导读:本文包含了酵母复合物论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:酿酒酵母,Rim101,ESCRT,VNX1
酵母复合物论文文献综述
赵运英,王頔,曹春蕾[1]（2019）在《酵母细胞中碱性应答蛋白Rim101与ESCRT复合物的相互调控作用》一文中研究指出本研究采用同源重组、倍比稀释及荧光定位等方法研究了ESCRT基因对Rim101蛋白定位的影响及Rim101其对钙稳态相关基因VNX1和SPF1的调控作用。结果显示,7个ESCRT基因(SNF7, SNF8, VPS20,STP22, VPS25, VPS28和VPS36)的缺失导致GFP-Rim101不能进入细胞核,VNX1基因的缺失不影响7个ESCRT缺失株对钙离子的敏感性,而SPF1基因的缺失导致7个ESCRT缺失株对钙离子更加敏感。研究表明ESCRT基因不仅调控Rim101的功能也影响其定位,VNX1和SPF1基因是Rim101组成型活性蛋白Rim101-531抑制ESCRT缺失株对钙离子敏感性所必需的,这些研究结果为进一步研究ESCRT的功能提供了基础。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年06期）
郑立新,蔡祥焜,乔秋爽,刘颖芬,辛乃宏[2]（2019）在《富硒酵母和小球藻复合物对ICR小鼠免疫力的影响》一文中研究指出目的:探讨富硒酵母和小球藻复合物对小鼠免疫力的影响。方法:健康ICR小鼠240只分成4组,每组60只,组内设3个剂量组和1个对照组,以0. 375、0. 750、2. 250 g·kg-1·d-1连续灌胃30 d后,分别进行迟发型变态反应试验、半数溶血值测定和抗体生成细胞检测、碳廓清试验、吞噬鸡红细胞试验、NK细胞活性检测和ConA诱导小鼠脾淋巴细胞转化试验。结果:3个剂量组足趾肿胀度均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P <0. 01);中剂量组淋巴细胞增殖能力明显高于对照组,差异有统计学意义(P <0. 01);低、高剂量组小鼠的抗体生成细胞数明显高于对照组,差异均有统计学意义(P <0. 05);高剂量组小鼠半数溶血值(HC50)明显高于对照组,差异具有统计学意义(P <0. 01);高剂量组小鼠的吞噬率、吞噬指数明显高于对照组,差异具有统计学意义(P <0. 01);其他指标差异均无统计学意义(P> 0. 05)。结论:富硒酵母和小球藻复合物具有增强免疫力的功能。(本文来源于《现代医学》期刊2019年06期）
刘升[3]（2019）在《酵母DNA损伤响应中ATR激酶及其相关复合物的结构研究》一文中研究指出细胞在生长的过程中会遇到各种来自外界或内部的压力,如辐射、化学分子、病毒、氧化自由基等等,这些压力条件很容易造成基因组DNA的损伤。DNA的损伤会造成很多不良后果,如细胞坏死,在高等生物中还有可能造成癌变。为了应对各种不利因素对基因组稳定性带来的影响,真核生物进化出了复杂的DNA损伤响应的机制,修复受损的DNA,调控细胞周期,或者诱导细胞启动凋亡程序。作为一种重要的组蛋白修饰形式,H2B的单泛素化(酵母中K123位点,人源K120位点)广泛地参与DNA复制、基因的转录与表达、DNA损伤修复及异染色质维持等生物过程。组蛋白修饰是染色质调控的重要方式之一。酿酒酵母H2B的泛素化由Rad6/Bre1(泛素结合酶Rad6,泛素连接酶Bre1)复合体进行催化。到目前为止还不清楚Rad6/Bre1如何结合泛素泛素激活酶Uba1和核小体。我们内源性地从酵母细胞中分别纯化得到了 Uba1和Rad6/Bre1复合体,并体外组装了 Uba1-Rad6-Bre1复合物和核小体-Rad6-Bre1复合物。叁维重构发现,Rad6/Bre1稳定结合在Uba1上部,首次发现了泛素化修饰的叁个酶形成了稳定的复合物,暗示了体内也存在叁种酶相互结合的可能性。这完全不同于已知的由泛素结合酶单独结合泛素激活酶并接受泛素后再结合泛素连接酶的结合方式,所以Uba1、Rad6和Bre1之间传递泛素的方式可能是独特的。此外,Rad6/Bre1也能稳定地结合核小体,首次获得了完整的Rad6/Bre1与底物结合的复合物,证明了体外组装完整核小体-Rad6-Bre1复合物的可能性,为后续进一步解析核小体-Rad6-Bre1复合物的冷冻电镜结构奠定了基础。在DNA损伤响应通路中,最关键的两种调控蛋白是ATM(ataxia-telangiectasia mutated)和 ATR(ATM-and Rad3-related)激酶,位于损伤响应信号传导的最上游。ATR在DNA的单链损伤响应以及稳定复制叉结构中起到核心的调控作用,是细胞不可缺少的关键激酶。目前已有人源ATR/ATRIP(ATR interacting protein)复合物以及来源于酿酒酵母的ATR/ATRIP同源蛋白Mec1/Ddc2的高分辨率冷冻电镜结构。但是目前解析的结构是未激活状态的ATR/ATRIP结构。由于ATR下游调控了众多细胞进程,所以其活性受到多种因子的严格调控。但是目前并不知道ATR/ATRIP和其他多种因子之间的相互作用方式,对于ATR的激活机制还并不清楚。我们解析了来源于裂殖酵母的ATR/ATRIP同源蛋白Rad3-Rad26在体内羟基脲(Hydroxyurea,HU)诱导激活状态下的8.8A冷冻电镜结构。HU能够抑制dNTP池从而造成DNA复制的停滞,引起DNA复制胁迫。Rad3-Rad26的整体结构与酿酒酵母Mec1/Ddc2—样呈蝴蝶状,但是其结构稳定性更低,体现在其HEAT区域的结构非常灵活,具有多种构象状态。激酶结构域结构相对较为稳定,在不同物种间保持更高的保守性。通过体外活性检测证实了HU的体内激活效果。结合体外孵育和电镜分析,发现多个DNA损伤检验点复合物蛋白能不同程度地体外激活Rad3-Rad26。并能与Rad3-Rad26在体外稳定相互作用形成复合物。结合检验点复合物蛋白后Rad3-Rad26的构象分布发生一定程度的变化,开放状比例减少,蝴蝶状比例增,尤其是完整的检验点复合物组分能最显着地影响Rad3-Rad26的活性和构象分布。脂肪酸的合成和代谢与细胞的生长状态密切相关。脂肪酸合成酶(fatty acid synthase,FAS)能体内合成软脂酸和硬脂酸。最近的研究表明ATR参与调控细胞代谢和运动,而FAS也与基因组的稳定性密切相关。但是两者之间的关联还不得而知。我们在内源性纯化Rad3-Rad26时,意外发现了有脂肪酸合成酶FAS稳定的共纯化。我们解析了共纯化的FAS和单独纯化的FAS的冷冻电镜结构,分辨率分别为4.7A和5.1A。两种FAS的整体结构与酿酒酵母中FAS的结构高度保守,为D3对称的桶形结构。通过比较共纯化的FAS和单独FAS的结构,我们发现FAS的底物传递核心ACP(acyl carrier protein)结构域具有明显的差异。在共纯化的FAS中,ACP稳定结合在AT(acyltransferase)结构域底物入口处,而单独纯化的FAS中无法清晰指认ACP结构域的位置。通过荧光成像发现FAS在正常条件和多种DNA损伤应激条件下都分布在细胞质中,没有进入细胞核;但是Rad3可以同时分布在细胞核与细胞质当中,并且在DNA损伤应激条件下细胞质分布的细胞比例明显提高。因此Rad3与FAS的相互作用有可能是通过Rad3的出核实现的。本论文中,我们初步探究了酿酒酵母中H2B泛素化过程中修饰酶及其与核小体底物之间的结合方式。首次得到了叁种泛素修饰酶的复合物以及修饰酶与核小体的复合物,表明了 Rad6不需要与Bre1解离即可结合Uba1,暗示了可能的新的泛素传递方式,初步实现了核小体与Rad6/Bre1的体外组装,为进一步探究H2B泛素化修饰的机制提供了基础。解析了裂殖酵母中ATR/ATRIP的同源蛋白Rad3-Rad26在HU体内激活状态下的中等分辨率的冷冻电镜结构,发现了Rad3-Rad26独有的高度动态以及二体相互作用界面的变化,加深了对Rad3-Rad26的结构认识。体外研究了检验点复合物相关成员对Rad3-Rad26的调控,指示了进一步体外组装检验点复合物需要RPA、9-1-1、Rad4以及ATPγs。发现了 Rad3-Rad26与FAS的共纯化以及Rad3-Rad26对FAS结构的稳定作用,暗示了 Rad3-Rad26可能直接参与了脂肪酸合成的调控,将DNA损伤响应与脂肪酸合成更直接地联系起来。(本文来源于《中国科学技术大学》期刊2019-05-01）
谢长林[4]（2019）在《酿酒酵母Mek1与Hop1复合物及海环杆菌去乙酰化酶CmCBDA的结构与功能研究》一文中研究指出论文的第一部分阐述了酿酒酵母减数分裂过程中,联会复合体的侧向元件Hopl与Mekl相互作用的结构与功能研究。减数分裂是一种特殊的细胞分裂方式,是有性生殖不可缺少的环节。减数分裂的正常进行对于维持物种染色体数目的稳定及产生多样性的后代十分重要。减数分裂前期Ⅰ过程中的同源重组是实现来自父本和母本基因信息交换的重要过程。同源重组的顺利进行需要联会复合体的参与以实现其一系列生物学行为的精确调控。联会复合体的结构组分Hopl通过其SCD结构域318位苏氨酸磷酸化与减数分裂特异性激酶Mekl FHA结构域的相互作用来实现后者的定位与激活。激活的Mekl磷酸化一系列底物使得同源重组过程中修复模板的选择倾向于同源染色体的非姐妹染色单体,从而实现减数分裂的同源重组及后续行为的正常进行。认知Mekl-FHA如何识别Hopl pT318对于深入理解Mekl的定位与激活十分重要。本文展示了酿酒酵母Mekl-FHA的单体及与Hopl pT318小肽复合物的晶体结构。通过分析Mekl-FHA和PDB中已有的FHA结构域,我们提出一类位于结合口袋处的PSXS Motif。此类Motif在叁维结构和底物识别模式上具有一定的保守性。通过分析复合物的结构,发现Hopl pT318的+2氨基酸残基Phe320和+3氨基酸残基Va1321对于Mekl-FHA的选择性识别十分重要。以此为依据,我们鉴定了以往发现可能被Mekl-FHA识别的位点,结果显示pT+2和pT+3不含疏水性残基的位点均不能被Mekl-FHA识别。与此同时,在裂殖酵母中我们鉴定出Mekl-FHA能够识别Hopl pT270,结合已报道的Mekl识别自身N端的pT15。上述结果暗示裂殖酵母Mekl能够通过两种方式实现自身的激活,这与酿酒酵母Mekl激活方式存在明显差异。本实验结果有助于更好的理解酿酒酵母和裂殖酵母减数分裂过程中Mekl和Hopl相互作用及功能的差异。论文的第二部分初步探索了来源于海环杆菌(Cyclobacterium marinum)去乙酰化酶CmCBDA的结构生物学研究。骨关节炎是一种十分常见的老年性疾病,全球有数亿人受此疾病困扰。老年性骨关节炎的主要原因是软骨的退化。软骨退化的重要预防和治疗方式之一便是服用葡萄糖胺类产品,因此,葡萄糖胺类产品成为受全球市场青睐的保健品和处方药。然而,葡萄糖胺工业化生产工艺的缺陷使得葡萄糖胺类产品生产成本增高导致市场价格高昂而致使许多患者无力购买。目前,葡萄糖胺工业化生产的主要受限步骤是从前体乙酰葡萄糖胺去乙酰化生成葡萄糖胺的过程。CmCBDA属于Ydjc家族蛋白质,是目前唯一已知能在体外温和条件下选择性催化乙酰葡萄糖胺去乙酰化的酶。阐述CmCBDA对乙酰葡萄糖胺的特异选择性对于开发生产葡萄糖胺优质的生物催化剂具有重要意义。在本论文中,我们解析了 CmCBDA与金属Mn离子和反应产物乙酸分子的复合物结构。实验结果显示CmCBDA在溶液中呈现二聚体的形态,与晶体的一个非对称单元包含两个CmCBDA分子一致。CmCBDA的整体结构呈现α-helix包裹β-sheet的形状,酶活的口袋位于β-sheet及其周边的loop区域。晶体结构的分析结果显示Asp22、His72 和 His143 参与螯合 Mn 离子,而 Asp21、His230 和 Arg253 参与结合反应产物乙酸分子。与另外两个已经解析的Ydjc家族蛋白质进行结构比对,我们推测CmCBDA对于乙酰葡萄糖胺的选择性可能与其结合口袋的相对狭窄封闭有关。本实验初步探索了 CmCBDA的结构生物学研究及其对乙酰葡萄糖胺的选择性,为进一步完整阐述CmCBDA的催化机制、底物选择性及后续的酶工程改造奠定了基础。(本文来源于《中国科学技术大学》期刊2019-03-01）
唐小懿,马杰,张富群,陈清华,季方[5]（2018）在《蒙脱石和酵母培养复合物对断奶仔猪生长性能、血清生化指标、免疫功能及抗氧化能力的影响》一文中研究指出本试验旨在研究饲粮中添加蒙脱石和酵母培养复合物替代抗生素和氧化锌(Zn O)对断奶仔猪生长性能、血清生化指标、免疫功能及抗氧化能力的影响。选取31日龄、平均体重为(6.78±0.19)kg的"杜×长×大"断奶仔猪180头,随机分为5组,每组6个重复,每个重复6头猪(公母各占1/2)。对照组饲喂基础饲粮+抗生素(500 g/t 15%金霉素+200 g/t 50%喹乙醇)+Zn O(3 kg/t),试验Ⅰ组饲喂基础饲粮+抗生素+Zn O+蒙脱石和酵母培养复合物(1.5 kg/t),试验Ⅱ组饲喂基础饲粮+Zn O+蒙脱石和酵母培养复合物,试验Ⅲ组饲喂基础饲粮+抗生素+蒙脱石和酵母培养复合物,试验Ⅳ组饲喂基础饲粮+蒙脱石和酵母培养复合物。试验期35 d。结果显示:1)试验15~35 d时,试验Ⅲ和Ⅳ组断奶仔猪的平均日采食量显着高于对照组和试验Ⅰ组(P<0.05);试验15~35 d和1~35 d时,试验Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ组的平均日增重显着高于对照组(P<0.05)。2)与对照组相比,试验14和35 d时,试验Ⅲ和Ⅳ组断奶仔猪的血清碱性磷酸酶(ALP)活性显着降低(P<0.05),试验Ⅱ、Ⅲ和Ⅳ组的血清谷丙转氨酶(ALT)活性显着降低(P<0.05);各组的血清总蛋白(TP)、白蛋白(ALB)、尿素氮(UN)含量和谷草转氨酶(AST)活性无显着差异(P>0.05)。3)与对照组相比,试验14 d时,各试验组断奶仔猪的血清免疫球蛋白A(Ig A)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、干扰素-γ(INF-γ)含量均显着升高(P<0.05),试验Ⅱ和Ⅲ组的血清免疫球蛋白M(Ig M)和白介素-4(IL-4)含量显着升高(P<0.05),试验Ⅰ组的血清白介素-1β(IL-1β)、白介素-2(IL-2)和白介素-6(IL-6)含量显着升高(P<0.05);试验35 d时,各试验组的血清免疫球蛋白G(Ig G)和TNF-α含量显著升高(P<0.05),试验Ⅰ和Ⅳ组的血清Ig M含量显着升高(P<0.05),试验Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ组的血清INF-γ和IL-6含量显着升高(P<0.05)。4)与对照组相比,试验14 d时,试验Ⅱ和Ⅲ组断奶仔猪的血清总抗氧化能力(T-AOC)显着升高(P<0.05),各试验组的血清谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)和超氧化物歧化酶(SOD)活性显着升高(P<0.05);试验35 d时,试验Ⅲ和Ⅳ组的血清T-AOC显着升高(P<0.05),试验Ⅲ组的血清SOD活性显着升高(P<0.05),各试验组的血清丙二醛(M DA)含量显着降低(P<0.05)。由此可知,饲粮中添加蒙脱石和酵母培养复合物能改善断奶仔猪的生长性能,提高仔猪的免疫功能和抗氧化能力。(本文来源于《动物营养学报》期刊2018年09期）
晁春江[6]（2018）在《裂殖酵母中核仁蛋白Dnt1调控后期促进复合物功能的研究》一文中研究指出在有丝分裂期过程中精确的染色体分离是维持基因组稳定性的关键。动粒是染色质上着丝粒区大的蛋白质复合体,它作为纺锤体微管的锚定位点和纺锤体组装检查点的信号枢纽。在中期,来自相反极体的纺锤体微管捕获姊妹动粒,发挥拉力,并在姊妹动粒之间产生张力。纺锤体组装检查点(spindle assembly checkpoint,SAC)检测不正确的动粒-微管附着并将这些缺陷转化为抑制后期促进复合物的信号。后期促进复合物(APC/C)是一个多亚基的E3泛素连接酶,通过靶向降解底物细胞周期蛋白B和Securin,促进细胞周期中期-后期转换。针对这两种关键底物的APC/C活性需要共激活因子Cdc20。为确保细胞进入有丝分裂和精确的分离其复制的基因组,APC/CCdc20活性必须严格控制。通过遗传学的研究,我们发现dnt1缺失会加强APC/C突变体的温度敏感性。这个过程既依赖于SAC的组分Mad2和Mad3,也部分依赖于E3泛素连接酶Dmal。我们还发现,表达两倍的Slp1可以微弱地逆转dnt1缺失的菌株对微管解聚药物TBZ的敏感。基于Dnt1与哺乳动物中p31comet和CUEDC2蛋白功能的相似性,我们尝试检测了这两个蛋白对于裂殖酵母中Dnt1功能的补偿作用。我们发现,过表达CUEDC2可以微弱地拯救dnt1缺失的菌株对微管解聚药物TBZ的敏感性,说明裂殖酵母中的Dnt1其功能可能与哺乳动物中CUEDC2部分类似。综上所述,本研究发现裂殖酵母中Dnt1参与调控后期促进复合物的活性,并初步探讨了可能的调控机制。(本文来源于《厦门大学》期刊2018-04-01）
郭琼[7]（2017）在《酿酒酵母Iml3-Chl4复合物的结构生物学研究以及膜蛋白NPC1的表达纯化》一文中研究指出遗传物质的准确复制并精确分配到子代细胞中是生物体存活与延续的基础。根据细胞分裂类型又可分为有丝分裂和减数分裂。但无论哪种细胞分裂,都需要纺锤体的纺锤丝附着在染色体的特定区域上,最终牵引染色体被拉向细胞的两极。人们把这个特定的区域称之为着丝粒,大分子复合物--动粒在着丝粒上进行组装,指导染色体的分离。根据在动粒上的位置,可将动粒组分分为内层动粒蛋白、外层动粒蛋白以及调节蛋白。目前一致认为内层动粒主要由16个CCAN蛋白(哺乳动物类)组分组成,该区域与着丝粒DNA紧密连接,随后招募其他的动粒组分。而CENP-L/CENP-N作为CCAN复合物的核心组成元件,在动粒组装的上游发挥作用,并招募其他组分在染色体上装配。但CENP-L/CENP-N是如何被招募到着丝粒核小体上目前还不是很透彻。本文以酿酒酵母着丝粒动粒蛋白Iml3/Chl4 (哺乳动物CENP-L/CENP-N的同源蛋白)为研究对象,解析了 Iml3蛋白和Iml3-Chl4378-458复合物的晶体结构。结构显示:Iml3是一个较新的结构组装模式,主要由两个分离的结构域组成:不完全的β折叠桶和扭曲的平面,通过分子间的疏水作用维持着整个结构的稳定性。在晶体结构中,尽管一个不对称单位中只有一个Iml3分子,但它与晶体学对称所产生的另一个Iml3分子通过β strand上的主链氢键形成同源二聚体。当Chl4蛋白存在时,Chl4能破坏Iml3的同源二聚界面,以更加稳定的方式结合Iml3。Chl4的C端形成4个β strands,以反平行的方式与Iml3的11个βstrands组成一个连续、延伸的β-sheet,并通过多对氢键以及盐桥相互作用保证了复合物的稳定和结合特异性。结构分析与文献查阅发现,Chl4通过与着丝粒Cse 4核小体(哺乳动物CENP-A核小体)的直接相互作用被招募,除了 Chl4的N端与Mif2蛋白(哺乳动物CENP-C的同源蛋白,具有DNA结合能力)相互作用的推动,是否还存在其他的作用力促使这个过程的发生呢?我们的凝胶阻滞和荧光偏振实验结果表明,Iml3和Chl4具有协同结合dsDNA的能力,而单独的Iml3和Chl4都不具有与dsDNA的结合能力。结构分析及突变体实验发现,这种非特异性结合dsDNA的能力主要来源于Iml3-Chl4复合物的β-sheet内侧碱性富集区。与我们几乎同时发表的的Stephen et al.研究组的研究表明:破坏Iml3与Chl4的二聚作用界面,直接导致了染色体分离的准确性以及使孢子的生成率降低,他们将此现象的最终原因归结为异源二聚界面的破坏。我们的凝胶阻滞以及荧光偏振等实验表明,异源二聚界面的破坏只是表象,二聚界面的破坏导致了Iml3-Chl4复合物上的β-sheet内层表面的碱性残基富集区被破坏,从而失去了dsDNA的结合能力,这可能直接阻碍了自身的着丝粒定位以及其下游内层动粒蛋白的招募,从而抑制了动粒的组装,最终影响了染色体的分离。胆固醇作为一种环戊烷多氢菲的衍生物,广泛存在于动物的脑及神经组织中,为哺乳动物生长发育所必须,同时也是细胞膜结构的重要组成部分。但是作为两性分子,胆固醇的转运以及信号传导既需要可溶蛋白的协助,又需要膜蛋白的参与。在哺乳动物中,胆固醇除了内质网上的从头合成,还涉及到外源性摄取:低密度脂蛋白结合到低密度脂蛋白受体上,随后内化进早期内涵体,在酸性pH的作用下,两者解离。低密度脂蛋白被转运至晚期内涵体,经溶酶体酶水解成自由胆固醇,在可溶蛋白NPC2/膜蛋白NPCl的协同作用下,转运出内涵体。当NPC2/NPC1基因发生突变时,会引起自由胆固醇在内涵体中的积累,在人源中这种疾病称为Niemann-PicktypeC (NPC)疾病。可以看出,膜蛋白NPCl是一种非常重要的转运蛋白。近来研究发现,NPC1还可以作为某些包膜丝状病毒感染宿主细胞的受体蛋白,帮助丝状病毒在宿主细胞内的复制、组装。但膜蛋白NPC1是如何既作为转运蛋白帮助胆固醇的转运,又作为受体蛋白帮助子代病毒感染宿主细胞还不是很透彻。本文以膜蛋白NPC1为研究对象,成功克隆了 NPC1蛋白在不同物种中的50个同源蛋白,筛选出了能在pichiaa系统中稳定表达的TlNPC1(Thermomyc s lanuginosus);同时根据多次实验以及二级结构的预测,成功筛选出能够稳定存在的TlNPC1截断片段;结合去垢剂的筛选、去甲基化、去糖基化、蛋白酶解、LCP脂质体以及冷冻电镜等方法,但都没有成功解析出NPC1蛋白的叁维结构。(本文来源于《中国科学技术大学》期刊2017-10-01）
刘俊杰[8]（2016）在《酵母RNA外切体复合物的冷冻电镜结构分析》一文中研究指出真核生物RNA外切体是多亚基蛋白复合物,由九亚基核心和Rrp44亚基组成。复合物中,九亚基核心无核苷酸酶活性,而Rrp44兼具从3’-5’的核苷酸外切酶和内切酶活性。大量功能研究表明,在细胞核和细胞质内众多辅助因子的协助下,外切体参与信使RNA,核糖体RNA,转运RNA,小RNA以及大量长非编码RNA的加工代谢,且影响重大。通过电镜单颗粒及生化实验分析,我们揭示了酵母外切体内应对不同RNA底物的多条降解通路。在过核降解通路中,单链RNA将穿过外切体的核心孔道进入Rrp44亚基被加工处理,同时诱发Rrp44亚基的构象变化。在直接降解通路中,RNA可以避开核心孔道而直接结合到Rrp44亚基的外切酶活性中心,且不诱发Rrp44的构象变化。同时,我们利用电镜技术对RNA在外切体复合物中降解的过程进行了统计分析和重现,为外切体复合物对不同类型的RNA底物的降解模式提供了机理上的解释。与此同时,通过对十亚基外切体复合物内源纯化方法的细节调整,我们成功地纯化并获得了酵母内源表达的外切体与其细胞质辅助因子Ski7的复合物样品,并利用冷冻单颗粒叁维重构获得了该复合物的多种状态下的高分辨率结构。其中,无底物状态的重构模型分辨率为4.2埃,底物结合状态重构模型的分辨率为5.8埃,我们因而可以从原子水平来分析两种状态的结构差异。结合外切体与其它种类RNA复合物的结构解析,我们大致揭示了RNA经由核心孔道诱发Rrp44构象变化以及激活降解进程的分子机制。结构的分析亦阐明了Ski7与外切体相互作用的方式,与已解析的外切体和Rrp6复合物结构对比可知,Ski7的N端结构域与Rrp6的C端结构域在二级结构排布上极其相似,且与外切体相互作用模式也基本一致,这在一定程度上解释了细胞内不同外切体族群如何差异性地在多种RNA加工处理事件中独立工作。(本文来源于《清华大学》期刊2016-06-01）
刘洋[9]（2015）在《金黄色葡萄球菌RsmA蛋白以及酿酒酵母ISW2染色体重塑复合物的结构初探》一文中研究指出1.金黄色葡萄球菌RsmA蛋白的初步晶体学研究金黄色葡萄球菌是一种重要的致病菌,是人类化脓感染中最常见的病原菌,能够引起局部化脓感染。抑制金黄色葡萄球菌感染的一种方式是抑制其相关毒性蛋白及毒性分子的表达。RsmA蛋白是金黄色葡萄球菌中的一种16S rRNA小亚基甲基转移酶,负责将16S rRNA 3’端第一个发卡结构区两个连续的腺嘌呤进行甲基化,并且能够使每个腺嘌呤第6位的氮原子发生一个双甲基化反应。研究发现RsmA蛋白的缺失会影响30S小亚基的生物合成,进而影响到蛋白质的相关翻译过程。对于该部分研究试图通过结构生物学的方法探究RsmA蛋白催化腺嘌呤发生双甲基化的结构基础,通过结构分析找到RsmA上潜在的靶向小分子药物位点,通过设计药物来抑制金黄色葡萄球菌感染。于是我们进行了RsmA蛋白的克隆、表达、纯化并对Native和SeMet-RsmA蛋白进行了晶体生长,收到了一套3.2 A的数据,通过数据处理了解了RsmA蛋白的一些初步晶体学数据,通过ITC实验检测了RsmA对SAM和SAH的结合,并进行了RsmA与SAM和SAH的共结晶,通过晶体筛选获得了复合物的晶体,但质量并不高有待进一步优化。2.酿酒酵母中的ISW2染色体重塑复合物的结构探索真核生物体内,染色质以核小体的形式存在,这种包装结构非常紧密,使得转录调控蛋白不能结合到DNA上,影响基因的表达。ATP依赖的染色体重塑复合物可以利用ATP水解释放的能量对核小体进行移动,组装,替换,进而导致细胞中染色质的结构发生改变,对基因的表达情况起到调控作用。在酿酒酵母中存在一种保守的ATP依赖的染色体重塑复合物ISWI家族,包含有ISWl和ISW2两种主要的重塑复合物。其中ISW2染色体重塑复合物含有iSW2、Itc1、Dpb4和Dlsl四个组分,该复合物可以调控核小体串联的间隔,发挥重塑功能。相比于ISWl,ISW2蛋白在发生重塑过程中对于核小体间的链接DNA的长度是没有要求的,并且对于核小体的结构不会起到破坏作用。对于这部分工作,尝试通过解析该复合物及其各组分的结构来探究其重塑的机理。我们对于ISW2各个组分进行了克隆、表达、纯化并进行了晶体生长,获得了Isw2单体的晶体。通过EMSA实验和pull-down实验探究了Isw2和Dpb4+Dls1对于双链DNA的结合能力以及Isw2与Dpb4+Dls1相互作用的片段,尝试了Isw2、Dpb4+Dls1+dsD NA和Isw2片段-Dpb4+Dls1的共晶。与此同时对得到的晶体进行了优化以及衍射数据的收集,希望得到结构信息。(本文来源于《中国科学技术大学》期刊2015-09-01）
吕红[10]（2014）在《裂殖酵母SAGA复合物亚基Spt20调控了胞裂蛋白环的组装》一文中研究指出细胞分裂的后期时,要实现两个子细胞的准确分离需要胞裂蛋白环的组装。在裂殖酵母中,胞裂蛋白Spn1、Spn2、Spn3和Spn4首先在细胞分离的位置组装成胞裂蛋白环的初级结构,随后Mid2蛋白被募集到环上进一步促进胞裂蛋白环结构的成熟和稳定。但是关于胞裂蛋白环组装和稳定的调控机制还知之甚少。在本研究中,我们发现着名的转录激活(本文来源于《2014全球华人遗传学大会全国第十叁次医学遗传学学术会议论文汇编》期刊2014-10-29）
酵母复合物论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:探讨富硒酵母和小球藻复合物对小鼠免疫力的影响。方法:健康ICR小鼠240只分成4组,每组60只,组内设3个剂量组和1个对照组,以0. 375、0. 750、2. 250 g·kg-1·d-1连续灌胃30 d后,分别进行迟发型变态反应试验、半数溶血值测定和抗体生成细胞检测、碳廓清试验、吞噬鸡红细胞试验、NK细胞活性检测和ConA诱导小鼠脾淋巴细胞转化试验。结果:3个剂量组足趾肿胀度均明显高于对照组,差异均有统计学意义(P <0. 01);中剂量组淋巴细胞增殖能力明显高于对照组,差异有统计学意义(P <0. 01);低、高剂量组小鼠的抗体生成细胞数明显高于对照组,差异均有统计学意义(P <0. 05);高剂量组小鼠半数溶血值(HC50)明显高于对照组,差异具有统计学意义(P <0. 01);高剂量组小鼠的吞噬率、吞噬指数明显高于对照组,差异具有统计学意义(P <0. 01);其他指标差异均无统计学意义(P> 0. 05)。结论:富硒酵母和小球藻复合物具有增强免疫力的功能。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
酵母复合物论文参考文献
[1].赵运英,王頔,曹春蕾.酵母细胞中碱性应答蛋白Rim101与ESCRT复合物的相互调控作用[J].基因组学与应用生物学.2019
[2].郑立新,蔡祥焜,乔秋爽,刘颖芬,辛乃宏.富硒酵母和小球藻复合物对ICR小鼠免疫力的影响[J].现代医学.2019
[3].刘升.酵母DNA损伤响应中ATR激酶及其相关复合物的结构研究[D].中国科学技术大学.2019
[4].谢长林.酿酒酵母Mek1与Hop1复合物及海环杆菌去乙酰化酶CmCBDA的结构与功能研究[D].中国科学技术大学.2019
[5].唐小懿,马杰,张富群,陈清华,季方.蒙脱石和酵母培养复合物对断奶仔猪生长性能、血清生化指标、免疫功能及抗氧化能力的影响[J].动物营养学报.2018
[6].晁春江.裂殖酵母中核仁蛋白Dnt1调控后期促进复合物功能的研究[D].厦门大学.2018
[7].郭琼.酿酒酵母Iml3-Chl4复合物的结构生物学研究以及膜蛋白NPC1的表达纯化[D].中国科学技术大学.2017
[8].刘俊杰.酵母RNA外切体复合物的冷冻电镜结构分析[D].清华大学.2016
[9].刘洋.金黄色葡萄球菌RsmA蛋白以及酿酒酵母ISW2染色体重塑复合物的结构初探[D].中国科学技术大学.2015
[10].吕红.裂殖酵母SAGA复合物亚基Spt20调控了胞裂蛋白环的组装[C].2014全球华人遗传学大会全国第十叁次医学遗传学学术会议论文汇编.2014