导读:本文包含了变异鉴定论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:猪繁殖与呼吸综合征病毒,NADC30-like,遗传变异分析
变异鉴定论文文献综述
赵洁雅,黄炯,王沅,汪萍,参都哈西[1]（2019）在《新疆NADC30-like PRRSV的分离鉴定及遗传变异分析》一文中研究指出为了探明研究新疆地区猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)NADC30-like病毒株XJTK的遗传变异特征,本试验分离病毒株后对该病毒的Nsp2和ORF5基因进行克隆和测序,其片段大小分别为648 bp和603 bp,其中Nsp2基因存在3处不连续共393个核苷酸的缺失,分别缺失333,57和3个核苷酸,完全符合NADC30-like毒株的基因特征;将病毒株XJTK与已知北美型PRRSV代表株VR2332,高致病性PRRSV国内代表株JXA1、TJ,美国分离株NADC30,及NADC30-like国内代表株HENAN-HEB、CHsx1401进行序列比对表明,XJTK株Nsp2和ORF5基因核苷酸序列与参考株同源率分别为36.4%～90.3%和83.7%～93.0%,进一步遗传进化分析表明,其与PRRSV毒株VR2332、JXA1和TJ株亲缘关系较远,与美国分离株NADC30及国内NADC30-like代表株CHsx1401和HENAN-HEB亲缘关系较近,同属于NADC30-like亚群,但仍属于相对独立的分支。本研究是新疆首次证实猪群中存在NADC30-like PRRSV,可为该地区猪繁殖与呼吸综合征的防制提供参考依据。(本文来源于《天津农业科学》期刊2019年12期）
王立刚,张跃博,颜华,张龙超,侯欣华[2]（2019）在《拷贝数变异全基因组关联鉴定猪骨率性状候选基因》一文中研究指出旨在挖掘影响猪骨率性状的全基因组范围内的拷贝数变异(copy number variations, CNVs),并对其所覆盖的基因的作用模式及机理进行研究。本研究利用基于测序深度的CNVcaller软件对大白×民猪F2群体的拷贝数变异进行检测,利用TASSEL软件中的混合线性模型(mixed-linear model, MLM)对骨率性状进行基因组关联分析;查找数据库对CNVs所覆盖基因进行深入分析,利用RNA重测序对75日龄大白猪腿软骨中4个显着CNVs的表达进行检测。结果表明,在F2代群体中,共检测到3 027个CNVs,其中,共有1 251个为缺失,987个为多拷贝,789个为缺失和多拷贝均存在。与骨率在基因组水平相关的CNVs共有4个,均位于7号染色体。4个变异中,有两个未与任何基因重迭。显着性最高的CNV4与骨髓分化相关标记(MYADM)基因重合。对75日龄猪腿软骨基因的表达研究发现,在后腿软骨中仅CNV2的表达丰度较高,推测CNV2通过影响其内部基因的表达量影响骨率,CNV4可能在胚胎发育期起调控作用。综上所述,本研究成功鉴定出影响猪骨率性状的4个CNVs,其中,CNV2和CNV4为影响骨率性状的主效CNVs,推测CNV2通过影响其内部基因的表达量影响骨率,CNV4可能在胚胎发育期起调控作用并最终影响骨率。本试验为今后骨率性状的调控机理研究奠定了理论基础,为猪骨率性状的育种提供了参考。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年11期）
王一鹏,王亚文,徐瑞涛,林依丹,李潭清[3]（2019）在《一株分离自免疫猪场的伪狂犬病病毒的鉴定与变异分析》一文中研究指出为了明确河北某伪狂犬病疫苗免疫猪场的哺乳仔猪出现神经症状和死亡的病因,作者对发病仔猪进行研究时从脑组织中分离到1株病毒,通过PCR、免疫过氧化物酶单层试验(IPMA)、动物试验以及基因序列分析等试验,证明所分离的病毒为伪狂犬病病毒(PRV),命名为HBXT-2018株。皮下接种该病毒后24 h,家兔开始啃咬病毒接种部位皮肤,在44～68 h内全部死亡。抗PRV Bartha-K61株的血清对分离株的中和抗体效价低于1∶8,而抗PRV变异株血清的中和抗体效价为1∶58.9。与Bartha株比较,HBXT-2018株的gB和gC的核苷酸和氨基酸序列多处发生单个或连续几个碱基(或氨基酸)置换、插入和缺失突变,预测的gB和gC上的潜在抗原表位也发生了改变。基于gB、gC和TK的系统进化分析表明,HBXT-2018株与国内流行毒株尤其与2011年之后的流行毒株处于同一个进化分支,而与Bartha株及其他欧美毒株处于不同的进化分支。上述结果表明,分离的PRV HBXT-2018株为致病毒株,其与当前国内流行的PRV变异株具有相同的遗传特征,与Bartha株为代表的欧美流行株的遗传关系远。Bartha-K61株抗血清对分离株的中和作用不明显,提示gB与gC的突变可能与该毒株免疫逃逸、继而导致仔猪发病有关。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年10期）
李慧英,刘星月,曹天旭,王葡萄,陈欣[4]（2019）在《红芽芋组培变异株分子鉴定及其子芋品质分析》一文中研究指出通过组织培养可以获得营养繁殖作物芋的体细胞突变材料,是芋新品种选育的有效途径。课题组前期在红芽芋‘赣芋1号’的组培过程中发现了3个优异的突变株。‘赣芋1号’子芋球茎形状为卵圆形,顶芽粉红色;组培变异株‘江芋2号’为圆形,顶芽白色;‘江芋3号’为圆形,顶芽紫色;‘江芋4号’为棒形,顶芽黄绿色。利用30对SSR引物对红芽芋亲本及其组培后代稳定的变异株(‘江芋2号’、‘江芋3号’、‘江芋4号’)进行分子检测,通过NTSYS 2.10软件进行SHAN聚类分析,并对子芋球茎品质(还原糖、可溶性糖、淀粉、纤维素、维生素C、可溶性蛋白含量)进行分析,进一步明确3份组织变异材料与亲本的遗传差异和球茎品质变异,对其进一步开发利用具有重要意义。分子检测结果表明,3份组培变异株在遗传上与亲本存在一定的遗传差异,其中‘江芋2号’与亲本差异最大,遗传相似系数为0.31。‘江芋2号’与‘江芋4号’最为相近,遗传相似系数达0.96。产量测定表明,子芋个数最多、质量最大的是亲本‘赣芋1号’(141个,12.35 kg),子芋个数最少,质量最小的是‘江芋4号’(4个,0.12kg);孙芋个数最多、质量最大的是‘江芋2号’(229个,8.4kg),孙芋个数最少,质量最小的是‘江芋4号’(4个,0.08kg)。就子芋球茎品质而言,3份组培变异株的淀粉、纤维素和维生素C含量差异较大,其中‘江芋4号’淀粉含量最高,为192.04 mg·g-1;‘江芋2号’淀粉含量最低,为76.88 mg·g-1,‘江芋3号’纤维素含量最高,是‘赣芋1号’的3.5倍;‘赣芋1号’纤维素含量最低且维生素C含量最高。另外还原糖、可溶性糖、可溶性蛋白含量无显着差异。综上,3份变异材料在子芋球茎品质和遗传上均与亲本‘赣芋1号’不同。本研究为进一步开发利用红芽芋组培变异材料提供了一定的理论依据。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21）
邹伟斌,赖月辉,牛贝贝,吴文福,齐冬梅[5]（2019）在《猪伪狂犬病病毒变异株GD株的分离鉴定及TK和gE基因的进化分析》一文中研究指出为了解猪伪狂犬病病毒(Pseudorabies virus,PRV)流行变异毒株的病原学特性及分子遗传变异特点,本研究从广东省某疑似暴发猪伪狂犬病的猪场采集的病料中分离到一株PRV毒株,命名为GD株。该病毒在PK-15细胞中能够产生典型的PRV细胞病变,病毒滴度可达109.0 TCID50/mL。将病毒感染KM SPF小鼠,接种小鼠在4 d内全部死亡,并且均出现典型的PR症状。序列比对结果显示,PRV GD株的TK和gE基因与国内外PRV参考株的核苷酸同源性分别为99.4%～100%和97.6～99.9%,氨基酸同源性分别为99.4%～100%和95.5%～99.8%。基于gE基因的遗传进化分析发现,PRV GD株与国内近几年分离鉴定的流行变异毒株位于同一分支上。与经典株相比,PRV GD株的gE蛋白氨基酸序列在48和496位均有1个天冬氨酸(D)的插入,符合PRV变异株的典型特征。本研究成功分离到一株PRV变异株,为PRV流行变异毒株的防控和新型疫苗的研究提供一定的科学依据。(本文来源于《现代畜牧兽医》期刊2019年10期）
李秀博,刘存,崔玉东,梁琳,张建伟[6]（2019）在《猪A型塞内卡病毒分离鉴定及其VP1基因变异分析》一文中研究指出2017年7月,南方某猪场发生不明病原引起的猪水疱性疾病。为了确诊本次水疱性疾病的病因及了解病原的遗传演化关系,笔者通过RT-PCR方法对引起该场水疱性疾病的病原进行检测,利用BHK21细胞分离病毒,RT-PCR、电镜观察等方法对分离病毒进行鉴定,同时对其主要的抗原基因VP1进行比对分析。RT-PCR检测结果表明导致该猪场发生水疱性疾病的病原为A型塞内卡病毒(Senecavirus A, SVA),将利用BHK21细胞分离并经鉴定的病毒命名为CH/FuJ1/2017株。同源性分析结果显示,CH/FuJ1/2017株与报道的SVV-001株的相似性最低,与分离自美国的USA-GBI29-2015株的相似性最高。基于SVA VP1基因氨基酸序列的分析结果表明,SVA分离株形成一个独立的小分支,与SVV-001株相比,SVA分离株在VP1蛋白的59、62、63、93、97、172位氨基酸存在突变,且位于VP1蛋白的B-C环上和CD-Ⅱ环上,这可能与SVA的细胞嗜性改变有关。综上表明我国SVA分离株具有遗传多样性,部分国内分离株与国外SVA分离株间具有密切的相关性。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年09期）
程月琴,李萍萍,王梦云,王昱程,王红卫[7]（2019）在《基于叶绿体DNA变异的怀山药鉴定体系构建》一文中研究指出通过对20个怀山药和20个其他品种山药叶片总DNA序列比对发现,怀山药在叶绿体DNA片段trnQ-rps16上有210 bp的长度变异,同时在叶绿体DNA片段psbM-trnD上有1个特异碱基突变位点,会导致其他品种山药样品HinP1I酶切位点丢失。根据2个叶绿体DNA片段的序列差异构建怀山药鉴定体系。使用trnQ-rps16和psbM-trnD特异引物分别对山药总DNA进行扩增,trnQ-rps16扩增产物进行凝胶电泳检测,psbM-trnD扩增产物经HinP1I酶切后电泳检测,将检测结果与样品进行比较。采用该体系对29个怀山药以及62个其他品种山药进行检测,均得到正确结果。对20个随机采集的市售山药根状茎样品检测,发现17个为怀山药,3个为其他品种山药,该结果与实际山药品种一致,表明该怀山药鉴定体系适用于怀山药的识别,具有简便快速、结果准确以及适用性广的特点。(本文来源于《河南农业大学学报》期刊2019年05期）
谢思思,孙颖,梁婉,王雪莹,宋文博[8]（2019）在《2017-2018年我国PRRSV分离鉴定与遗传变异分析》一文中研究指出简介猪繁殖与呼吸综合征(Porcinereproductive and respiratory syndrome,PRRS)是由猪繁殖与呼吸综合征病毒(Porcine Reproductive and Respiratory Syndrome Virus,PRRSV)引起的以妊娠母猪繁殖障碍、仔猪呼吸系统疾病为主要症状的一种烈性传染病。自20世纪90年代初在欧美出现以来,PRRS已成为严重危害世界养猪业健康发展的一种重要疾病。PRRS在我国猪群中的流行形势依然严峻,具体表现在流行毒株的种类繁多,毒株之间的重组变异复杂,新毒株常有报道。因此,有必要开展PRRSV在我国的(本文来源于《第叁届中国猪业科技大会暨中国畜牧兽医学会2019年学术年会论文集》期刊2019-09-19）
刘宁,苏琳琳,姚俊,王生奎,高林[9]（2019）在《伪狂犬病病毒云南变异毒株的分离鉴定及gE、gD、gC、TK基因序列分析》一文中研究指出2013-2016年期间,从云南陆良、富源、寻甸及西双版纳规模猪场经Bartha-K61疫苗免疫猪群中发生流产的胎儿内脏组织病料中成功分离获得4株伪狂犬病病毒流行毒株,分别命名为FY-YN-2014、LL-YN-2014、XSBN-YN-2015和XD-YN-2014株。经TCID_(50)测定、动物致病性试验、免疫保护试验及gE、gD、gC、TK基因序列分析,结果显示TCID_(50)分别为10~(-6.083)/100μL、10~(-5.75)/100μL、10~(-6.583)/100μL、10~(-6.5)/100μL。采用Bartha-K61疫苗免疫过的经产母猪血清样品对XSBN-YN-2015分离毒株进行微量病毒中和试验,其结果显示gB抗体阳性、gE抗体阴性的血清样品的中和效价在1∶16～1∶32之间,用gB、gE抗体均为阳性的血清样品时,其中和效价在1∶64～1∶128之间。4株分离毒株接种昆明小白鼠、家兔2～5 d后,均出现奇痒的典型伪狂犬病临床症状。对健康非免疫断奶仔猪进行攻毒,同样出现伪狂犬病的典型发病症状,且能从脑及内脏组织中扩增出伪狂犬病病毒gE基因并成功回收分离到病毒株。在昆明小白鼠上的LD_(50)分别是10~(2.625) TCID_(50)、10~(2.875) TCID_(50)、10~(2.625) TCID_(50)、10~(2.5) TCID_(50)。XSBN-YN-2015株在非免疫断奶仔猪(伪狂犬病病毒gE、gB抗体阴性)测得的LD_(50)=10~(5.33) TCID_(50)。XSBN分离毒株对免疫2次Bartha-K61疫苗的断奶仔猪的攻击试验结果显示,被攻击仔猪均出现高热、精神萎顿、厌食等临床表现,但1周后均能耐过并逐渐康复,提示Bartha-K61疫苗株免疫猪只对当前流行的伪狂犬病病毒云南变异毒株的攻击基本能够提供100%保护。4株伪狂犬病病毒云南流行毒株与近年来国内报道的TJ、HeN1、NH1201等变异毒株的gE、gC、gD及TK基因核苷酸及氨基酸序列均高度一致,同源性高达99%～100%,均分属于同一进化树分支,不过与早期的国内毒株SC、GDSH株,国外毒株Becker、Nia-1、CL15、Kaplan、Kolchis、Hercules、NIA3及疫苗株Bartha相比,均存在一定程度的变异,也未分属于同一进化分支,因此,4株伪狂犬病病毒云南流行毒株也属于变异毒株。(本文来源于《中国兽医学报》期刊2019年09期）
蒋云峰,Ahsan,Habib,郑直,陈国跃,魏育明[10]（2019）在《大麦茎基腐病抗性位点Qcrs.cpi-4H的图位克隆与小麦同源基因优异等位变异的鉴定》一文中研究指出茎基腐病(Fusarium crown rot)是由镰刀菌引起的世界半干旱地区麦类作物的一种常见严重病害,引起麦类作物严重减产。筛选抗性材料,解析其抗病的遗传基础是麦类作物茎基腐病抗性改良的重要基础。我们前期鉴定了一个位于野生大麦4HL的主效抗茎基腐病位点Qcrs.cpi-4H,可以解释45.3%的表型变异。利用1820个株系的近等基因系衍生群体对Qcrs.cpi-4H进行精细定位研究,将其定位于0.09 cM范围,对应637 kb的物理区域,其中包含29个预测基因。通过构建新的遗传群体,候选基因区域被缩小至200 kb的物理区间,其中包含9个预测基因。结合近等基因系转录组分析的结果,我们正在对筛选到的候选基因展开功能验证的相关工作。克隆Qcrs.cpi-4H对理解麦类作物茎基腐病抗性的遗传机制和育种改良具有重要意义。后续鉴定该基因在小麦中同源基因的优异等位变异,可用于小麦抗茎基腐病育种。(本文来源于《第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集》期刊2019-08-11）
变异鉴定论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
旨在挖掘影响猪骨率性状的全基因组范围内的拷贝数变异(copy number variations, CNVs),并对其所覆盖的基因的作用模式及机理进行研究。本研究利用基于测序深度的CNVcaller软件对大白×民猪F2群体的拷贝数变异进行检测,利用TASSEL软件中的混合线性模型(mixed-linear model, MLM)对骨率性状进行基因组关联分析;查找数据库对CNVs所覆盖基因进行深入分析,利用RNA重测序对75日龄大白猪腿软骨中4个显着CNVs的表达进行检测。结果表明,在F2代群体中,共检测到3 027个CNVs,其中,共有1 251个为缺失,987个为多拷贝,789个为缺失和多拷贝均存在。与骨率在基因组水平相关的CNVs共有4个,均位于7号染色体。4个变异中,有两个未与任何基因重迭。显着性最高的CNV4与骨髓分化相关标记(MYADM)基因重合。对75日龄猪腿软骨基因的表达研究发现,在后腿软骨中仅CNV2的表达丰度较高,推测CNV2通过影响其内部基因的表达量影响骨率,CNV4可能在胚胎发育期起调控作用。综上所述,本研究成功鉴定出影响猪骨率性状的4个CNVs,其中,CNV2和CNV4为影响骨率性状的主效CNVs,推测CNV2通过影响其内部基因的表达量影响骨率,CNV4可能在胚胎发育期起调控作用并最终影响骨率。本试验为今后骨率性状的调控机理研究奠定了理论基础,为猪骨率性状的育种提供了参考。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
变异鉴定论文参考文献
[1].赵洁雅,黄炯,王沅,汪萍,参都哈西.新疆NADC30-likePRRSV的分离鉴定及遗传变异分析[J].天津农业科学.2019
[2].王立刚,张跃博,颜华,张龙超,侯欣华.拷贝数变异全基因组关联鉴定猪骨率性状候选基因[J].畜牧兽医学报.2019
[3].王一鹏,王亚文,徐瑞涛,林依丹,李潭清.一株分离自免疫猪场的伪狂犬病病毒的鉴定与变异分析[J].畜牧兽医学报.2019
[4].李慧英,刘星月,曹天旭,王葡萄,陈欣.红芽芋组培变异株分子鉴定及其子芋品质分析[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019
[5].邹伟斌,赖月辉,牛贝贝,吴文福,齐冬梅.猪伪狂犬病病毒变异株GD株的分离鉴定及TK和gE基因的进化分析[J].现代畜牧兽医.2019
[6].李秀博,刘存,崔玉东,梁琳,张建伟.猪A型塞内卡病毒分离鉴定及其VP1基因变异分析[J].畜牧兽医学报.2019
[7].程月琴,李萍萍,王梦云,王昱程,王红卫.基于叶绿体DNA变异的怀山药鉴定体系构建[J].河南农业大学学报.2019
[8].谢思思,孙颖,梁婉,王雪莹,宋文博.2017-2018年我国PRRSV分离鉴定与遗传变异分析[C].第叁届中国猪业科技大会暨中国畜牧兽医学会2019年学术年会论文集.2019
[9].刘宁,苏琳琳,姚俊,王生奎,高林.伪狂犬病病毒云南变异毒株的分离鉴定及gE、gD、gC、TK基因序列分析[J].中国兽医学报.2019
[10].蒋云峰,Ahsan,Habib,郑直,陈国跃,魏育明.大麦茎基腐病抗性位点Qcrs.cpi-4H的图位克隆与小麦同源基因优异等位变异的鉴定[C].第十届全国小麦基因组学及分子育种大会摘要集.2019
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