导读:本文包含了偏肿拟栓菌论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:共代谢,漆酶,偏肿拟栓菌,白腐真菌
偏肿拟栓菌论文文献综述
温继伟,高大文[1](2011)在《偏肿拟栓菌共代谢降解芘条件的优化》一文中研究指出为提高中国东北土着白腐真菌偏肿拟栓菌(Pseudotrametes gibbosa)对高分子量多环芳烃芘的共代谢降解效果,通过正交试验研究了共代谢基质、接种量、装液量及2,2′-连氮-二(3-乙基苯并噻唑-6-磺酸)(ABTS)的最佳配比,同时采用浓度梯度法考察芘的初始浓度对偏肿拟栓菌共代谢降解芘的影响.结果表明,偏肿拟栓菌Pseudotrametes gibbosa共代谢降解芘的最佳培养基为:麸皮浓度为20g/L,接种量为3片直径为10mm的菌片,装液量为50mL,不加ABTS,在该培养条件下,酶活可达53.41U/mL,对芘的降解率达到88.8%.初始浓度小于10mg/L的芘对菌体产酶有一定的促进作用,大于10mg/L时抑制漆酶的分泌,同时菌体对初始浓度小于90mg/L芘的降解率在22.24%~93.54%之间.(本文来源于《中国环境科学》期刊2011年09期)
闫洪波[2](2009)在《偏肿拟栓菌锰过氧化物酶cDNA基因克隆及在毕赤酵母中的表达》一文中研究指出锰过氧化物酶(MnP;EC1.11.1.13)是一种依赖H_2O_2的亚铁血红素糖蛋白酶,是一种常见的降解木质素的过氧化物酶,广泛存在于白腐菌中,目前国内对白腐菌MnP的研究多集中在酶学的基础研究上,对于白腐菌MnP的分子生物学研究还相对较少。由于MnP对木质素和多环芳烃等多种异生物质具有独特的胞外降解能力,因此这种酶在生物技术应用中极具吸引力,研究白腐菌MnP的基因结构和异源表达,为进一步深入研究MnP的降解机制与mnp基因表达调控之间的关系提供基础理论依据,对进一步构建优良工程菌株具有重要意义和理论价值。偏肿拟栓菌Pseudotrametes gibbosa是我国东北林区常见的一种多孔菌目多孔菌科的白腐真菌,在培养特性、产漆酶活性方面已有研究,但是对于该菌种另一种降解木质素的主要酶系锰过氧化物酶的研究尚属空白。本论文检测了偏肿拟栓菌分解木质素酶系统的产酶活性,对其MnP的cDNA基因进行了克隆和序列分析,并将该mnp基因转化毕赤酵母中实现了异源表达,主要研究结果如下:1.在4种不同的培养液中对偏肿拟栓菌和红平菇的木质素降解酶系统进行了锰过氧化物酶、漆酶和木质素过氧化物酶活性检测。结果在不含Mn~(2+)的培养液中两种白腐菌均未检测到MnP的活性变化,但可检测到漆酶的活性变化;在含有Mn~(2+)及添加了酶作用底物木屑和2,6-DMP的培养液中可同时检测到MnP和漆酶的活性变化;在4种不同的培养液中均未检测到木质素过氧化物酶的活性变化。表明偏肿拟栓菌和红平菇的木质素降解酶系统中可同时产生MnP和漆酶,而均不产生木质素过氧化物酶。2.对比4种培养液的酶活力测定结果,发现在培养液内添加酶作用底物木屑和2,6-DMP后可以显着提高MnP和漆酶的分泌量,表明底物对于白腐菌木质素降解酶系统的产生具有诱导作用;底物不同对于培养过程中酶活的高低影响也不同,添加木屑为底物要比添加2,6-DMP为底物的MnP和漆酶的产量稍高;在相同的培养方式中,偏肿拟栓菌比红平菇产生的酶活力稍高,偏肿拟栓菌MnP酶活力最高达165U/L,漆酶的最高酶活力为445U/L。3.采用简并PCR、RT-PCR、RACE方法从偏肿拟栓菌的成熟菌丝中克隆到了MnP的cDNA全长基因,命名为Pg-MnP。该基因含有1095 bp的完整开放阅读框(openreading frame,ORF),起始密码子ATG,终止密码子TAA,编码364aa,5'非翻译区(5'UTR)有51个核苷酸,3'非翻译区(3'UTR)有160个核苷酸;Pg-MnP的cDNA全长基因与彩绒革盖菌Trametes versicolor的MnP基因同源性最高,序列相似性达到86%,与射脉菌Phlebia radiam、绵皮孔菌Spongipellis sp、拟蜡菌Ceriporiopsis sp、糙皮侧耳Pleurotus ostreatus的MnP基因序列相似性达到68%~80%,与T.versicolor的IiP基因同源性也较高,序列相似性达到67%。4.Pg-MnP基因序列中G+C含量占62.65%、A+T含量占37.35%;氨基酸组成中,Ala含量最高,达12.05%、其次为Gly和Thr,均达到8.22%,而Tyr含量为0.00%;预测蛋白分子量为38.24kD,pI为4.49,带负电荷残基(Asp+Glu)有45个,带正电荷残基(Arg+Lys)有20个,总原子数为5311个,分子式为C_(1690)H_(2619)N_(455)O_(536)S_(11),不稳定指数为49.13,属不稳定蛋白,脂肪族指数为80.22,总平均疏水性为0.010;5.Pg-MnP蛋白信号肽最可能的剪切位点在21~22aa之间,为ANG-AA;该蛋白序列在30~50aa、129~147aa间存有两个疏水区域,跨膜区预测位置也在30~50aa、129~147aa间,这与亲/疏水性预测结果一致;Pg-MnP蛋白的二级结构中主要以无规则卷曲和a螺旋为主,二者在氨基酸中的比例达51.92%和36.81%,间或有β折叠结构;对该蛋白进行亚细胞定位,发现Pg-MnP的蛋白主要位于胞外、过氧化物酶体、内质网隔膜及内质网管腔;用SWISS-MODEL在线叁维结构比对预测,用Chimera输出了MnP的叁维模型,用Cn3D进行功能位点模拟,预测了Fe血红素,Ca原子、Mn结合位点及组氨酸残基位置。6.采用RT-PCR方法克隆得到用于酵母表达的pg-MnP完整CDS基因片段,将Pg-MnP目的基因片段与pPICZB载体质粒双酶切,构建重组质粒pPICZB/MnP;通过电转化的方法,将pPICZB/MnP重组质粒整合到毕赤酵母中进行MnP的异源表达,PCR验证结果表明,重组质粒pPICZB/MnP已被成功转化到毕赤酵母中;将重组MnP进行诱导表达,在96h内酵母的生物量随着培养时间的延长而不断增加,诱导表达的酵母培养上清液中MnP酶活72h达到最高,最大酶活力7U/L,在添加了heme的培养基中未检测到MnP的活性变化。(本文来源于《东北林业大学》期刊2009-03-01)
陈军,高大文,池玉杰,梁红[3](2008)在《偏肿拟栓菌Pseudotrametes gibbosa产漆酶的条件优化》一文中研究指出漆酶是一类含铜的多酚氧化酶,广泛存在于真菌,尤其是白腐真菌(Thurston 1994),是重要的产漆酶菌。由于漆酶能够催化许多芳香族化合物和广泛的作用底物,具有很大的实际应用价值。近年来,漆酶在造纸工业(本文来源于《菌物学报》期刊2008年06期)
偏肿拟栓菌论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
锰过氧化物酶(MnP;EC1.11.1.13)是一种依赖H_2O_2的亚铁血红素糖蛋白酶,是一种常见的降解木质素的过氧化物酶,广泛存在于白腐菌中,目前国内对白腐菌MnP的研究多集中在酶学的基础研究上,对于白腐菌MnP的分子生物学研究还相对较少。由于MnP对木质素和多环芳烃等多种异生物质具有独特的胞外降解能力,因此这种酶在生物技术应用中极具吸引力,研究白腐菌MnP的基因结构和异源表达,为进一步深入研究MnP的降解机制与mnp基因表达调控之间的关系提供基础理论依据,对进一步构建优良工程菌株具有重要意义和理论价值。偏肿拟栓菌Pseudotrametes gibbosa是我国东北林区常见的一种多孔菌目多孔菌科的白腐真菌,在培养特性、产漆酶活性方面已有研究,但是对于该菌种另一种降解木质素的主要酶系锰过氧化物酶的研究尚属空白。本论文检测了偏肿拟栓菌分解木质素酶系统的产酶活性,对其MnP的cDNA基因进行了克隆和序列分析,并将该mnp基因转化毕赤酵母中实现了异源表达,主要研究结果如下:1.在4种不同的培养液中对偏肿拟栓菌和红平菇的木质素降解酶系统进行了锰过氧化物酶、漆酶和木质素过氧化物酶活性检测。结果在不含Mn~(2+)的培养液中两种白腐菌均未检测到MnP的活性变化,但可检测到漆酶的活性变化;在含有Mn~(2+)及添加了酶作用底物木屑和2,6-DMP的培养液中可同时检测到MnP和漆酶的活性变化;在4种不同的培养液中均未检测到木质素过氧化物酶的活性变化。表明偏肿拟栓菌和红平菇的木质素降解酶系统中可同时产生MnP和漆酶,而均不产生木质素过氧化物酶。2.对比4种培养液的酶活力测定结果,发现在培养液内添加酶作用底物木屑和2,6-DMP后可以显着提高MnP和漆酶的分泌量,表明底物对于白腐菌木质素降解酶系统的产生具有诱导作用;底物不同对于培养过程中酶活的高低影响也不同,添加木屑为底物要比添加2,6-DMP为底物的MnP和漆酶的产量稍高;在相同的培养方式中,偏肿拟栓菌比红平菇产生的酶活力稍高,偏肿拟栓菌MnP酶活力最高达165U/L,漆酶的最高酶活力为445U/L。3.采用简并PCR、RT-PCR、RACE方法从偏肿拟栓菌的成熟菌丝中克隆到了MnP的cDNA全长基因,命名为Pg-MnP。该基因含有1095 bp的完整开放阅读框(openreading frame,ORF),起始密码子ATG,终止密码子TAA,编码364aa,5'非翻译区(5'UTR)有51个核苷酸,3'非翻译区(3'UTR)有160个核苷酸;Pg-MnP的cDNA全长基因与彩绒革盖菌Trametes versicolor的MnP基因同源性最高,序列相似性达到86%,与射脉菌Phlebia radiam、绵皮孔菌Spongipellis sp、拟蜡菌Ceriporiopsis sp、糙皮侧耳Pleurotus ostreatus的MnP基因序列相似性达到68%~80%,与T.versicolor的IiP基因同源性也较高,序列相似性达到67%。4.Pg-MnP基因序列中G+C含量占62.65%、A+T含量占37.35%;氨基酸组成中,Ala含量最高,达12.05%、其次为Gly和Thr,均达到8.22%,而Tyr含量为0.00%;预测蛋白分子量为38.24kD,pI为4.49,带负电荷残基(Asp+Glu)有45个,带正电荷残基(Arg+Lys)有20个,总原子数为5311个,分子式为C_(1690)H_(2619)N_(455)O_(536)S_(11),不稳定指数为49.13,属不稳定蛋白,脂肪族指数为80.22,总平均疏水性为0.010;5.Pg-MnP蛋白信号肽最可能的剪切位点在21~22aa之间,为ANG-AA;该蛋白序列在30~50aa、129~147aa间存有两个疏水区域,跨膜区预测位置也在30~50aa、129~147aa间,这与亲/疏水性预测结果一致;Pg-MnP蛋白的二级结构中主要以无规则卷曲和a螺旋为主,二者在氨基酸中的比例达51.92%和36.81%,间或有β折叠结构;对该蛋白进行亚细胞定位,发现Pg-MnP的蛋白主要位于胞外、过氧化物酶体、内质网隔膜及内质网管腔;用SWISS-MODEL在线叁维结构比对预测,用Chimera输出了MnP的叁维模型,用Cn3D进行功能位点模拟,预测了Fe血红素,Ca原子、Mn结合位点及组氨酸残基位置。6.采用RT-PCR方法克隆得到用于酵母表达的pg-MnP完整CDS基因片段,将Pg-MnP目的基因片段与pPICZB载体质粒双酶切,构建重组质粒pPICZB/MnP;通过电转化的方法,将pPICZB/MnP重组质粒整合到毕赤酵母中进行MnP的异源表达,PCR验证结果表明,重组质粒pPICZB/MnP已被成功转化到毕赤酵母中;将重组MnP进行诱导表达,在96h内酵母的生物量随着培养时间的延长而不断增加,诱导表达的酵母培养上清液中MnP酶活72h达到最高,最大酶活力7U/L,在添加了heme的培养基中未检测到MnP的活性变化。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
偏肿拟栓菌论文参考文献
[1].温继伟,高大文.偏肿拟栓菌共代谢降解芘条件的优化[J].中国环境科学.2011
[2].闫洪波.偏肿拟栓菌锰过氧化物酶cDNA基因克隆及在毕赤酵母中的表达[D].东北林业大学.2009
[3].陈军,高大文,池玉杰,梁红.偏肿拟栓菌Pseudotrametesgibbosa产漆酶的条件优化[J].菌物学报.2008