导读:本文包含了染色质纤维论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:染色质可接近性,GST-MNase-Seq,小鼠胚胎成纤维细胞
染色质纤维论文文献综述
卓宝文[1]（2017）在《利用GST-MNase-Seq技术解析小鼠胚胎成纤维细胞的染色质高级结构》一文中研究指出真核生物的遗传信息存储在DNA的线性序列之中,但是合适的基因表达需要染色质折迭形成复杂的叁维高级结构。染色质的基本组成单位是核小体,因此染色质的折迭作为染色质的一个重要特征,反映在对于转录机制的可接近性上。紧密包装的染色质被认为是基因沉默的标志,而染色质的开放先于线性序列基因的表达,因此开放的染色质被认为是细胞命运决定的指示器。目前对于开放染色质区域的鉴定也是基于对于染色质的可接近性的研究。在本课题中,我们试图从染色质可接近性的角度出发,绘制小鼠胚胎成纤维细胞染色质高级结构在全基因组范围内的动态变化图谱。我们利用改造后的带有谷胱甘肽S—转移酶(GST)标签的微球菌核酸酶(GST-MNase)对小鼠胚胎成纤维细胞进行了不完全酶切处理,我们通过设置不同的时间点改变酶的作用条件,从而能够对MEF全基因组的染色质的可接近性进行定量分析。结果显示在转录活跃的基因的MNase可接近性信号的富集随着酶切时间的延长逐渐降低,而且MNase可接近性信号的富集与基因的表达活性成正相关。结合高通量测序技术(GST-MNase-Seq),定位可接近的染色质区域,并利用生物信息学的方法,进一步将可接近的染色质区域分为活跃开放区域、紧密包装区域、静息开放区域。我们发现该方法得到的活跃开放染色质区域都包含在基于脱氧核糖核酸酶I方法定位到的染色质开放区域中,而GST-MNase-Seq得到的静息开放染色质区域是此前没有人观察到过的,我们猜测这些区域的基因在细胞发育过程中对细胞命运决定起着关键作用。(本文来源于《第叁军医大学》期刊2017-05-01）
Wei,Li,Ping,Chen,Juan,Yu,Liping,Dong,Dan,Liang[2]（2017）在《FACT调控染色质纤维四核小体结构单元激活基因转录》一文中研究指出文章简介真核生物中,基因组DNA折迭形成染色质,在基因转录调控中发挥至关重要的作用。由于染色质分子的高度复杂性、异质性和动态性,长期以来人们对染色质动态结构的了解还非常有限。本研究利用单分子磁镊技术,揭示四聚核小体串珠结构是染色质纤维逐级折迭过程中形成的中间态;进一步研究发现该结构高度动态,连接组蛋白H1不仅能够增强核小体的稳定性,还能促进核小体外圈DNA的动态缠绕。(本文来源于《科学新闻》期刊2017年04期）
梁丹,陈萍,李国红[3]（2015）在《30nm染色质纤维的结构及调控》一文中研究指出真核细胞中,基因组DNA缠绕组蛋白八聚体形成核小体,核小体再经过多层次折迭压缩形成具有高级结构的染色质.过去30多年,科学家对30 nm染色质纤维的结构进行了大量的研究,然而关于30 nm染色质纤维的精细结构仍然存在很大的争议.本文综述了近年来对30 nm染色质纤维结构的最新研究进展,并重点阐述了最近解析的30 nm染色质纤维左手双螺旋结构.同时,我们还进一步讨论了一些对30 nm染色质纤维结构起调控作用的因子及其作用机制.最后,我们对30 nm染色质纤维结构与功能领域所面临的挑战和问题进行了展望.(本文来源于《生物化学与生物物理进展》期刊2015年11期）
汪星,徐淼,赵光年,刘国友,郝德龙[4]（2015）在《CTCF和cohesin参与人成纤维细胞中HOXA基因簇染色质高级构象的组织》一文中研究指出位于人体不同部位的成纤维细胞具有细胞特异性的HOX基因表达模式,可以作为区分不同成纤维细胞的依据之一.在个体发育的过程中,建立或维持不同HOX基因表达模式的机制始终是引人关注的问题.本实验室前期工作在NT2/D1人畸胎瘤细胞中证明了CTCF/cohesin介导的染色质高级构象在维甲酸诱导的HOXA基因共线性开启过程中发挥了重要作用.为了进一步研究原代细胞中CTCF/cohesin对HOXA基因的调控作用,本研究选取了来自体轴不同部位并且HOXA基因表达模式互补的人胚肺和包皮成纤维细胞,对HOXA基因簇中CTCF和cohesin的结合水平以及相关的染色质高级构象进行了检测.与人胚肺成纤维细胞相比,包皮成纤维细胞中的cohesin结合水平较低,相关的染色质高级构象比较"开放",并且主要表达5′端的HOXA基因.本研究还发现CTCF结合位点CBSA56处于HOXA基因簇染色质高级构象中的核心位置,并且该位点参与的染色质相互作用在两种成纤维细胞中呈现出明显的差异,说明CBSA56是一个关键的CTCF结合位点.以上结果表明,CTCF和cohesin参与了人原代成纤维细胞中HOXA基因簇染色质高级构象的组织和HOXA基因的表达调控,并且提示细胞类型特异性的染色质高级构象与HOXA基因的空间共线性表达模式之间存在协同关系.(本文来源于《中国科学:生命科学》期刊2015年08期）
梁丹,陈萍,李国红[5]（2014）在《30nm染色质纤维结构与表观遗传调控》一文中研究指出真核生物的DNA以染色质形式通过逐级折迭压缩形成高级结构存在于细胞核中。染色质高级结构直接参与了真核基因的转录调控和其它与DNA相关的生物学事件,因此研究染色质高级结构对了解表观遗传学分子机制有着至关重要的作用。近些年,研究者们针对30 nm染色质高级结构提出了两个模型:螺线管模型和Zig-Zag模型。2014年,我们利用体外染色质组装体系重建了30 nm染色质纤维,运用高精度冷冻电镜技术得到了分辨率为11?的30 nm染色质纤维的精细结构,提出了30 nm染色质高级结构的左手双螺旋Zig-Zag模型。本文综述了30 nm染色质纤维结构研究方面的相关进展,并对30 nm染色质高级结构的表观遗传调控机理以及单分子成像和操纵技术在研究30 nm染色质高级结构中潜在的应用作出讨论和展望。(本文来源于《生命的化学》期刊2014年05期）
董立平,陈萍,李国红[6]（2014）在《30nm染色质纤维高级结构的研究进展》一文中研究指出真核生物的遗传物质DNA以染色质形式通过逐级折迭压缩存在于细胞核中。DNA缠绕组蛋白八聚体形成核小体,相邻的核小体由连接DNA串联起来形成染色质的一级结构:核小体串珠结构(beads-on-a-string)。一级结构进一步折迭形成30 nm染色质纤维。近30多年来,30 nm染色质纤维高级结构的解析一直是困扰分子生物学家们的一大难题。研究者利用电镜和X射线晶体学等生物物理学方法对30 nm染色质纤维结构进行研究,提出30 nm结构的两大模型:螺线管(solenoid)模型和Z字结构(zig-zag)模型。笔者综述了30 nm染色质纤维结构解析方面的研究进展,并着重阐述最近利用冷冻电镜方法解析的30 nm染色质结构,即以四个核小体为结构单元的左手双螺旋结构模型,最后对30 nm染色质纤维在体内是否存在,以及它在表观遗传调控中可能发挥的重要作用等问题进行了讨论和展望。(本文来源于《自然杂志》期刊2014年04期）
刘骏[7]（2014）在《叁维冷冻电镜成像技术成功运用于解析30nm染色质纤维的高分辨率结构》一文中研究指出经过多年来的不懈努力,中国科学院生物物理研究所的科学家,在破译"生命信息"的分子机理研究中,取得了重大成果.在这项突破性成果里,朱平研究员和李国红研究员领导的科研团队,利用先进的叁维冷冻电子显微镜成像技术,首次解析了30 nm染色质纤维的高分辨率结构,并提出了一种全新的染色质纤维的双螺旋结构模型.2014年4月25日,在(本文来源于《中国科学:生命科学》期刊2014年06期）
李宁[8]（2012）在《盐离子对Hela细胞“30nm”染色质提取纯化的影响及“30nm”纤维结构初探》一文中研究指出染色质“30nm”纤维是遗传信息发挥作用的重要处所,其结构受到了广泛的关注,自其概念提出至今已有30多年。在此期间,研究人员基于不同的实验材料和方法给出了染色质纤维不同的结构模型并引起了该领域的热议。本实验选择Hela细胞作为实验材料,以前人的实验方法作为基础,综合考虑Hela细胞自身的特点,对实验方法作出了改良和创新,使整个实验方案更加适用于本课题的研究。本实验从细胞内进行染色质“30”nm纤维的提取纯化及电镜观察,力求对争议的热点进行初步的实验分析。根据研究内容制定了实验思路：首先,利用最接近细胞内环境的缓冲液进行染色质纤维结构的细胞内提取及纯化,然后进行醋酸铀负染、钨丝喷金属及快速冷冻等制样方法制备电镜样品并进行电镜观察,最后综合生化实验结果及电镜照片进行实验分析。通过实验,得到了以下初步的研究结论：1,含有1.5mM MgCl2,1mM CaCl2,75mM NaCl的细胞核裂解液有效地抑制了He]a细胞内源性核酸酶对染色质结构的酶切；2,Hela细胞染色质纤维结构形态受到盐离子的影响,表现出在OmM Na+到100mM Na+之间随着盐浓度的升高,染色质结构逐渐折迭紧密的趋势。3, Hela细胞长短染色质纤维结构存在结构模型上的差异,表现为短片段染色质结构更接近one-start模型,长片段染色质结构更接近two-start模型；4,通过冷冻电镜观察,Hela细胞长染色质纤维结构表现出一定的two-start结构模型的特点。(本文来源于《山东大学》期刊2012-05-11）
茆象千,彭家和,董覃,邱平[9]（1998）在《不同龄大鼠大脑神经细胞核染色质10nm和30nm纤维核小体排布特征分析》一文中研究指出目的：观察不同年龄大鼠大脑神经细胞核染色质１０ｎｍ和３０ｎｍ纤维核小体排布特征，探讨老化过程导致大脑神经细胞核转录活性衰退的分子机制。方法：选用微球菌核酸酶（ＭＣＮ）为染色质结构识别探针，经蔗糖密度梯度离心、凝胶电泳，可显示不同龄大鼠大脑染色质结构特征的变化。结果：幼年鼠、成年鼠和老年鼠大脑染色质１０ｎｍ纤维核小体重复长度分别保持在（１７６±４）、（１７５±６）和（１７８±７）ｂｐ水平上；而３０ｎｍ抗酶解寡聚体核小体数目为：酶解３０％染色质时，分别是（３９±０．４７）、（４２±０．２６）和（４６±０．０２）；酶解５０％染色质时，则是（１８±０．１２）、（２１±０．４１）和（２６±０．２７）。结论：大鼠大脑细胞核１０ｎｍ染色质纤维核小体重复长度不受老化过程影响；３０ｎｍ纤维抗酶解寡聚体大小与年龄呈正相关，提示大鼠老化过程大脑染色质构象发生不利于ＭＣＮ酶解的变化，这可能是老化导致转录功能衰退的重要原因之一(本文来源于《第叁军医大学学报》期刊1998年06期）
于宏升,张宗玉[10]（1997）在《衰老人胚肺成纤维细胞核及染色质的体外转录活性》一文中研究指出研究人胚肺成纤维细胞（简称2BS）核及染色质体外转录活性与代龄的关系。方法：用γ-~(32)PATP及~3H-UTP参入法测定衰老2BS细胞核及染色质的转录活性。结果：（1）衰老2BS细胞核的转录起始能力较年轻的下降44％（P＜0.01）；（2）衰老和年轻2BS细胞核内不与染色质结合的RNA聚合酶（RNP）转录活性无差异（P＞0．05），而与染色质结合的RNA聚合酶转录活性则随增龄明显下降（P＜0．01）；（3）衰老2BS染色质体外转录活性较年轻2BS下降58％（P＜0．01），对DNaseⅠ的敏感性也有所降低。结论：衰老2BS细胞核染色质结构的改变可能是转录活性下降的原因。(本文来源于《北京医科大学学报》期刊1997年06期）
染色质纤维论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
文章简介真核生物中,基因组DNA折迭形成染色质,在基因转录调控中发挥至关重要的作用。由于染色质分子的高度复杂性、异质性和动态性,长期以来人们对染色质动态结构的了解还非常有限。本研究利用单分子磁镊技术,揭示四聚核小体串珠结构是染色质纤维逐级折迭过程中形成的中间态;进一步研究发现该结构高度动态,连接组蛋白H1不仅能够增强核小体的稳定性,还能促进核小体外圈DNA的动态缠绕。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
染色质纤维论文参考文献
[1].卓宝文.利用GST-MNase-Seq技术解析小鼠胚胎成纤维细胞的染色质高级结构[D].第叁军医大学.2017
[2].Wei,Li,Ping,Chen,Juan,Yu,Liping,Dong,Dan,Liang.FACT调控染色质纤维四核小体结构单元激活基因转录[J].科学新闻.2017
[3].梁丹,陈萍,李国红.30nm染色质纤维的结构及调控[J].生物化学与生物物理进展.2015
[4].汪星,徐淼,赵光年,刘国友,郝德龙.CTCF和cohesin参与人成纤维细胞中HOXA基因簇染色质高级构象的组织[J].中国科学:生命科学.2015
[5].梁丹,陈萍,李国红.30nm染色质纤维结构与表观遗传调控[J].生命的化学.2014
[6].董立平,陈萍,李国红.30nm染色质纤维高级结构的研究进展[J].自然杂志.2014
[7].刘骏.叁维冷冻电镜成像技术成功运用于解析30nm染色质纤维的高分辨率结构[J].中国科学:生命科学.2014
[8].李宁.盐离子对Hela细胞“30nm”染色质提取纯化的影响及“30nm”纤维结构初探[D].山东大学.2012
[9].茆象千,彭家和,董覃,邱平.不同龄大鼠大脑神经细胞核染色质10nm和30nm纤维核小体排布特征分析[J].第叁军医大学学报.1998
[10].于宏升,张宗玉.衰老人胚肺成纤维细胞核及染色质的体外转录活性[J].北京医科大学学报.1997
标签：染色质可接近性; GST-MNase-Seq; 小鼠胚胎成纤维细胞;