方强强:岩陀ITS2片段PCR扩增条件优化及物种鉴别研究论文

方强强:岩陀ITS2片段PCR扩增条件优化及物种鉴别研究论文

本文主要研究内容

作者方强强,王燕(2019)在《岩陀ITS2片段PCR扩增条件优化及物种鉴别研究》一文中研究指出:以岩陀植物叶片为材料,利用试剂盒提取方法提取植物叶片中的DNA,对ITS2序列进行PCR扩增条件优化并对ITS2序列鉴别物种能力进行考察;通过单因素实验分别研究退火温度、DNA模板量、循环次数等因素对岩陀DNA条形码鉴别中所选的ITS2序列扩增反应的影响,并对扩增体系进行优化,采用Seqman7.1软件对测序峰图进行校对拼接,应用MEGA计算种内种间遗传距离,采用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建系统发育树;结果表明:优化后的PCR扩增反应体系总体积为25μL,含TaqPCR Master Mix 12.5μL、DNA模板量5ng、上下游引物(10mol/L)各1μL、dd H2O 9.5μL,ITS2序列在退火温度设置为60℃,循环次数为30次的条件下进行PCR扩增,获得清晰单一的电泳条带,ITS2测序成功率100%,比对后的序列长度475bp,GC含量约50%,种内种间变异存在重叠,没有明显的Barcoding gap;结论:通过试剂盒提取岩陀植物叶片DNA,在优化后的PCR扩增反应体系对ITS2序列进行扩增,可以满足后续对鬼灯檠属多基原植物岩陀的亲缘关系、物种鉴别和遗传多样性等领域的研究,但ITS2序列不适合岩陀种DNA条形码鉴别。

Abstract

yi yan tuo zhi wu xie pian wei cai liao ,li yong shi ji he di qu fang fa di qu zhi wu xie pian zhong de DNA,dui ITS2xu lie jin hang PCRkuo zeng tiao jian you hua bing dui ITS2xu lie jian bie wu chong neng li jin hang kao cha ;tong guo chan yin su shi yan fen bie yan jiu tui huo wen du 、DNAmo ban liang 、xun huan ci shu deng yin su dui yan tuo DNAtiao xing ma jian bie zhong suo shua de ITS2xu lie kuo zeng fan ying de ying xiang ,bing dui kuo zeng ti ji jin hang you hua ,cai yong Seqman7.1ruan jian dui ce xu feng tu jin hang jiao dui pin jie ,ying yong MEGAji suan chong nei chong jian wei chuan ju li ,cai yong lin jie fa (neighbor-joining,NJ)gou jian ji tong fa yo shu ;jie guo biao ming :you hua hou de PCRkuo zeng fan ying ti ji zong ti ji wei 25μL,han TaqPCR Master Mix 12.5μL、DNAmo ban liang 5ng、shang xia you yin wu (10mol/L)ge 1μL、dd H2O 9.5μL,ITS2xu lie zai tui huo wen du she zhi wei 60℃,xun huan ci shu wei 30ci de tiao jian xia jin hang PCRkuo zeng ,huo de qing xi chan yi de dian yong tiao dai ,ITS2ce xu cheng gong lv 100%,bi dui hou de xu lie chang du 475bp,GChan liang yao 50%,chong nei chong jian bian yi cun zai chong die ,mei you ming xian de Barcoding gap;jie lun :tong guo shi ji he di qu yan tuo zhi wu xie pian DNA,zai you hua hou de PCRkuo zeng fan ying ti ji dui ITS2xu lie jin hang kuo zeng ,ke yi man zu hou xu dui gui deng qing shu duo ji yuan zhi wu yan tuo de qin yuan guan ji 、wu chong jian bie he wei chuan duo yang xing deng ling yu de yan jiu ,dan ITS2xu lie bu kuo ge yan tuo chong DNAtiao xing ma jian bie 。

论文参考文献

  • [1].基于ITS2序列的朱砂根及其混伪品分子鉴定[J]. 陈新连,周建国,马双姣,姚辉,林余霖,王瑀.  中国现代中药.2017(07)
  • [2].ITS2序列鉴别10种杜鹃属药用植物[J]. 刘义梅,张乐华,陈士林,陈科力.  中药材.2011(09)
  • [3].ITS2序列鉴定十大功劳属药用植物[J]. 明孟碟,张超,严绪华,刘美霞,夏叶,杨红兵,胡志刚.  中国现代中药.2015(10)
  • [4].基于ITS2条形码对铁皮石斛及其混伪品分子鉴定的初步研究[J]. 刘依丽,冯尚国,何仁锋,赵妙玉,吴慧,崔艺庆,陈倩,王慧中.  杭州师范大学学报(自然科学版).2014(01)
  • [5].ITS2条形码对白及属植物的初步分析研究[J]. 宋爽,周洋帆,黄丽,杨娟,文国松,徐绍忠,查应洪,赵明富,赵昶灵.  云南农业大学学报(自然科学).2017(01)
  • [6].基于ITS2序列的维吾尔药材蜀葵及其近缘种鉴定研究[J]. 樊丛照,坤杜孜·阿依,李晓瑾.  中国现代中药.2016(10)
  • [7].市售中药材冬葵子和苘麻子ITS2条形码鉴定[J]. 高婷,辛天怡,宋洁洁,宋经元.  中草药.2017(13)
  • [8].贵州苗药虎耳草及近缘种基于ITS2序列的鉴定研究[J]. 郑春辉,杨永敏,吴春贵,梁凯乾,田晓红,魏妮娜.  遵义医学院学报.2018(01)
  • [9].基于菊科紫菀族ITS2二级结构的预测和比较分析[J]. 王毅,刘秋宇,李刚,刘虹,覃瑞.  中南民族大学学报(自然科学版).2015(04)
  • [10].基于ITS2序列的禹州漏芦和漏芦药材基因识别[J]. 陈江平,侯典云,严绪华,胡志强,魏蒙,胡志刚,汪乐原.  世界科学技术-中医药现代化.2016(02)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自现代园艺的方强强,王燕,发表于刊物现代园艺2019年05期论文,是一篇关于岩陀论文,提取论文,核糖体论文,扩增条件论文,测序论文,分子鉴别论文,现代园艺2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自现代园艺2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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