何平:基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子论文

何平:基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子论文

本文主要研究内容

作者何平,李林光,王海波,常源升(2019)在《基于转录组分析不同着色桃果皮花青苷表达模式与转录因子》一文中研究指出:桃(Prunus persica)是我国重要的果树树种之一,其果皮色泽是重要的外观品质。本研究以同期成熟的红色桃‘秋雪’和白里‘肥桃’为试材,基于Illumina HiSeqTM 2500高通量测序平台,采用RNA-seq技术比较分析两个品种桃果实不同发育时期转录组数据。测序共产生16.59 Gb Clean Data测序数据,基于有参或无参转录组序列组装法获得30 211个Unigene,其中3 060个差异表达基因在Nr、Swissprot、GO、COG和KEGG数据库中得到功能注释。在这些注释的差异基因当中有6个KEGG通路得到显著富集,其中包括类黄酮合成通路和光合通路。差异基因与植物转录因子数据库比对,筛选到153个差异表达基因分属于32个转录因子家族,其中包括已报道的参与调控花青苷合成的MYB和bHLH两类转录因子家族。进一步对花青苷代谢途径中的类黄酮合成通路中的关键酶基因进行q-PCR分析发现, CHS、CHI和F3H在‘肥桃’和‘秋雪’桃中表达方式很相似,但DFR、ANS和UFGT表达模式上存在较大差别,尤其是UFGT基因。通过果皮花青苷含量检测分析发现,‘秋雪’桃与‘肥桃’果皮中花青苷含量变化趋势与UFGT基因的表达模式一致。本研究结果有助于阐明桃不同果皮色泽分子遗传差异,为揭示其调控机制奠定基础。

Abstract

tao (Prunus persica)shi wo guo chong yao de guo shu shu chong zhi yi ,ji guo pi se ze shi chong yao de wai guan pin zhi 。ben yan jiu yi tong ji cheng shou de gong se tao ‘qiu xue ’he bai li ‘fei tao ’wei shi cai ,ji yu Illumina HiSeqTM 2500gao tong liang ce xu ping tai ,cai yong RNA-seqji shu bi jiao fen xi liang ge pin chong tao guo shi bu tong fa yo shi ji zhuai lu zu shu ju 。ce xu gong chan sheng 16.59 Gb Clean Datace xu shu ju ,ji yu you can huo mo can zhuai lu zu xu lie zu zhuang fa huo de 30 211ge Unigene,ji zhong 3 060ge cha yi biao da ji yin zai Nr、Swissprot、GO、COGhe KEGGshu ju ku zhong de dao gong neng zhu shi 。zai zhe xie zhu shi de cha yi ji yin dang zhong you 6ge KEGGtong lu de dao xian zhe fu ji ,ji zhong bao gua lei huang tong ge cheng tong lu he guang ge tong lu 。cha yi ji yin yu zhi wu zhuai lu yin zi shu ju ku bi dui ,shai shua dao 153ge cha yi biao da ji yin fen shu yu 32ge zhuai lu yin zi jia zu ,ji zhong bao gua yi bao dao de can yu diao kong hua qing gan ge cheng de MYBhe bHLHliang lei zhuai lu yin zi jia zu 。jin yi bu dui hua qing gan dai xie tu jing zhong de lei huang tong ge cheng tong lu zhong de guan jian mei ji yin jin hang q-PCRfen xi fa xian , CHS、CHIhe F3Hzai ‘fei tao ’he ‘qiu xue ’tao zhong biao da fang shi hen xiang shi ,dan DFR、ANShe UFGTbiao da mo shi shang cun zai jiao da cha bie ,you ji shi UFGTji yin 。tong guo guo pi hua qing gan han liang jian ce fen xi fa xian ,‘qiu xue ’tao yu ‘fei tao ’guo pi zhong hua qing gan han liang bian hua qu shi yu UFGTji yin de biao da mo shi yi zhi 。ben yan jiu jie guo you zhu yu chan ming tao bu tong guo pi se ze fen zi wei chuan cha yi ,wei jie shi ji diao kong ji zhi dian ding ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自植物生理学报的何平,李林光,王海波,常源升,发表于刊物植物生理学报2019年03期论文,是一篇关于转录组论文,转录因子论文,果皮色泽论文,花青苷论文,植物生理学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自植物生理学报2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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