导读:本文包含了超高产橡胶树论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:橡胶树,SSR,AFLP,TRAP
超高产橡胶树论文文献综述
张燕燕,黄华孙,胡彦师,程汉,安泽伟[1](2010)在《云南超高产橡胶树的SSR、AFLP和TRAP分析》一文中研究指出利用SSR、AFLP和TRAP3种分子标记对云南勐腊农场发现的2株超高产橡胶树云PR107、云RRIM501与正常产量单株(PR107、RRIM501)进行遗传分析,共筛选到具有多态性的SSR引物7对、AFLP引物28对和TRAP引物12对,3种标记分别检测到多态性条带9、94和21条,平均每对引物可分别检测到1.16、3.36和1.4条多态性条带,结果表明,2株超高产橡胶树的遗传组成均发生了改变。(本文来源于《热带作物学报》期刊2010年06期)
肖小虎[2](2009)在《橡胶树超高产单株与普通株胶乳差异表达基因的筛选及初步分析》一文中研究指出天然橡胶(顺式-1,4-聚异戊二烯)具有优异的弹性、伸展性、绝缘性和热稳定性,是一种重要的工业原料和不可或缺的战略物资,我国严重短缺,大部分依赖进口。由于地处非传统植胶区,我国的天然橡胶产业是一种严格的资源约束型产业,目前可供扩大的植胶面积已十分有限,大幅度提高单位面积产量已成为我国天然橡胶产业发展的唯一可靠出路。在我国西双版纳垦区发现的超高产橡胶树单株,产量是普通橡胶树的10倍以上,为橡胶树高产机理研究提供了宝贵的实验材料。解析这些橡胶树单株超高产的分子机理,将为橡胶生产上大面积重现超高产现象奠定基础,也为橡胶树高产育种和橡胶树生产技术的革新提供理论依据和技术指导。本文以超高产橡胶树PR107单株及其邻近对照株为材料,利用cDNA-AFLP技术筛选胶乳差异表达基因,通过对所分离差异片段的测序、进一步鉴定及生物信息学分析,结合对橡胶生物合成基因的表达分析,初步探讨了橡胶树超高产的可能机理。主要研究结果如下:1.建立了适于橡胶树胶乳转录组分析的银染cDNA-AFLP技术根据本实验室现有条件,在经典cDNA-AFLP技术基础上进行改进和优化,通过合适酶切组合的选择、最优PCR反应参数的获取以及银染结果的优化等实验,建立了一套适于橡胶树胶乳转录组分析的银染cDNA-AFLP技术。该技术的优点是灵敏度高、重复性好,理论上可覆盖橡胶树胶乳转录组的90%以上。2.全面筛选了在超高产橡胶树和普通橡胶树胶乳中显着差异表达的基因利用我们自己建立的银染cDNA-AFLP技术,系统比较分析了超高产橡胶树和普通株胶乳的转录组,共筛选了两个限制酶对的全部384对引物,最终得到453个经确认的差异表达的基因转录本片段(TDF),其中247个得到功能注释,这些TDF参与细胞代谢、转录与翻译、防御与胁迫应答、蛋白降解和细胞信号传导等,而只有2个直接参与橡胶生物合成。对差异表达基因的初步分析表明,超高产橡胶树乳管活跃的细胞代谢和良好的胁迫应答机制可能是其高产的主要原因。3.比较分析了橡胶合成相关基因在不同产量单株和品系中的表达水平橡胶延伸因子(REF)、小橡胶粒子蛋白(SRPP)和顺式异戊烯基转移酶(CPT)等10个基因直接参与橡胶生物合成,但它们大多数在胶乳中的表达水平与橡胶树单株(超高产单株及普通对照株)和品系(热研8-79、热研7-33-97和PR107)的产胶水平并不正相关,进一步说明橡胶树超高产的主要原因可能不在橡胶生物合成环节。(本文来源于《海南大学》期刊2009-06-01)
方永军[3](2008)在《基于EST的超高产橡胶树胶乳基因表达谱分析及其高产机理探讨以及坛紫菜丝状孢子体基因表达分析》一文中研究指出基因表达序列标签(Expressed Sequence Tag,EST)是指对cDNA克隆进行末端测序所得的长度为100-500bp可以用来代表基因的序列片段。自1991年技术被首次提出以来,因其能低廉、快速、高通量获得基因表达信息,而得到迅速发展。EST已成为公共数据库中增长最快的数据,EST技术亦被广泛应用到分子遗传学、基因组学等生命科学的多个研究领域。除用于研究基因表达外,EST还被应用于新基因发现、基因图谱构建、单核苷酸多态性(SNP)研究、基因芯片技术、选择性剪切识别以及系统进化分析等众多方面。本论文详细介绍了基于EST测序的超高产橡胶乳管和坛紫菜丝状孢子体基因表达分析。天然橡胶是重要的工业原料和战略储备物资,在云南橡胶种植园发现的超高产橡胶树为研究橡胶高产机理,筛选高产相关基因提供了宝贵的材料。本研究中随机挑取了22688个胶乳基因cDNA克隆进行5'端测序,获得20126个高质量的EST,聚类拼接后得到6606条暂定一致性序列(TC:Tentative ConsensusSequences),包括3120个congtig和2986个singlet。通过BLAST注释,5263条序列能找到高度同源序列,注释率为79.7%,剩下1343条为未知序列。注释结果显示超高丰度和高丰度表达基因主要编码与橡胶生物合成和防御相关的蛋白,如REF(2290 ESTs),Hevein(919 ESTs),SRPP(525 ESTs),HSP(151 ESTs)等。对已注释的功能基因进行分类,显示参与细胞代谢、次生代谢和大分子代谢功能的基因普遍高表达,与生物合成和对刺激反应等功能相关的基因表达丰度较高。通过代谢途径分析,我们找到了编码橡胶生物合成过程中的13个主要蛋白,除超高表达的REF和SRPP外,还包括MVA通路上的所有关键酶基因和催化大分子合成的酶基因,由此推测MVA途径为超高产橡胶胶乳中主要的橡胶合成途径。比较分析发现在超高产胶和普通胶之间有65个基因存在显着差异表达(P<0.05),其中11个为高表达,54个为低表达。高表达基因主要与生物合成、刺激反应、防御反应及大分子定位等功能相关。与橡胶合成密切相关的13个蛋白中橡胶延伸因子(REF)、小橡胶粒子蛋白(SRPP)、甲羟戊酸激酶(MK)、磷酸甲羟戊酸激酶(PMK)和异戊烯基焦磷酸异构酶(IPPI)在超高产胶中表达量较高,推测它们与橡胶高产相关。紫菜兼具重要的经济价值和理论研究价值,有着典型的世代交替生活史,已逐渐成为海洋藻类研究的模式生物。坛紫菜是我国特有的栽培品种,本研究是首次对坛紫菜进行大规模的EST测序和分析以及数据库构建,初步探讨了坛紫菜孢子体世代基因表达特征和世代间差异表达基因。随机测序11000个克隆,经过聚类拼接得到2182条TCs,其中Singlet 1310条,Contig872条。经同源搜索发现,690条TC序列能在NCBI数据库中找到其高度同源序列,注释率为32%。功能分析发现孢子体世代功能基因主要集中于细胞过程和代谢过程,其中又以绑定和催化活性功能相关基因比例最高(818 ESTs,占总有效测序量15.3%),其次为大分子复合物、细胞器组成、核酸绑定、水解酶活性、氧化还原等功能。代谢途径分析表明,除磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)以外,PCK型C4固碳途径中的关键酶均被发现,特别是磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶(PEPCK)基因高峰度表达,推测坛紫菜丝状体世代很可能存在高效率的C4固碳途径。尽管坛紫菜与条斑紫菜在形态上非常相似,但在基因组成上却仅有不到30%的相似性,4种热休克蛋白在坛紫菜孢子体特异性表达,44个基因在孢子体中可能表达上调。密码子使用分析显示坛紫菜在进化中受到高GC压力的影响。3680条EST已递交到dbEST数据库(DN604790—DN608469)。这是首次对坛紫菜进行大规模EST测序,所得数据和结论对今后紫菜分子生物学和世代交替分子机制的研究提供了重要的资源。(本文来源于《浙江大学》期刊2008-06-13)
超高产橡胶树论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
天然橡胶(顺式-1,4-聚异戊二烯)具有优异的弹性、伸展性、绝缘性和热稳定性,是一种重要的工业原料和不可或缺的战略物资,我国严重短缺,大部分依赖进口。由于地处非传统植胶区,我国的天然橡胶产业是一种严格的资源约束型产业,目前可供扩大的植胶面积已十分有限,大幅度提高单位面积产量已成为我国天然橡胶产业发展的唯一可靠出路。在我国西双版纳垦区发现的超高产橡胶树单株,产量是普通橡胶树的10倍以上,为橡胶树高产机理研究提供了宝贵的实验材料。解析这些橡胶树单株超高产的分子机理,将为橡胶生产上大面积重现超高产现象奠定基础,也为橡胶树高产育种和橡胶树生产技术的革新提供理论依据和技术指导。本文以超高产橡胶树PR107单株及其邻近对照株为材料,利用cDNA-AFLP技术筛选胶乳差异表达基因,通过对所分离差异片段的测序、进一步鉴定及生物信息学分析,结合对橡胶生物合成基因的表达分析,初步探讨了橡胶树超高产的可能机理。主要研究结果如下:1.建立了适于橡胶树胶乳转录组分析的银染cDNA-AFLP技术根据本实验室现有条件,在经典cDNA-AFLP技术基础上进行改进和优化,通过合适酶切组合的选择、最优PCR反应参数的获取以及银染结果的优化等实验,建立了一套适于橡胶树胶乳转录组分析的银染cDNA-AFLP技术。该技术的优点是灵敏度高、重复性好,理论上可覆盖橡胶树胶乳转录组的90%以上。2.全面筛选了在超高产橡胶树和普通橡胶树胶乳中显着差异表达的基因利用我们自己建立的银染cDNA-AFLP技术,系统比较分析了超高产橡胶树和普通株胶乳的转录组,共筛选了两个限制酶对的全部384对引物,最终得到453个经确认的差异表达的基因转录本片段(TDF),其中247个得到功能注释,这些TDF参与细胞代谢、转录与翻译、防御与胁迫应答、蛋白降解和细胞信号传导等,而只有2个直接参与橡胶生物合成。对差异表达基因的初步分析表明,超高产橡胶树乳管活跃的细胞代谢和良好的胁迫应答机制可能是其高产的主要原因。3.比较分析了橡胶合成相关基因在不同产量单株和品系中的表达水平橡胶延伸因子(REF)、小橡胶粒子蛋白(SRPP)和顺式异戊烯基转移酶(CPT)等10个基因直接参与橡胶生物合成,但它们大多数在胶乳中的表达水平与橡胶树单株(超高产单株及普通对照株)和品系(热研8-79、热研7-33-97和PR107)的产胶水平并不正相关,进一步说明橡胶树超高产的主要原因可能不在橡胶生物合成环节。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
超高产橡胶树论文参考文献
[1].张燕燕,黄华孙,胡彦师,程汉,安泽伟.云南超高产橡胶树的SSR、AFLP和TRAP分析[J].热带作物学报.2010
[2].肖小虎.橡胶树超高产单株与普通株胶乳差异表达基因的筛选及初步分析[D].海南大学.2009
[3].方永军.基于EST的超高产橡胶树胶乳基因表达谱分析及其高产机理探讨以及坛紫菜丝状孢子体基因表达分析[D].浙江大学.2008