本文主要研究内容
作者刘丽娟,董然然,王开功,程振涛,文明,温贵兰,李晨,杨琦,周碧君（2019）在《敲除小RNA gcvB后沙门菌的转录组分析》一文中研究指出：为筛选与沙门菌小RNA gcvB相关的靶基因,采用高通量的转录组测序(RNA-seq)技术对野生型沙门菌和敲除小RNA gcvB沙门菌的mRNA进行对比分析,全面地预测GcvB的靶基因的数量与种类,通过GO和KEGG数据库对筛选基因进行比对注释,进一步分析筛选基因的主要功能及涉及的生物过程。并利用荧光定量PCR对部分差异表达基因进行验证。结果显示:差异表达基因共1 244个,其中基因表达上调678个,基因表达下调566个。GO富集分析显示,差异表达基因主要涉及氧化还原活性、铁离子结合、运动活性等分子功能,细菌鞭毛的细胞成分,细胞呼吸、钴胺素代谢过程和钴胺素生物合成过程等生物过程。KEGG数据库分析显示,差异表达基因主要参与细菌趋化性、卟啉和叶绿素代谢、不同环境中的微生物代谢、双组分系统、甲烷代谢等14个信号通路。对筛选出的10个差异表达基因进行荧光定量PCR验证,结果显示:差异表达基因相对表达量与RNA-seq测序结果基本一致。本研究为进一步探明小RNA gcvB与靶基因相互作用、小RNA的调控机制,以及沙门菌致病机制奠定了基础。
Abstract
wei shai shua yu sha men jun xiao RNA gcvBxiang guan de ba ji yin ,cai yong gao tong liang de zhuai lu zu ce xu (RNA-seq)ji shu dui ye sheng xing sha men jun he qiao chu xiao RNA gcvBsha men jun de mRNAjin hang dui bi fen xi ,quan mian de yu ce GcvBde ba ji yin de shu liang yu chong lei ,tong guo GOhe KEGGshu ju ku dui shai shua ji yin jin hang bi dui zhu shi ,jin yi bu fen xi shai shua ji yin de zhu yao gong neng ji she ji de sheng wu guo cheng 。bing li yong ying guang ding liang PCRdui bu fen cha yi biao da ji yin jin hang yan zheng 。jie guo xian shi :cha yi biao da ji yin gong 1 244ge ,ji zhong ji yin biao da shang diao 678ge ,ji yin biao da xia diao 566ge 。GOfu ji fen xi xian shi ,cha yi biao da ji yin zhu yao she ji yang hua hai yuan huo xing 、tie li zi jie ge 、yun dong huo xing deng fen zi gong neng ,xi jun bian mao de xi bao cheng fen ,xi bao hu xi 、gu an su dai xie guo cheng he gu an su sheng wu ge cheng guo cheng deng sheng wu guo cheng 。KEGGshu ju ku fen xi xian shi ,cha yi biao da ji yin zhu yao can yu xi jun qu hua xing 、bu lin he xie lu su dai xie 、bu tong huan jing zhong de wei sheng wu dai xie 、shuang zu fen ji tong 、jia wan dai xie deng 14ge xin hao tong lu 。dui shai shua chu de 10ge cha yi biao da ji yin jin hang ying guang ding liang PCRyan zheng ,jie guo xian shi :cha yi biao da ji yin xiang dui biao da liang yu RNA-seqce xu jie guo ji ben yi zhi 。ben yan jiu wei jin yi bu tan ming xiao RNA gcvByu ba ji yin xiang hu zuo yong 、xiao RNAde diao kong ji zhi ,yi ji sha men jun zhi bing ji zhi dian ding le ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自畜牧兽医学报的刘丽娟,董然然,王开功,程振涛,文明,温贵兰,李晨,杨琦,周碧君，发表于刊物畜牧兽医学报2019年04期论文，是一篇关于沙门菌论文,转录组测序论文,靶基因论文,畜牧兽医学报2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自畜牧兽医学报2019年04期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：沙门菌论文; 转录组测序论文; 靶基因论文; 畜牧兽医学报2019年04期论文;