武胜勇
第二军医大学200433
【摘要】目的:筛选肝纤维化相关microRNA,并试分析其功能。方法:制备模型大鼠与正常大鼠,取肝活组织,提取RNA,进行RNA筛选与表达量分析,并测定行CoL-1、CTGF、TIMP-1水平,并进行相关性分析。结果:正常大鼠239个MicroRNA片段,肝纤维化模型大鼠250个,相交片段212个,其中9个存在较大变化,microRNA-138上调表达差异倍数达3.843123;正常组与模型组MicroRNA-138表达量与CoL-1、CTGF、TIMP-1水平差异具有统计学意义(P<0.0),且存在相关性。结论:microRNA-138可能具有抑制肝纤维化作用。
【关键词】肝纤维化;microRNA;调控
【中图分类号】R331.3+6【文献标识码】A【文章编号】1276-7808(2015)-06-499-01
肝纤维化是指各类损伤因素反复刺激性发生的肝脏病理改变,是各类肝病常见临床表现,具有不可逆性,可进展为肝硬化、肝癌。MicroRNA是一类小分子非编码RNA,参与调控各类细胞生长、分化、凋亡等,研究证实其在肝纤维化发生、进展过程中发挥重要作用。本次研究试筛选肝纤维化相关microRNA,并探讨其在肝纤维化中发挥的功能,以供借鉴。
1资料及方法
1.1研究对象
取健康清洁级雄性大鼠40只,3~4周、体重(150±10)g,常规试验,正常食水。
1.2仪器与试剂
猪血清、10%水合氯醛、4%多聚甲醛、无水乙醇、中性树胶、TRIzolRRNA提取试剂盒,CR型高速冷冻离心机、制冰机、4℃冰箱、低温冰箱、酶标仪、台式离心机、石蜡切片机、PV扫描仪、,PCR扩增仪IHi-Seq2000高通量测序仪、超净工作台等。
1.3方法
1.3.1实验一
参照陈述所给出方法,制备肝纤维化模型大鼠。分别取5份正常大鼠肝组织、5份模型大鼠肝组织,提取RNA。主要步骤:①-80℃冰箱留存,分批取出;②液氮处理,碾碎,预称重,定量组织100mg,置入离心管;③加入1.5mlTRIZOL,摇匀,室温放置5min,加入0.3ml氯仿,混匀15s,留置2-3min,12000r/min离心,15min,取上清液0.8m;④加入0.7ml异丙醇,室温静置10min,10000r/min,持续10min,弃上企业,加入75%乙醇1.4ml,7000r/min,5min,弃上清液,干燥5min,100mlDEPC灭菌处理,-70℃保存,留用。RNA纯度分析:以infinite酶标仪测定标本,进行样品完整性检测、纯度分析,最后进行表达差异检测。表达定量分析采用去PCR技术检测,77℃-60min接着85℃-5min反应条件逆转录,所得产物以灭菌水稀释后-20℃保存,以SDSRQ7500softwareV2.0软件计算样本Ct。
1.3.2实验二
取正常大鼠40只、肝纤维化模型大鼠40只的肝组织,参照实验一测定表达差异最大的MicroRNA-138表达量,并进行CoL-1、CTGF、TIMP-1水平,并进行相关性分析。
1.4统计学处理
数据资料以SPSS18.0软件处理。计量资料以均数±标准差(x±s)表示,若服从正太分布,组间比较采用t检验,若不服从正太分布,组间比较采用非参数检验,相关性分析采用单因素相关性分析,P<0.05表示差异具有统计学意义。
2结果
2.1MicroRNA数目差异与表达差异
修剪低质量片段后,正常大鼠肝组织共获得704821个片段,肝纤维化模型大鼠共获得795643个片段,参考SOAP比对程序,结果显示正常大鼠肝组织中3805343个片段存在,肝纤维化模型大鼠中有3705440个片段真实存在。再次对比寻找,正常大鼠肝样本中有239个MicroRNA片段,肝纤维化模型大鼠中有250个MicroRNA片段,相交片段212个,占前者88.70%,占后者84.80%。进行高通量检测,结果显示212个相交MicroRNA片段,有9个存在较大变化,正常大鼠与肝纤维化模型大鼠表达量差异倍数>2倍,分别是-1、-30b-5p、-144、-451、-674-3p、-27a、-138、-146b、-342-5p,前5个位下调表达,后5个为上调表达,其中-138上调表达十分显著,差异倍数为3.843123。
2.2细胞因子表达
研究显示,正常组与模型组MicroRNA-138表达量与CoL-1、CTGF、TIMP-1水平差异具有统计学意义(P<0.05)(见表1)。相关性分析,MicroRNA-138表达量与CoL-1、CTGF、TIMP-1水平均有相关性,r分别为0.818、0.912、0.843、0.82,且P<0.01,具有统计学意义(P<0.05)。
3讨论
研究显示,MicroRNA可能为肝纤维化有关,相交片段212个,中有9个表达量差异倍数在2倍以上,占4.25%,其中MicroRNA-138差异最为显著,其与人I型胶原(CoL-1)、结缔组织生长因子(CTGF)、基质金属蛋白酶的组织抑制剂(TIMP-1)密切相关,提示MicroRNA-138上调,可能通过以上三种物质抑制肝纤维化,但具体作用机制尚有待深入研究。
参考文献:
[1]王晓军,张荣珍,胡苑笙,等.我国病毒性肝炎流行现状研究[J].疾病监测2004,19(8):290-292.
[2]陈超.肝纤维化化相关microRNA的筛选及其功能研究[D].上海:第二军医大学,2012.