赵佳琦:宏基因组学揭示二氟沙星对牦牛瘤胃微生态及CAZy谱影响论文

赵佳琦:宏基因组学揭示二氟沙星对牦牛瘤胃微生态及CAZy谱影响论文

本文主要研究内容

作者赵佳琦,文勇立,安雅静,艾鷖,李子谦,齐沛森,李强,何世明(2019)在《宏基因组学揭示二氟沙星对牦牛瘤胃微生态及CAZy谱影响》一文中研究指出:反刍动物瘤胃微生物结构和功能关系到生态系统正常的物质循环、能量流动。为了探讨抗生素对瘤胃微生态的影响,揭示抗生素对反刍动物瘤胃微生物影响的规律,以牦牛为研究对象,进行二氟沙星(DIF)处理,采集瘤胃液,提取DNA,采用宏基因组学方法分析DIF对瘤胃微生物组成及碳水化合物酶类(CAZy)的影响。结果显示,拟杆菌门(Bacteroidetes)、变形菌门(Proteobacteria)等相对丰度下降,而厚壁菌门(Firmicutes)、广古菌门(Euryarchaeota)等增加。普雷沃菌属(Prevotella)、拟杆菌属(Bacteroides)等相对丰度下降,而金黄杆菌属(Chryseobacterium)、链球菌属(Streptococcus)等增加;CAZy酶类中,CBM17、CBM25等丰度上调(P<0.01或P<0.05);GH53、CE8、CE13、CBM21、CBM26及对接蛋白(dockerin)等下调(P<0.01或P<0.05)。结论:DIF影响瘤胃微生物结构,并不同程度改变各优势门、属的相对丰度,抑制部分有益菌的作用;改变CAZy酶中部分家族基因丰度,影响瘤胃微生物对淀粉及果胶的降解作用,降低瘤胃微生物降解植物纤维素的效率。

Abstract

fan chu dong wu liu wei wei sheng wu jie gou he gong neng guan ji dao sheng tai ji tong zheng chang de wu zhi xun huan 、neng liang liu dong 。wei le tan tao kang sheng su dui liu wei wei sheng tai de ying xiang ,jie shi kang sheng su dui fan chu dong wu liu wei wei sheng wu ying xiang de gui lv ,yi mao niu wei yan jiu dui xiang ,jin hang er fu sha xing (DIF)chu li ,cai ji liu wei ye ,di qu DNA,cai yong hong ji yin zu xue fang fa fen xi DIFdui liu wei wei sheng wu zu cheng ji tan shui hua ge wu mei lei (CAZy)de ying xiang 。jie guo xian shi ,ni gan jun men (Bacteroidetes)、bian xing jun men (Proteobacteria)deng xiang dui feng du xia jiang ,er hou bi jun men (Firmicutes)、an gu jun men (Euryarchaeota)deng zeng jia 。pu lei wo jun shu (Prevotella)、ni gan jun shu (Bacteroides)deng xiang dui feng du xia jiang ,er jin huang gan jun shu (Chryseobacterium)、lian qiu jun shu (Streptococcus)deng zeng jia ;CAZymei lei zhong ,CBM17、CBM25deng feng du shang diao (P<0.01huo P<0.05);GH53、CE8、CE13、CBM21、CBM26ji dui jie dan bai (dockerin)deng xia diao (P<0.01huo P<0.05)。jie lun :DIFying xiang liu wei wei sheng wu jie gou ,bing bu tong cheng du gai bian ge you shi men 、shu de xiang dui feng du ,yi zhi bu fen you yi jun de zuo yong ;gai bian CAZymei zhong bu fen jia zu ji yin feng du ,ying xiang liu wei wei sheng wu dui dian fen ji guo jiao de jiang jie zuo yong ,jiang di liu wei wei sheng wu jiang jie zhi wu qian wei su de xiao lv 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自畜牧与兽医的赵佳琦,文勇立,安雅静,艾鷖,李子谦,齐沛森,李强,何世明,发表于刊物畜牧与兽医2019年03期论文,是一篇关于瘤胃微生物论文,抗生素论文,宏基因组论文,二氟沙星论文,牦牛论文,畜牧与兽医2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自畜牧与兽医2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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