导读:本文包含了红花基因论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:红花,CtWD40,转录因子,基因克隆
红花基因论文文献综述
董园园,李俊锋,彭鸿远,王一非,王刚[1]（2019）在《红花CtWD40基因克隆及表达分析》一文中研究指出目的克隆红花WD40(CtWD40)转录因子,分析其在不同组织间的表达水平及与红花羟基黄色素含量的相关性。方法以红花花瓣转录组WD40候选基因为参考,克隆获得CtWD40基因序列。同时对该转录因子保守结构域、蛋白叁维结构及系统发育等内容进行生物信息学分析,荧光定量PCR方法研究了该基因在红花不同组织中基因表达差异,并采用HPLC法测定红花各花期花瓣中羟基红花黄色素A含量。结果成功克隆CtWD40基因并且发现该蛋白序列中8个保守WD结构域,通过系统发育分析发现CtWD40与菊科WD40蛋白亲缘关系最近。结论 CtWD40基因在在不同花期花瓣组织中出现先升高后降低表达趋势,皮尔森相关系数分析揭示CtWD40在花瓣中基因表达水平与羟基黄花黄色素A含量具有显着相关性。(本文来源于《中草药》期刊2019年15期）
张一菡,李卿,张磊,谭何新,陈祥慧[2]（2019）在《西红花MADS-box基因家族的生物信息学分析》一文中研究指出西红花是中国传统中药材,以花柱入药,被誉为"植物黄金"。MADS-box转录因子家族在显花植物的花器官形成和分化过程中发挥重要作用,其有极大的可能影响西红花花器官的形成进而影响花柱发育。本研究采用生物信息学方法,对来自西红花转录组数据库中的17条MADS-box转录因子的核苷酸进行解读,及对其编码的氨基酸序列的组成成分、理化性质、信号肽、导肽、跨膜结构域、亚细胞定位、亲疏水性、蛋白质的二级、叁级结构及功能域进行预测分析,并将西红花和其他植物的MADS-box蛋白进行同源比对,同时构建了西红花和模式植物拟南芥MADS-box蛋白家族的系统进化树。结果表明,西红花MADS-box基因的开放阅读框在630～750 bp左右,分子量在24～29 kD之间,理论等电点(pI)均大于7,介于8.69～9.54之间,表现为碱性疏水蛋白,既不含有信号肽也没有跨膜结构,二级结构主要原件为α-螺旋和无规则卷曲,含有一个MADS-MEF结构域和K-box结构域。氨基酸同源性比对结果表明西红花和石刁柏的MADS-box蛋白同源性较高。与拟南芥的进化树分析结果显示,西红花MADS-box蛋白可聚为两大类,分属于MIKC和Mβ亚家族。本工作可为今后进一步深入研究西红花MADS-box蛋白的生物学功能提供可靠的参考依据。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年07期）
蒋璐,束红梅,巩元勇,孙雨茜,郭书巧[3]（2019）在《西红花β-胡萝卜素羟化酶CsBCH1-z基因的分离与生物信息学分析》一文中研究指出为更好地理解西红花类胡萝卜素合成代谢途径,从西红花中分离和克隆了1个新的β-胡萝卜素羟化酶基因CsBCH1-z,并从柱头cDNA中克隆了该基因的全长编码序列为906 bp,编码301个氨基酸残基,对应的基因组序列为1261 bp,5个外显子由4个内含子子间隔开。与已知的CsBCH1基因的氨基酸序列比较,发现在N端由于6个碱基的缺失,造成了2个氨基酸的缺失和1个氨基酸由异亮氨酸突变为亮氨酸,另外还有一处单碱基的变异造成苏氨酸突变为丙氨酸。通过预测其蛋白含有3个明显的跨膜结构域,C端包含了2组"HXXXXH"和"HXXHH"结构域,是典型的脂肪酸羟化酶。β-胡萝卜素羟化酶是西红花苷合成的重要前体物质,CsBCH1-z柱头中的表达量>叶片>花瓣;雄蕊中表达很低;球茎中表达不可见。(本文来源于《中国农学通报》期刊2019年16期）
郭丹丹[4]（2019）在《红花黄酮类成分生物合成途径关键基因的特征和功能研究》一文中研究指出红花(Carthamin tictorius L.)是一种具有活血通经,散瘀止痛之功效的传统药用植物,入药部位为其干燥管状花。现代药理研究表明,它具有抗血栓、抗氧化、抗炎、抗过敏等作用,其主要的药效成分为黄酮醇类化合物(如山萘酚及其苷类,槲皮素及其苷类)以及特异性查尔酮化合物(如羟基红花黄色素A、Carthamin等)。迄今为止,模式植物中黄酮的生物合成途径已有很多的研究,普遍认为,其源于苯丙氨酸途径,通过查尔酮合成酶这一桥梁启动黄酮类成分的生物合成。但是关于红花中黄酮的生物合成途径,尤其是特有的活性查尔酮成分生物合成途径研究仍鲜有报道。基于本课题组前期构建的红花花冠转录组数据库以及Y品系(黄色花,富含HSYA)和W品系(白色花,不含HSYA)时序性差异表达图谱,我们筛选出在Y品系特异性高表达的266个差异基因,其中包含了参与红花生物合成途径的重要结构基因:查尔酮合成酶基因CHS、查尔酮异构酶基因CHI、黄酮苷末端修饰酶UGT和转录调控因子MYB等多个基因。首先,借助RACE克隆技术拼接出差异基因(CtCHS1、Ct CHI1、UGT)和转录因子(CtMyb13)全长。氨基酸序列同源性比对和系统进化树分析显示CtCHS1与其他家族的查尔酮合成酶具有87%的氨基酸相似度,CtCHI1与来自Saussurea medusa的CHI有高达92%的氨基酸相似度,后者的过表达可以显着提高水母雪莲毛状根中的芹菜素含量。为了验证基因的体外功能,我们运用异源表达技术,分离纯化出基因编码蛋白酶CtCHS1和CtCHI1,并对酶体外活性进行底物筛选和催化参数检测。体外实验结果表明CtCHS1具有典型的CHS活性,即催化3个丙二酰辅酶A和1个香豆酰辅酶A生成柚皮素,CtCHI1可以催化2,,4,,4,6,-羟基查尔酮异构化为柚皮素,从而证明CtCHS1和CtCHI1均是具有活性的催化蛋白酶。为了分析基因在植物体内的定位特征,将构建的重组瞬时表达载体pMT39-CtCHS1和pMT39-CtCHI1通过农杆菌GV3101介导侵染拟南芥原生质体和烟草进行瞬时表达,亚细胞定位分析结果显示pMT39-CtCHS1定位在细胞质,pMT39-CtCHI1定位在细胞核。构建35S启动的真核重组载体并融合GFP标签,通过花粉管通道法转化红花Y品系,实现红花植株水平的基因工程操作和新基因在蛋白水平的检测。和空载组比较,在mRNA水平上,过表达CtCHS1可以激活上游基因PAL2,PAL3,4CL2,CHS4和CHS6的表达,同时抑制4CL1,4CL3,4CL5,CHI2和DFR1的表达。在代谢水平上,CtCHS1过表达可以促使醌式查尔酮化合物HSYA和Carthamin分别上调19.83%和29.48%,黄酮醇类化合物呈现出与之完全相反的趋势,均呈现不同程度的下调,槲皮素,槲皮素-3-O-葡萄糖苷下调高达50~60%,山萘酚和芦丁也分别下降14.41%和24.89%,山萘酚-3-O-β-D葡萄糖苷下调17.06%,D-Phenylalanine下调39.51%。由此推测,CtCHS1可能参与正向调节醌式查尔酮化合物分支的含量积累,并抑制黄酮醇类分支化合物的生成。利用叶盘转化法我们获得了CtCHI1过表达烟草植株,CtCHI1过表达促进了上游基因NtC4H和Nt4CL表达。HPLC结果显示花青素苷元下降高达64.55%,槲皮素苷元在下降高达70%,山萘酚苷元则显着增加10%~20%。由此可以看出CtCHI1的过表达在烟草中对代谢产物的积累起了分流作用。在转基因红花中,CtCHI1过表达可以促进上游基因CtPAL3,CtC4H1和CtCHS1分别增长3.88,2.12和3.03倍,抑制下游基因CtF3H和CtDFR2的表达。为了评价CtCHI1过表达对转基因红花代谢组的影响,我们对转基因组和未转基因组的红花进行了PCA和PLS-DA分析,通过PCA分析,我们发现转基因组和未转基因组代谢组主成分可以得到有效分离。另外,监督PLS-DA在负离子模式下能得到很好的响应,可以分离出788差异性代谢产物。对次生代谢物进行UPLC-QTOF/MS定量分析表明,CtCHI1过表达可以显着提高HSYA和山萘酚-3-O-芸香糖苷,二氢山萘酚和芦丁的含量。在红花转录组数据库中,共有27个糖基转移酶UGT基因全长,基于时序性表达图谱分析,我们筛选出在两个品系的生长发育过程中具有显着差异的CtUGT3,CtUGT16和CtUGT25。系统进化树分析显示CtUGT3和CtUGT16归类到广泛参与植物体内代谢进程的UGT71亚家族中。Ct UGT25与PoUGT具有很高的序列相似度,隶属于UGT90亚家族,主要参与黄酮类化合物的糖基化修饰。将CtUGT3,CtUGT16和CtUGT25与已经报道的10个黄酮糖基转移酶基因进行多序列比对,结果显示这叁个UGT基因与黄酮糖基转移酶基因具有很高的同源性。由此可以预见,CtUGT3,CtUGT16和CtUGT25可能也具有参与红花体内黄酮类化合物的糖基化修饰功能。运用WOLF PSORT亚细胞定位预测,我们发现CtUGT3和CtUGT16可能主要位于细胞质,CtUGT25可能主要位于叶绿体。Signal P4.1 Server分析证实这叁个蛋白均没有信号肽。这些结果显示CtUGT3,CtUGT16和CtUGT25可能不具有蛋白转运功能,主要在细胞质和叶绿体中发挥蛋白酶催化功能。通过MeJA诱导实验,我们构建了“基因-化合物”在红花两个不同品系中时序性表达相关网络,结果表明CtUGT3和CtUGT25在Y品系红花中主要诱导山萘酚-3-O-葡萄糖苷黄酮醇的积累,在W品系中促进槲皮素-3-O-葡萄糖苷黄酮醇的生成,CtUGT16则广泛参与两个红花品系中槲皮素-3-O-葡萄糖苷的正向调控。另外,我们首次对红花MYB家族进行了系统的生物信息学分析,从转录祖数据库中共筛选出21个R2R3-MYB,利用multiple em for motif elicitation(MEME)和Simple Modular Architecture Research Tool(SMART)分析R2R3-MYB中10个motif所在位置及功能,结果显示motif 3和motif 6是保守DNA结合域,其他motif多为未知功能结构域。通过基因芯片和化合物时序性表达相关性分析发现,R2R3-MYB转录因子MYB13,MYB14与HSYA和山萘酚-3-O-葡萄糖苷的积累呈正相关关系(∣r∣≥0.7),且MYB13与MYB14序列高度相似,在进化上具有近源关系。为了研究MYB调控的分子机制,我们构建了红花花冠次级酵母文库,通过Y2H共转法筛选出了与MYB13互作的7个蛋白:CtSDGL,CtEPGL,CtPHOX1L,CtB2L,CtASC1,CtMPL1,CtMPL2。更深入的研究正在进行中。综上所述,过表达CtCHS1和CtCHI1可以正反馈调控上游基因PAL,CHS的表达,并促进红花中醌式查尔酮类化合物的积累;但抑制了下游基因表达。Ct UGT3,CtUGT16和CtUGT25广泛参与红花体内黄酮醇类化合物的糖基化修饰。R2R3-MYB转录因子MYB13可能正向调控HSYA和山萘酚-3-O-葡萄糖苷的积累。本研究结果为阐明红花黄酮类成分的生物合成途径提供了重要科学依据。(本文来源于《中国人民解放军海军军医大学》期刊2019-05-30）
贾鑫磊,何贝轩,郭丹丹,高越,郭美丽[5]（2019）在《红花花冠伸长相关基因CtXTH1的特征与功能研究》一文中研究指出本研究从红花花冠转录组数据库筛选出13个木葡聚糖内切转葡糖基/水解酶基因(XTHs)和8个膨胀素基因(EXPs)。通过花冠表达谱芯片数据和花冠长度的相关分析和qRT-PCR确认,筛选出可能与花冠伸长相关的4个XTHs和1个EXP (r≥0.60),分别为CtXTH1、CtXTH2、CtXTH3、CtXTH4和CtEXP1。采用RACE法克隆了这5个基因的全长序列,生物信息学分析发现CtXTH1可能与花冠发育有关,表达模式分析发现其在花中特异性积累。通过构建红花过表达重组载体(pMT39-CtXTH1)进行遗传转化发现, CtXTH1的过表达可以显着增加红花花冠长度(约5.34%～10.25%)和花冠重量(约30.00%～36.02%),同时,过表达植株种子重量、每果球小花数和种子数均有增大的趋势,而对花冠中的主要黄酮类成分的含量没有显着影响。对花冠显微结构观察发现,过表达植株在花冠管状部分表现出更松散和不规则的特征,提示CtXTH1可能有助于增加组织的松弛从而促进花冠伸长。本研究为高产红花品种的选育提供重要的参考价值。(本文来源于《药学学报》期刊2019年06期）
荣朵艳,张翔,潘婷,王菊凤,杨港[6]（2019）在《红花檵木LcFLS1基因的克隆及其表达与转化研究》一文中研究指出该研究以红花檵木(Loropetalum chinense var.rubrum)为材料,根据转录组测序结果和PCR方法克隆到1个黄酮醇合成酶(FLS)同源基因,命名为LcFLS1。生物信息学分析显示,LcFLS1的开放阅读框为996bp,编码331个氨基酸。氨基酸序列分析显示,LcFLS1具有典型的2-酮戊二酸和铁依赖性双加氧酶结构域;蛋白结构预测表明,球形蛋白结构的核心区域存在10个与2-酮戊二酸配体互作的位点。进化树分析结果表明,LcFLS1与茶树(Camellia sinensis)等木本植物的亲缘关系较近,而与拟南芥(Arabidopsis thaliana)等草本植物的亲缘关系较远。荧光定量PCR检测显示,LcFLS1在红花檵木的花中相对表达量最高,而在茎中最少。成功构建了LcFLS1基因的过表达载体pLcFLS1-SUPER1300,经农杆菌侵染花序法将pLcFLS1-SUPER1300质粒转入拟南芥中获得转基因植株,PCR鉴定表明获得了转LcFLS1基因拟南芥阳性植株。该研究结果为红花檵木黄酮醇的生物合成机制研究,以及药用价值的开发利用奠定了基础。(本文来源于《西北植物学报》期刊2019年03期）
[7]（2019）在《红花岗区“传承红色基因·童心向党”成效明显》一文中研究指出2018年,红花岗区认真贯彻落实习近平总书记视察遵义时提出的"传承红色基因、讲好遵义故事"重要指示精神,按照省市文明委、关工委的工作要求,由区委宣传部主办,区文明办、区教育局、区关工委等单位承办的"扣好人生第一粒扣子"主(本文来源于《晚晴》期刊2019年03期）
钱诚,王安燕[8]（2019）在《红花岗区 传承红色基因 激活红色元素》一文中研究指出新闻提示1935年,举世瞩目的遵义会议召开。84年来,红色成为遵义城市发展历程中最夺目的底色。作为遵义市中心城区的红花岗区,汇集了遵义会议会址、红军总政治部旧址、李德和博古旧居、苏维埃银行、红军烈士陵园等革命遗址,处处可见红色元素。$(本文来源于《贵州日报》期刊2019-01-24）
王法微,董园园,王晓杰,刘秀明,杜琳娜[9]（2018）在《红花全基因组测序及黄酮类等代谢调控关键基因的挖掘》一文中研究指出红花为被子植物门,双子叶植物纲,菊科。本课题组对红花(吉红1号)基因组做de novo拼接,采用Illunima二代叁代技术结合测序(200×),Kmer评估红花基因组大小1.35Gb,组装基因组大小1.04Gb,GC含量36.2%,基因组覆盖度77.03%,Contig N50长度为40.26Kb,Scaffold N50长度为980.42kb,以上结果显示基因组组装质量较高。对红花基因组进行注释发现,在组装的1.04Gb的区域中有579Mb为重复区域,说明真核生物基因组中,红花的重复序列占有较高的比例。同时预测到了29692个编码蛋白基因,另外还预测了2485个rRNA,1370个tRNA,1062个SnRNA以及157个miRNA。为了评估红花基因组进化地位,通过分析拟南芥、猕猴桃、辣椒、马铃薯、芝麻及葡萄的基因组,了解他们的系统进化,进一步揭示了红花的基因组进化关系,表明红花基因组在进化中的复杂性,它的基因组分化事件可以追溯到6 000万年以前。红花是一个药油兼用的药用植物,红花的发育过程涉及黄酮类代谢,脂肪酸,多糖等生物合成。课题组通过对红花发育中4个关键时期的花和3个时期的籽粒进行了RNA-seq分析,分别在花瓣和籽粒中利用Kmens聚类30个表达趋势近似的基因亚群,通过GO分析提示这些基因在红花发育中参与单糖、黄酮、不饱和脂肪酸的合成代谢。而黄酮含量是评估红花重要价值的重要因素,在注释的红花基因组上有221个有关黄酮合成的酶,104个不饱和脂肪酸合成酶,63个糖基转移酶。另有42个黄酮代谢酶基因在红花花瓣发育中表达异常,说明这些基因在红花黄酮累积的过程中占有重要地位。(本文来源于《中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会综述与摘要集》期刊2018-11-19）
卿卓,苏睿,赵文正,李林庶,任晓晓[10]（2018）在《腾冲红花油茶1,6-二磷酸果糖醛缩酶基因克隆及组织表达分析》一文中研究指出果糖-1,6-二磷酸醛缩酶(FBP2)不仅是植物糖酵解途径中核心调节酶之一,而且还能为油脂合成过程提供2种关键底物,对油料作物起着至关重要的作用。本研究以腾冲红花油茶为试材,根据已知普通油茶FBP2基因序列设计特异性引物,采用SMART RACE方法克隆出腾冲红花油茶1,6-二磷酸果糖醛缩酶全长cDNA,命名为CRFBPase (GenBank accession No. MG764086)。序列分析表明,该cDNA全长1 077 bp,编码358个氨基酸,分子质量为38 428.13 Da,等电点为7.56。根据cDNA序列推导出该蛋白氨基酸,利用DNAMAN与其他植物中的同源FBP2基因进行序列比对,发现腾冲红花油茶CRFBPase与普通油茶(JX914588.1)和拟南芥(BT000106.1) FBP2氨基酸的相似性分别为99.4%和66.9%。系统进化分析显示,腾冲红花油茶CRFBPase与普通油茶(JX914588.1)、马铃薯(DQ235169.1)、轮叶党参(AB243014.1) FBP2位于同一分支。组织表达分析结果显示,CRFBPase基因在腾冲红花油茶子房和种仁中均有一定量的表达且种仁中表达量最高。腾冲红花油茶和普通油茶种仁CRFBPase基因表达量与含油量的比较分析表明两者存在正相关关系。结果表明CRFBPase基因在腾冲红花油茶种仁发育调控过程大量诱导表达,且对其油脂代谢过程起着重要作用,为揭示腾冲红花油茶种仁中油脂代谢分子调控研究提供参考。(本文来源于《分子植物育种》期刊2018年21期）
红花基因论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
西红花是中国传统中药材,以花柱入药,被誉为"植物黄金"。MADS-box转录因子家族在显花植物的花器官形成和分化过程中发挥重要作用,其有极大的可能影响西红花花器官的形成进而影响花柱发育。本研究采用生物信息学方法,对来自西红花转录组数据库中的17条MADS-box转录因子的核苷酸进行解读,及对其编码的氨基酸序列的组成成分、理化性质、信号肽、导肽、跨膜结构域、亚细胞定位、亲疏水性、蛋白质的二级、叁级结构及功能域进行预测分析,并将西红花和其他植物的MADS-box蛋白进行同源比对,同时构建了西红花和模式植物拟南芥MADS-box蛋白家族的系统进化树。结果表明,西红花MADS-box基因的开放阅读框在630～750 bp左右,分子量在24～29 kD之间,理论等电点(pI)均大于7,介于8.69～9.54之间,表现为碱性疏水蛋白,既不含有信号肽也没有跨膜结构,二级结构主要原件为α-螺旋和无规则卷曲,含有一个MADS-MEF结构域和K-box结构域。氨基酸同源性比对结果表明西红花和石刁柏的MADS-box蛋白同源性较高。与拟南芥的进化树分析结果显示,西红花MADS-box蛋白可聚为两大类,分属于MIKC和Mβ亚家族。本工作可为今后进一步深入研究西红花MADS-box蛋白的生物学功能提供可靠的参考依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
红花基因论文参考文献
[1].董园园,李俊锋,彭鸿远,王一非,王刚.红花CtWD40基因克隆及表达分析[J].中草药.2019
[2].张一菡,李卿,张磊,谭何新,陈祥慧.西红花MADS-box基因家族的生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学.2019
[3].蒋璐,束红梅,巩元勇,孙雨茜,郭书巧.西红花β-胡萝卜素羟化酶CsBCH1-z基因的分离与生物信息学分析[J].中国农学通报.2019
[4].郭丹丹.红花黄酮类成分生物合成途径关键基因的特征和功能研究[D].中国人民解放军海军军医大学.2019
[5].贾鑫磊,何贝轩,郭丹丹,高越,郭美丽.红花花冠伸长相关基因CtXTH1的特征与功能研究[J].药学学报.2019
[6].荣朵艳,张翔,潘婷,王菊凤,杨港.红花檵木LcFLS1基因的克隆及其表达与转化研究[J].西北植物学报.2019
[7]..红花岗区“传承红色基因·童心向党”成效明显[J].晚晴.2019
[8].钱诚,王安燕.红花岗区传承红色基因激活红色元素[N].贵州日报.2019
[9].王法微,董园园,王晓杰,刘秀明,杜琳娜.红花全基因组测序及黄酮类等代谢调控关键基因的挖掘[C].中国作物学会油料作物专业委员会第八次会员代表大会暨学术年会综述与摘要集.2018
[10].卿卓,苏睿,赵文正,李林庶,任晓晓.腾冲红花油茶1,6-二磷酸果糖醛缩酶基因克隆及组织表达分析[J].分子植物育种.2018