郑乾明:侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析论文

郑乾明:侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析论文

本文主要研究内容

作者郑乾明,王小柯,王壮,马玉华(2019)在《侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析》一文中研究指出:通过高通量测序和RT-PCR扩增,克隆并分析蟹爪兰X病毒(Zygocactus virus X,ZyVX)贵州分离物ZyVX-GZ基因组序列。对表现病毒病症状的红肉火龙果植株进行高通量测序,获得4条ZyVX相关contig。RT-PCR扩增并拼接获得ZyVX-GZ基因组,全长为6 567 nt,5’-UTR和3’-UTR分别为60nt和70nt。含有5个ORF,分别编码复制酶蛋白、TGB1、TGB2、TGB3蛋白和外壳蛋白。ZyVX-GZ与P39和B1分离物基因组序列一致性均为91%。TGB1-3、外壳蛋白基因与大多数分离物核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为95%~99%和96%~100%;复制酶基因的核苷酸和推导的氨基酸序列一致性分别为80%~89%和92%~97%。系统进化分析表明,ZyVX群体的遗传分化与寄主种类、地理分布不存在相关性。本研究结果丰富了ZyVX群体的基因组序列信息,为ZyVX的监测和防控提供了基础。

Abstract

tong guo gao tong liang ce xu he RT-PCRkuo zeng ,ke long bing fen xi xie zhao lan Xbing du (Zygocactus virus X,ZyVX)gui zhou fen li wu ZyVX-GZji yin zu xu lie 。dui biao xian bing du bing zheng zhuang de gong rou huo long guo zhi zhu jin hang gao tong liang ce xu ,huo de 4tiao ZyVXxiang guan contig。RT-PCRkuo zeng bing pin jie huo de ZyVX-GZji yin zu ,quan chang wei 6 567 nt,5’-UTRhe 3’-UTRfen bie wei 60nthe 70nt。han you 5ge ORF,fen bie bian ma fu zhi mei dan bai 、TGB1、TGB2、TGB3dan bai he wai ke dan bai 。ZyVX-GZyu P39he B1fen li wu ji yin zu xu lie yi zhi xing jun wei 91%。TGB1-3、wai ke dan bai ji yin yu da duo shu fen li wu he gan suan he tui dao de an ji suan xu lie yi zhi xing fen bie wei 95%~99%he 96%~100%;fu zhi mei ji yin de he gan suan he tui dao de an ji suan xu lie yi zhi xing fen bie wei 80%~89%he 92%~97%。ji tong jin hua fen xi biao ming ,ZyVXqun ti de wei chuan fen hua yu ji zhu chong lei 、de li fen bu bu cun zai xiang guan xing 。ben yan jiu jie guo feng fu le ZyVXqun ti de ji yin zu xu lie xin xi ,wei ZyVXde jian ce he fang kong di gong le ji chu 。

论文参考文献

  • [1].侵染丝瓜的黄瓜绿斑驳花叶病毒山东分离物分子鉴定[J]. 王云,辛志梅,赵黎明,竺晓平,王云祥.  山东农业科学.2014(08)
  • [2].黄瓜绿斑驳花叶病毒广东分离物的分子鉴定[J]. 张卫东,权永兵,廖力,徐淼锋,迟远丽,陈其文.  广东农业科学.2011(20)
  • [3].香蕉束顶病毒海口分离物基因组的克隆及序列分析[J]. 冯团诚,王健华,刘志昕.  植物病理学报.2010(01)
  • [4].黄瓜绿斑驳花叶病毒的分子检测及云南分离物的序列分析[J]. 吴鑫,丁元明,何月秋,李旻,李克海,王绍君,周剑.  扬州大学学报(农业与生命科学版).2010(03)
  • [5].李属坏死环斑病毒新疆分离物运动蛋白基因片段的克隆与序列分析[J]. 韩剑,罗明,殷智婷,周国辉,张祥林.  植物保护学报.2015(04)
  • [6].烟草花叶病毒丁香分离物的分离与鉴定[J]. 黄金光,邓丛良,范在丰,田国忠,李怀方.  植物病理学报.2004(03)
  • [7].辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析[J]. 刘湘宁,戴良英,李魏,董铮,唐前君.  植物保护.2017(02)
  • [8].甘蔗花叶病毒第Ⅳ组分离物RT-PCR检测体系的建立及应用[J]. 闫志勇,程德杰,房乐,许小洁,田延平,贾曦,李向东.  植物病理学报.2017(04)
  • [9].小西葫芦黄花叶病毒辽宁分离物的鉴定与序列分析[J]. 付晶晶,杨彩霞,韩彤,廖一鸣,李梁,李梦新,孙伟,王蒴.  福建农林大学学报(自然科学版).2017(05)
  • [10].小西葫芦黄花叶病毒石河子分离物的分子变异[J]. 王志江,杨海燕,向本春,郑银英.  石河子大学学报(自然科学版).2015(06)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自植物病理学报的郑乾明,王小柯,王壮,马玉华,发表于刊物植物病理学报2019年02期论文,是一篇关于复制酶论文,外壳蛋白论文,核苷酸论文,序列一致性论文,植物病理学报2019年02期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自植物病理学报2019年02期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  ;  

    郑乾明:侵染红肉火龙果的蟹爪兰X病毒贵州分离物基因组分析论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢