本文主要研究内容
作者闵婕（2019）在《基于细菌全基因组技术对AMDY2-9-2的氧化硫能力研究》一文中研究指出：AMDY2-9-2由安徽铜陵酸性矿水样品中分离纯化得到。安徽铜陵废矿区环境具有含铁硫化矿物,重金属含量高,pH低等特征,酸性矿区环境形成的原因一方面源自于含硫化物化学反应,另一方面可能源自于矿区微生物群落氧化硫产生的S042-等酸性硫化物。因此,为了研究硫氧化微生物在酸性环境形成中的作用,本实验以AMDY2-9-2为研究对象,利用细菌全基因组技术,重点研究AMDY2-9-2的硫氧化能力。在通过De novo全基因组技术获得AMDY2-9-2全部基因后,利用现有通用数据库,对基因进行注释,由此可获得AMDY2-9-2硫氧化基因及其可能的硫氧化通路;此外,通过比较基因组的手段,将AMDY2-9-2基因与典型硫氧化菌株做共线性,基因家族等信息分析,获得AMDY2-9-2硫氧化基因可能的定位,作用方式及进化等信息,为深入的实验研究指明方向。根据AMDY2-9-2全基因组的结果,通过在其培养环境中添加不同浓度,不同粒径的单质硫以研究其对单质硫的氧化情况,此外,通过改变AMDY2-9-2与单质硫的接触方式以及培养环境中电子受体,研究其氧化单质硫的方式以及硫氧化功能蛋白的作用途径。通过这一系列针对AMDY2-9-2硫氧化能力的研究,旨在发现其氧化硫的方式及关键环节。希望通过后期人为干预的方式减缓其硫氧化进程,以此达到缓解及治理矿区环境酸化现象。在经GOG,GO及KEGG数据库注释及比较基因组的生物信息分析后,AMDY2-9-2基因数据显示出了其独立的硫氧化基因体系,但并未显示出独立的铁还原基因体系;与铁代谢有关的基因多以铁硫簇的形式存在。这就表明,AMDY2-9-2的铁还原功能与硫代谢功能可能是偶联的。此外,AMDY2-9-2中编码铁硫代谢过程的基因同时也编码其他生理过程,如氨基酸代谢,碳循环等,因此,在菌株存在的环境中所发现的如SO42-,Fe2+等指征硫氧化及铁还原的标记物,并不完全意味着AMDY2-9-2即具有硫氧化-还原铁偶联能力,因这些物质亦有可能是其他生理过程的中间产物。因此,只有结合了基因水平的实验结果与理化实验结果,才可最终确认AMDY2-9-2的铁硫代谢功能。在生理生化实验部分,我们以菌体生长量,pH,Eh,SO42-以及Fe2+浓度来表征和衡量单质硫的氧化程度及单质硫氧化-铁还原的偶联程度。研究结果显示,当培养基中单质硫添加量小于等于6g/L时,AMDY2-9-2对单质硫的氧化能力与单质硫添加量呈正相关;当添加同样浓度的单质硫时,所添加的单质硫粒径越小,AMDY2-9-2对单质硫的氧化程度越高。研究AMDY2-9-2氧化单质硫的作用方式的实验结果表明,AMDY2-9-2氧化单质硫时,AMDY2-9-2必须与单质硫有直接或间接的接触,并且只有在菌体完整且具有生物活性的条件下才能参与单质硫的氧化过程;此外,在硫氧化过程中,氧和Fe3+这两种电子受体可同作为电子受体而参与到单质硫的氧化过程,但相比于Fe3+,氧是AMDY2-9-2氧化单质硫的更高效电子受体;该实验结果说明,在缺乏氧受体的情况下,Fe3+是能够作为代替的电子受体参与硫氧化过程,换言之,在乏氧情况下,AMDY2-9-2具有硫氧化-铁还原偶联功能。
Abstract
AMDY2-9-2you an hui tong ling suan xing kuang shui yang pin zhong fen li chun hua de dao 。an hui tong ling fei kuang ou huan jing ju you han tie liu hua kuang wu ,chong jin shu han liang gao ,pHdi deng te zheng ,suan xing kuang ou huan jing xing cheng de yuan yin yi fang mian yuan zi yu han liu hua wu hua xue fan ying ,ling yi fang mian ke neng yuan zi yu kuang ou wei sheng wu qun la yang hua liu chan sheng de S042-deng suan xing liu hua wu 。yin ci ,wei le yan jiu liu yang hua wei sheng wu zai suan xing huan jing xing cheng zhong de zuo yong ,ben shi yan yi AMDY2-9-2wei yan jiu dui xiang ,li yong xi jun quan ji yin zu ji shu ,chong dian yan jiu AMDY2-9-2de liu yang hua neng li 。zai tong guo De novoquan ji yin zu ji shu huo de AMDY2-9-2quan bu ji yin hou ,li yong xian you tong yong shu ju ku ,dui ji yin jin hang zhu shi ,you ci ke huo de AMDY2-9-2liu yang hua ji yin ji ji ke neng de liu yang hua tong lu ;ci wai ,tong guo bi jiao ji yin zu de shou duan ,jiang AMDY2-9-2ji yin yu dian xing liu yang hua jun zhu zuo gong xian xing ,ji yin jia zu deng xin xi fen xi ,huo de AMDY2-9-2liu yang hua ji yin ke neng de ding wei ,zuo yong fang shi ji jin hua deng xin xi ,wei shen ru de shi yan yan jiu zhi ming fang xiang 。gen ju AMDY2-9-2quan ji yin zu de jie guo ,tong guo zai ji pei yang huan jing zhong tian jia bu tong nong du ,bu tong li jing de chan zhi liu yi yan jiu ji dui chan zhi liu de yang hua qing kuang ,ci wai ,tong guo gai bian AMDY2-9-2yu chan zhi liu de jie chu fang shi yi ji pei yang huan jing zhong dian zi shou ti ,yan jiu ji yang hua chan zhi liu de fang shi yi ji liu yang hua gong neng dan bai de zuo yong tu jing 。tong guo zhe yi ji lie zhen dui AMDY2-9-2liu yang hua neng li de yan jiu ,zhi zai fa xian ji yang hua liu de fang shi ji guan jian huan jie 。xi wang tong guo hou ji ren wei gan yu de fang shi jian huan ji liu yang hua jin cheng ,yi ci da dao huan jie ji zhi li kuang ou huan jing suan hua xian xiang 。zai jing GOG,GOji KEGGshu ju ku zhu shi ji bi jiao ji yin zu de sheng wu xin xi fen xi hou ,AMDY2-9-2ji yin shu ju xian shi chu le ji du li de liu yang hua ji yin ti ji ,dan bing wei xian shi chu du li de tie hai yuan ji yin ti ji ;yu tie dai xie you guan de ji yin duo yi tie liu cu de xing shi cun zai 。zhe jiu biao ming ,AMDY2-9-2de tie hai yuan gong neng yu liu dai xie gong neng ke neng shi ou lian de 。ci wai ,AMDY2-9-2zhong bian ma tie liu dai xie guo cheng de ji yin tong shi ye bian ma ji ta sheng li guo cheng ,ru an ji suan dai xie ,tan xun huan deng ,yin ci ,zai jun zhu cun zai de huan jing zhong suo fa xian de ru SO42-,Fe2+deng zhi zheng liu yang hua ji tie hai yuan de biao ji wu ,bing bu wan quan yi wei zhao AMDY2-9-2ji ju you liu yang hua -hai yuan tie ou lian neng li ,yin zhe xie wu zhi yi you ke neng shi ji ta sheng li guo cheng de zhong jian chan wu 。yin ci ,zhi you jie ge le ji yin shui ping de shi yan jie guo yu li hua shi yan jie guo ,cai ke zui zhong que ren AMDY2-9-2de tie liu dai xie gong neng 。zai sheng li sheng hua shi yan bu fen ,wo men yi jun ti sheng chang liang ,pH,Eh,SO42-yi ji Fe2+nong du lai biao zheng he heng liang chan zhi liu de yang hua cheng du ji chan zhi liu yang hua -tie hai yuan de ou lian cheng du 。yan jiu jie guo xian shi ,dang pei yang ji zhong chan zhi liu tian jia liang xiao yu deng yu 6g/Lshi ,AMDY2-9-2dui chan zhi liu de yang hua neng li yu chan zhi liu tian jia liang cheng zheng xiang guan ;dang tian jia tong yang nong du de chan zhi liu shi ,suo tian jia de chan zhi liu li jing yue xiao ,AMDY2-9-2dui chan zhi liu de yang hua cheng du yue gao 。yan jiu AMDY2-9-2yang hua chan zhi liu de zuo yong fang shi de shi yan jie guo biao ming ,AMDY2-9-2yang hua chan zhi liu shi ,AMDY2-9-2bi xu yu chan zhi liu you zhi jie huo jian jie de jie chu ,bing ju zhi you zai jun ti wan zheng ju ju you sheng wu huo xing de tiao jian xia cai neng can yu chan zhi liu de yang hua guo cheng ;ci wai ,zai liu yang hua guo cheng zhong ,yang he Fe3+zhe liang chong dian zi shou ti ke tong zuo wei dian zi shou ti er can yu dao chan zhi liu de yang hua guo cheng ,dan xiang bi yu Fe3+,yang shi AMDY2-9-2yang hua chan zhi liu de geng gao xiao dian zi shou ti ;gai shi yan jie guo shui ming ,zai que fa yang shou ti de qing kuang xia ,Fe3+shi neng gou zuo wei dai ti de dian zi shou ti can yu liu yang hua guo cheng ,huan yan zhi ,zai fa yang qing kuang xia ,AMDY2-9-2ju you liu yang hua -tie hai yuan ou lian gong neng 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自南京大学的闵婕，发表于刊物南京大学2019-07-02论文，是一篇关于酸性矿区环境论文,全基因组技术论文,硫氧化菌论文,硫氧化实验论文,铁硫偶联论文,南京大学2019-07-02论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自南京大学2019-07-02论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：酸性矿区环境论文; 全基因组技术论文; 硫氧化菌论文; 硫氧化实验论文; 铁硫偶联论文; 南京大学2019-07-02论文;