鹿志伟:基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析论文

鹿志伟:基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析论文

本文主要研究内容

作者鹿志伟,侯晓婉,杨子平,张燕梅,李俊峰,周文钊(2019)在《基于转录组的剑麻ARF基因家族的鉴定及表达分析》一文中研究指出:生长素反应因子(Auxin Response Factors, ARFs)是植物特有的多基因转录因子家族,参与植物生长发育过程的调节。本研究基于转录组数据,通过生物信息学方法鉴定剑麻ARF基因家族成员,同时对其进行相关生物信息学分析。结果表明:在剑麻中共鉴定得到15个ARF基因,并依次命名为AhARF1~15。其编码的蛋白质含有409~1011个氨基酸,分子量约为45.17~112.13 ku,等电点为5.17~9.34。亚细胞定位预测结果显示,13个AhARFs定位于细胞核,2个AhARFs定位于叶绿体。保守结构域分析结果表明,AhARFs基因家族有8个成员同时含有B3、ARF和Aux/IAA这3个相对保守的结构域,其他成员仅含有B3和ARF这2个结构域。进化树分析表明,剑麻AhARFs蛋白可分为5个亚家族。15个剑麻AhARFs基因在剑麻紫色卷叶病不同发病时期呈现不同的表达规律。本研究为进一步深入探索剑麻ARF基因家族的功能奠定了重要理论基础。

Abstract

sheng chang su fan ying yin zi (Auxin Response Factors, ARFs)shi zhi wu te you de duo ji yin zhuai lu yin zi jia zu ,can yu zhi wu sheng chang fa yo guo cheng de diao jie 。ben yan jiu ji yu zhuai lu zu shu ju ,tong guo sheng wu xin xi xue fang fa jian ding jian ma ARFji yin jia zu cheng yuan ,tong shi dui ji jin hang xiang guan sheng wu xin xi xue fen xi 。jie guo biao ming :zai jian ma zhong gong jian ding de dao 15ge ARFji yin ,bing yi ci ming ming wei AhARF1~15。ji bian ma de dan bai zhi han you 409~1011ge an ji suan ,fen zi liang yao wei 45.17~112.13 ku,deng dian dian wei 5.17~9.34。ya xi bao ding wei yu ce jie guo xian shi ,13ge AhARFsding wei yu xi bao he ,2ge AhARFsding wei yu xie lu ti 。bao shou jie gou yu fen xi jie guo biao ming ,AhARFsji yin jia zu you 8ge cheng yuan tong shi han you B3、ARFhe Aux/IAAzhe 3ge xiang dui bao shou de jie gou yu ,ji ta cheng yuan jin han you B3he ARFzhe 2ge jie gou yu 。jin hua shu fen xi biao ming ,jian ma AhARFsdan bai ke fen wei 5ge ya jia zu 。15ge jian ma AhARFsji yin zai jian ma zi se juan xie bing bu tong fa bing shi ji cheng xian bu tong de biao da gui lv 。ben yan jiu wei jin yi bu shen ru tan suo jian ma ARFji yin jia zu de gong neng dian ding le chong yao li lun ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自热带作物学报的鹿志伟,侯晓婉,杨子平,张燕梅,李俊峰,周文钊,发表于刊物热带作物学报2019年10期论文,是一篇关于剑麻论文,基因家族论文,转录组论文,热带作物学报2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自热带作物学报2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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