导读:本文包含了种群分化基因序列论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:温室白粉虱,mtDNA,COI,地理种群
种群分化基因序列论文文献综述
陈吉强,张毅波,张桂芬,刘怀,万方浩[1]（2018）在《基于线粒体COI基因序列的温室白粉虱在中国不同地理种群的遗传分化研究》一文中研究指出温室白粉虱Trialeurodes vaporariorum(Westwood 1856)是全球范围内重要的农林害虫,其寄主植物繁多,对农业造成巨大损失。为了探明温室白粉虱在我国的不同地理位置遗传分化及基因交流情况,于2016年到2017年对全国范围内不同地区的温室白粉虱进行了系统调查。对采集到的温室白粉虱的mtDNA COI基因序列进行测序和分析,利用DnaSP 6.0和Arlequin3.5.2.2软件对该粉虱种群间的遗传多样性、遗传分化程度、基因流水平及分子变异进行了分析,并构建了单倍型系统发育树及网络图。结果表明,在我国18个省(市、自治区)有温室白粉虱分布。在测序得到的1043条有效序列(752)种中,检测到10个变异位点数和10种单倍型,其中1种单倍型为72个地理种群所共享。总群体的单倍型多样性指数为0.047,各地理种群单倍型多样度范围在0-0.600之间。总群体的Tajima's D检验结果不显着,符合中性突变,说明该种害虫在历史上没有出现群体扩张,群体大小稳定。固定系数Fst变化范围是-1-1,基因流Nm的变化范围为0-inf。分子变异分析(AMOVA)结果表明,粉虱遗传变异主要来自种群内部,而种群间未发生明显的遗传分化。根据各地理种群的单倍型建立的系统发育树、单倍型网络图表明,各单倍型散布在不同的地理种群中,无明显的地理分布格局。研究结果揭示,温室白粉虱各种群间的基因交流并未受到地理距离的影响。(本文来源于《第五届全国入侵生物学大会——入侵生物与生态安全会议摘要》期刊2018-08-03）
张敏莹,徐东坡,方弟安,周彦锋,刘凯[2]（2018）在《秀丽白虾3个地理种群mtDNA 16S rRNA基因序列变异及遗传分化》一文中研究指出为探究秀丽白虾Exopalaemon modestus不同地理种群的遗传变异,采用PCR产物纯化测序的方法,分别测定了太湖、鄱阳湖和兴凯湖3个种群共计129个秀丽白虾样品的mtDNA 16S rRNA基因序列。结果表明:在486 bp序列中,检测到10个变异位点,占所测序列的2.06%;共发现8种单倍型,其中太湖种群5种,鄱阳湖种群4种,兴凯湖种群1种;单倍型Ⅰ为太湖和鄱阳湖种群共有,单倍型Ⅳ为鄱阳湖和兴凯湖种群共有,3个种群未有共享单倍型;平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.691 00和0.002 46,遗传多样性较低;AMOVA分析显示,3个种群间的遗传变异为29.58%,种群内的遗传变异为70.42%,遗传分化系数(Gst)为0.295 8,基因流(Nm)为0.595 2,3个种群间遗传分化存在极显着性差异(P<0.01)。本研究结果可为秀利白虾种质资源保护提供基础数据。(本文来源于《大连海洋大学学报》期刊2018年03期）
李小兵,唐琼英,俞丹,刘焕章[3]（2018）在《基于线粒体细胞色素b基因序列探讨长江流域斑点蛇种群遗传结构和地理分化》一文中研究指出通过分析303尾来自长江上游赤水河、长江上游干流和长江中游的斑点蛇Saurogobio punctatus线粒体细胞色素b(Cyt b)基因序列,探讨这3个种群的遗传结构及地理分化过程。用于分析的Cyt b基因序列长1 097 bp,含变异位点80个,其中简约信息位点34个。303尾个体共检测到49个单倍型,整体呈现较高的单倍型多样性(H_d=0.803)和较低的核苷酸多样性(P_i=0.003 71)。由单倍型构建的系统发育树显示:所有来自长江中游种群的单倍型聚在一起,形成一个单系群,处于系统发育树最进化的位置;来自长江上游干流和赤水河种群的单倍型处于更基部的位置,不能构成单系群。长江上游干流种群与赤水河种群间具有较多的共享单倍型,二者间的遗传分化指数较低(F_(ST)=0.029 4),存在广泛的基因交流。而长江中游与长江上游干流及赤水河种群间的FST值分别为0.614 0和0.706 0,暗示长江上游与长江中游的斑点蛇间已发生高度分化。中性检验及错配分析显示,长江上游干流种群及赤水河种群经历过种群扩张,而长江中游种群未检测到扩张。Bayesian skyline plot(BSP)分析显示,斑点蛇种群从距今20万年前开始发生扩张,一直持续到末次间冰期(MIS5)晚期,而后迅速扩张。根据BSP分析及单倍型网络图,推测斑点蛇的起源中心可能在长江上游,然后通过种群扩张逐渐扩散到长江中游,进化成遗传分化较大的种群。(本文来源于《四川动物》期刊2018年03期）
史树森,崔娟,朱诗禹,徐伟,王小奇[4]（2018）在《基于线粒体COI基因序列的大豆食心虫不同地理种群遗传分化》一文中研究指出为揭示大豆食心虫Leguminivora glycinivorella不同地理种群间的遗传分化情况,通过测定19个地理种群214头老熟幼虫的线粒体COI基因序列,利用MEGA 6.0和Dna SP 5.0软件对不同地理种群间序列变异和遗传分化进行分析。结果表明,在214条408 bp的COI基因序列中发现46个变异位点,获得49种单倍型。总群体单倍型多样度为0.8277,固定系数为0.59,基因流为0.17。总群体Tajima’s D检验结果不显着,说明在较近时间内大豆食心虫未经历群体扩张。大豆食心虫不同地理种群间基因交流较少,贵阳种群、都安种群与其它地理种群分化明显,整体的遗传多样性和遗传分化程度较高,地理距离是影响不同地理种群间遗传距离的重要因素。(本文来源于《植物保护学报》期刊2018年02期）
张鹏飞,周晓榕,庞保平,谭瑶,田帅[5]（2017）在《基于线粒体COI基因序列的内蒙古沙葱萤叶甲种群遗传多样性及遗传分化》一文中研究指出沙葱萤叶甲Galeruca daurica(Joannis)是一种近年来在内蒙古草原上猖獗发生为害的新害虫,为明确内蒙古沙葱萤叶甲不同地理种群间的遗传多样性及遗传分化,本研究测定了内蒙古8个地理种群的197头沙葱萤叶甲的线粒体COI基因417 bp序列,利用Dna SP 5.0、Arlequin 3.11和Network 4.6.1.0等软件对沙葱萤叶甲种群间的遗传多样性、遗传分化、分子变异等进行分析。在所分析的197个COI序列中,共有43个变异位点和62个单倍型,其中2个单倍型为各种群共享,每个种群具有3个及以上的独享单倍型。总种群的单倍型多态度指数Hd为0.9466,不同地理种群单倍型多态度Hd在0.8889-0.9600。总群体固定系数Fst为0.0315,基因流Nm为15.37。中性检验结果不显着(Tajima's D=-1.6300,0.10>P>0.05),说明内蒙古沙葱萤叶甲在较近的历史时期内没有出现种群扩张现象。分子变异分析(AMOVA)结果表明,沙葱萤叶甲的遗传分化主要来自种群内部(96.34%),而种群间未发生明显的遗传分化。各种群间遗传分化程度与地理距离无显着相关性。不同地理种群的单倍型在中介网络图上散布在不同的分布群中,未形成明显的地理分布格局。结果表明沙葱萤叶甲不同地理种群遗传多样性高,基因交流程度高,遗传分化不明显且与地理距离无显着相关性。(本文来源于《环境昆虫学报》期刊2017年02期）
赵琳,张敏莹,徐东坡,周彦锋,方弟安[6]（2016）在《2个地理种群大银鱼COⅠ基因序列变异与遗传分化》一文中研究指出为探究大银鱼Protosalanx hyalocranius不同地理种群的遗传变异情况,采用PCR产物纯化测序方法,测定了太湖、洪泽湖两个种群共96尾大银鱼线粒体细胞色素C氧化酶Ⅰ亚基(cytochrome oxidaseⅠ,COⅠ)基因的部分序列。结果表明:在638 bp序列中共检测到6个变异位点,占核苷酸总数的0.94%;A、G、T、C平均含量依次为26.2%、34.0%、21.3%和18.5%,A+T含量(47.5%)低于G+C含量(52.5%);共发现7种单倍型,其中hap1、hap5和hap7为共享单倍型,hap6为洪泽湖种群特有,hap2、hap3和hap4为太湖种群特有,在7种单倍型中,hap1为明显的优势单倍体型,共54个个体(占总个体数的56.25%);平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.642和0.001 48,遗传多样性较低;AMOVA分析显示,种群内遗传变异为79.82%,种群间变异为20.18%,两种群间遗传分化系数(Fst)为0.201 79,表明两种群间遗传分化程度较高。本研究结果可为合理开发和利用大银鱼野生资源提供参考。(本文来源于《大连海洋大学学报》期刊2016年03期）
陈世春,王晓庆,彭萍,胡翔,段小凤[7]（2015）在《基于16S rRNA基因序列的11个假眼小绿叶蝉地理种群遗传分化研究》一文中研究指出假眼小绿叶蝉Empoasca vitis(Gthe)是我国危害最为严重的茶园害虫。本研究对假眼小绿叶蝉11个地理种群的101个个体的16S rRNA序列片段进行了扩增和测序,以此分析11个地理种群间的遗传多样性、分子变异和种群遗传结构。结果表明:假眼小绿叶蝉16S rRNA基因序列片段全长493 bp,A+T含量为77%。101个个体中共检测出变异位点11个,形成单倍型13个,单倍型进化网络关系显示四川群体具有的单倍型与原始单倍型(H2)距离较远。群体单倍型多样性指数为0.68812,种群内部单倍型多样性在0~0.80556之间,且总群体和各地理种群的中性检验结果均为不显着,表示假眼小绿叶蝉进化符合中性模型,其种群较为稳定。AMOVA分子变异分析结果表明假眼小绿叶蝉的遗传分化主要源于种群内部。(本文来源于《西南农业学报》期刊2015年02期）
张爽,苏筱雨,黄大庄,马向超[8]（2015）在《不同地理种群桑天牛的线粒体COⅠ基因序列变异与遗传分化》一文中研究指出采用PCR技术扩增6个地理种群桑天牛的线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ(mt DNA COⅠ)基因序列,基于mt DNA COⅠ基因序列变异探讨不同地理分布桑天牛种群间的遗传距离、系统发育以及遗传分化程度。对6个地理种群的33个桑天牛样本的mt DNA COⅠ基因扩增产物的测序结果表明共有19个位点发生变异,占序列总长的4.0%,其中来自河南省济源的桑天牛有12个变异位点,来自浙江省的桑天牛有9个变异位点,来自河北省4个地区的桑天牛的变异位点较少;河北省的4个地理种群的遗传距离较小,在0.001 3~0.002 6之间,河北、河南、浙江种群间的遗传距离较大,其中河南种群与河北种群的遗传距离又远远大于浙江种群与河北种群的遗传距离,后2大地理种群分布区域的海拔更接近。利用MEGA4.1软件构建的NJ系统进化树显示,6个地理种群形成河北、河南和浙江3大地理分布格局;从遗传分化程度上来看,桑天牛种群的3大地理分布格局不存在共享的单元型,遗传分化系数(FST)在0.804 1~0.892 2范围内,遗传分化程度较高。综合分析认为,不同地理种群桑天牛存在分化的原因除地理分布外,更重要的是生态条件的差异。(本文来源于《蚕业科学》期刊2015年02期）
周宁宁,王梦馨,崔林,潘铖,张新亭[9]（2014）在《基于COI基因全长序列的假眼小绿叶蝉地理种群遗传分化研究》一文中研究指出假眼小绿叶蝉Empoasca vitis(Gthe)是我国大陆茶区分布最广、为害最重的茶树害虫,其种群世代重迭严重,数量大。从我国13个主要产茶省份各选出一个重点产茶县(市),采集假眼小绿叶蝉标本,首次扩增得到其线粒体CO I基因全长序列,并以此探讨了假眼小绿叶蝉13个地理种群间的遗传多样性、分子变异、遗传分化程度及基因流水平。在13个地理种群中共得到了176条CO I基因序列,发现了113个变异位点,形成了105个CO I单倍型。总群体单倍型多样性Hd为0.9720,种群内单倍型多样性在0.804—1.000范围内,总群体和各种群的Tajima's D检验结果均不显着,说明茶园假眼小绿叶蝉的进化符合中性模型,种群数量较为稳定。AMOVA分子变异分析结果表明,茶园假眼小绿叶蝉的遗传分化主要来自于种群内部。Mantel检验显示各地理种群的遗传距离与地理距离之间不具有显着的相关性。总群体的遗传分化系数Gst为0.03652,固定系数Fst为0.10876,基因流Nm为4.097,表明地理种群间存在较频繁的基因交流,遗传差异较小。推测,20世纪90年代以来的省际之间频繁的茶树鲜叶贩运、异地茶苗的大批量调拨等因素促进了假眼小绿叶蝉的长距离迁移,加强了不同种群间的基因交流。(本文来源于《生态学报》期刊2014年23期）
钱晨[10]（2014）在《基于核基因内含子序列变异探讨震旦鸦雀（Paradoxornis heudei）种群遗传分化》一文中研究指出震旦鸦雀(Paradoxornis heudei)隶属于雀形目(Passeriformes)鸦雀科(Paradoxomithidae)鸦雀属(Paradoxornis),主要分布在我国东北地区、中东部、内蒙古东北部和西伯利亚东南部,是东亚地区的特有种,且被世界保护联盟(IUCN)在红色名录中列为全球近危种。本研究以长江下游平原湿地、华北平原湿地、东北平原湿地及叁江平原湿地震旦鸦雀的13个地理种群306个个体为研究对象,基于8个核基因内含子的位点变异,探讨了各地方种群遗传多样性与遗传结构,分析了冰期气候变化对震旦鸦雀种群动态的影响。主要结果如下:1.8个核基因内含子序列长度分别为15743(628bp)、ACLY-16(859bp)、GADPH(341bp)、ODC(735bp)、RPL30-3(1122bp)、TGFβ2(592bp)、VLDLR-7(607bp)、βACT-3(457bp),合并序列后全长(All-8)为5341bp;变异位点分别为4(15743)、3(ACLY-16)、7(GADPH)、6(ODC)、10(RPL30-3)、1(TGFβ2)、2(VLDLR-7)、4(βACT-3)、37(All-8)个;分别定义了6(15743)、5(ACLY-16)、11(GADPH)、13(ODC)、16(RPL30-3)、2(TGFβ2)、3(VLDLR-7)、7(βACT-3)、352(All-8)个单元型。2.震旦鸦雀核基因内含子变异较小,其遗传多样性较低。不同的核基因内含子变异在不同的地方种群表现并不相同,北方种群的单元型及核苷酸较低。种群的遗传分化分析表明,多数种群间具有显着的遗传分化。3.基于遗传距离构建的地理种群之间的系统发生树表明,位于黄河下游的东营、封丘及衡水种群在历史上较早演化形成,而东北地区的齐齐哈尔、福利屯、盘锦种群则较晚。核基因内含子序列变异揭示震旦鸦雀种群具有微弱的系统地理结构。4.BEAST分析表明,震旦鸦雀的有效种群大小在距今约32,500年前有较快的增长,而在距今11,000年以后有效种群大小基本不变。在末次冰期的冰盛期,震旦鸦雀种群处于增长状态,可能并不存在冰期避难所。冰期的气候变化本身并未对震旦鸦雀的种群动态产生较大的影响,而海侵与海退则是影响震旦鸦雀的种群动态的主要因素。(本文来源于《南京师范大学》期刊2014-05-15）
种群分化基因序列论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为探究秀丽白虾Exopalaemon modestus不同地理种群的遗传变异,采用PCR产物纯化测序的方法,分别测定了太湖、鄱阳湖和兴凯湖3个种群共计129个秀丽白虾样品的mtDNA 16S rRNA基因序列。结果表明:在486 bp序列中,检测到10个变异位点,占所测序列的2.06%;共发现8种单倍型,其中太湖种群5种,鄱阳湖种群4种,兴凯湖种群1种;单倍型Ⅰ为太湖和鄱阳湖种群共有,单倍型Ⅳ为鄱阳湖和兴凯湖种群共有,3个种群未有共享单倍型;平均单倍型多样性(Hd)和核苷酸多样性(Pi)分别为0.691 00和0.002 46,遗传多样性较低;AMOVA分析显示,3个种群间的遗传变异为29.58%,种群内的遗传变异为70.42%,遗传分化系数(Gst)为0.295 8,基因流(Nm)为0.595 2,3个种群间遗传分化存在极显着性差异(P<0.01)。本研究结果可为秀利白虾种质资源保护提供基础数据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
种群分化基因序列论文参考文献
[1].陈吉强,张毅波,张桂芬,刘怀,万方浩.基于线粒体COI基因序列的温室白粉虱在中国不同地理种群的遗传分化研究[C].第五届全国入侵生物学大会——入侵生物与生态安全会议摘要.2018
[2].张敏莹,徐东坡,方弟安,周彦锋,刘凯.秀丽白虾3个地理种群mtDNA16SrRNA基因序列变异及遗传分化[J].大连海洋大学学报.2018
[3].李小兵,唐琼英,俞丹,刘焕章.基于线粒体细胞色素b基因序列探讨长江流域斑点蛇种群遗传结构和地理分化[J].四川动物.2018
[4].史树森,崔娟,朱诗禹,徐伟,王小奇.基于线粒体COI基因序列的大豆食心虫不同地理种群遗传分化[J].植物保护学报.2018
[5].张鹏飞,周晓榕,庞保平,谭瑶,田帅.基于线粒体COI基因序列的内蒙古沙葱萤叶甲种群遗传多样性及遗传分化[J].环境昆虫学报.2017
[6].赵琳,张敏莹,徐东坡,周彦锋,方弟安.2个地理种群大银鱼COⅠ基因序列变异与遗传分化[J].大连海洋大学学报.2016
[7].陈世春,王晓庆,彭萍,胡翔,段小凤.基于16SrRNA基因序列的11个假眼小绿叶蝉地理种群遗传分化研究[J].西南农业学报.2015
[8].张爽,苏筱雨,黄大庄,马向超.不同地理种群桑天牛的线粒体COⅠ基因序列变异与遗传分化[J].蚕业科学.2015
[9].周宁宁,王梦馨,崔林,潘铖,张新亭.基于COI基因全长序列的假眼小绿叶蝉地理种群遗传分化研究[J].生态学报.2014
[10].钱晨.基于核基因内含子序列变异探讨震旦鸦雀（Paradoxornisheudei）种群遗传分化[D].南京师范大学.2014