引物序列会查重吗
2022-04-14阅读(590)
问：相同基因位点pcr的引物序列相同吗
- 答：你的题目我不是很理解，你是打算从不同的模板里扩出相同的基因吗？如果是的话，你的引物当然是可以通用的，pcr引物的序列完全取决于你的目标基因序列，如果你想通过PCR在目标基因外侧加不同的序列，那就要用不同的引物了
问：PCR引物序列在国外生物医学期刊投稿中要验证吗？
- 答：引物序列一般不需要验证，放在附表里就行了
NCBI中没有引物提交这个功能吧。。。
问：细菌耐药基因一样，为什么查文献看到每个文献中引物序列不一样
- 答：mecA是一个基因吗？如果是，那么不同文献里面所取的基因位置可能是不同的，扩增的位置也不同。你做这个PCR是为了看有没有这个基因存在，还是什么别的？如果只是看是否存在，那随便用里面的一对引物做PCR即可。
问：测序以后拿回来的DNA序列，怎么判断它的里面有没有引物序列？如果有的话怎么切除引物序列？谢谢！
- 答：是否有引物序列要看你是如何测序的，如果短片段700个碱基以内双向测序且测序结果很好的情况下，应该能看到两端引物序列，如果是单向测序会看到一端引物序列；长片段一般是看不到引物序列的。你说的切除引物序列是在测序结果上，还是产物上，如果测序结果切除的话，找到对应序列删除就可以了，产物上的，就看你设计引物时是否带酶切位点了。
- 答：比对呀，之前的引物序列你是知道的，从测序结果里搜索就可以了。切除引物，可以再引物里设计一对酶切位点
- 答：好吧，测序结果里是不可能有引物的序列，这是由Sanger测序原理决定的。
问：如何根据引物来反查DNA序列
- 答：1.登陆NCBI网站2.在上排找到BLAST,点击进入,我只用过Old blast,你可以点击Old blast的连接进入。3.找到Search for short, nearly exact matches，点击进入4.在serch框中输入你的引物的序列，可以先输上游引物，点击blast,然后点击format5.根据你的引物的特点以及扩增片段的种属来源等选择e value值最高的那一个，点击进入既能找到你要的dna序列
问：做PCR需要用的引物序列有，但不知道是不是对的，我想测试下，如何测试，有高手指点吗？
- 答：你如果把你的东西拿给公司做，他们就会给你设计引物。我们做qPCR，就可以找公司做引物，自己做了不对的话，他也会帮你看。
- 答：推荐NCBI的primer blast，可以测试引物的特异性
如果是想看引物的具体属性，例如Tm，GC，hairpin之类的，你可以装个单机版的 Primer Premier 6
问：测出来的序列里找不到pcr 引物序列
- 答：你拿到的测序结果，是从引物开始后面30－50个碱基以后开始的序列，引物序列是看不到的。这个和测序机器的性能有关。一般从引物开始的一小段序列出峰会很不稳定，有稳定峰图可以读出序列一般都是20－30个碱基之后了。你手头若是有峰图结果你看看最开始那段的峰图就知道了。
至于拿到的序列到底是什么，ncbi上blast一下不就什么都知道了 - 答：你看看你的测序结果是不是你连接的测序载体。
- 答：当然找不到了
测出来的是引物的互补序列
而不是引物序列
只要测序成功
是肯定能找到互补序列的 - 答：有可能是你根本没扩出来东西.还有就是在扩增的过程中你的引物导致整个扩增发生原位突变,使的你阔增出来的片段在某个位点突变.这样的话你可以在查找过程中将引物序列减少一部分在查找
问：PCR的引物的序列是怎么回事 随便的一段吗？ PCR的引物有几种？
- 答：根据扩增目标、实验方案和引物设计的原则用专门的软件设计的。大部分情况下不同的扩增目标需要设计不同的引物，除此之外还有随机引物，随机扩增的时候用的，还有反转录用的oligo d(T)和随机引物也是引物。第二问不明白你想问什么
- 答：想了解PCR引物序列建议你i先看看PCR设计引物的原则
