导读:本文包含了内含子外显子的预测论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:可变剪接,二次判别方法,支持向量机
内含子外显子的预测论文文献综述
邢永强,张利绒,罗辽复,陈伟[1]（2009）在《老鼠基因组盒式外显子和内含子保留型可变剪接位点预测》一文中研究指出老鼠和人类基因组的同源性超过90%,老鼠基因组的研究为人类基因组序列研究提供了参考数据.统计分析了老鼠盒式外显子和内含子保留型剪接位点附近的序列保守性特征,并据此分别利用基于多样性指标的支持向量机和二次判别法对老鼠基因组中这两种剪接类型的供体端和受体端可变剪接位点进行了预测.独立检验结果表明,盒式外显子和内含子保留型的供体端和受体端可变剪接位点的预测均能达到较高的识别精度.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2009年05期）
邢永强,张利绒,罗辽复[2]（2008）在《人类基因组盒式外显子和内含子保留的可变剪接位点预测》一文中研究指出信使RNA的可变剪接是真核生物有别于原核生物的基本特征之一,信使RNA前体的可变剪接极大地丰富了高等真核生物蛋白质的多样性,并与生物体的组织特异性密切相关。文章对人类盒式外显子和内含子保留的一些基本特征进行了统计;根据剪接位点附近的单碱基、碱基二联体和叁联体的保守性等特征,利用基于多样性指标的二次判别法,对盒式外显子和内含子保留的供体端和受体端可变剪接位点进行了预测。交叉检验结果表明,盒式外显子供体端和受体端的识别精度分别达到93%、84%以上的水平;内含子保留供体端和受体端的识别精度分别达到89%、81%以上的水平。(本文来源于《生物物理学报》期刊2008年05期）
张永生[3]（2007）在《基于支持向量机的外显子与内含子识别及回归预测研究》一文中研究指出支持向量机(SVM)于1995年提出，包括分类(SVC)和回归(SVR)，是目前发展最快的机器学习方法。它基于结构风险最小，较好地解决了非线性、过学习、维数灾难、局部极小点、小样本等实际问题，泛化推广能力优异。本论文通过改进SVM，对外显子与内含子识别、纵向数据多维时间序列预测和非纵向数据化合物定量构效关系进行了研究，主要内容及结果归结如下：1)创建了一种新的DNA序列特征提取方法——多尺度组分与关联法。以此为基础，采用Fisher判别和SVC对外显子与内含子进行了识别，结果测试集上外显子灵敏度(S_n)、外显子特异度(S_n)、内含子灵敏度(S_q)、相关系数(CC)分别达到0.9240、0.9893、0.9900、0.9160。新方法具算法简单、准确度高、应用范围广等特点。2)基于SVR并融合带受控项的自回归模型(CAR)，建立了一种既反映样本集动态特征又体现环境因子影响的非线性多维时间序列分析预测方法(SVR-CAR)。用一步预测法对两个纵向数据样本集的预测结果表明，SVR-CAR在所有5个参比模型中预测精度最高。SVR-CAR在生态学、农业科学、经济学等多维时间序列预测领域有较广泛的应用前景。3)为提高定量构效关系(QSAR)研究的预测精度，发展了一种新的基于SVR非线性筛选分子结构描述符、基于k-近邻群的非线性组合预测方法。以非纵向数据取代苯胺和苯酚类化合物对大型溞的QSAR实例验证表明：非线性组合预测新方法在所有10个参比模型中预测精度最高，且能更精细地反映描述符与化合物毒性间的非线性关系，具结构风险最小、非线性筛选描述符和子模型、非线性组合预测、自动选择最优核函数及其相应参数等诸多优点，在QSAR研究中有广泛应用前景。(本文来源于《湖南农业大学》期刊2007-06-13）
陈翠霞,李前忠,王小龙[4]（2004）在《用离散量预测拟南芥全基因组中内含子、外显子和基因间序列》一文中研究指出将拟南芥基因组全序列,按内含子、外显子及基因间序列区分为叁类.在统计分析的基础上,选取21种叁联体的概率,作为信号参数,并以这些参数分别构建内含子、外显子和基因间序列的离散源,计算了离散量.某区间上任意一段序列的类型是由其离散量D(X)与同一区间上的叁个标准离散量D(Xe)、D(Xi)和D(Xs)之间的离散增量的最小值决定的.由此实现了用离散量对叁种核苷酸序列类型的预测,预测结果表明:标准集准确率达到84.26%,检验集达到84.64%.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2004年04期）
鲍卫华,李前忠[5]（2004）在《预测线虫和酵母基因组中内含子、外显子及基因间序列的离散增量方法》一文中研究指出把基因组中的内含子、外显子和基因间序列分为叁类序列,从这些序列中取64种叁核苷的重复出现次数作为离散源的状态参数,计算叁类序列的标准离散量,比较待测序列的离散量与叁个标准离散量之间的离散增量值,由离散增量的最小值决定待测序列属于哪一类.本文用离散增量方法对线虫和酵母序列进行预测,结果表明,对酵母内含子预测的敏感性为81.5%,对外显子预测的敏感性为88.5%、特异性为99.6%,对基因间序列预测的敏感性为65.4%、特异性为87.5%;若以在相同长度区间的序列为标准离散源,预测相应长度区间的序列,对线虫内含子的预测的敏感性为82.2%、特异性为94.2%,对外显子预测的敏感性为91.1%、特异性为97.5%,对基因间序列预测的敏感性为78.8%.(本文来源于《内蒙古大学学报(自然科学版)》期刊2004年01期）
内含子外显子的预测论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
信使RNA的可变剪接是真核生物有别于原核生物的基本特征之一,信使RNA前体的可变剪接极大地丰富了高等真核生物蛋白质的多样性,并与生物体的组织特异性密切相关。文章对人类盒式外显子和内含子保留的一些基本特征进行了统计;根据剪接位点附近的单碱基、碱基二联体和叁联体的保守性等特征,利用基于多样性指标的二次判别法,对盒式外显子和内含子保留的供体端和受体端可变剪接位点进行了预测。交叉检验结果表明,盒式外显子供体端和受体端的识别精度分别达到93%、84%以上的水平;内含子保留供体端和受体端的识别精度分别达到89%、81%以上的水平。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
内含子外显子的预测论文参考文献
[1].邢永强,张利绒,罗辽复,陈伟.老鼠基因组盒式外显子和内含子保留型可变剪接位点预测[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2009
[2].邢永强,张利绒,罗辽复.人类基因组盒式外显子和内含子保留的可变剪接位点预测[J].生物物理学报.2008
[3].张永生.基于支持向量机的外显子与内含子识别及回归预测研究[D].湖南农业大学.2007
[4].陈翠霞,李前忠,王小龙.用离散量预测拟南芥全基因组中内含子、外显子和基因间序列[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2004
[5].鲍卫华,李前忠.预测线虫和酵母基因组中内含子、外显子及基因间序列的离散增量方法[J].内蒙古大学学报(自然科学版).2004