史艳梅:瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异分析论文

史艳梅:瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异分析论文

本文主要研究内容

作者史艳梅,黄笑含,杨铁柱,许国绿,沈和定(2019)在《瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异分析》一文中研究指出:从蛋白质水平探讨瘤背石磺和里氏拟石磺背部皮肤蛋白质组差异表达,为完善石磺科贝类从海洋到陆地进化的研究以及解释两种石磺不同的环境适应性提供蛋白质依据。应用Label-free非标定量蛋白质组学技术,结合软件Sequest HT和Proteome Discoverer (Thermo),对瘤背石磺和里氏拟石磺的背部皮肤进行蛋白质组搜库鉴定及定量分析,其中瘤背石磺中鉴定到1 491个蛋白质,里氏拟石磺中鉴定到1 030个蛋白质;用Pfind软件对表达图谱进行同源序列的鉴定及定量分析,检测到928个同源蛋白表达量有差异,瘤背石磺较里氏拟石磺上调表达406个(p<0.05, FC>1.5),下调表达339个(p<0.05, FC<0.5)。适应水下生活的里氏拟石磺背部皮肤角质化程度较低,差异同源蛋白序列分析显示与角质形成、细胞凋亡相关蛋白在里氏拟石磺背部皮肤中高表达,与皮肤保湿性能相关的神经酰胺类物质在瘤背石磺中高表达;KEGG分析显示,嘌呤代谢通路中存在的差异蛋白最多,共73个,其中瘤背石磺较里氏拟石磺上调表达22个,下调表达21个。蛋白组差异分析显示关键酶尿素酶在陆栖性较强的瘤背石磺中高表达,与前人所做动物从水生到陆生进化过程中尿素酶基因完全丢失的研究结论有所出入,属于特殊物种。里氏拟石磺的皮肤辅助呼吸能力和血窦数目均高于瘤背石磺,且背部皮肤中肌纤维更加粗壮,此生理现象在蛋白质组上的表现为两种石磺能量代谢及氧离子运输相关蛋白的差别较大;瘤背石磺背部皮肤中对环境污染反应灵敏的谷胱甘肽S转移酶和谷胱甘肽过氧化物酶的表达量高于里氏拟石磺,推测其与瘤背石磺较强的皮肤免疫能力和环境适应性相关。蛋白表达谱中928个差异表达同源序列为两种石磺表现差异和环境适应的分子机制研究提供了有意义的蛋白质组的基础数据。

Abstract

cong dan bai zhi shui ping tan tao liu bei dan huang he li shi ni dan huang bei bu pi fu dan bai zhi zu cha yi biao da ,wei wan shan dan huang ke bei lei cong hai xiang dao liu de jin hua de yan jiu yi ji jie shi liang chong dan huang bu tong de huan jing kuo ying xing di gong dan bai zhi yi ju 。ying yong Label-freefei biao ding liang dan bai zhi zu xue ji shu ,jie ge ruan jian Sequest HThe Proteome Discoverer (Thermo),dui liu bei dan huang he li shi ni dan huang de bei bu pi fu jin hang dan bai zhi zu sou ku jian ding ji ding liang fen xi ,ji zhong liu bei dan huang zhong jian ding dao 1 491ge dan bai zhi ,li shi ni dan huang zhong jian ding dao 1 030ge dan bai zhi ;yong Pfindruan jian dui biao da tu pu jin hang tong yuan xu lie de jian ding ji ding liang fen xi ,jian ce dao 928ge tong yuan dan bai biao da liang you cha yi ,liu bei dan huang jiao li shi ni dan huang shang diao biao da 406ge (p<0.05, FC>1.5),xia diao biao da 339ge (p<0.05, FC<0.5)。kuo ying shui xia sheng huo de li shi ni dan huang bei bu pi fu jiao zhi hua cheng du jiao di ,cha yi tong yuan dan bai xu lie fen xi xian shi yu jiao zhi xing cheng 、xi bao diao wang xiang guan dan bai zai li shi ni dan huang bei bu pi fu zhong gao biao da ,yu pi fu bao shi xing neng xiang guan de shen jing xian an lei wu zhi zai liu bei dan huang zhong gao biao da ;KEGGfen xi xian shi ,piao ling dai xie tong lu zhong cun zai de cha yi dan bai zui duo ,gong 73ge ,ji zhong liu bei dan huang jiao li shi ni dan huang shang diao biao da 22ge ,xia diao biao da 21ge 。dan bai zu cha yi fen xi xian shi guan jian mei niao su mei zai liu qi xing jiao jiang de liu bei dan huang zhong gao biao da ,yu qian ren suo zuo dong wu cong shui sheng dao liu sheng jin hua guo cheng zhong niao su mei ji yin wan quan diu shi de yan jiu jie lun you suo chu ru ,shu yu te shu wu chong 。li shi ni dan huang de pi fu fu zhu hu xi neng li he xie dou shu mu jun gao yu liu bei dan huang ,ju bei bu pi fu zhong ji qian wei geng jia cu zhuang ,ci sheng li xian xiang zai dan bai zhi zu shang de biao xian wei liang chong dan huang neng liang dai xie ji yang li zi yun shu xiang guan dan bai de cha bie jiao da ;liu bei dan huang bei bu pi fu zhong dui huan jing wu ran fan ying ling min de gu guang gan tai Szhuai yi mei he gu guang gan tai guo yang hua wu mei de biao da liang gao yu li shi ni dan huang ,tui ce ji yu liu bei dan huang jiao jiang de pi fu mian yi neng li he huan jing kuo ying xing xiang guan 。dan bai biao da pu zhong 928ge cha yi biao da tong yuan xu lie wei liang chong dan huang biao xian cha yi he huan jing kuo ying de fen zi ji zhi yan jiu di gong le you yi yi de dan bai zhi zu de ji chu shu ju 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自基因组学与应用生物学的史艳梅,黄笑含,杨铁柱,许国绿,沈和定,发表于刊物基因组学与应用生物学2019年04期论文,是一篇关于瘤背石磺论文,里氏拟石磺论文,蛋白质组论文,两栖性适应论文,基因组学与应用生物学2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自基因组学与应用生物学2019年04期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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