本文主要研究内容
作者方强强,王燕(2019)在《岩陀ITS2片段PCR扩增条件优化及物种鉴别研究》一文中研究指出:以岩陀植物叶片为材料,利用试剂盒提取方法提取植物叶片中的DNA,对ITS2序列进行PCR扩增条件优化并对ITS2序列鉴别物种能力进行考察;通过单因素实验分别研究退火温度、DNA模板量、循环次数等因素对岩陀DNA条形码鉴别中所选的ITS2序列扩增反应的影响,并对扩增体系进行优化,采用Seqman7.1软件对测序峰图进行校对拼接,应用MEGA计算种内种间遗传距离,采用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树;结果表明:优化后的PCR扩增反应体系总体积为25μL,含TaqPCR Master Mix 12.5μL、DNA模板量5ng、上下游引物(10mol/L)各1μL、dd H2O 9.5μL,ITS2序列在退火温度设置为60℃,循环次数为30次的条件下进行PCR扩增,获得清晰单一的电泳条带,ITS2测序成功率100%,比对后的序列长度475bp,GC含量约50%,种内种间变异存在重叠,没有明显的Barcoding gap;结论:通过试剂盒提取岩陀植物叶片DNA,在优化后的PCR扩增反应体系对ITS2序列进行扩增,可以满足后续对鬼灯檠属多基原植物岩陀的亲缘关系、物种鉴别和遗传多样性等领域的研究,但ITS2序列不适合岩陀种DNA条形码鉴别。
Abstract
yi yan tuo zhi wu xie pian wei cai liao ,li yong shi ji he di qu fang fa di qu zhi wu xie pian zhong de DNA,dui ITS2xu lie jin hang PCRkuo zeng tiao jian you hua bing dui ITS2xu lie jian bie wu chong neng li jin hang kao cha ;tong guo chan yin su shi yan fen bie yan jiu tui huo wen du 、DNAmo ban liang 、xun huan ci shu deng yin su dui yan tuo DNAtiao xing ma jian bie zhong suo shua de ITS2xu lie kuo zeng fan ying de ying xiang ,bing dui kuo zeng ti ji jin hang you hua ,cai yong Seqman7.1ruan jian dui ce xu feng tu jin hang jiao dui pin jie ,ying yong MEGAji suan chong nei chong jian wei chuan ju li ,cai yong lin jie fa (neighbor-joining,NJ)gou jian ji tong fa yo shu ;jie guo biao ming :you hua hou de PCRkuo zeng fan ying ti ji zong ti ji wei 25μL,han TaqPCR Master Mix 12.5μL、DNAmo ban liang 5ng、shang xia you yin wu (10mol/L)ge 1μL、dd H2O 9.5μL,ITS2xu lie zai tui huo wen du she zhi wei 60℃,xun huan ci shu wei 30ci de tiao jian xia jin hang PCRkuo zeng ,huo de qing xi chan yi de dian yong tiao dai ,ITS2ce xu cheng gong lv 100%,bi dui hou de xu lie chang du 475bp,GChan liang yao 50%,chong nei chong jian bian yi cun zai chong die ,mei you ming xian de Barcoding gap;jie lun :tong guo shi ji he di qu yan tuo zhi wu xie pian DNA,zai you hua hou de PCRkuo zeng fan ying ti ji dui ITS2xu lie jin hang kuo zeng ,ke yi man zu hou xu dui gui deng qing shu duo ji yuan zhi wu yan tuo de qin yuan guan ji 、wu chong jian bie he wei chuan duo yang xing deng ling yu de yan jiu ,dan ITS2xu lie bu kuo ge yan tuo chong DNAtiao xing ma jian bie 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自现代园艺的方强强,王燕,发表于刊物现代园艺2019年05期论文,是一篇关于岩陀论文,提取论文,核糖体论文,扩增条件论文,测序论文,分子鉴别论文,现代园艺2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自现代园艺2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。