廖琼:甘蓝型油菜钙离子转运蛋白CAX家族基因生物信息学及其对镉胁迫响应表达分析论文

廖琼:甘蓝型油菜钙离子转运蛋白CAX家族基因生物信息学及其对镉胁迫响应表达分析论文

本文主要研究内容

作者廖琼,周婷,肖燕,唐天骄,宋海星,官春云,华营鹏,张振华(2019)在《甘蓝型油菜钙离子转运蛋白CAX家族基因生物信息学及其对镉胁迫响应表达分析》一文中研究指出:CAXs(Cation/H+ exchanger antiporter)是一类重要的阳离子跨膜转运蛋白,在调控植物Ca2+平衡,参与转运金属离子Cd2+和Mn2+中发挥了重要作用,但在甘蓝型油菜中尚缺乏系统研究。本文利用生物信息学的方法对甘蓝型油菜CAX家族成员的基因拷贝数、系统进化、进化选择压力、分子特征、保守基序、染色体定位、基因结构及其启动子区域所能结合的顺式作用元件进行了预测和分析;同时采用荧光定量PCR分析了甘蓝型油菜BnaCAXs的组织表达模式及其对Cd2+胁迫的响应。结果表明,甘蓝型油菜CAX家族共包含17个成员,系统进化分析结果表明BnaCAXs与拟南芥进化相似,并且明显地分为5个亚家族。BnaCAXs家族所有基因成员的Ka/Ks值均小于0.3,受到强烈的纯化选择作用。大部分BnaCAXs均属于稳定的疏水蛋白,并包含8~11个跨膜结构域。基因结构差异明显,内含子数目从6~11不等,并且Dof、MYB以及W-BOX是其启动子上丰度较大的顺式作用元件,可能参与到BnaCAX抗逆过程的调控。荧光定量PCR结果表明,甘蓝型油菜CAX基因主要在地下部表达;BnaC4.CAX1-2和BnaC3.CAX2-2是该家族的核心基因,并受到Cd2+胁迫的显著诱导。

Abstract

CAXs(Cation/H+ exchanger antiporter)shi yi lei chong yao de yang li zi kua mo zhuai yun dan bai ,zai diao kong zhi wu Ca2+ping heng ,can yu zhuai yun jin shu li zi Cd2+he Mn2+zhong fa hui le chong yao zuo yong ,dan zai gan lan xing you cai zhong shang que fa ji tong yan jiu 。ben wen li yong sheng wu xin xi xue de fang fa dui gan lan xing you cai CAXjia zu cheng yuan de ji yin kao bei shu 、ji tong jin hua 、jin hua shua ze ya li 、fen zi te zheng 、bao shou ji xu 、ran se ti ding wei 、ji yin jie gou ji ji qi dong zi ou yu suo neng jie ge de shun shi zuo yong yuan jian jin hang le yu ce he fen xi ;tong shi cai yong ying guang ding liang PCRfen xi le gan lan xing you cai BnaCAXsde zu zhi biao da mo shi ji ji dui Cd2+xie pai de xiang ying 。jie guo biao ming ,gan lan xing you cai CAXjia zu gong bao han 17ge cheng yuan ,ji tong jin hua fen xi jie guo biao ming BnaCAXsyu ni na gai jin hua xiang shi ,bing ju ming xian de fen wei 5ge ya jia zu 。BnaCAXsjia zu suo you ji yin cheng yuan de Ka/Kszhi jun xiao yu 0.3,shou dao jiang lie de chun hua shua ze zuo yong 。da bu fen BnaCAXsjun shu yu wen ding de shu shui dan bai ,bing bao han 8~11ge kua mo jie gou yu 。ji yin jie gou cha yi ming xian ,nei han zi shu mu cong 6~11bu deng ,bing ju Dof、MYByi ji W-BOXshi ji qi dong zi shang feng du jiao da de shun shi zuo yong yuan jian ,ke neng can yu dao BnaCAXkang ni guo cheng de diao kong 。ying guang ding liang PCRjie guo biao ming ,gan lan xing you cai CAXji yin zhu yao zai de xia bu biao da ;BnaC4.CAX1-2he BnaC3.CAX2-2shi gai jia zu de he xin ji yin ,bing shou dao Cd2+xie pai de xian zhe you dao 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自植物生理学报的廖琼,周婷,肖燕,唐天骄,宋海星,官春云,华营鹏,张振华,发表于刊物植物生理学报2019年05期论文,是一篇关于甘蓝型油菜论文,镉胁迫论文,生物信息学论文,植物生理学报2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自植物生理学报2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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