导读:本文包含了剖面隐马氏模型论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:多序列比对,剖面隐马尔可夫模型,量子粒子群优化算法
剖面隐马氏模型论文文献综述
李成渊,龙海侠,孙俊,须文波[1]（2010）在《基于剖面隐马氏模型的多序列比对》一文中研究指出多序列比对被称为NP完全问题,是生物信息中最基本的问题之一。目前,广泛使用剖面隐马尔可夫模型解决多序列比对问题。作者在粒子群优化算法的基础上,提出了将量子粒子群优化算法用于剖面隐马尔可夫模型的训练过程,进而构建了一种基于剖面隐马氏模型和量子粒子群优化算法的多序列比对算法。从核酸序列和BaliBASE比对数据库中选取了一些比对例子进行了模拟实验,并与其他算法进行了比较,结果表明,所提出的算法能在有限的时间内不仅能找到理想的隐隐马尔可夫模型,而且能得到最优的比对结果。(本文来源于《食品与生物技术学报》期刊2010年04期）
王斌宾,史定华[2]（2006）在《剖面隐马氏模型训练算法的改进》一文中研究指出利用剖面隐马氏模型获得多序列联配,一般需要经过初始化、训练、联配叁个过程．然而,目前广泛采用的Baum-Welch训练算法假设各条可观察序列互相独立,这与实际情况有所不符．本文对剖面隐马氏模型,给出可观察序列在互相不独立情况下的改进Baum-Welch算法,在可观察序列两种特殊情况下(互相独立和一致依赖),得到了改进算法的具体表达式,讨论了一般情况下权重的选取方法．最后通过一个具体的蛋白质家族的多序列联配来说明改进算法的效果．(本文来源于《应用数学与计算数学学报》期刊2006年01期）
剖面隐马氏模型论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
利用剖面隐马氏模型获得多序列联配,一般需要经过初始化、训练、联配叁个过程．然而,目前广泛采用的Baum-Welch训练算法假设各条可观察序列互相独立,这与实际情况有所不符．本文对剖面隐马氏模型,给出可观察序列在互相不独立情况下的改进Baum-Welch算法,在可观察序列两种特殊情况下(互相独立和一致依赖),得到了改进算法的具体表达式,讨论了一般情况下权重的选取方法．最后通过一个具体的蛋白质家族的多序列联配来说明改进算法的效果．
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
剖面隐马氏模型论文参考文献
[1].李成渊,龙海侠,孙俊,须文波.基于剖面隐马氏模型的多序列比对[J].食品与生物技术学报.2010
[2].王斌宾,史定华.剖面隐马氏模型训练算法的改进[J].应用数学与计算数学学报.2006