陈立杰:贵阳花溪古茶树遗传进化的SNP分析论文

陈立杰:贵阳花溪古茶树遗传进化的SNP分析论文

本文主要研究内容

作者陈立杰,张素勤,尹杰,宋勤飞,牛素贞,赵基英,陈丹萍,王胜威,耿广东(2019)在《贵阳花溪古茶树遗传进化的SNP分析》一文中研究指出:试验采用SNP(单核苷酸多态性)技术对贵阳花溪古茶树资源的遗传多样性、群体结构和遗传进化进行了分析.结果表明,利用生物信息学分析古茶树样品的重测序数据,获得了1 656 258个SLAF标签,古茶树样品平均测序深度为24.21x,其中多态性的SLAF标签有462 897个,共得到283 376个高一致性的群体SNP标记.从基于SNP标记获得的进化树可以看出,来自相近地方的古茶树在进化树上基本上处于相近位置,但是花溪古茶树存在着广泛的遗传变异,主成分分析(PCA)获得了与进化树一致的结果.群体结构分析可清晰地把古茶树资源分为乔木型和灌木型2个类群.乔木型古茶树位于进化树下部,而灌木型古茶树处于进化树上部,表明茶树是由乔木型向灌木型进化的.

Abstract

shi yan cai yong SNP(chan he gan suan duo tai xing )ji shu dui gui yang hua xi gu cha shu zi yuan de wei chuan duo yang xing 、qun ti jie gou he wei chuan jin hua jin hang le fen xi .jie guo biao ming ,li yong sheng wu xin xi xue fen xi gu cha shu yang pin de chong ce xu shu ju ,huo de le 1 656 258ge SLAFbiao qian ,gu cha shu yang pin ping jun ce xu shen du wei 24.21x,ji zhong duo tai xing de SLAFbiao qian you 462 897ge ,gong de dao 283 376ge gao yi zhi xing de qun ti SNPbiao ji .cong ji yu SNPbiao ji huo de de jin hua shu ke yi kan chu ,lai zi xiang jin de fang de gu cha shu zai jin hua shu shang ji ben shang chu yu xiang jin wei zhi ,dan shi hua xi gu cha shu cun zai zhao an fan de wei chuan bian yi ,zhu cheng fen fen xi (PCA)huo de le yu jin hua shu yi zhi de jie guo .qun ti jie gou fen xi ke qing xi de ba gu cha shu zi yuan fen wei qiao mu xing he guan mu xing 2ge lei qun .qiao mu xing gu cha shu wei yu jin hua shu xia bu ,er guan mu xing gu cha shu chu yu jin hua shu shang bu ,biao ming cha shu shi you qiao mu xing xiang guan mu xing jin hua de .

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自西南大学学报(自然科学版)的陈立杰,张素勤,尹杰,宋勤飞,牛素贞,赵基英,陈丹萍,王胜威,耿广东,发表于刊物西南大学学报(自然科学版)2019年08期论文,是一篇关于古茶树论文,特异位点扩增片段测序论文,进化树论文,遗传结构论文,西南大学学报(自然科学版)2019年08期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自西南大学学报(自然科学版)2019年08期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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