导读:本文包含了模拟靶标论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:多亮点水下靶标,方位角,模拟功能
模拟靶标论文文献综述
邓伟,苏建军[1]（2019）在《水下靶标基于鱼雷攻击方位模拟潜艇多亮点仿真》一文中研究指出为了精确研究水下靶标模拟潜艇目标多亮点声特性;采用基于方位角的数值仿真对潜艇目标声特性进行了理论研究;获得了潜艇不同方位角上声亮点特性,结合水下靶标模拟功能及技术特点,综合实际情况分析了水下靶标模拟潜艇多亮点能力及不足;研究结论对试验数据后期处理及异议性判断分析具有重要帮助,同时对水下靶标发展提供技术支持。(本文来源于《中国声学学会水声学分会2019年学术会议论文集》期刊2019-05-25）
郭彪,孔小林,张林锐,郭芝宏,张旭光[2]（2019）在《一种模拟外军主动防护系统的靶标》一文中研究指出通过对当前陆军地面作战的主要对手——T90坦克进行分析,针对各类反坦克导弹、坦克炮、炮射导弹、制导兵器等性能试验要求、作战试验要求和部队实战化训练需求,提出了一种能够模拟外军主动防御系统的靶标,旨在为相关设备建设和试验开展提供思路。(本文来源于《兵器装备工程学报》期刊2019年02期）
郑国勋[3]（2018）在《新型抗抑郁药物与靶标相互作用的分子模拟研究》一文中研究指出抑郁症已经成为了世界第四大疾患,主要表现为情绪低落、意志消沉、并有自主神经或躯体性伴随症状,严重危害人类身心健康。目前,临床上常用的TCAs,SSRIs和SNRIs等抗抑郁药物对30%-40%患者无效,且普遍存在疗效迟滞、毒副作用大和耐受性差等问题。因此,寻求有效性和安全性,解决疗效滞后问题是抗抑郁药物的研究方向。本论文通过分子模拟和能量计算方法从分子层面系统研究了新型抗抑郁药物NRIs与其靶点hNET之间的作用机制,解释了单胺转运体hSERT和hNET选择性抑制剂的分子机制,探讨了兼具5-HT_(1A)受体部分激动效应和hSERT抑制活性的维拉佐酮可能的结合模式,旨在为设计具有疗效强、安全性高和起效快的新型抗抑郁药物奠定理论基础。1.新型抗抑郁药物NRIs与hNET作用机制研究。选择阿托莫西汀,马普替林,瑞波西汀和维洛沙嗪4个NRIs为代表,采用分子对接,分子动力学模拟和能量计算方法,并通过模拟突变和对比晶体构象对模拟结果进行验证。结果表明,模拟结果可靠且具有较高的准确性,并确定了hNET中11个氨基酸(F72,D75,A145,V148,G149,Y152,F317,F323,S419,S420和G423)对NRIs的结合发挥着关键作用。2.hSERT与hNET选择性抑制剂分子机制研究。以西酞普兰(SSRI),酞普兰(NRIs)及其类似物(SNRI)为分子探针,通过分子对接获得复合物,并对复合物进行分子动力学模拟。经能量分析,能量与结构关系讨论以及蛋白-配体相互作用描述符的统计分析解释了3个分子对hSERT和hNET选择性的分子机制。结果表明,分子的选择性主要受转运体中Warm Spots的影响。这些Warm Spots主要位于hSERT或hNET跨膜TM3,TM8和TM10区域。对于hNET,7个氨基酸(A73,A145,Y151,S420,M424,A477和I481)对分子的选择性影响较大。增强分子与氨基酸(A73,Y151,A477和I481)或者减弱与S420和M424的相互作用能够提高分子对hNET的选择性;对于hSERT,9个氨基酸(A96,A169,A173,Y175,F335,T439,L443,T497和V501)对分子的选择性影响较大。加强分子与氨基酸(A96,A173,T439和L443)或者减弱与氨基酸(Y175,T497和V501)的相互作用能够增强分子对hSERT的选择性。3.新型抗抑郁药物维拉佐酮作用机制研究。维拉佐酮通过双重机制发挥药效,既能抑制hSERT的活性,也能激动5-HT_(1A)受体。对于其激动5-HT_(1A)受体的作用机制,选择维拉佐酮及其50个类似物为代表,通过Prime/MM-GBSA能量预测值选择初始构象,并对其中6个复合物(14,29,36,39,48和51)进行分子动力学模拟。随后,通过能量计算,残基能量分解计算以及丙氨酸扫描探究了维拉佐酮与5-HT_(1A)受体的相互作用。结果表明,受体中22个氨基酸(M92~(2.60),A93~(2.61),Y96~(2.64),W102~(ECL1),C109~(3.25),F112~(3.28),I113~(3.29),D116~(3.32),V117~(3.33),S119~(3.35),C120~(3.36),T121~(3.37),T188~(ECL2),I189~(ECL2),T196~(5.39),T200~(5.43),A303~(5.46),W358~(6.48),F361~(6.51),F362~(6.52),N386~(7.39)和Y390~(7.43))对维拉佐酮的结合具有重要的作用。对于其与hSERT的相互作用,选择维拉佐酮及其5个类似物(15,20,22,39和47)为代表,以晶体hSERT结构(5I73)为起点,对复合物进行分子动力学模拟,并对蛋白-配体相互作用描述符进行统计分析,探讨了维拉佐酮与hSERT可能的作用模式。结果表明,hSERT中11个氨基酸(Y95,D98,R104,I172,Y175,Y176,F335,F341,S438,T439和E493)对维拉佐酮的结合较为关键。维拉佐酮与hSERT结合时,同时占据着hSERT S1和S2位点,且S1和S2之间的离子型开关(R104/E493)呈开放状态。本论文中所研究的新型抗抑郁药物与靶标之间的作用机制将对研发骨架新颖、毒副作用小和起效快的新型抗抑郁药物具有重要的理论指导意义,同时能够为设计具有新型机制的抗抑郁药物提供新的视角和策略。(本文来源于《重庆大学》期刊2018-04-01）
唐刘建,温垚珂,徐诚,宋焦[4]（2018）在《手枪弹侵彻软防护人体胸部靶标的数值模拟》一文中研究指出采用显示有限元法对9 mm铅芯手枪弹侵彻软防护人体靶标的过程进行了数值模拟,分析侵彻过程中的典型现象与人体靶标的动态响应。数值分析表明:手枪弹被严重磨损与镦粗,软防护侵彻层为7层;弹着点在心脏部位时,人体靶标内部,肋骨的最大应力为178.3 MPa,左肺的最大应力为0.231 MPa,右肺的最大应力为0.363 MPa,心脏的最大应力为0.055 9 MPa。(本文来源于《兵器装备工程学报》期刊2018年01期）
李宁[5]（2017）在《模拟复杂地形的变量喷雾靶标特征激光检测研究》一文中研究指出喷雾靶标的检测是精密变量喷雾的重要环节。激光传感器具有扫描速度快、测量精度高以及适用于室外环境等出色的性能,在精密变量喷雾的研究与应用中备受关注。然而实际喷雾的过程中,复杂地形条件容易造成变量喷雾机实时传感器检测靶标特征出现偏差。本文研究的主要目标就是探索如何降低激光传感器姿态角的偏移对喷雾靶标检测的影响,从而获取精确的喷雾靶标外形尺寸信息以及叁维重构图像。首先研究了所选用的二维激光扫描传感器的检测原理以及靶标激光检测数据的获取与叁维重构的方法。在此基础上,利用直线滑台靶标激光检测平台设计了靶标激光检测试验,通过试验验证了所选用的激光传感器的优良性能以及靶标叁维重构方法的有效性。然后研究了模拟复杂地形的直线滑台靶标激光检测与矫正。利用直线滑台靶标激光检测平台,通过改变激光传感器的叁维安装角度模拟复杂路况,分别针对激光传感器存在固定的横滚角、偏航角和俯仰角的情况,提出了极坐标值与叁角函数重新匹配、深度值系数矫正以及检测帧与检测点重新组合等3种姿态角偏移矫正方法,并且设计试验验证了激光传感器3种姿态角偏移单一固定存在以及复合固定存在时矫正方法的有效性。试验结果显示树形雕花板的宽度、高度以及树冠高度等尺寸相对误差均小于5%,仿真树的相关参数相对误差均小于10%,矫正后的叁维重构图像与矫正前相比有较大改善,满足变量喷雾检测的精度要求。最后研究了融合动态车体姿态角偏移数据的车载激光靶标检测与矫正。本文基于惯性测量单元与UTM-30LX型激光传感器搭建了车载激光靶标检测平台,惯性测量单元实时获取车体的偏航角、俯仰角及横滚角。根据利用试验车动态变化的姿态角偏移数据矫正靶标激光检测数据的思想,提出了车体横滚角、俯仰角以及偏航角分别动态存在时靶标激光检测数据的矫正方法,分别为融合横滚角的极坐标值与叁角函数重新匹配法、分段融合俯仰角平均值的检测帧与检测点重新组合法以及融合偏航角平均值的深度值系数矫正法。然后设计试验验证了俯仰角单一动态存在、俯仰角和横滚角复合动态存在以及复杂地形叁种情况下激光检测数据矫正方法的有效性。试验结果显示矫正后靶标的叁维重构图像与矫正前相比有较大改善,且长方体柜子的宽度、高度以及仿真树的宽度、高度和树冠高度相对误差均小于10%,矫正效果良好,验证了矫正方法的有效性。本文根据复杂地形条件对靶标激光检测的影响,研究了激光传感器存在固定姿态角偏移以及动态姿态角偏移的靶标检测与矫正,为实际变量喷雾靶标检测环节提供了一定的理论与试验基础。(本文来源于《江苏大学》期刊2017-04-01）
刘慧,李宁,沈跃,徐慧[6]（2016）在《模拟复杂地形的喷雾靶标激光检测与叁维重构》一文中研究指出喷雾靶标的检测是精密变量喷雾的重要环节,激光传感器以其精度高、速度快、不受光照干扰等特点被广泛应用于精密变量喷雾研究中。为了消除激光传感器姿态角的偏移对喷雾靶标检测的影响,获取精确的喷雾靶标外形尺寸信息以及叁维重构图像,进行了室内模拟复杂地形激光检测矫正研究。该文基于UTM-30LX型激光传感器搭建了室内靶标检测试验平台,模拟复杂路况设计了滚转角、俯仰角和偏航角等姿态角偏移检测试验,提出了采用极坐标值与叁角函数重新匹配、检测帧与检测点重新组合和深度值系数矫正等3种姿态角偏移矫正方法。首先对树形雕花板进行单一姿态角偏移检测试验,选取适合的检测距离与行进速度,对每种姿态角的多个偏移角度进行多次重复试验,然后矫正所获取的数据信息,对矫正后的目标尺寸进行误差分析并重构目标叁维图像。再以仿真树为试验对象,验证在3种姿态角度同时改变时矫正方法的有效性。试验结果显示树形雕花板高度、宽度、树冠高度等尺寸相对误差均小于5%,仿真树相应参数尺寸相对误差均小于10%,满足变量喷雾检测的精度要求。(本文来源于《农业工程学报》期刊2016年18期）
樊春燕[7]（2016）在《全基因组范围内玉米miRNAs靶标及模拟靶标的识别与分析》一文中研究指出近年来,发现蛋白编码基因、长非编码RNAs (lncRNAs)以及假基因等转录本间存在复杂的相互作用。它们作为竞争性内源RNAs (Competing endogenous RNAs, ceRNAs)、天然]miRNA decoys/sponges或模拟靶标(target mimics),通过竞争结合共同的microRNAs反应元件(nicroRNA response element, MRE)实现相互调节。microRNAs(miRNA s)是一类长度约21-24nt的单链小非编码RNAs,普遍存在于真核生物中,并且在转录水平或转录后水平调控基因表达。植物miRNAs在调控植物发育、花期、叶形态发生、激素信号、磷酸盐和硫酸盐等环境胁迫等生物学过程中发挥重要作用。基因间长非编码RNAs (long intergenic noncoding RNAs, lincRNAs)是一类位于基因组间区的长度大于200nt的转录本,并在转录或转录后水平通过多种RNAs介导的机制调控基因表达,在动物中主要参与胚胎干细胞分化、免疫监视、细胞周期调控等生物学过程,而在植物中大多与生殖发育、开花时间及胁迫相应等作用有关。假基因是与功能RNAs或蛋白编码基因高度相似的一类非功能基因组序列,对于假基因的研究有助于注释基因组及其基因组进化的理解。蛋白编码基因被认为是真核生物最主要的转录本,然而非编码RNAs也起着很重要的作用。之前的研究表明mRNAs可以普遍的作为miRNAs的靶标及模拟靶标,而lincRNAs及假基因等其他转录本作为miRNAs靶标及模拟靶标的研究尚少,尤其在植物中的研究更是处在起步阶段。玉米是世界上重要的农作物之一,对于玉米的研究有助于我们了解植物的发育和进化的遗传模型系统。本文通过整合miRNAs、lincRNAs、假基因、cDNAs以及降解组数据,利用生物信息学手段预测了作为miRNAs的靶标和模拟靶标的lincRNAs和假基因,并通过共表达网络和ceRNAs假说分别预测了作为miRNA s靶标和miRN A模拟靶标的lincRNAs功能。我们的研究结果表明：1.通过计算机方法系统的预测了玉米中466个lincRNAs可以作为165个miRNAs靶标的和86个lincRNAs可以作为58个miRNAs的模拟靶标,并利用降解组数据验证得到了34个lincRNAs可以作为33个miRNAs的靶标。2.不管作为miRNAs靶标还是miRNAs模拟靶标,当miRNAs结合到lincRNAs上时其结合区域都有较高的保守性,表明miRNAs在不同物种有潜在的参与lincRNAs的调控的可能。3.利用筛选得到的78个miRNAs、117个lincRNAs、8834个nRNAs构建了miRNAs相关的调控网络。基于lincRNA-mRNA共表达网络和ceRNAs假说的分析,我们发现作为miRNAs靶标的34个lincRNAs和作为miRNA模拟靶标的86个1incRNAs普遍参与细胞和代谢等过程,并在催化活性和分子结合等功能的发挥中具有重要作用。4.通过降解组确认及筛选规则的过滤,发现109个miRNAs和作为miRNAs靶标的203个假基因形成的236对miRNA-假基因复合物,也找到了有348个假基因可能作为ceRNAs与miRNAs竞争性结合影响miRNAs真正靶标作用的发挥。结论：在全基因组范围内识别了玉米niRNAs、lincRNAs、假基因和mRNAs之间潜在的调控关系,从而发现有降解组数据支持的作为miRNAs靶标而形成的miRNA-lincRNA复合物有42对,miRNA-假基因复合物有236对。另外发现有86个lincRNAs和348个假基因可能作为miRNAs竞争性的模拟靶标,与miRNAs真正的靶标竞争性的结合IniR NAs。因此,本文旨在为挖掘miRNAs调控的网络和探索lincRNAs及假基因的功能奠定理论基础。(本文来源于《陕西师范大学》期刊2016-05-01）
李赵杰[8]（2016）在《Tae-miR9677前体及其小串联模拟靶标表达载体构建及小麦遗传转化研究》一文中研究指出miRNA在植物的生长、发育和逆境胁迫应答等各种生物学过程中发挥重要的调节作用。近年来,植物miRNA的鉴定及功能研究已成为热点研究领域,然而小麦作为重要的粮食作物,其miRNA功能研究却远远滞后于其他植物,这种情况亟待解决。为揭示本课题组前期研究发现的小麦穗部特异性高表达Tae-miR9677的相关功能,本研究首先通过分离克隆或人工合成分别获得Tae-miR9677前体(Tae-pre-miR9677)及其小串联模拟靶标(Tae-miR9677 STTM)序列,并将其连接在改造后的双元表达载体pCAMBIA3301上,分别获得了以Ubiqutin(UBI)启动子启动的Tae-pre-miR9677及Tae-miR9677STTM的表达载体pCAMBIA3301-Tae-pre-miR9677和pCAMBIA3301-Tae-miR9677 STTM;利用基因枪转化法和农杆菌转化法将其转入受体小麦绵阳19,获得转基因阳性小麦株系,为后续利用转基因小麦株系研究Tae-miRNA 9677的功能奠定基础工作。研究主要结果如下:(1)Tae-miR9677 STTM过表达载体构建及小麦遗传转化本实验首先设计并人工合成得到两端带有BamHⅠ、PmlⅠ和KpnⅠ酶切位点的Tae-miR9677 STTM序列,通过基因重组技术改造双元表达载体pCAMBIA3301,获得以UBI启动的Tae-miR9677 STTM表达载体pCAMBIA3301-Tae-miR9677 STTM。该载体除携带以UBI启动子控制的Tae-miR9677 STTM外,还具有一个受CAMV35S启动子控制的Bar基因,后者可以为后续利用除草剂Phosphinothricin(PPT)对愈伤组织进行筛选及再生植株的抗性鉴定提供了条件。通过基因枪转化法轰击受体小麦绵阳19幼胚愈伤共3683个,经过PPT筛选培养及分化培养,最终获得42株再生植株。利用目标序列特异性引物进行PCR检测,鉴定出阳性植株8株,转化率为0.21%;8株T0代阳性植株共收获种子27粒T0代种子。将27粒T0代种子全部萌发,成苗后获27株T1代植株,对其进行目标序列特异PCR鉴定,多次重复鉴定获得3株转基因T1代阳性植株;同时,对27株T1代植株用Basta溶液进行检测,同样,只有3株PCR检测为阳性的T1代植株对Basta溶液表现出抗性反应,这2种检测相互印证,表明本研究得到了3株T1代转基因阳性植株。(2)Tae-pre-miR9677过表达载体构建及小麦遗传转化本实验首先设计特异引物克隆得到两端带有BamHⅠ、PmlⅠ和KpnⅠ酶切位点的pre-Tae-miR9677序列,通过基因重组技术改造双元表达载体pCAMBIA3301,获得以UBI启动的Tae-pre-miR9677表达载体。该载体除携带以UBI启动子控制的Tae-pre-miR9677外,还具有一个受CAMV35S启动子控制的Bar基因,后者可以为后续利用除草剂Phosphinothricin(PPT)筛选转化再生植株提供抗性。通过改造的含有过表达载体pCAMBIA3301-Tae-pre-miR9677的农杆菌EHA105侵染受体小麦绵阳19成熟胚共1300个,经过PPT筛选,最终获得再生植株7株,利用改造得到的过表达载体pCAMBIA3301-Tae-pre-9677特异性引物进行PCR检测,鉴定出阳性植株1株;对7株转基因植株进行Basta涂抹实验,同样,只有1株PCR检测为阳性的T0代植株对Basta溶液表现出抗性反应,这2种检测相互印证,表明本研究得到了1株T0代转基因阳性植株。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2016-05-01）
李赵杰,简超,刘香利,赵惠贤[9]（2016）在《Tae-miR9677小串联模拟靶标(STTM)表达载体构建及小麦的遗传转化研究》一文中研究指出小串联模拟靶标(Short tandem target mimic,STTM)技术是一种新开发的miRNA功能研究方法。Tae-miR9677作为一种新发现的在小麦穗部特异性高表达的miRNA,其功能至今未知。为了进一步探索Tae-miR9677的功能,构建了Ubiqutin(UBI)启动子启动的Tae-miR9677 STTM过表达载体,并通过基因枪介导法对小麦品种绵阳19幼胚愈伤组织进行转化。结果表明,3 683个愈伤组织经过PPT(Phosphinothricin)筛选,最终分化获得42株再生植株;利用特异性引物进行PCR检测,鉴定出8株T0代阳性植株。(本文来源于《麦类作物学报》期刊2016年04期）
潘大波[10]（2016）在《HCV相关靶标与抑制剂相互作用的分子模拟研究》一文中研究指出发现高效专一地抑制在丙型肝炎病毒(hepatitis C virus,HCV)生命周期中起关键作用的蛋白的抑制剂是抗HCV药物研发的重要环节。非结构蛋白3/4A(nonsturcture protein 3/4A,NS3/4A)、非结构蛋白3解旋酶(nonsturcture protein3 helicase,NS3解旋酶)和非结构蛋白5B(nonsturcture protein 5B,NS5B)是抗HCV药物的重要靶标,它们在HCV复制和翻译过程中担负着重要的角色,如对核酸的解旋和易位等。目前,一系列能够有效地抑制这些蛋白的药物已经被发现,如已批准上市的针对NS3/4A的药物波普瑞韦、特拉瑞韦和司美匹韦等。但是HCV耐药病毒株的出现使得对现有药物的耐药越来越严重,耐药性的产生严重影响了药物的疗效。因此寻找新颖的能够有效地抗HCV耐药病毒株的抑制剂迫在眉睫。随着计算机技术的不断进步,分子模拟方法作为寻找新型抑制剂的重要工具已被广泛应用于靶标与药物的作用机制、耐药机制等研究中。如分子动力学模拟、拉伸分子动力学模拟、自适应偏置力模拟和Metadynamics模拟等分子模拟方法都已经广泛应用于HCV相关靶标结构和功能的研究当中。本论文将从结构和能量的角度详细地阐释相关抑制剂与HCV靶标NS5B、NS3解旋酶和NS3/4A的相互作用机制和抑制剂的解离机制。这些实验结果将为设计全新的抗HCV药物提供一定的理论基础。本论文首先简述了HCV生命周期的各个阶段、主要的HCV药物作用靶标的结构和功能以及目前针对这些靶标上市或在研的药物。并总结了分子模拟方法在HCV相关靶标与抑制剂之间的相互作用,靶标对抑制剂的耐药机制等方面的运用情况。然后简单介绍了本论文用到的几种分子模拟方法:自适应偏置力模拟、拉伸分子动力学模拟和Metadynamics模拟等。基于这些模拟方法,本论文的研究内容包括4个部分。论文第一部分阐释了NS5B突变对抑制剂BMS-791325的耐药机制。我们运用分子动力学模拟、结合自由能计算、氨基酸残基能量分解和自适应偏置力模拟等方法探讨了BMS-791325与NS5B蛋白的野生型(WT)、突变型A421V、L392I和P495L的作用机制。模拟结果表明NS5B与BMS-791325结合的关键作用能为疏水相互作用能,NS5B中氨基酸残基L392、A393、A396、T399、H428、V494、P495和W500的能量贡献值超过1 kcal/mol。BMS-791325从NS5B解离的第一步为氨基酸残基R503与BMS-791325之间的亲水作用能降低,第二步为拇指区Ⅰ变构位点与BMS-791325之间疏水作用的消失促使BMS-791325最终逃离ns5b。氨基酸残基突变(a421v、l392i和p495l)导致bms-791325与ns5b结合亲和力和bms-791325从ns5b解离的平均力势降低。发生p495l之后,495位氨基酸残基骨架环结构消失,使其周围的蛋白柔性增大,蛋白不能很好地锚定抑制剂。在a421v和l392i突变型ns5b体系中,突变后氨基酸残基与抑制剂之间疏水相互作用能的降低是其产生耐药的主要原因。论文第二部分研究了药物索菲布韦的叁磷酸活性代谢产物gs-461203及底物utp与ns5b靶标的结合与解离机制。我们从晶体结构出发分别构建了叁元复合物ns5b-rna-gs-461203和ns5b-rna-utp。gs-461203和utp分别与ns5b-rna的分子动力学模拟结果表明:极性和非极性相互作用能对gs-461203与ns5b和utp与ns5b的结合是有利的;与utp相比,gs-461203的2’-氟-2’-碳甲基核糖能够与氨基酸残基s282和i160形成很强的作用,使gs-461203能够竞争性地结合到ns5b-rna结合位点中。运用随机加速分子动力学模拟的方法预测得到utp和gs-461203从ns5b-rna结合位点的解离路径是从ns5b手掌区的背面解离。通过拉伸分子动力学模拟gs-461203和utp的解离过程发现,它们的解离过程大致分为3步:小分子的平移,小分子碱基和核糖的翻转和小分子与靶标完全分开。s282t对utp与ns5b-rna的结合影响较小,但是对gs-461203与ns5b-rna结合影响较大。论文第叁部分研究了ns3解旋酶与其3个吲哚环类抑制剂之间的相互作用。我们运用metadynamics模拟方法研究了抑制剂在ns3解旋酶活性口袋中的作用机制及解离过程,并构建了抑制剂解离过程的自由能表面变化图。抑制剂的解离过程大致分为吲哚环1位连接的疏水基团构象发生变化之后离开疏水空腔、吲哚环3位的乙羧基与ns3解旋酶之间的氢键断裂和抑制剂调节到利于从ns3解旋酶结构域Ⅰ和Ⅲ之间的裂缝往外逃离的构象而完全解离3步。该类抑制剂的吲哚环与活性口袋之间有很好的几何匹配,3位的乙羧基能够与氨基酸残基g255和t269形成很强的氢键作用,使其构成了吲哚环类抑制剂的基本骨架。吲哚环1位引入疏水基团能够插入到活性口袋的疏水空腔而阻碍抑制剂的解离;吲哚环6位引入体积庞大的基团能够增加抑制剂逃离所要克服的空间位阻。论文第四部分研究了ns3/4a突变对bms-650032的耐药机制。分子动力学模拟和结合自由能计算的结果显示非极性相互作用能在bms-650032与ns3/4a结合过程中起到关键作用。根据残基能量分解结果定义了bms-650032与ns3/4a相互作用的11个关键的氨基酸残基。metadynamics模拟bms-650032逃离ns3/4a的活性口袋表明bms-650032的p2’和p4部分先离开疏水平面,接着p1和p1’部分逃离活性口袋,最后bms-650032整体从活性口袋中解离出来。a156t、r155k和d168a突变导致bms-650032与ns3/4a的结合亲和力下降以及BMS-650032更加容易从活性口袋中解离。其中A156T突变,扰乱了NS3/4A的疏水口袋,使BMS-650032与NS3/4A的结合能力降低。而R155K和D168A突变通过破坏R123-D168-R155-D81之间的盐桥来削弱NS3/4A与BMS-650032之间的结合能力。(本文来源于《兰州大学》期刊2016-04-01）
模拟靶标论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
通过对当前陆军地面作战的主要对手——T90坦克进行分析,针对各类反坦克导弹、坦克炮、炮射导弹、制导兵器等性能试验要求、作战试验要求和部队实战化训练需求,提出了一种能够模拟外军主动防御系统的靶标,旨在为相关设备建设和试验开展提供思路。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
模拟靶标论文参考文献
[1].邓伟,苏建军.水下靶标基于鱼雷攻击方位模拟潜艇多亮点仿真[C].中国声学学会水声学分会2019年学术会议论文集.2019
[2].郭彪,孔小林,张林锐,郭芝宏,张旭光.一种模拟外军主动防护系统的靶标[J].兵器装备工程学报.2019
[3].郑国勋.新型抗抑郁药物与靶标相互作用的分子模拟研究[D].重庆大学.2018
[4].唐刘建,温垚珂,徐诚,宋焦.手枪弹侵彻软防护人体胸部靶标的数值模拟[J].兵器装备工程学报.2018
[5].李宁.模拟复杂地形的变量喷雾靶标特征激光检测研究[D].江苏大学.2017
[6].刘慧,李宁,沈跃,徐慧.模拟复杂地形的喷雾靶标激光检测与叁维重构[J].农业工程学报.2016
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