本文主要研究内容
作者刘合霞,李博（2019）在《牛耳朵与黄花牛耳朵比较转录组学分析》一文中研究指出：牛耳朵和黄花牛耳朵在岩溶环境的适应性上区别显著。为研究它们在岩溶环境中分子适应机制的差异及相关基因,本实验对它们的叶片转录组进行了测序,通过比较转录组分析,筛选两个物种中的直系同源基因,检测正选择基因,寻找可能参与适应岩溶环境的基因。结果表明,牛耳朵与黄花牛耳朵的N50值分别为795和819,在牛耳朵中测序得到了157 728个unigene,黄花牛耳朵为156 965个。为了解两个物种unigene的功能信息,将其与公共数据库进行BLAST同源比对;用OrthoMCL筛选两个物种间的直系同源基因,经过严格的数据筛选后,共得到了1 898对直系同源基因,并计算其Ka、Ks及Ka/Ks值,利用公式T=K/2r估算两个物种的分化时间约为0.86±0.72百万年前(Mya)。在两个物种中有152对直系同源基因受到了强烈的正选择作用,对其进行GO、KEGG功能富集分析及基因功能注释,得到了与岩溶环境适应有关的19对功能基因。对两个物种的进化分析不仅估算了大概的分化时间,而且还发现了在岩溶环境中差异适应的相关基因。
Abstract
niu er duo he huang hua niu er duo zai yan rong huan jing de kuo ying xing shang ou bie xian zhe 。wei yan jiu ta men zai yan rong huan jing zhong fen zi kuo ying ji zhi de cha yi ji xiang guan ji yin ,ben shi yan dui ta men de xie pian zhuai lu zu jin hang le ce xu ,tong guo bi jiao zhuai lu zu fen xi ,shai shua liang ge wu chong zhong de zhi ji tong yuan ji yin ,jian ce zheng shua ze ji yin ,xun zhao ke neng can yu kuo ying yan rong huan jing de ji yin 。jie guo biao ming ,niu er duo yu huang hua niu er duo de N50zhi fen bie wei 795he 819,zai niu er duo zhong ce xu de dao le 157 728ge unigene,huang hua niu er duo wei 156 965ge 。wei le jie liang ge wu chong unigenede gong neng xin xi ,jiang ji yu gong gong shu ju ku jin hang BLASTtong yuan bi dui ;yong OrthoMCLshai shua liang ge wu chong jian de zhi ji tong yuan ji yin ,jing guo yan ge de shu ju shai shua hou ,gong de dao le 1 898dui zhi ji tong yuan ji yin ,bing ji suan ji Ka、Ksji Ka/Kszhi ,li yong gong shi T=K/2rgu suan liang ge wu chong de fen hua shi jian yao wei 0.86±0.72bai mo nian qian (Mya)。zai liang ge wu chong zhong you 152dui zhi ji tong yuan ji yin shou dao le jiang lie de zheng shua ze zuo yong ,dui ji jin hang GO、KEGGgong neng fu ji fen xi ji ji yin gong neng zhu shi ,de dao le yu yan rong huan jing kuo ying you guan de 19dui gong neng ji yin 。dui liang ge wu chong de jin hua fen xi bu jin gu suan le da gai de fen hua shi jian ,er ju hai fa xian le zai yan rong huan jing zhong cha yi kuo ying de xiang guan ji yin 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自分子植物育种的刘合霞,李博，发表于刊物分子植物育种2019年06期论文，是一篇关于牛耳朵论文,黄花牛耳朵论文,比较转录组论文,岩溶环境的适应性论文,正选择基因论文,分子植物育种2019年06期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自分子植物育种2019年06期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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