本文主要研究内容
作者胡宏涛,龚逸文(2019)在《植入(l,d)模体发现若干算法的实现与比较》一文中研究指出:模体发现是生物信息学的核心问题之一,对于研究基因表达的调控机制有着极为重要的生物意义。植入(l,d)模体发现(Planted (l,d) motif search,PMS)是模体发现领域中一个广为接受的问题模型。本文主要研究了4个基础的算法解决模体发现问题,这些算法可以帮助人们理解模体发现问题。4个精确算法主要包括:(1)实现基于候选模体实例字符串深度优先搜索+剪枝思想解决的位点比对的PMS问题。(2)实现基于候选模体字符深度优先搜索+剪枝思想解决的位点比对的PM S问题。(3)实现基于候选模体字符广度优先搜索+剪枝思想解决的位点比对的PM S问题。(4)实现PM SP算法。
Abstract
mo ti fa xian shi sheng wu xin xi xue de he xin wen ti zhi yi ,dui yu yan jiu ji yin biao da de diao kong ji zhi you zhao ji wei chong yao de sheng wu yi yi 。zhi ru (l,d)mo ti fa xian (Planted (l,d) motif search,PMS)shi mo ti fa xian ling yu zhong yi ge an wei jie shou de wen ti mo xing 。ben wen zhu yao yan jiu le 4ge ji chu de suan fa jie jue mo ti fa xian wen ti ,zhe xie suan fa ke yi bang zhu ren men li jie mo ti fa xian wen ti 。4ge jing que suan fa zhu yao bao gua :(1)shi xian ji yu hou shua mo ti shi li zi fu chuan shen du you xian sou suo +jian zhi sai xiang jie jue de wei dian bi dui de PMSwen ti 。(2)shi xian ji yu hou shua mo ti zi fu shen du you xian sou suo +jian zhi sai xiang jie jue de wei dian bi dui de PM Swen ti 。(3)shi xian ji yu hou shua mo ti zi fu an du you xian sou suo +jian zhi sai xiang jie jue de wei dian bi dui de PM Swen ti 。(4)shi xian PM SPsuan fa 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自智能计算机与应用的胡宏涛,龚逸文,发表于刊物智能计算机与应用2019年01期论文,是一篇关于模体发现论文,生物信息学论文,算法论文,智能计算机与应用2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自智能计算机与应用2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。
标签:模体发现论文; 生物信息学论文; 算法论文; 智能计算机与应用2019年01期论文;