熊翠玲:基于比较转录组学分析揭示中华蜜蜂及意大利蜜蜂幼虫的球囊菌抗性差异机制论文

熊翠玲:基于比较转录组学分析揭示中华蜜蜂及意大利蜜蜂幼虫的球囊菌抗性差异机制论文

本文主要研究内容

作者熊翠玲,杜宇,王鸿权,郑燕珍,付中民,王海朋,张璐,陈大福,郭睿(2019)在《基于比较转录组学分析揭示中华蜜蜂及意大利蜜蜂幼虫的球囊菌抗性差异机制》一文中研究指出:为探究中华蜜蜂(Apis cerana cerana,以下简称中蜂)与意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,以下简称意蜂)幼虫的球囊菌(Ascospahaera apis)抗性差异产生的原因,利用Venn分析、GO分类分析、KEGG代谢通路分析以及Ka/Ks分析对二者的转录组进行比较研究。Venn分析结果显示,中蜂与意蜂的同源基因有17 656个,归属于8 111个基因家族,二者的特有基因分别有1 158和241个,分别归属于468和86个基因家族。GO分类结果显示,中蜂和意蜂的特有基因分别富集在38和28个GO条目。KEGG代谢通路富集分析结果显示,中蜂和意蜂的特有基因分别富集于96和21个代谢通路;进一步分析发现中蜂的特有基因富集在内吞作用、溶酶体、泛素介导的蛋白水解和黑化作用等4个细胞免疫通路,以及MAPK信号通路和Toll-like受体信号通路等2个体液免疫通路,而意蜂仅有1个特有基因富集在MAPK信号通路。Ka/Ks分析结果显示受到强烈正向选择、弱正向选择、中性选择和负向选择的单拷贝同源基因分别有37、281、2 630和3 269个。对受到强烈正向选择的基因进行GO分类和KEGG代谢通路富集分析,GO结果显示中蜂和意蜂的单拷贝同源基因富集的GO条目类型相同;KEGG结果显示中蜂的单拷贝基因仅富集在氧化磷酸化。上述结果表明免疫相关基因数量的差异是二者的球囊菌抗性差异产生的重要原因之一,中蜂在与球囊菌的协同进化过程中可能通过提高能量利用从而限制球囊菌的增殖。本研究结果可为阐明中蜂及意蜂幼虫的球囊菌抗性差异产生的分子机制提供参考。

Abstract

wei tan jiu zhong hua mi feng (Apis cerana cerana,yi xia jian chen zhong feng )yu yi da li mi feng (Apis mellifera ligustica,yi xia jian chen yi feng )you chong de qiu nang jun (Ascospahaera apis)kang xing cha yi chan sheng de yuan yin ,li yong Vennfen xi 、GOfen lei fen xi 、KEGGdai xie tong lu fen xi yi ji Ka/Ksfen xi dui er zhe de zhuai lu zu jin hang bi jiao yan jiu 。Vennfen xi jie guo xian shi ,zhong feng yu yi feng de tong yuan ji yin you 17 656ge ,gui shu yu 8 111ge ji yin jia zu ,er zhe de te you ji yin fen bie you 1 158he 241ge ,fen bie gui shu yu 468he 86ge ji yin jia zu 。GOfen lei jie guo xian shi ,zhong feng he yi feng de te you ji yin fen bie fu ji zai 38he 28ge GOtiao mu 。KEGGdai xie tong lu fu ji fen xi jie guo xian shi ,zhong feng he yi feng de te you ji yin fen bie fu ji yu 96he 21ge dai xie tong lu ;jin yi bu fen xi fa xian zhong feng de te you ji yin fu ji zai nei tun zuo yong 、rong mei ti 、fan su jie dao de dan bai shui jie he hei hua zuo yong deng 4ge xi bao mian yi tong lu ,yi ji MAPKxin hao tong lu he Toll-likeshou ti xin hao tong lu deng 2ge ti ye mian yi tong lu ,er yi feng jin you 1ge te you ji yin fu ji zai MAPKxin hao tong lu 。Ka/Ksfen xi jie guo xian shi shou dao jiang lie zheng xiang shua ze 、ruo zheng xiang shua ze 、zhong xing shua ze he fu xiang shua ze de chan kao bei tong yuan ji yin fen bie you 37、281、2 630he 3 269ge 。dui shou dao jiang lie zheng xiang shua ze de ji yin jin hang GOfen lei he KEGGdai xie tong lu fu ji fen xi ,GOjie guo xian shi zhong feng he yi feng de chan kao bei tong yuan ji yin fu ji de GOtiao mu lei xing xiang tong ;KEGGjie guo xian shi zhong feng de chan kao bei ji yin jin fu ji zai yang hua lin suan hua 。shang shu jie guo biao ming mian yi xiang guan ji yin shu liang de cha yi shi er zhe de qiu nang jun kang xing cha yi chan sheng de chong yao yuan yin zhi yi ,zhong feng zai yu qiu nang jun de xie tong jin hua guo cheng zhong ke neng tong guo di gao neng liang li yong cong er xian zhi qiu nang jun de zeng shi 。ben yan jiu jie guo ke wei chan ming zhong feng ji yi feng you chong de qiu nang jun kang xing cha yi chan sheng de fen zi ji zhi di gong can kao 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国农业大学学报的熊翠玲,杜宇,王鸿权,郑燕珍,付中民,王海朋,张璐,陈大福,郭睿,发表于刊物中国农业大学学报2019年05期论文,是一篇关于中华蜜蜂论文,意大利蜜蜂论文,幼虫论文,比较转录组学论文,球囊菌论文,中国农业大学学报2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国农业大学学报2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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