本文主要研究内容
作者杨平,谢寿安,巩雪芳,车显荣,王延来,吕淑杰（2019）在《花椒窄吉丁转录组及化学感受相关基因的分析》一文中研究指出：【目的】建立花椒窄吉丁Agrilus zanthoxylumi转录组数据库,挖掘其基因组数据。【方法】采用高通量测序平台Illumina NovaSeq6000对花椒窄吉丁成虫不同组织(触角、头、胸、腹、足、翅)进行转录组测序、序列组装,使用BLAST软件将花椒窄吉丁unigenes序列与公共数据库进行比对,BLAST同源性搜索的方法从中筛选出与其化学感受相关的基因,并与其他已研究发表的鞘翅目昆虫化学感受相关基因的核酸序列比对,进行系统发育分析。利用RPKM值对这些基因在花椒窄吉丁成虫不同组织中的表达量进行分析。【结果】经测序及序列拼接后共得到80 320条unigenes和169 398条contigs,其G+C比例分别是37.63%和39.18%,平均长度分别为828.75和1 084.33 bp; unigenes长度主要分布在200～400 bp的共有37 374条,占全部unigenes的46.53%。在NR数据库中注释的与花椒窄吉丁转录组相似基因所属物种分布为赤拟谷盗Tribolium castaneum所占比例26.80%,其后依次是小家鼠Mus musculus(13.87%),蛀犀金龟Oryctes borbonicus(5.26%),山松甲虫Dendroctonus ponderosae(4.10%),黑蚁Lasius niger(2.36%),其他物种所占比例是47.61%。在GO数据库中比对到27 488个unigenes,可分为分子功能、细胞组分和生物学进程三大类共59个过程;利用KOG数据库功能注释分为25类,注释到unigenes最多功能类别的是普通功能,共4 666个,最少的是与细胞移动相关,共40个;将80 320个unigenes映射到KEGG数据库中,21 104条unigens注释到代谢通路35个,占26.27%,注释最多的代谢途径是转录途径,共涉及到2 037条unigenes。从NR数据库中共注释到8个气味受体(odorant receptor, OR)基因、7个离子型受体(ionotropic receptor, IR)基因和6个味觉受体(gustatory receptor, GR)基因,各组织中的基因表达量分析发现,这3类化学感受相关基因在成虫触角中的表达量显著高于其他组织中的表达量,雌、雄触角中表达量差异最显著的为AzanOR1,而在雌、雄成虫足中这3类化学感受相关基因表达量没有差异。【结论】本研究首次获得了花椒窄吉丁转录组数据,为进一步研究花椒窄吉丁的基因功能奠定了分子基础。
Abstract
【mu de 】jian li hua jiao zhai ji ding Agrilus zanthoxylumizhuai lu zu shu ju ku ,wa jue ji ji yin zu shu ju 。【fang fa 】cai yong gao tong liang ce xu ping tai Illumina NovaSeq6000dui hua jiao zhai ji ding cheng chong bu tong zu zhi (chu jiao 、tou 、xiong 、fu 、zu 、chi )jin hang zhuai lu zu ce xu 、xu lie zu zhuang ,shi yong BLASTruan jian jiang hua jiao zhai ji ding unigenesxu lie yu gong gong shu ju ku jin hang bi dui ,BLASTtong yuan xing sou suo de fang fa cong zhong shai shua chu yu ji hua xue gan shou xiang guan de ji yin ,bing yu ji ta yi yan jiu fa biao de qiao chi mu kun chong hua xue gan shou xiang guan ji yin de he suan xu lie bi dui ,jin hang ji tong fa yo fen xi 。li yong RPKMzhi dui zhe xie ji yin zai hua jiao zhai ji ding cheng chong bu tong zu zhi zhong de biao da liang jin hang fen xi 。【jie guo 】jing ce xu ji xu lie pin jie hou gong de dao 80 320tiao unigeneshe 169 398tiao contigs,ji G+Cbi li fen bie shi 37.63%he 39.18%,ping jun chang du fen bie wei 828.75he 1 084.33 bp; unigeneschang du zhu yao fen bu zai 200～400 bpde gong you 37 374tiao ,zhan quan bu unigenesde 46.53%。zai NRshu ju ku zhong zhu shi de yu hua jiao zhai ji ding zhuai lu zu xiang shi ji yin suo shu wu chong fen bu wei chi ni gu dao Tribolium castaneumsuo zhan bi li 26.80%,ji hou yi ci shi xiao jia shu Mus musculus(13.87%),zhu xi jin gui Oryctes borbonicus(5.26%),shan song jia chong Dendroctonus ponderosae(4.10%),hei yi Lasius niger(2.36%),ji ta wu chong suo zhan bi li shi 47.61%。zai GOshu ju ku zhong bi dui dao 27 488ge unigenes,ke fen wei fen zi gong neng 、xi bao zu fen he sheng wu xue jin cheng san da lei gong 59ge guo cheng ;li yong KOGshu ju ku gong neng zhu shi fen wei 25lei ,zhu shi dao unigeneszui duo gong neng lei bie de shi pu tong gong neng ,gong 4 666ge ,zui shao de shi yu xi bao yi dong xiang guan ,gong 40ge ;jiang 80 320ge unigenesying she dao KEGGshu ju ku zhong ,21 104tiao unigenszhu shi dao dai xie tong lu 35ge ,zhan 26.27%,zhu shi zui duo de dai xie tu jing shi zhuai lu tu jing ,gong she ji dao 2 037tiao unigenes。cong NRshu ju ku zhong gong zhu shi dao 8ge qi wei shou ti (odorant receptor, OR)ji yin 、7ge li zi xing shou ti (ionotropic receptor, IR)ji yin he 6ge wei jiao shou ti (gustatory receptor, GR)ji yin ,ge zu zhi zhong de ji yin biao da liang fen xi fa xian ,zhe 3lei hua xue gan shou xiang guan ji yin zai cheng chong chu jiao zhong de biao da liang xian zhe gao yu ji ta zu zhi zhong de biao da liang ,ci 、xiong chu jiao zhong biao da liang cha yi zui xian zhe de wei AzanOR1,er zai ci 、xiong cheng chong zu zhong zhe 3lei hua xue gan shou xiang guan ji yin biao da liang mei you cha yi 。【jie lun 】ben yan jiu shou ci huo de le hua jiao zhai ji ding zhuai lu zu shu ju ,wei jin yi bu yan jiu hua jiao zhai ji ding de ji yin gong neng dian ding le fen zi ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自昆虫学报的杨平,谢寿安,巩雪芳,车显荣,王延来,吕淑杰，发表于刊物昆虫学报2019年05期论文，是一篇关于花椒窄吉丁论文,转录组论文,高通量测序论文,基因注释论文,生物信息学论文,昆虫学报2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自昆虫学报2019年05期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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