钟纯燕:山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的转录组分析论文

钟纯燕:山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的转录组分析论文

本文主要研究内容

作者钟纯燕,李基棕,毛立,李文良,郝飞,孙敏,刘茂军,主性,嵇辛勤,肖芳,杨蕾蕾,张纹纹(2019)在《山羊副流感病毒3型感染MDBK细胞的转录组分析》一文中研究指出:本研究旨在探究山羊副流感病毒3型(CPIV3)感染MDBK细胞后的转录组基因变化情况,丰富CPIV3转录组信息。取1MOI CPIV3JSHA2014-1病毒液感染MDBK细胞,设非感染正常细胞为对照,于24h后收获细胞,提取总RNA,利用Illumina HiSeqTM2500对感染组与对照组进行高通量测序,并用测序评估、基因注释等生物信息学方法进行分析。结果显示,差异表达基因共261个,其中表达上调140个,表达下调121个,经RT-qPCR方法验证8个差异表达的干扰素信号通路相关基因,结果与高通量测序一致。进一步GO分类结果显示,差异表达基因主要涉及细胞生物学进程、构成细胞的组分以及实现的分子功能三个方面,KEGG分析显示这些基因参与代谢、生物系统、细胞进程、基因信息进程和环境信息进程。本研究为深入探究CPIV3的致病机制奠定了基础。

Abstract

ben yan jiu zhi zai tan jiu shan yang fu liu gan bing du 3xing (CPIV3)gan ran MDBKxi bao hou de zhuai lu zu ji yin bian hua qing kuang ,feng fu CPIV3zhuai lu zu xin xi 。qu 1MOI CPIV3JSHA2014-1bing du ye gan ran MDBKxi bao ,she fei gan ran zheng chang xi bao wei dui zhao ,yu 24hhou shou huo xi bao ,di qu zong RNA,li yong Illumina HiSeqTM2500dui gan ran zu yu dui zhao zu jin hang gao tong liang ce xu ,bing yong ce xu ping gu 、ji yin zhu shi deng sheng wu xin xi xue fang fa jin hang fen xi 。jie guo xian shi ,cha yi biao da ji yin gong 261ge ,ji zhong biao da shang diao 140ge ,biao da xia diao 121ge ,jing RT-qPCRfang fa yan zheng 8ge cha yi biao da de gan rao su xin hao tong lu xiang guan ji yin ,jie guo yu gao tong liang ce xu yi zhi 。jin yi bu GOfen lei jie guo xian shi ,cha yi biao da ji yin zhu yao she ji xi bao sheng wu xue jin cheng 、gou cheng xi bao de zu fen yi ji shi xian de fen zi gong neng san ge fang mian ,KEGGfen xi xian shi zhe xie ji yin can yu dai xie 、sheng wu ji tong 、xi bao jin cheng 、ji yin xin xi jin cheng he huan jing xin xi jin cheng 。ben yan jiu wei shen ru tan jiu CPIV3de zhi bing ji zhi dian ding le ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自畜牧兽医学报的钟纯燕,李基棕,毛立,李文良,郝飞,孙敏,刘茂军,主性,嵇辛勤,肖芳,杨蕾蕾,张纹纹,发表于刊物畜牧兽医学报2019年02期论文,是一篇关于山羊副流感病毒型论文,细胞论文,高通量测序论文,转录组论文,畜牧兽医学报2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自畜牧兽医学报2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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