孙明洁:两种弧菌感染大黄鱼免疫相关基因的SNP位点分析论文

孙明洁:两种弧菌感染大黄鱼免疫相关基因的SNP位点分析论文

本文主要研究内容

作者孙明洁,张娜,徐善良,鲍宝龙,龚小玲(2019)在《两种弧菌感染大黄鱼免疫相关基因的SNP位点分析》一文中研究指出:为了探究大黄鱼(Larimichthys crocea)免疫相关基因的SNP与弧菌抗性关系,分别利用鳗弧菌(Vibrio anguillarum)和副溶血弧菌(Vibrio parahaemolyticus)人工感染大黄鱼。对感染前后抗感群体的转录组进行高通量测序、筛选并分析其抗病差异:(1)筛选氨基酸的非同义突变SNP位点在抗鳗弧菌组有17个,而抗副溶血弧菌组的有28个;(2)一代测序验证结果发现,染色体NW011323507.1上白细胞介素6受体基因(IL-6R)第91 196位碱基G突变为C,导致缬氨酸突变为亮氨酸,该位点G/C在抗鳗弧菌组、对照组样本之间突变基因型CC频率分别为12.5%和0,呈显著性差异(P<0.05);(3)补体C1q/肿瘤坏死因子相关蛋白9(CTRP9)基因在染色体NW011323975.1上的35 665位碱基突变(A-G),在副溶血弧菌抗感易感群体中突变位点基因型GG频率分别为37.5%和0,呈极显著性差异(P<0.01)。结果表明,IL-6R-91196-G/C位点突变与大黄鱼抗鳗弧菌有关联,CTRP9-35665-A/G位点突变与大黄鱼抗副溶血弧菌有关联,这为大黄鱼抗弧菌群体的选育提供了理论依据。

Abstract

wei le tan jiu da huang yu (Larimichthys crocea)mian yi xiang guan ji yin de SNPyu hu jun kang xing guan ji ,fen bie li yong man hu jun (Vibrio anguillarum)he fu rong xie hu jun (Vibrio parahaemolyticus)ren gong gan ran da huang yu 。dui gan ran qian hou kang gan qun ti de zhuai lu zu jin hang gao tong liang ce xu 、shai shua bing fen xi ji kang bing cha yi :(1)shai shua an ji suan de fei tong yi tu bian SNPwei dian zai kang man hu jun zu you 17ge ,er kang fu rong xie hu jun zu de you 28ge ;(2)yi dai ce xu yan zheng jie guo fa xian ,ran se ti NW011323507.1shang bai xi bao jie su 6shou ti ji yin (IL-6R)di 91 196wei jian ji Gtu bian wei C,dao zhi xie an suan tu bian wei liang an suan ,gai wei dian G/Czai kang man hu jun zu 、dui zhao zu yang ben zhi jian tu bian ji yin xing CCpin lv fen bie wei 12.5%he 0,cheng xian zhe xing cha yi (P<0.05);(3)bu ti C1q/zhong liu huai si yin zi xiang guan dan bai 9(CTRP9)ji yin zai ran se ti NW011323975.1shang de 35 665wei jian ji tu bian (A-G),zai fu rong xie hu jun kang gan yi gan qun ti zhong tu bian wei dian ji yin xing GGpin lv fen bie wei 37.5%he 0,cheng ji xian zhe xing cha yi (P<0.01)。jie guo biao ming ,IL-6R-91196-G/Cwei dian tu bian yu da huang yu kang man hu jun you guan lian ,CTRP9-35665-A/Gwei dian tu bian yu da huang yu kang fu rong xie hu jun you guan lian ,zhe wei da huang yu kang hu jun qun ti de shua yo di gong le li lun yi ju 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自上海海洋大学学报的孙明洁,张娜,徐善良,鲍宝龙,龚小玲,发表于刊物上海海洋大学学报2019年05期论文,是一篇关于鳗弧菌论文,副溶血弧菌论文,大黄鱼论文,转录组论文,免疫基因论文,上海海洋大学学报2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自上海海洋大学学报2019年05期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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