导读:本文包含了抗旱转录因子论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:野生大豆,GsWRKY57,转录因子,过表达
抗旱转录因子论文文献综述
王岩岩,张永兴,郭葳,代文君,周新安[1](2019)在《野生大豆转录因子GsWRKY57基因的克隆与抗旱性功能分析》一文中研究指出WRKY转录因子是近年来在植物中发现的一类重要转录因子,在植物抗逆相关过程中发挥重要作用。本研究通过对野生大豆转录组数据进行分析,从野生大豆中克隆得到GsWRKY57基因的CDS序列。该基因开放阅读框为903bp,编码300个氨基酸残基,分子量为34.23kD,等电点为5.88。氨基酸序列分析显示该蛋白含有一个WRKY保守结构域,属于III类WRKY转录因子。系统发育树分析表明该蛋白与栽培大豆同源性最高、其次是赤豆、木豆。启动子作用元件分析预测显示该基因可能存在多种非生物胁迫作用元件。组织特异性表达分析表明该基因在大豆叶片中高丰度表达,然后依次是茎、花、荚、根。GsWRKY57基因表达受茉莉酸、水杨酸、脱落酸、干旱等植物逆境诱导。过表达GsWRKY57基因的转基因拟南芥植株相对于野生型耐旱能力增强。(本文来源于《中国油料作物学报》期刊2019年04期)
任美艳,唐宽刚,薛敏,郭慧琴,王茅雁[2](2019)在《沙冬青AmNAC3转录因子基因在抗旱性和抗寒性中的功能鉴定》一文中研究指出为了研究强抗逆植物沙冬青Am NAC3转录因子基因在抗旱性和抗寒性中的功能,首先利用半定量RT-PCR方法对该基因进行了表达分析。结果表明,在室内培养的沙冬青幼苗中,Am NAC3有一定量的基础表达,在干旱胁迫下其转录水平明显上调,而在低温胁迫下其表达上调较弱。然后利用5'RACE技术获得该基因的5'端序列及全长cDNA序列,并利用RT-PCR方法克隆到其全长编码区(846bp)。将编码区片段构建到植物表达载体上,利用农杆菌介导法获得转基因拟南芥。进一步分析表明,转基因拟南芥对于干旱和低温胁迫的抗性表型与野生型无明显差异,但其离体叶片的失水率和气孔开度均大于野生型。此外,转基因幼苗中气孔开闭相关基因ABI1和ABI2的表达量降低。这些结果表明,Am NAC3可能主要在响应干旱胁迫和调节气孔开闭及叶片保水性中发挥功能,而在抵抗低温胁迫中无明显作用。(本文来源于《中国生物工程杂志》期刊2019年08期)
王立国,傅明川,李浩,刘任重,柳展基[3](2019)在《陆地棉NAC转录因子基因GhSNAC1的克隆及其抗旱耐盐分析》一文中研究指出NAC (NAM/ATAF/CUC)家族是植物中特有的一类转录因子,其功能涉及植物生长发育调控、激素信号转导、逆境胁迫响应等重要生理过程。本研究利用反转录PCR (reverse transcription PCR, RT-PCR)技术从陆地棉(Gossypium hirsutum)中克隆了1个逆境胁迫响应(stress-responsive) NAC类转录因子基因,命名为GhSNAC1 (GenBank No. KU759894)。该基因长度为1 104 bp,预测编码蛋白含有299个氨基酸,分子量为33.9 kD,等电点为6.18。蛋白序列分析表明,GhSNAC1具有典型的NAC转录因子特征,N端含有保守的NAC结构域。进化分析表明,GhSNAC1与拟南芥(Arabidopsis thaliana) ATAF1 (Arabidopsis transcription activation factor 1)高度相似。qRT-PCR结果显示,GhSNAC1受到干旱、高盐、低温和黄萎病菌(Verticillium dahliae)胁迫诱导,提示该基因可能参与生物和非生物胁迫响应。在烟草(Nicotiana tabacum)中过表达GhSNAC1,分析干旱或盐胁迫条件下转基因和野生型烟草株系种子的萌发率和幼苗生长差异,实验结果显示,在100 mmol/L NaCl或200 mmol/L甘露醇胁迫下,野生型烟草的种子萌发受到明显抑制,萌发率低于50%,而转基因株系显着优于野生型,其种子萌发率均在80%以上;野生型烟草幼苗弱小,而转基因株系长势强,其单株鲜重和根长分别是野生型的2倍和1.5倍以上。上述结果表明,过表达GhSNAC1可显着提高转基因烟草的抗旱耐盐能力。本研究为深入探究GhSNAC1抗旱耐盐的分子机制提供了基础资料。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2019年04期)
王立国,傅明川,李浩,刘任重,柳展基[4](2018)在《陆地棉NAC转录因子GhSNAC1的克隆及其抗旱耐盐分析》一文中研究指出NAC基因家族是植物中特有的一类转录因子,其功能涉及植物生长发育调控、激素信号转导、逆境胁迫响应等多种生理过程。本研究从陆地棉中克隆了一个NAC基因GhSNAC1,长度为1104bp,推测编码蛋白含有299个氨基酸,分子量为33.9 kDa,等电点为6.18。蛋白序列分析表明,GhSNAC1具有典型的NAC转录因子特征,其N端含有保守的NAC结构域。实时荧光定量PCR结果显示,GhSNAC1受到干旱、高盐、低温和黄萎病菌胁迫诱导。异源表达转基因功能初步分析表明,过量表达GhSNAC1的转基因烟草抗旱耐盐能力显着提升。(本文来源于《2018年山东作物学会学术年会论文集》期刊2018-08-25)
王彩[5](2018)在《花生抗旱相关转录因子AREB1-2基因的功能分析》一文中研究指出花生又名落花生,是重要的油料和经济作物,在世界范围内大量种植。花生用途广泛,在我们的生活中扮演着重要角色。然而花生的产量和质量的提高受到干旱的影响,干旱是我国花生生产的主要限制因子。AREB1(Abscisic-acid respons element binding protein 1)是一类与抗旱相关的转录因子。课题组前期研究表明花生AREB1的表达量与品种抗旱性显着正相关。本研究以丰花2号为材料,克隆花生AREB1家族的另一个基因AhAREB1-2。选用抗旱性不同的26个品种(系)进行苗期15%PEG处理,研究AhAREB1-2表达量与抗旱性的关系;构建AhAREB1-2的病毒诱导沉默载体,经农杆菌介导转化丰花2号,对基因沉默植株进行干旱、高盐等胁迫处理,分析AhAREB1-2的功能。主要研究结果如下:1.克隆获得AREB1-2的两个CDS序列,命名为AhAREB1-2a和AhAREB1-2b,分别编码370、421个氨基酸,软件预测分子量分别为38.7kDa、44.9 kDa,等电点分别为9.90、9.47。保守结构域分析表明,AhAREB1-2a和AhAREB1-2b具有C1、C2、C3、C4和bZIP保守结构域。2.分析AhAREB1-2a和AhAREB1-2b的组织特异性以及5种非生物胁迫诱导的表达模式,结果表明,AhAREB1-2a和AhAREB1-2b在花生叶片中的表达量最高,AhAREB1-2b的表达量高于AhAREB1-2a。在花生苗期脱落酸(100μmol/LABA)、干旱脱水、高盐(250mmol/L NaCl)、15%PEG及甲基紫精(50μmol/L MV)胁迫下,叶片AhAREB1-2a和AhAREB1-2b基因表达量上调,15%PEG6000处理4h时表达量最高;26个花生品种(系)幼苗叶片中AhAREB1-2a和AhAREB1-2b的表达量与抗旱系数呈显着正相关。3.以TRV2为基础载体,构建了含有AhAREB1-2a和AhAREB1-2b基因的目标片段的沉默载体TRV2-AREB1-2a和TRV2-AREB1-2b。根癌农杆菌GV3101介导进行花生遗传转化,得到基因沉默植株。对基因沉默植株及离体叶片进行不同胁迫处理,自然干旱与PEG模拟干旱胁迫处理后,沉默植株萎蔫程度高于对照、离体叶片失绿速度快于对照;高盐胁迫处理后,沉默植株的离体叶片失绿速度高于对照;MV胁迫处理后沉默植株的离体叶片比对照的氧化程度更严重。说明AhAREB1-2a和AhAREB1-2b基因在花生抗旱、耐盐及抗氧化途径中具有重要作用。(本文来源于《山东农业大学》期刊2018-05-15)
李春艳[6](2018)在《玉米ZF-HD转录因子家族耐盐、抗旱相关基因的鉴定及特性分析》一文中研究指出玉米是世界上重要的粮食作物,可用于饲料、食品和工业原料。玉米生产在国民经济中占有重要的作用,但是干旱、盐渍等非生物胁迫严重影响玉米的产量,是导致玉米减产的主要因素。利用生物信息学技术挖掘与抗旱、耐盐相关基因,为玉米的分子育种提供了有效的途径。ZF-HD是陆生植物特有的一类转录因子,在植物的生长发育及非生物胁迫过程中发挥重要的调控作用。在拟南芥和水稻中与抗逆相关的ZF-HD转录因子的功能已相继被报道,而在玉米中却鲜有研究。因此筛选响应干旱、盐胁迫的ZF-HD基因对培育抗逆玉米新品种具有重要意义。本研究通过生物信息学的方法在玉米全基因组中鉴定ZF-HD基因,系统分析了该基因家族序列特性、进化关系及干旱、高盐和脱落酸条件下ZF-HD基因的表达特性。主要研究结果如下:(1)通过Blastp同源搜索,在玉米全基因组中共鉴定了24个非重复ZF-HD基因,这些基因不均衡的分布在玉米的9条染色体上(第9号染色体除外)。通过分析发现,有3对旁系同源基因参与了片段重复,1对旁系同源基因参与了串联重复。(2)通过对玉米的ZF-HD基因家族结构预测,发现玉米有21个占总数87.5%基因没有内含子,这无内含子特点同样也发现在拟南芥和水稻上。分子进化关系表明,24个ZF-HD基因被分为6个亚类,且同一亚族基因结构和蛋白基序的种类及排列顺序非常相似,证明该家族基因序列高度保守。(3)利用qTeller转录组数据库,分析ZF-HD家族成员在玉米12个组织的表达特性。结果表明,旁系同源基因对的表达模式较为相似。此外,大多数基因在雄穗和雌穗和幼胚中高度表达,近一半基因在花丝中高度表达,表明该家族基因参与玉米花及幼胚发育过程并发挥重要作用。(4)分析24个ZF-HD基因启动子序列的的顺式作用元件,发现18个占总数75%的基因含有ABRE顺式元件。此外,我们利用荧光定量PCR技术对所有基因干旱、高盐和ABA诱导表达模式进行了鉴定,结果表明,所有基因响应干旱或盐胁迫或ABA,其中ZmZHD11和ZmZHD12这两个基因除了受强烈响应这叁种处理,在干旱和高盐诱导下表达显着上调,表明这两个基因可能依赖ABA传导途径调控抗逆胁迫过程。(5)分析候选基因ZmZHD11和ZmZHD12编码的蛋白序列,发现氨基酸长度、组成及立体结构非常相似。然后构建超表达载体为之后利用过表达技术研究其在非生物胁迫的作用机制奠定基础。(本文来源于《西南大学》期刊2018-04-10)
信雨萌,沙伟,张梅娟,孟灵军,马天意[7](2018)在《砂藓抗旱相关转录因子基因RcbZIP1的克隆与表达分析》一文中研究指出bZIP转录因子是植物体内一类比较大的转录因子家族,在植物的生长发育以及抗逆反应中起着非常重要的作用。本研究成功从砂藓(Racomitrium canescens)中克隆得到一条bZIP转录因子基因的cDNA序列,命名为RcbZIP1。对RcbZIP1进行了表达载体构建和生物信息学分析,以及砂藓在复水和脱水处理中RcbZIP1的表达变化检测。结果表明,RcbZIP1的cDNA开放阅读框长1026bp;编码蛋白质的氨基酸数目为341,相对分质量约为37.52kD,理论等电点为7.14;不稳定指数为56.98,脂肪指数为73.43,总平均亲水性为-0.580,预测该蛋白为亲水性蛋白,不含有信号肽,可能定位于细胞核内。实时荧光定量PCR结果显示,RcbZIP1基因的表达量在复水过程中呈现先骤升后波动下降的变化趋势,在脱水处理时间达到一定长度时表现出骤升的变化,由此可初步推断bZIP1可能参与干旱胁迫应答。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2018年07期)
王前前[8](2017)在《玉米热激转录因子ZmHsfA4α的抗旱功能研究》一文中研究指出玉米是我国叁大禾本科粮食作物之一,既可作为粮食,也可作为重要的工业原料,在保证粮食生产及粮食安全方面发挥重要作用。但是玉米在生长过程中,经常遭受一些不良环境因子的影响,从而导致其产量和品质的下降,其中最主要的是非生物逆境因子,如高温、干旱及高盐等。目前,通过转基因技术进行作物遗传改良、培育抗逆新品种以提高作物抗逆性,是保证粮食产量和品质的最为行之有效的方法之一。研究表明,转录因子在植物的抗逆应答过程中发挥重要调控作用,它们可以同时激活或抑制多个下游基因的表达,效果更加显着,目前在植物中很多转录因子基因被鉴定参与逆境应答反应。HSF是植物中重要的转录因子家族之一,广泛参与到植物的生长发育及非生物逆境响应过程,在模式植物拟南芥及番茄中,HSF基因的作用机制已被研究清楚。然而,玉米作为重要粮食作物,其HSF基因的功能研究还未见报道,分子作用机制也不清楚。根据实验室相关研究基础,我们获得了一个潜在与逆境相关的HSF基因ZmHsfA4α,通过基因表达、基因特征以及过表达分析对其抗旱功能进行鉴定,并通过互作蛋白鉴定进一步阐明其作用机制。获得的主要结果如下:1.从玉米B73中克隆得到ZmHsfA4α全长CDS序列,测序结果与B73基因组数据库公布序列完全一致,该基因全长1302bp,编码433个氨基酸。基因芯片数据显示ZmHsfA4a在玉米的各个组织中均有表达,其中在叶中表达水平较高,荧光定量PCR结果显示ZmHsfA4a在检测的六个组织,根、茎、叶、雄穗、花丝、及包被叶中均表达、且在叶中表达水平较高,这与芯片数据基本一致。诱导表达分析结果显示,ZmHsfA4a受到干旱和高温诱导表达,而在ABA和NaCl处理下呈下调表达。2.亚细胞定位结果显示ZmHsfA4a-p1305融合蛋白只在细胞核中表达,表明ZmHsfA4a是一个核定位蛋白;转录活性分析结果表明,ZmHsfA4a在酵母AH109菌株中具有转录活性,并且主要活性区域位于230-280氨基酸之间。3.构建过表达载体ZmHsfA4a-p1301a,通过农杆菌介导转化拟南芥。转基因拟南芥在含有300 mM甘露醇的MS培养基上萌发率显着高于野生型,且在干旱条件下,转基因植株的耐受性增强。表达分析显示,转基因拟南芥中逆境相关基因在干旱处理之后的表达水平升高,并且高于野生型植株。4.ZmHsfA4a过表达到水稻zhonghua11中,转基因水稻对干旱抗性增强。干旱处理后,转基因水稻植株的相对电导率及丙二醛含量显着低于野生型植株,并且干旱处理后一些逆境相关基因的表达水平在转基因植株中要高于野生型植株,这些结果进一步表明ZmHsfA4a增强了转基因水稻抗旱性。此外转基因水稻对外源ABA的敏感性增加,说明ZmHsfA4a参与水稻ABA介导信号通路。5.过表达ZmHsfA4a增加了转基因玉米对干旱耐受性。相对失水率实验表明转基因植株相对于野生型植株的相对失水率较低,干旱处理后,转基因玉米的相对电导率及丙二醛含量显着低于野生型植株,但游离脯氨酸含量显着高于野生型植株,这表明转基因玉米抗旱性增强。对ABA含量测定发现,正常情况下转基因玉米与野生型植株没有差异,干旱处理后转基因玉米ABA含量显着高于野生型植株,并且ABA合成相关基因ZmVP14的表达与ABA含量趋势相一致,说明ZmHsfA4a参与了玉米ABA信号转导途径。BIFC和pulldown实验结果表明,ZmHsfA4a可以自身相互作用形成同源多聚体,并且ZmHsfA4a可以与EMP2相互作用。以上实验结果表明,ZmHsfA4通过ABA介导信号转导途径参与干旱胁迫应答调控,同时EMP2参与了ZmHsfA4a的调控过程。(本文来源于《安徽农业大学》期刊2017-05-01)
徐红云[9](2017)在《拟南芥Trihelix转录因子AST1调控植物抗旱、耐盐的机制研究》一文中研究指出Trihelix转录因子因其DNA结构域中含有一个(螺旋-环-螺旋-环-螺旋-环)的保守区域而得名,并且Trihelix家族蛋白能够识别光应答GT元件,虽然其在盐、旱和光等胁迫应答过程中都起重要调控作用。然而只有少数Trihelix基因的功能被鉴定。本研究克隆了 一个 Trihelix 家族基因,命名为 AST 1(Arabidopsis SIP1 clade Trihelixl,AT3G24860),并探讨了其响应非生物胁迫的抗逆机理。(1)首先构建PBI121-ProAST1-GUS载体,然后通过拟南芥花絮侵染的方法获得稳定转基因苗。通过GUS染色分析AST1基因在不同发育阶段和组织器官中的表达,发现随着植物的生长,AST1基因的表达量不断上升,当植物开始抽茎后,AST1基因的表达量降低。GUS染色和定量PCR共同分析发现AST1基因在叶片、花和茎中的表达量要高于根和果荚。qRT-PCR分析发现,经过NaCl和Mannitol诱导后,AST1能够响应盐和渗透胁迫。将PBI121-ProAST1-GUS苗用NaCl和Mannitol处理后,通过GUS染色和GUS酶活测定发现AST1基因在非生物胁迫诱导后的表达量显着上升。亚细胞定位分析表明AST1蛋白定位于细胞核。(2)通过蘸花法转化获得稳定表达AST1的转基因拟南芥,同时,筛选获得了 AST1纯合突变体株系,通过与野生型拟南芥和转pROK2空载转基因拟南芥的比较发现,在NaCl和Mannitol胁迫后,AST1的表达能够显着提高植物的抗逆性。进一步研究发现,AST1主要通过负调控气孔的开度而减少水分的蒸发,维持K+/Na+离子平衡,调控脯氨酸的合成,减少细胞的损伤及增强植物清除活性氧的能力等方式调控其抗逆能力。通过实时定量PCR发现,AST1能够调控气孔调节基因AtMYB61,Na+(K+)/H+转运蛋白基因,脯氨酸合成和降解基因,SODs、PODs和LEA家族抗逆基因的表达,从而调控植物的抗旱、耐盐能力。(3)渗透胁迫处理下,比较了 AST1过表达和突变体植株的转录组分析,发现共有144个差异表达基因,其中有65个为上调表达基因,77个为下调表达基因,并且通过GO分析发现差异基因主要参与刺激响应,信号转导,免疫响应等生物过程。利用MEME软件对实时定量PCR和转录组中上调表达基因的启动子序列进行保守区域预测,找到一段12bp长的保守序列,并通过酵母单杂交,植物体内AST1与元件互作分析,EMSA(Electrophoretic Mobility Shift Assay)和 ChIP(Chromatin immunoprecipitation)等实验找到AST1识别的核心序列为[A/G][G/A][A/T]GAGAG,命名为AGAG-box。另外通过酵母单杂交、EMSA和ChIP等实验证实,AST1能够识别一些GT元件,包括GGTAATT,TACAGT,GGTAAAT and GGTAAA,但是不能识别 GTTAC 和 GGTTAA。同时通过ChIP-qPCR发现,AST1通过识别AGAG-box和GT元件来调控AtMYB61,P5CS1、P5CS2、HKT1、NHX2、NHX3、NHX6、SODs、PODs和LEA 等抗逆基因的表达。综上所述发现,AST1转录因子通过结合一个新的元件AGAG-box和一些GT元件来调控非生物胁迫响应基因,从而调控细胞离子平衡,维持细胞渗透压,减少水分的蒸发、减少细胞的死亡及提高ROS清除能力等,提高植物对逆境的耐受性,深入揭示了 AST1基因的抗逆机制。(本文来源于《东北林业大学》期刊2017-03-01)
周宏[10](2016)在《桑树抗旱相关4个转录因子家族鉴定与表达分析》一文中研究指出自然条件下,植物在整个生命周期中经常受到多种胁迫。干旱是主要制约植物生长发育,作物产量减少的非生物胁迫之一(仅次于病虫害)。植物在分子、细胞和生理水平等多方面应答反应和防御系统来适应胁迫环境,许多基因都参与植物对非生物胁迫的应答。因此,非生物胁迫响应的相关基因研究具有重要理论和现实意义。转录因子参与生物和非生物胁迫的应答反应,在调节植物适应环境变化中起重要作用。转录因子通过调节下游基因的表达,实现对植物的形态建成、生长发育及抵抗生物和非生物胁迫的调节作用。转录因子除了可应答外界刺激和环境胁迫,还可控制目的基因的时空特异性表达,通过基因产物的作用对内、外界信号作出应答,引起植物的生理、生化发生变化,提高抗逆性。我国是蚕桑生产的发源地,桑树种质资源极其丰富。桑树不仅具有药用价值的经济作物,还形成了较强的适应性,抗逆境的特性,可用于受损生态环境的治理。多种逆境条件常常对桑树的生长产生重大的影响。桑树一些重要调控基因及其胁迫下分子机制的研究,对提高桑树产量、抗逆性及保存桑树种质资源有重要作用。目前,植物抗逆相关的转录因子研究主要集中在MYB、WRKY、b ZIP、AP2/ERF和NAC等几大类。但桑树中这些转录因子的研究还很贫乏。通过改变桑树基因抗逆性提高桑树的抗旱性,可以降低干旱自然条件对桑树生长和产量的不利影响,具有深远的意义。因此,本文重点对桑树抗旱相关的trihelix、b ZIP、MYB和ERF转录因子进行鉴定和分析,主要结果总结如下:1.桑树抗旱性相关的trihelix、b ZIP、MYB和ERF四个转录因子家族鉴定本文借鉴其他物种的主要抗旱转录因子基因的研究情况及桑树全基因组序列数据库,利用生物信息学方法对桑树抗旱性相关的trihelix、b ZIP、MYB、和ERF等四个转录因子家族进行鉴定和分析,并从基因组水平上对这四个基因家族的序列特征进行了系统分析与预测。研究结果如下:鉴定出桑树trihelix转录因子家族成员29个,序列聚类和功能结构域分析发现该家族均含有高度保守的、特征性的trihelix结构域;根据亲缘关系远近和结构域特点,将桑树trihelix转录因子家族分为5个亚家族。基于MEME程序分析,trihelix家族的保守基序与聚类分析结果具有较高一致性。鉴定出桑树b ZIP转录因子家族成员32个,序列聚类和功能结构域分析发现该家族均含有高度保守的、特征性的b ZIP结构域;根据亲缘关系远近和结构域特点,将桑树b ZIP转录因子家族划分为A、B、C、D、E、F、G、H、I和其他族等几个亚家族。基于MEME程序分析,b ZIP家族的保守基序与聚类分析结果具有较高一致性。鉴定出含2个及2个以上Myb_DNA-binding结构域的桑树MYB转录因子家族成员99个,其中含有2个Myb_DNA-binding的转录因子96个,含有3个Myb_DNA-binding结构域的转录因子3个。序列聚类和功能结构域分析发现该家族高度保守、特征性的DNA结合结构域,MYB结构域。序列特征motif1分析表明,含有2个motif1特征结构域的MYB家族成员24个,含有3个mofit1有3个,其余均含1个Motif1特征结构域。基于MEME程序分析,桑树MYB转录因子家族的保守基序与聚类分析结果具有较高的一致性。鉴定出桑树ERF转录因子家族成员85个,序列聚类和功能结构域分析发现该家族均含有高度保守的、特征性结构域;根据亲缘关系远近和结构域特点,并将桑树ERF转录因子家族划分为A、B、C、D、E、F、G、H、I、J、K、L等12个群及其他群,其中J群家族成员最多。基于MEME程序分析,桑树ERF其保守基序与聚类分析结果具有较高的一致性。4个转录因子聚类分析表明,桑树与拟南芥4个转录因子家族的分类相一致,但每个物种均含有不同亚家族的成员,表明该基因家族的分化早于物种的分化。以上研究结果初步明确了桑树trihelix、b ZIP、MYB、和ERF转录因子家族成员、结构和功能特点,为进一步揭示这四个转录因子家族的分子进化规律和生物学功能奠定了基础。2.桑树干旱胁迫转录组中转录因子鉴定采用桑树育71-1品种为材料,进行了干旱胁迫和正常生长条件下两个样本的转录组测序(RNA-seq)分析。通过分析,共鉴定到1051个差异表达基因。通过桑树trihelix、MYB、b ZIP和ERF转录因子家族基因的差异表达分析,发现10个差异表达基因,2个是下调差异基因,其余是上调差异基因。10个差异表达基因中,trihelix转录因子家族有1个下调差异基因;b ZIP转录因子家族有1个上调差异基因;MYB转录因子家族有3个是上调差异基因,1个是下调差异基因;ERF转录因子家族4个,均是上调差异基因。四个转录因子家族差异基因富集分析表明:桑树四个转录因子家族差异基因功能的执行主要集中生物过程分类下的各项。分子功能分类下的差异蛋白执行转录因子活性、序列特异性的DNA结合;核酸结合;DNA结合等功能。在细胞组分分类下的差异蛋白只执行核功能一项。3.桑树Mntrihelix基因的克隆和序列分析及表达模式成功克隆桑树Mntrihelix基因,其序列ORF长度为567bp,编码188个氨基酸残基。SMART分析其有一个SMART SANT结构域。SMARTblast进化分析表明,属于trihelix转录因子的GT1类亚家族;在非冗余的蛋白数据库中,Mntrihelix与川桑、可可树和木本棉亲缘关系较近,与川桑的关系最为密切;参考物种数据库中,其与拟南芥和大豆的亲缘关系较近。通过q RT-PCR分析Mntrihelix在干旱、高盐和低温的胁迫条件下的表达情况:基因表达量在胁迫条件下都有不同程度的上调。4.桑树Mnb ZIP基因的克隆和序列分析及表达模式.成功克隆桑树Mnb ZIP基因,其序列ORF长度为675bp,编码224个氨基酸的蛋白。SMARTblast进化分析表明,属于b ZIP转录因子的b ZIP_plant_GBF1家族;在非冗余的蛋白数据库中,Mnb ZIP与川桑、苹果和甜橙亲缘关系较近,与川桑的关系最为密切;参考物种数据库中,其与拟南芥和大豆的亲缘关系较近。通过q RT-PCR分析Mnb ZIP在干旱、高盐和低温的胁迫条件下的表达情况:基因表达量在胁迫条件下都有不同程度的上调。5.桑树Mn MYB基因的克隆和序列分析及表达模式.成功克隆了桑树Mn MYB基因,其序列ORF长度为822bp,编码293个氨基酸的蛋白。SMART分析发现含有两个典型的SMART SANT结构域。SMARTblast进化分析表明,属于MYB转录因子的myb_SHAQKYF类亚家族;在非冗余的蛋白数据库中,Mn MYB与川桑、金丝小枣和毛果杨亲缘关系较近,与川桑的关系最为密切;参考物种数据库,其与拟南芥和大豆亲缘关系较近。通过q RT-PCR分析Mn MYB在干旱、高盐和低温的胁迫条件下的表达情况:基因表达量在胁迫条件下都有不同程度的上调。针对桑MYB基因在抗旱中起到的重要作用,构建了桑转录因子基因的原核表达载体,在大肠杆菌中成功诱导表达,并获得了高纯度目的蛋白,为多克隆抗体的制备提供了优质蛋白来源,以完成后续的免疫组化、基因定位和蛋白互作研究。6.桑树Mn ERF基因的克隆和序列分析及表达模式.成功的克隆了桑树Mn ERF基因,其序列ORF长度为321bp,编码106个氨基酸的蛋白。SMART分析发现,含有一个SMARTAP2结构域。SMARTblast进化分析表明,属于ERF转录因子家族;在非冗余的蛋白数据库中,Mn ERF与川桑、构树亲缘关系较近;参考物种数据库中,其与拟南芥和大豆亲缘关系较近。q RT-PCR分析Mn ERF在干旱、高盐和低温胁迫条件下的表达情况:基因表达量在胁迫条件下都有不同程度的上调。(本文来源于《江苏科技大学》期刊2016-12-10)
抗旱转录因子论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
为了研究强抗逆植物沙冬青Am NAC3转录因子基因在抗旱性和抗寒性中的功能,首先利用半定量RT-PCR方法对该基因进行了表达分析。结果表明,在室内培养的沙冬青幼苗中,Am NAC3有一定量的基础表达,在干旱胁迫下其转录水平明显上调,而在低温胁迫下其表达上调较弱。然后利用5'RACE技术获得该基因的5'端序列及全长cDNA序列,并利用RT-PCR方法克隆到其全长编码区(846bp)。将编码区片段构建到植物表达载体上,利用农杆菌介导法获得转基因拟南芥。进一步分析表明,转基因拟南芥对于干旱和低温胁迫的抗性表型与野生型无明显差异,但其离体叶片的失水率和气孔开度均大于野生型。此外,转基因幼苗中气孔开闭相关基因ABI1和ABI2的表达量降低。这些结果表明,Am NAC3可能主要在响应干旱胁迫和调节气孔开闭及叶片保水性中发挥功能,而在抵抗低温胁迫中无明显作用。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
抗旱转录因子论文参考文献
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