制以及OJL结构和功能的关系奠定了重要的基础。研究发现蜘蛛抱蛋凝集素cDNA全长1162bp,开放阅读框长930bp,编码309个氨基酸的前体蛋白,起始密码子位于38~40bp,终止密码子位于在965~967bp处,在起始密码子上游有1个由37个碱基组成的5’非编码区;在终止密码子下游有1个由195个碱基组成的3’非编码区,其后面还有一段真核生物mRNA所特有的poly(A)序列。通过序列的分析可以发现该蛋白含有2个结构域,即其前体蛋白含有:信号肽序列、亚基1、连接肽、亚基2和C—末端剪切序列。蛋白亚基1和2分别由106和108个氨基酸组成,分子量为12KD左右,等电点分别为5和7.13。在整个氨基酸的组成中,亚基1的氨基酸中极性氨基酸占33.64%,疏水性氨基酸占32.76%,酸性氨基酸占10.91%,碱性氨基酸占8.81%;在亚基2中极性氨基酸占34.82%,疏水性氨基酸占35.71%,酸性氨基酸占7.14%,而碱性氨基酸同样占6.25%。AEL与百合科其它凝集素的同源性较高,第一个亚基所编码的氨基酸序列与雪花莲凝集素同源性达51.8%,与囊丝黄精凝集素同源性为60.4%,多花黄精凝集素65.5%与铃兰凝集素第一个结构域同源性为50.0%,与铃兰凝集素第二个结构域同源性为49.1%。第二个亚基的数字分别为61.6%、74.3%、77.7%、57.8%、55.7%。在大多数百合科凝集素中,通常都具有叁个甘露糖结合位点盒,通过对AEL的分析发现它比较特殊,AEL-subunit1有两个甘露糖结合位点,一个已经发生突变;AEL-subunit2:只有一个甘露糖,其中有两个已经发生突变。二级和叁级结构分析发现他与GNA的结构非常相似。密码子的偏爱性分析发现AEL中不存在稀有密码子,可直接用于大肠杆菌的表达。因此,该基因的克隆为深入研究AEL结构基因、剪切机制、表达和调控机制以及其结构与功能的关系奠定了重要的基础。(本文来源于《四川大学》期刊2007-05-20)

戴蕾[3](2007)在《麦冬凝集素的分离纯化及其部分性质研究》一文中研究指出本章对麦冬凝集素的研究主要包括分离纯化、性质、活性以及结构几个方面。麦冬(Ophiopogon Japonicus (Thund) Ker-Galw)块根经匀浆、生理盐水浸取、硫酸铵分级沉淀、DEAE-Sepharose阴离子交换层析及Sephacryl S-100分子筛层析可纯化得到麦冬凝集素(Ophiopogon Japonicus Lectin,OJL)纯品,经SDS-PAGE检测为单一蛋白带。Sephacryl S-100分子筛凝胶过滤测得OJL的表观分子量为24KD,SDS-PAGE显示其亚基分子量约为12.0 KD,证明OJL分子为由两个亚基组成的同源二聚体。OJL可以凝集素兔血细胞,其活性的最低浓度是15.6μg/ml。在对OJL性质研究时发现,随着温度的升高,其凝血活性不断减弱。并且在90℃处理20min后,OJL由于变性而完全失去了凝集活性,说明OJL是一种对热比较敏感的凝集素。OJL在一定的pH范围内酸碱性对OJL凝血活性基本没有什么影响,其最适pH为4-8,极端pH才使OJL凝血活性略微降低,表明OJL对pH具有一定的耐受性。经极端pH处理后OJL的荧光光谱与天然OJL的荧光光谱相似表明OJL活性丧失并没有引起构象的变化。OJL在经EDTA透析后,活性保持不变,而且金属离子的加入并不改变其活性,证明其凝血活性不依赖于金属离子;OJL对兔血细胞的凝集作用能够完全被甘露聚糖抑制,表明OJL是一种典型的甘露糖结合凝集素。变性剂对OJL的变性研究表明3mol/L的盐酸胍能使OJL完全失去凝集活性,其荧光强度随着盐酸胍的浓度的增大而增强,并发生了红移。由此说明,高浓度的盐酸胍作为变性剂破坏了蛋白质分子的有序结构,使其疏水氨基酸Trp残基周围的疏水环境遭到破坏,Trp分子从蛋白质疏水内部暴露出来。而8mol/L脲仅使OJL丧失约33%的凝血活性。说明和盐酸胍相比脲对OJL的变性作用并不明显。SDS对OJL的变性作用研究表明随着SDS浓度的增加,OJL的凝血活性逐渐略有下降,在SDS浓度达到20mmol/L时,则由于发生明显的溶血现象,而完全检测不到OJL的凝血活性。NBS滴定法修饰OJL,在自然条件下,有1个Trp残基被修饰,Trp残基的修饰并没有引起OJL活性的明显改变,但是其荧光强度随着NBS浓度的增高而下降。2,3-丁二酮对OJL精氨酸残基的化学修饰表明修饰后的OJL血凝集活性几乎完全丧失,且其荧光强度明显下降。说明Arg是维持其活性的必需基团,可能位于OJL的血凝活性中心或位于中心附近参与了活性中心构象的维持,Arg被修饰后OJL活性的丧失很可能是由于活性中心的破坏或活性中心构象的改变所造成的。而其他氨基酸的化学修饰研究表明Tyr,Ser/Thr等残基与OJL凝集活性无关,氨基酸的修饰并没有引起活性的改变。天然OJL的内源荧光光谱研究表明:激发光波长为280nm时,其最大荧光发射峰位在328nm处,荧光光谱未见有酪氨酸(Tyr)残基的发射峰,表明OJL分子中很可能发生了从Tyr到Trp的能量转移;激发波长为295nm时,其最大荧光发射峰位也在328nm处,比游离Trp的最大荧光发射峰(348nm)蓝移了近20nm,说明Trp周围的极性较弱,处于疏水的微环境。不同淬灭剂对OJL的荧光淬灭研究表明丙烯酰胺作为不带电荷的中性淬灭剂能很好的淬灭荧光基团的荧光,而且几乎是完全淬灭(93.46%)。而对于带电荷的淬灭剂CsCl和KI对OJL的荧光淬灭程度较小(分别为41.25%和55.56%)。淬灭研究的结果表明凝集素OJL的荧光基团Trp和Tyr主要位于凝集素分子的疏水内核中。抑菌实验结果表明OJL对水稻稻瘟病菌和玉米弯孢菌的生长表现出抑制作用,其最低的抑制浓度均为0.5mg/ml。这是第一次在百合科植物中发现的具有抑制真菌的甘露糖结合凝集素。(本文来源于《四川大学》期刊2007-05-20)

麦冬凝集素论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

麦冬凝集素(Ophiopogon japonicus Lectin,OJL)是来源于百合科的具有多重生物学活性的甘露糖结合蛋白,属于单子叶甘露糖结合凝集素。蜘蛛抱蛋凝集素也是具有多种生物学活性的甘露糖结合蛋白,在抗虫抗肿瘤方面显示了良好的活性,具有广阔的运用前景。这类凝集素由于具有独特的糖结合特异性、逆转录病毒抑制活性和保护农作物免受昆虫和线虫攻击而引起人们浓厚的兴趣。本文采用同源克隆的方法,通过对麦冬与蜘蛛抱蛋球茎RNA的提取,反转录成cDNA,从Genbank上比较已登录的百合科凝集素的序列,找出其保守序列,并结合软件设计了简并引物,进行3’RACE末端快速扩增,得到了3’端的部分序列,然后根据已得到的序列设计特异性引物,应用在cDNA的3’端随机添加若干PolyA的方法,在cDNA模板3’端加上PolyA,再以此为模板进行PCR,从而克隆得到了麦冬凝集素5’端的部分序列。将3’与5’序列合并,就能获得其cDNA全长序列。以获得的全长cDNA序列和推导出的氨基酸序列与百合科其他植物凝集素在Genbank中的Blast上进行比较,可知麦冬凝集素的全长cDNA序列由704个核苷酸组成,开放阅读框长513bp,编码170个氨基酸,起始密码子位于第46~48bp,终止密码子位于在556~558bp处,在起始密码子上游有一个由45个碱基组成的5’非编码区;在终止密码子下游有一个由146个碱基组成的3’非编码区,包括两个加poly(A)信号和一段真核生物mRNA所特有的poly(A)序列。通过序列的测定,发现OJL基因均编码前体蛋白:含有信号肽序列、成熟蛋白序列和C-末端剪切序列。该成熟蛋白由109个氨基酸组成,分子量为12.1KD。成熟蛋白在氨基酸水平上与雪花莲凝集素同源性达70.4%,与囊丝黄精凝集素同源性为81.1%,与多花黄精凝集素同源性为83.5%与蜘蛛抱蛋凝集素第一个亚基的同源性为66.4%,与蜘蛛抱蛋凝集素第二个亚基的同源性为73.2%。在blocks数据库(www.blocks.fhcrc.org)中检索OJL蛋白氨基酸序列的结构域,发现OJL氨基酸序列中存在一个凝集素功能结构域区,并具有2个典型的甘露糖专一结合位点盒(QDNY)。成熟蛋白氨基酸中极性氨基酸占44.04%,疏水性氨基酸占30.28%,酸性氨基酸占7.34%,碱性氨基酸占2.75%。OJL的信号肽包括27个氨基酸。此基因的克隆,为深入研究OJL结构基因,剪切机制,表达和调控机制以及OJL结构和功能的关系奠定了重要的基础。研究发现蜘蛛抱蛋凝集素cDNA全长1162bp,开放阅读框长930bp,编码309个氨基酸的前体蛋白,起始密码子位于38~40bp,终止密码子位于在965~967bp处,在起始密码子上游有1个由37个碱基组成的5’非编码区;在终止密码子下游有1个由195个碱基组成的3’非编码区,其后面还有一段真核生物mRNA所特有的poly(A)序列。通过序列的分析可以发现该蛋白含有2个结构域,即其前体蛋白含有:信号肽序列、亚基1、连接肽、亚基2和C—末端剪切序列。蛋白亚基1和2分别由106和108个氨基酸组成,分子量为12KD左右,等电点分别为5和7.13。在整个氨基酸的组成中,亚基1的氨基酸中极性氨基酸占33.64%,疏水性氨基酸占32.76%,酸性氨基酸占10.91%,碱性氨基酸占8.81%;在亚基2中极性氨基酸占34.82%,疏水性氨基酸占35.71%,酸性氨基酸占7.14%,而碱性氨基酸同样占6.25%。AEL与百合科其它凝集素的同源性较高,第一个亚基所编码的氨基酸序列与雪花莲凝集素同源性达51.8%,与囊丝黄精凝集素同源性为60.4%,多花黄精凝集素65.5%与铃兰凝集素第一个结构域同源性为50.0%,与铃兰凝集素第二个结构域同源性为49.1%。第二个亚基的数字分别为61.6%、74.3%、77.7%、57.8%、55.7%。在大多数百合科凝集素中,通常都具有叁个甘露糖结合位点盒,通过对AEL的分析发现它比较特殊,AEL-subunit1有两个甘露糖结合位点,一个已经发生突变;AEL-subunit2:只有一个甘露糖,其中有两个已经发生突变。二级和叁级结构分析发现他与GNA的结构非常相似。密码子的偏爱性分析发现AEL中不存在稀有密码子,可直接用于大肠杆菌的表达。因此,该基因的克隆为深入研究AEL结构基因、剪切机制、表达和调控机制以及其结构与功能的关系奠定了重要的基础。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

麦冬凝集素论文参考文献

[1].戴蕾,金辉,叶松华,王维,鲍锦库.麦冬凝集素的氨基酸修饰和荧光光谱研究[J].四川大学学报(自然科学版).2008

[2].刘金枝.麦冬凝集素与蜘蛛抱蛋凝集素的基因克隆及序列分析[D].四川大学.2007

[3].戴蕾.麦冬凝集素的分离纯化及其部分性质研究[D].四川大学.2007

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