导读:本文包含了生物数据库论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:鱼类,物种鉴定,条形码技术,裂腹鱼,身份证,遗传多样性,沈彦,鮡科,四大家鱼,DNA
生物数据库论文文献综述
张晴丹[1]（2020）在《长江鱼有了“身份证”》一文中研究指出2020年,“十年禁渔”在抓紧推行,为长江渔业资源的可持续利用创造条件。作为我国“淡水鱼类的摇篮”,长江渔业资源包含鱼类约400余种,鱼类产量占我国淡水鱼类产量的70%左右,是渔业发展的重要支撑。长江沿岸蓬勃的经济发展和人类活动却给渔业资源带来了(本文来源于《中国渔业报》期刊2020-01-06）
尤红俊,赵倩倩,韩稳琦,常凤军,寿锡凌[2]（2019）在《基于基因表达综合数据库芯片的慢性心力衰竭生物标志物的筛选与生物信息学分析》一文中研究指出目的:对慢性心力衰竭(CHF)患者基因芯片数据进行生物信息学分析,寻找表达特征基因谱。方法:利用基因表达综合数据库(GEO)中基因芯片数据筛选出CHF信息的芯片。分别采用GO富集分析和KEGG富集分析对差异基因进行功能注释和通路分析。结果:CHF患者外周血样品中9个基因存在差异表达,其中4个(CX3CR1、HSPA1L、DYNLL1、MYC)表达上调,5个(JUN、ZNF331、RORA、TRIM13、PPP1R16B)表达下调。这些差异表达的基因被富集到不同的生物学过程或分子功能的子集中,主要集中在14个方面,在分子功能—蛋白质结合方面富集最显着(GO:0005515),同时主要富集在Inflammatory bowel disease (IBD)、MAPK signaling pathway、Erb B signaling pathway和Colorectal cancer四条通路上。结论:通过对GEO数据库中CHF的表达数据分析研究而筛选出的差异表达基因,可能为该疾病的早期诊断治疗和靶向药物的开发提供重要理论依据。(本文来源于《心肺血管病杂志》期刊2019年11期）
伍春艳,雷瑞鹏[3]（2019）在《人体生物样本库与健康信息数据库跨库整合的伦理与法律思考》一文中研究指出因应生命科技的发展愿景与需求,人体生物样本库和健康信息数据库的跨库整合成为未来发展趋势。这种跨库整合将进一步挖掘样本资源的价值,推动精准医疗战略规划的实现。跨库整合的实现并非简单的数据链接,而是通过数据分析探寻其间的关联性或相关性。因此,人体生物样本库和健康信息数据库应充分关注跨库整合过程中的知情同意、隐私保护等问题,探究和规划具备合理性和适配性的伦理指南和法律规范。(本文来源于《自然辩证法研究》期刊2019年10期）
蒋雪莉,李慧,柳菁菁,张琳娜,李文秀[4]（2019）在《恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用》一文中研究指出目的生物样本库对临床转化性研究具有重要的推动作用,随着生物样品数量的日益增加和研究需求的多样性,传统的电子表格管理模式已不能满足庞大样品量及其临床信息高效、集中管理的需求。因此迫切需要对生物样本实行信息化管理,构建恶性肿瘤生物样本及临床信息的信息化管理体系,以实现生物样本信息的系统化、规范化、高效化管理。方法以恶性肿瘤生物样本信息数据库为依托,对恶性肿瘤样品源及样品信息进行结构化设计,通过恶性肿瘤样品组、样品源组、虚拟医用冰箱的构建,整合恶性肿瘤患者基本信息、临床信息等相关信息,并实现查询统计功能。结果成功构建了恶性肿瘤生物样本数据库,包含样品组、样品源组、虚拟医用冰箱组,实现了生物样本的查询统计应用,包括各癌种的样品量统计、各科室血液样品和组织样品的采集量统计,以及对样品管出库管理的应用。结论构建的恶性肿瘤生物样本信息数据库,数据信息完整、结构设计合理,样品组信息具有可扩展性。该数据库满足了我院当前生物样本数据信息化管理的需求,实现了多项查询统计应用和出库应用,为相关恶性肿瘤疾病的研究提供了可靠保障。(本文来源于《中华临床实验室管理电子杂志》期刊2019年03期）
本刊编辑部[5]（2019）在《我刊被英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)数据库收录》一文中研究指出《实用肿瘤学杂志》经英国《国际农业与生物科学研究中心》专家评估,认为符合CABI数据库要求,决定正式收录。英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)数据库,为世界叁大农业科学数据库之一,由120多个国家和地区70多种文字发表的9000多种期刊和连续出版物中选录的英文文摘组成。(本文来源于《实用肿瘤学杂志》期刊2019年04期）
张宇辰[6]（2019）在《牙周炎差异表达基因的筛选、信号通路预测:基于GEO数据库生物信息学分析》一文中研究指出目的探讨牙周炎差异表达基因及其在牙周炎发病机制中的作用和相关信号通路。方法计算机系统检索GEO数据库中关于牙周炎相关基因表达谱芯片数据集,采用GEOR软件分析差异表达基因,绘制火山图。对筛选出的差异表达基因进行基因本体论(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEEG)分析,预测其可能功能及信号通路。采用蛋白-蛋白相互作用数据库(STRING)筛选出的差异表达基因编码蛋白间的相互作用关系。并用Cytohubba软件鉴定信号通路关键基因。结果选取了GSE79705数据集为研究对象,共筛选出差异表达基因40个;其中上调表达38个,下调表达2个。功能富集分析显示,上述差异表达基因主要富集于对脂多糖的反应、免疫球蛋白介导免疫反应的免疫球蛋白产生、MHCⅡ类受体活性、趋化因子活性等。信号通路主要富集于炎症反应、免疫应答和白细胞趋化。40个差异表达基因中,CXCL8为信号通路的关键基因。结论牙周炎患者齿龈沟液中存在差异表达基因谱,且差异表达基因大多富集于炎性反应生物学功能及信号通路, CXCL8在慢性牙周炎发病中可能发挥重要关键基因作用。(本文来源于《中国处方药》期刊2019年07期）
本刊编辑部[7]（2019）在《我刊被英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)数据库收录》一文中研究指出《实用肿瘤学杂志》经英国《国际农业与生物科学研究中心》专家评估,认为符合CABI数据库要求,决定正式收录。英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)数据库,为世界叁大农业科学数据库之一,由120多个国家和地区70多种文字发表的9000多种期刊和连续出版物中选录的英文文摘组成。(本文来源于《实用肿瘤学杂志》期刊2019年03期）
顾泳[8]（2019）在《华山医院启动六大脑病前沿研究》一文中研究指出立足长叁角，探索脑科学前沿研究。首批入驻新虹桥国际医学园区的复旦大学附属华山医院西院迎来开业一周年。昨天召开的长叁角健康一体化暨脑科学前沿创新论坛上，华山医院六大前瞻性脑疾病队列正式启动，包括大型脑血管病、帕金森病、精神障碍、老年痴呆、脑占位、癫痫。华山(本文来源于《解放日报》期刊2019-06-20）
殷雪琴,倪娜,张琴,冷天艳,杨丽华[9]（2019）在《基于Oncomine数据库及生物信息学方法挖掘UBE2C基因在卵巢癌中的表达及作用机制》一文中研究指出目的通过深度挖掘Oncomine数据库中的基因信息,分析泛素结合酶E2C(UBE2C)在卵巢癌中的表达及作用机制。方法收集Oncomine数据库中关于UBE2C研究的信息,对其在卵巢癌的表达水平变化进行分析。采用Kaplan-Meier法分析UBE2C表达水平与卵巢癌患者生存之间的关系,探讨其临床意义。应用Genecards数据库收集与UBE2C基因相关的蛋白,并通过STRING绘制UBE2C相关蛋白网络图,分析蛋白富集的生理过程。结果在Oncomine数据库中共收集14项关于卵巢癌和卵巢正常组织UBE2C基因有差异表达的研究,对其数据进行分析,发现卵巢癌组织中UBE2C基因的表达显着高于卵巢正常组织(P<0.05)。通过Kaplan-Meier生存分析发现高表达UBE2C基因的卵巢癌患者无病生存期、总生存期明显短于低表达者,低表达患者的预后更好(P<0.05)。通过Genecards数据库收集到与UBE2C相关的蛋白有RLIM、CBX4、SIAH2等25个,其相关蛋白富集分析结果显示主要富集在泛素依赖蛋白的分解代谢过程、蛋白质分解代谢过程、蛋白质泛素化、有丝分裂细胞周期中泛素-蛋白连接酶活性的调控、有丝分裂细胞周期的调节、细胞周期等生理过程。结论 UBE2C基因可能通过调节蛋白泛素化过程在卵巢癌发生、发展中发挥作用,高表达时提示卵巢癌患者预后不良,靶向UBE2C可能是一个潜在的肿瘤诊断和治疗工具。(本文来源于《天津医药》期刊2019年06期）
李雪霞,李炫坤,陈兰萍,薛文佳,邹焱堂[10]（2019）在《基于生物信息学数据库研究肿瘤组织细胞表达KIAA0146的机制及意义》一文中研究指出KIAA0146通过直接参与细胞DNA损伤修复过程在肿瘤的发生及治疗中起重要作用.NF-κB通过调控其靶基因在肿瘤细胞DNA损伤修复中发挥作用.但是KIAA0146基因在肿瘤组织细胞中的表达情况以及NF-κB是否调控该基因表达至今并不清楚.文章发现:KIAA0146在宫颈癌细胞中显着高表达.在TNFα处理的淋巴母细胞检测中发现KIAA0146基因区内包含5个NF-κB结合区.在TNFα处理的宫颈癌细胞内检测发现KIAA0146基因区内包含12个富集倍数超过20的NF-κB结合峰.而且这些NF-κB结合峰内均包含NF-κB结合位点(κB位点).此发现表明,TNFα诱导NF-κB通过κB位点结合KIAA0146基因.文章还发现:在宫颈癌细胞内TNFα诱导NF-κB在转录水平上调KIAA0146及2个已知NF-κB靶基因(IL6和NFKBIA)的表达.而且NF-κB特异性抑制剂Bay11-7082阻止TNFα诱导NF-κB在转录水平上调KIAA0146和NFKBIA的表达.因此TNFα诱导NF-κB在转录水平上调KIAA0146的表达可能是该基因在宫颈癌中高表达的分子机制.文章最后发现,KIAA0146基因高表达的宫颈癌、膀胱癌、头颈鳞状细胞癌和肺腺癌患者五年生存率显着提高.(本文来源于《韩山师范学院学报》期刊2019年03期）
生物数据库论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的:对慢性心力衰竭(CHF)患者基因芯片数据进行生物信息学分析,寻找表达特征基因谱。方法:利用基因表达综合数据库(GEO)中基因芯片数据筛选出CHF信息的芯片。分别采用GO富集分析和KEGG富集分析对差异基因进行功能注释和通路分析。结果:CHF患者外周血样品中9个基因存在差异表达,其中4个(CX3CR1、HSPA1L、DYNLL1、MYC)表达上调,5个(JUN、ZNF331、RORA、TRIM13、PPP1R16B)表达下调。这些差异表达的基因被富集到不同的生物学过程或分子功能的子集中,主要集中在14个方面,在分子功能—蛋白质结合方面富集最显着(GO:0005515),同时主要富集在Inflammatory bowel disease (IBD)、MAPK signaling pathway、Erb B signaling pathway和Colorectal cancer四条通路上。结论:通过对GEO数据库中CHF的表达数据分析研究而筛选出的差异表达基因,可能为该疾病的早期诊断治疗和靶向药物的开发提供重要理论依据。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
生物数据库论文参考文献
[1].张晴丹.长江鱼有了“身份证”[N].中国渔业报.2020
[2].尤红俊,赵倩倩,韩稳琦,常凤军,寿锡凌.基于基因表达综合数据库芯片的慢性心力衰竭生物标志物的筛选与生物信息学分析[J].心肺血管病杂志.2019
[3].伍春艳,雷瑞鹏.人体生物样本库与健康信息数据库跨库整合的伦理与法律思考[J].自然辩证法研究.2019
[4].蒋雪莉,李慧,柳菁菁,张琳娜,李文秀.恶性肿瘤生物样本信息数据库的构建及应用[J].中华临床实验室管理电子杂志.2019
[5].本刊编辑部.我刊被英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)数据库收录[J].实用肿瘤学杂志.2019
[6].张宇辰.牙周炎差异表达基因的筛选、信号通路预测:基于GEO数据库生物信息学分析[J].中国处方药.2019
[7].本刊编辑部.我刊被英国国际农业与生物科学研究中心(CABI)数据库收录[J].实用肿瘤学杂志.2019
[8].顾泳.华山医院启动六大脑病前沿研究[N].解放日报.2019
[9].殷雪琴,倪娜,张琴,冷天艳,杨丽华.基于Oncomine数据库及生物信息学方法挖掘UBE2C基因在卵巢癌中的表达及作用机制[J].天津医药.2019
[10].李雪霞,李炫坤,陈兰萍,薛文佳,邹焱堂.基于生物信息学数据库研究肿瘤组织细胞表达KIAA0146的机制及意义[J].韩山师范学院学报.2019