线性化文库论文-陈芸,周鹏,张子平,王艺磊

线性化文库论文-陈芸,周鹏,张子平,王艺磊

导读:本文包含了线性化文库论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:性腺发育,cDNA文库,大黄鱼,ESTs

线性化文库论文文献综述

陈芸,周鹏,张子平,王艺磊[1](2011)在《大黄鱼性腺线性化cDNA文库的构建及生殖免疫相关基因的筛选》一文中研究指出以大黄鱼(Larimichthys crocea)性腺为材料,采用SMART(switching mechanism at 5′end of RNA transcript)技术和DSN(duplex-specific nuclease)处理构建了大黄鱼性腺线性化cDNA文库,文库的库容为4.3×106PFU/mL,重组率为95.8%,插入片段大小为0.5-3 kb,说明该文库质量良好。从文库中随机挑取了3 961个克隆进行测序,共获得3 535条高质量的表达序列标签(ESTs)。包含与生殖免疫相关的基因33条,其中非特异性免疫相关基因17条,特异性免疫相关基因16条。(本文来源于《生物技术通报》期刊2011年07期)

邹志华,张子平,王艺磊,陈锦民,贾锡伟[2](2009)在《锯缘青蟹性腺发育与性别分化相关组织混合线性化cDNA文库构建及EST初步分析》一文中研究指出分别提取锯缘青蟹Scylla serrata卵巢、精巢、眼柄、促雄腺的总RNA,等量混合后经oligotex试剂分离mRNA,利用SMART(Switch mechanisms at the 5′end of RNA transcript)技术及DSN(duplex-specific nuclease)的特性构建线性化cDNA质粒文库。经检测文库约含有5.3×107重组子,扩增后的文库含有1011以上重组子。文库的插入cDNA长度为0.5—2.5kb,重组率大于98%。从构建的文库中随机挑取5 202个克隆进行大规模EST测序,获得3 346条ESTs,其中长度大于100bp的高质量ESTs 2 697条。经拼接与软件分析,2 697 ESTs代表了2 522个Unigenes,包括2 355个Singlets和167个Contigs,冗余率6.49%。EST序列经生物信息学分析(BLASTX,e<10-6),发现了Sry-like protein C、Sox14 protein、Sox4b、sex-determining protein fem-1、vitellogenin、vitellogenin receptor、cyclin A、cathepsin C和cyclin-dependent kinase 2等与性别分化和性腺发育相关的基因,以及热休克蛋白家族、泛素系统、抗氧化防御体系和抗病相关的功能基因。该文库具有较高的质量和利用价值,可为更大规模EST分析及采用基因芯片技术开展锯缘青蟹性腺发育及性别分化相关功能基因的研究奠定基础。(本文来源于《热带海洋学报》期刊2009年06期)

线性化文库论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

分别提取锯缘青蟹Scylla serrata卵巢、精巢、眼柄、促雄腺的总RNA,等量混合后经oligotex试剂分离mRNA,利用SMART(Switch mechanisms at the 5′end of RNA transcript)技术及DSN(duplex-specific nuclease)的特性构建线性化cDNA质粒文库。经检测文库约含有5.3×107重组子,扩增后的文库含有1011以上重组子。文库的插入cDNA长度为0.5—2.5kb,重组率大于98%。从构建的文库中随机挑取5 202个克隆进行大规模EST测序,获得3 346条ESTs,其中长度大于100bp的高质量ESTs 2 697条。经拼接与软件分析,2 697 ESTs代表了2 522个Unigenes,包括2 355个Singlets和167个Contigs,冗余率6.49%。EST序列经生物信息学分析(BLASTX,e<10-6),发现了Sry-like protein C、Sox14 protein、Sox4b、sex-determining protein fem-1、vitellogenin、vitellogenin receptor、cyclin A、cathepsin C和cyclin-dependent kinase 2等与性别分化和性腺发育相关的基因,以及热休克蛋白家族、泛素系统、抗氧化防御体系和抗病相关的功能基因。该文库具有较高的质量和利用价值,可为更大规模EST分析及采用基因芯片技术开展锯缘青蟹性腺发育及性别分化相关功能基因的研究奠定基础。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

线性化文库论文参考文献

[1].陈芸,周鹏,张子平,王艺磊.大黄鱼性腺线性化cDNA文库的构建及生殖免疫相关基因的筛选[J].生物技术通报.2011

[2].邹志华,张子平,王艺磊,陈锦民,贾锡伟.锯缘青蟹性腺发育与性别分化相关组织混合线性化cDNA文库构建及EST初步分析[J].热带海洋学报.2009

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