导读:本文包含了平台相关驱动论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:黑色素瘤,基因,驱动基因,错义突变
平台相关驱动论文文献综述
张弟[1]（2018）在《黑色素瘤驱动突变基因的识别及其相关信息平台的构建》一文中研究指出黑色素瘤也称为恶性黑色素瘤,是一种从黑色素细胞发展而来的皮肤癌。它通常是由暴露在阳光紫外线下造成的DNA损伤引起的,基因也参与黑色素瘤的发生。下一代测序技术已经使黑色素瘤整体的基因图谱得到了更全面的认识。癌细胞中突变和其它基因突变协同作用,在癌细胞生长、增殖相关的信号转导通路中扮演重要的角色。通过找出在黑色素瘤细胞中活跃的关键信号通路,同时鉴定出这些通路中的驱动基因,最终可以用靶向药物治疗疾病。本论文中,基于测序数据和其它组学数据,重点围绕着黑色素瘤的基因数据库构建及基因、突变水平上的研究。随着测序技术的发展,越来越多的黑色素瘤相关基因被报道。然而,这些基因是散在分布的,目前还没有数据库系统收录这些基因,对此,我们开发了黑色素瘤基因数据库。此外在基因层面上,我们提出了一种有效鉴定驱动基因的方法。同时为了更准确的定位基因上具体的突变,我们构建了预测黑色素瘤错义突变模型。最后,基于黑色素瘤同义突变数据,探讨同义突变参与黑色素瘤的机制,从而鉴定出黑色素瘤中经常发生有害错义突变的基因。本研究中我们分析了同义突变可能参与黑色素瘤的机制。本文的工作总结如下:1.构建黑色素瘤基因数据库。黑色素瘤基因数据库(MGDB)收录已发表文献中报道的黑色素瘤相关基因。这个数据库的主要目的是建立一个黑色素瘤相关基因的网络,促进黑色素瘤发生机制的研究。通过文献阅读和数据库检索,收集了 527个人类黑色素瘤基因(422个蛋白质编码基因和105个非编码基因)。每个黑色素瘤基因从七个不同的方面(基因的基本信息,表达,甲基化,突变,相互作用,通路和药物信息)进行注释和分析。另外,还提供了基因对应的文献证据。MGDB不仅具有用户友好的网页界面,同时还具有多种浏览方式和搜索功能。此外,为了评估这些黑色素瘤基因,我们进行了网络和生物功能通路富集分析,发现这些基因确实参与黑色素瘤发生的过程。2.黑色素瘤中驱动基因预测算法研究。首先根据突变数据和相互作用数据,把突变对应的基因映射到相互作用网络上,对相互作用网络中的每一个突变基因,构建一个邻居网络,并用统计的方法找出显着性的邻居网络,再结合突变频次,对突变基因进行综合打分。此外,利用多组学数据寻找驱动基因。首先基于黑色素瘤中的多组学数据,采用相似性矩阵融合算法,构建了病人和病人之间的相似性矩阵。通过基因本体注释信息,构建了基因和基因之间的相似性矩阵。再根据样本突变信息构建了基因和样本之间的关系。最后,利用稀疏子空间对驱动基因进行排序。跟其它算法相比,在同样的基准数据集上,我们构建的第一种方法的准确度比它高。排名靠前的基因,也被证明在黑色素瘤中发挥重要的作用,也佐证了此方法的有效性。功能和通路富集分析结果也表明这些驱动基因在黑色素瘤中参与重要作用。3.黑色素瘤错义突变预测模型构建。在我们的研究中,使用20个特征(包含保守性,pfam结构域,功能区域注释,最邻近剪接位点距离,蛋白质结构和氨基酸理化性质)构建的模型用来预测黑色素瘤有害错义突变。训练集上,随机森林十折交叉验证结果AUC达到了94%,测试集上AUC也是94%。与其它方法相比,我们方法的主要优点是在正负样本预测上无偏向性。此外大部分的特征在正负样本中具有很高的区分度,我们推断这些特征在预测有害错义突变发挥重要的作用。4.黑色素瘤同义突变致病机制研究。尽管同义突变不会改变蛋白质序列,但累积的证据表明它们可能通过剪接等机制影响蛋白质功能。然而,在黑色素瘤基因组领域中对同义突变的研究很少。在这项研究中,我们分析了TCGA(癌症基因组图谱)黑色素瘤样本中有害同义突变。通过对同义突变参与疾病的5种机制进行分析,包含剪接调控,转录因子结合,miRNA结合,密码子优化和mRNA二级结构。我们发现同义突变可能参与黑色素瘤调控的机制有叁种:邻近剪接位点的外显子剪接调控或影响DNase I超敏位点或使用非最优密码子。更重要的是,miRNA结合改变的位点比其它位点的进化速率低。根据人类基因组中每个基因对应的同义突变概率,我们通过泊松分布发现12个显着基因含有再发生功能同义突变。其中,GRIN2A和TECTA基因已被报道在黑色素瘤中发挥作用,其余的基因可能对黑色素瘤有潜在的影响。这些发现表明,同义突变在黑色素瘤中起着调控作用,值得研究者关注。(本文来源于《安徽大学》期刊2018-02-01）
张建[2]（2017）在《基于模型驱动的自动化测试平台相关技术研究》一文中研究指出基于模型驱动的嵌入式软件测试方法是近几年国内外研究的热点。它利用模型描述软件的功能,解决了嵌入式软件硬件方面的制约,降低了嵌入式软件测试难度。由于该技术比较复杂,现有的基于模型驱动的嵌入式软件测试工具往往只关注被测软件的测试需求覆盖度,而没有在其他方面做进一步的效率提升。因此对现在绝大多数软件来说,是不能满足测试需求的。本文对真实项目中嵌入式软件系统(无人机飞控系统)的功能和需求进行分析。根据基于模型驱动的测试技术路线制定了目标系统的测试方案。即首先将描述飞控系统功能的UML顺序图模型进行转换得到系统的形式化描述模型(时间自动机网络模型),并且对转换前后的模型进行一致性验证,以确保模型的可靠性。然后通过对形式化模型分析处理得到测试用例集,并在此基础上进行测试用例优化约简,最后执行被优化的测试用例生成软件测试报告。为了提高测试方案的效率,本文对方案中的模型形式化和测试用例优化约简做了相关研究。为了解决复杂系统UML顺序图中多组合片段嵌套的情况,保证系统模型的正确性,并提高测试效率和质量。本文提出了模型形式化转换及一致性验证算法,通过对系统的UML顺序图描述集合进行解析、构建网络关系、转换得到系统形式化模型,并对模型进行一致性验证得到可靠的形式化模型。基于形式化模型自动生成初始测试用例集。该测试用例集中的测试用例是随机生成,会出现测试用例冗余、执行效率低的情况,为了解决这一问题,本文提出测试用例优化约简方法,该方法对初始测试用例集进行分类、排序、约简得到优化测试用例集,从而提高了测试用例执行效率。基于上述的测试方案,本文实现了嵌入式软件测试平台。以无人机飞控系统为被测对象,验证了 UML顺序图转换得到的时间自动机网络模型的可靠性。对该形式化模型生成的测试用例进行优化约简生成优化的测试用例子集。对比执行初始测试用例集和优化的测试用例子集的结果,验证该约简算法的正确性。实验结果表明该算法能够明显的提升测试用例执行效率。整个测试平台能够全面的对嵌入式飞控系统进行测试,并且能够输出可信的测试结果。(本文来源于《杭州电子科技大学》期刊2017-03-01）
李珂[3]（2016）在《我省将建一批创新驱动助力工程相关平台》一文中研究指出本报讯 （ 李珂） 日前，省科协出台我省创新驱动助力工程相关平台建设和管理实施办法。对经批准成立的省产业会企协作创新联盟、省学会协同服务企业创新基地、省国家学会服务站，从创新驱动助力工程专项资金中给予一定的建设和运行补助。根据实施办法，省产(本文来源于《福建日报》期刊2016-04-27）
家伟,石凯,宫顺,李超,王文[4]（2015）在《山东首个“蓝创”基地落户芝罘》一文中研究指出本报讯（通讯员 家伟 石凯 宫顺李超 YMG 王文）昨日，烟台首届蓝色创客高峰论坛暨“山东蓝色创客基地”启动仪式在东山宾馆举行，山东省首个蓝色创客基地落户芝罘区黄务街道。此次高峰论坛上，芝罘区政府分别与中国科学院烟台海岸带生物产业技术创新与育成中心、(本文来源于《烟台日报》期刊2015-08-23）
张玉萍[5]（2008）在《平台相关模型驱动技术及其在场站管理系统中的应用》一文中研究指出随着经济全球化和区域经济一体化进程的加快,集装箱运输快速发展,我国大陆由于经济高速增长,集装箱吞吐量也在逐年增加。集装箱场站是储存和保管空、重箱的场地,随着集装箱运输的快速发展,集装箱场站的业务也变得越来越复杂。实现场站管理的信息化成为场站发展的一个迫切需要。目前已开发出的各种场站系统是基于传统的软件开发过程的,常常是由低层的设计和编码驱动的。场站的管理需求转化为注重快速应对市场竞争,讲究随需而变,要求体现自我特色,因而很难在已投入运行的场站管理系统或传统的场站管理系统产品中得到满足。为解决这些问题,本文主要做了如下几个方面的研究:首先,针对传统的场站管理系统自身在开发过程中存在着生产效率低、可移植性差及系统维护困难等自身的弊端,引入模型驱动架构(Model Driven Architecture,MDA)思想,而MDA能很好地克服以上传统场站管理系统开发存在的弊端。平台无关模型(Platform Independent Model,PIM)、平台相关模型(Platform Specific Model,PSM)和代码是MDA的核心。其次,对MDA的思想、特点与开发过程相关理论进行分析,并在此基础上,研究场站管理系统的平台相关模型,建立一个适合场站业务特点的平台相关模型。同时分析一般代码生成器的结构特点,构建场站管理系统的代码生成器结构。通过分析与比较,最终采用XML定义元数据、Velocity技术定义模板。再次,对场站管理系统进行分析与设计,同时对场站管理系统模型驱动的代码生成器进行设计,该代码生成器的设计实现了静态内容和动态内容相分离,内部事件和外部相分离。最后,将代码自动生成应用到场站管理系统中,在J2EE体系结构上实现场站管理系统代码的自动生成,主要体现在场站管理系统关系模型到SQL和Web模型到代码的自动生成这两个方面。(本文来源于《哈尔滨工业大学》期刊2008-06-01）
平台相关驱动论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
基于模型驱动的嵌入式软件测试方法是近几年国内外研究的热点。它利用模型描述软件的功能,解决了嵌入式软件硬件方面的制约,降低了嵌入式软件测试难度。由于该技术比较复杂,现有的基于模型驱动的嵌入式软件测试工具往往只关注被测软件的测试需求覆盖度,而没有在其他方面做进一步的效率提升。因此对现在绝大多数软件来说,是不能满足测试需求的。本文对真实项目中嵌入式软件系统(无人机飞控系统)的功能和需求进行分析。根据基于模型驱动的测试技术路线制定了目标系统的测试方案。即首先将描述飞控系统功能的UML顺序图模型进行转换得到系统的形式化描述模型(时间自动机网络模型),并且对转换前后的模型进行一致性验证,以确保模型的可靠性。然后通过对形式化模型分析处理得到测试用例集,并在此基础上进行测试用例优化约简,最后执行被优化的测试用例生成软件测试报告。为了提高测试方案的效率,本文对方案中的模型形式化和测试用例优化约简做了相关研究。为了解决复杂系统UML顺序图中多组合片段嵌套的情况,保证系统模型的正确性,并提高测试效率和质量。本文提出了模型形式化转换及一致性验证算法,通过对系统的UML顺序图描述集合进行解析、构建网络关系、转换得到系统形式化模型,并对模型进行一致性验证得到可靠的形式化模型。基于形式化模型自动生成初始测试用例集。该测试用例集中的测试用例是随机生成,会出现测试用例冗余、执行效率低的情况,为了解决这一问题,本文提出测试用例优化约简方法,该方法对初始测试用例集进行分类、排序、约简得到优化测试用例集,从而提高了测试用例执行效率。基于上述的测试方案,本文实现了嵌入式软件测试平台。以无人机飞控系统为被测对象,验证了 UML顺序图转换得到的时间自动机网络模型的可靠性。对该形式化模型生成的测试用例进行优化约简生成优化的测试用例子集。对比执行初始测试用例集和优化的测试用例子集的结果,验证该约简算法的正确性。实验结果表明该算法能够明显的提升测试用例执行效率。整个测试平台能够全面的对嵌入式飞控系统进行测试,并且能够输出可信的测试结果。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
平台相关驱动论文参考文献
[1].张弟.黑色素瘤驱动突变基因的识别及其相关信息平台的构建[D].安徽大学.2018
[2].张建.基于模型驱动的自动化测试平台相关技术研究[D].杭州电子科技大学.2017
[3].李珂.我省将建一批创新驱动助力工程相关平台[N].福建日报.2016
[4].家伟,石凯,宫顺,李超,王文.山东首个“蓝创”基地落户芝罘[N].烟台日报.2015
[5].张玉萍.平台相关模型驱动技术及其在场站管理系统中的应用[D].哈尔滨工业大学.2008