乔文青:陆地棉低世代群体纤维品质QTL定位及候选基因功能注释论文

乔文青:陆地棉低世代群体纤维品质QTL定位及候选基因功能注释论文

本文主要研究内容

作者乔文青,严根土,石建斌,王宁,张亚林,许庆华,周红,黄群(2019)在《陆地棉低世代群体纤维品质QTL定位及候选基因功能注释》一文中研究指出:【目的】通过对纤维品质数量性状位点(Quantitative trait loci,QTLs)定位及其基因功能注释,为分子标记辅助育种提供理论依据。【方法】以2个纤维品质有差异的陆地棉品种(系)中棉所49和396289为亲本构建F2群体,以高密度遗传图谱为基础,对3个环境的F2:3家系做包括细度和成熟度等在内的7个纤维品质性状QTLs定位,利用直系同源基因簇(Clusters of orthologous groups,COG)、基因本体(Gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)等数据库对QTLs做基因功能注释。【结果】获得157个与纤维品质有关的QTLs,分布于20条染色体上,A03、A04、D02、A11和D07等有较多性状的QTLs聚集,可能是控制纤维品质性状的关键染色体。共获得13个稳定QTLs,其中qFL-A03-1和qFin-A11-4在3个环境中重复出现,另有9个QTLs则在2个环境中重复出现。通过COG、GO和KEGG对QTLs进行基因功能注释,共获得4 763个候选基因,3个数据库分别注释到2 416、4 188和2 512个基因,在稳定QTLs中共注释到429个基因,其中一些基因可能与纤维品质关系密切。【结论】利用高通量测序获得的高密度遗传图谱有助于获得较多QTLs,有利于纤维品质相关候选基因的筛选及性状的改良,提高育种效率。

Abstract

【mu de 】tong guo dui qian wei pin zhi shu liang xing zhuang wei dian (Quantitative trait loci,QTLs)ding wei ji ji ji yin gong neng zhu shi ,wei fen zi biao ji fu zhu yo chong di gong li lun yi ju 。【fang fa 】yi 2ge qian wei pin zhi you cha yi de liu de mian pin chong (ji )zhong mian suo 49he 396289wei qin ben gou jian F2qun ti ,yi gao mi du wei chuan tu pu wei ji chu ,dui 3ge huan jing de F2:3jia ji zuo bao gua xi du he cheng shou du deng zai nei de 7ge qian wei pin zhi xing zhuang QTLsding wei ,li yong zhi ji tong yuan ji yin cu (Clusters of orthologous groups,COG)、ji yin ben ti (Gene ontology,GO)he jing dou ji yin yu ji yin zu bai ke quan shu (Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)deng shu ju ku dui QTLszuo ji yin gong neng zhu shi 。【jie guo 】huo de 157ge yu qian wei pin zhi you guan de QTLs,fen bu yu 20tiao ran se ti shang ,A03、A04、D02、A11he D07deng you jiao duo xing zhuang de QTLsju ji ,ke neng shi kong zhi qian wei pin zhi xing zhuang de guan jian ran se ti 。gong huo de 13ge wen ding QTLs,ji zhong qFL-A03-1he qFin-A11-4zai 3ge huan jing zhong chong fu chu xian ,ling you 9ge QTLsze zai 2ge huan jing zhong chong fu chu xian 。tong guo COG、GOhe KEGGdui QTLsjin hang ji yin gong neng zhu shi ,gong huo de 4 763ge hou shua ji yin ,3ge shu ju ku fen bie zhu shi dao 2 416、4 188he 2 512ge ji yin ,zai wen ding QTLszhong gong zhu shi dao 429ge ji yin ,ji zhong yi xie ji yin ke neng yu qian wei pin zhi guan ji mi qie 。【jie lun 】li yong gao tong liang ce xu huo de de gao mi du wei chuan tu pu you zhu yu huo de jiao duo QTLs,you li yu qian wei pin zhi xiang guan hou shua ji yin de shai shua ji xing zhuang de gai liang ,di gao yo chong xiao lv 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自棉花学报的乔文青,严根土,石建斌,王宁,张亚林,许庆华,周红,黄群,发表于刊物棉花学报2019年04期论文,是一篇关于陆地棉论文,纤维品质论文,定位论文,基因注释论文,棉花学报2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自棉花学报2019年04期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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