梁桂红:甘蓝型油菜NRT1.5和NRT1.8家族基因的生物信息学分析及其对氮-镉胁迫的响应论文

梁桂红:甘蓝型油菜NRT1.5和NRT1.8家族基因的生物信息学分析及其对氮-镉胁迫的响应论文

本文主要研究内容

作者梁桂红,华营鹏,周婷,廖琼,宋海星,张振华(2019)在《甘蓝型油菜NRT1.5和NRT1.8家族基因的生物信息学分析及其对氮-镉胁迫的响应》一文中研究指出:植物对硝酸盐的吸收和转运需要硝酸盐转运体(nitratetransporters,NRTs)的协助。在拟南芥中,硝酸盐的长途转运及其在根部和地上部的分配,主要受NRT1家族的两个成员NRT1.5和NRT1.8的协同调控,且两者的表达均受到硝酸盐的强烈诱导。本文以AtNRT1.5和AtNRT1.8基因序列为基础序列,采用生物信息学方法鉴定了白菜、甘蓝和甘蓝型油菜中NRT1.5和NRT1.8同源基因,并对基因结构和分子特性、基因拷贝数变异、基因染色体分布、系统进化树、蛋白保守序列比对和跨膜结构域、基因响应低氮和镉胁迫的转录组测序以及基因共表达网络进行了分析。结果表明,白菜、甘蓝及甘蓝型油菜中NRT1.5和NRT1.8蛋白均含有保守的跨膜结构域和保守基序(F-Y-L-A-L-N-LG-S-L),属于MFS (major facilitator superfamily)超家族的小肽转运体PTR (peptide transporter)家族。转录组测序结果表明,甘蓝型油菜低氮处理72 h,根部NRT1.5基因的表达丰度上调而抑制NRT1.8的表达;镉处理条件下,乙烯/茉莉酸-硝酸盐转运体介导的信号途径能够促进NRT1.8表达上调而抑制NRT1.5的表达,从而使更多的硝酸盐从地上部运输到根部,提高植物抗镉胁迫的能力。本研究为进一步了解甘蓝型油菜NRT1.5和NRT1.8家族基因的生物学功能及其对氮-镉胁迫的响应奠定基础,同时为NRT1.5和NRT1.8家族基因在其他物种中的生物信息学研究提供参考。

Abstract

zhi wu dui xiao suan yan de xi shou he zhuai yun xu yao xiao suan yan zhuai yun ti (nitratetransporters,NRTs)de xie zhu 。zai ni na gai zhong ,xiao suan yan de chang tu zhuai yun ji ji zai gen bu he de shang bu de fen pei ,zhu yao shou NRT1jia zu de liang ge cheng yuan NRT1.5he NRT1.8de xie tong diao kong ,ju liang zhe de biao da jun shou dao xiao suan yan de jiang lie you dao 。ben wen yi AtNRT1.5he AtNRT1.8ji yin xu lie wei ji chu xu lie ,cai yong sheng wu xin xi xue fang fa jian ding le bai cai 、gan lan he gan lan xing you cai zhong NRT1.5he NRT1.8tong yuan ji yin ,bing dui ji yin jie gou he fen zi te xing 、ji yin kao bei shu bian yi 、ji yin ran se ti fen bu 、ji tong jin hua shu 、dan bai bao shou xu lie bi dui he kua mo jie gou yu 、ji yin xiang ying di dan he ge xie pai de zhuai lu zu ce xu yi ji ji yin gong biao da wang lao jin hang le fen xi 。jie guo biao ming ,bai cai 、gan lan ji gan lan xing you cai zhong NRT1.5he NRT1.8dan bai jun han you bao shou de kua mo jie gou yu he bao shou ji xu (F-Y-L-A-L-N-LG-S-L),shu yu MFS (major facilitator superfamily)chao jia zu de xiao tai zhuai yun ti PTR (peptide transporter)jia zu 。zhuai lu zu ce xu jie guo biao ming ,gan lan xing you cai di dan chu li 72 h,gen bu NRT1.5ji yin de biao da feng du shang diao er yi zhi NRT1.8de biao da ;ge chu li tiao jian xia ,yi xi /mo li suan -xiao suan yan zhuai yun ti jie dao de xin hao tu jing neng gou cu jin NRT1.8biao da shang diao er yi zhi NRT1.5de biao da ,cong er shi geng duo de xiao suan yan cong de shang bu yun shu dao gen bu ,di gao zhi wu kang ge xie pai de neng li 。ben yan jiu wei jin yi bu le jie gan lan xing you cai NRT1.5he NRT1.8jia zu ji yin de sheng wu xue gong neng ji ji dui dan -ge xie pai de xiang ying dian ding ji chu ,tong shi wei NRT1.5he NRT1.8jia zu ji yin zai ji ta wu chong zhong de sheng wu xin xi xue yan jiu di gong can kao 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自作物学报的梁桂红,华营鹏,周婷,廖琼,宋海星,张振华,发表于刊物作物学报2019年03期论文,是一篇关于甘蓝型油菜论文,生物信息学论文,硝酸盐论文,作物学报2019年03期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自作物学报2019年03期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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