郭燕:基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析论文

郭燕:基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析论文

本文主要研究内容

作者郭燕,乔大河,杨春,李燕,陈正武,陈娟(2019)在《基于全基因组SNP的贵州久安古茶树遗传关系分析》一文中研究指出:贵州久安分布着大量的古茶树资源。为了明晰这些茶树资源间的遗传关系,本研究以分布于久安5个不同区域的100份古茶树为材料,首先利用GBS(genotyping by sequencing)技术对它们的全基因组SNP进行了鉴定,然后基于鉴定到的SNP进行了系统进化树构建、主成分分析以及遗传结构分析。100份古茶树材料共获得548597个高质量SNP,并对这些SNP进行了变异类型注释。系统进化树、主成分分析以及遗传结构分析的结果高度一致,结果表明同一区域内的材料间亲缘关系较近;100份资源可以分为3个类群;古茶园(G)的材料与其他4个区域的材料遗传背景差异较大,这4个区域的资源可能有相同的亲本来源。

Abstract

gui zhou jiu an fen bu zhao da liang de gu cha shu zi yuan 。wei le ming xi zhe xie cha shu zi yuan jian de wei chuan guan ji ,ben yan jiu yi fen bu yu jiu an 5ge bu tong ou yu de 100fen gu cha shu wei cai liao ,shou xian li yong GBS(genotyping by sequencing)ji shu dui ta men de quan ji yin zu SNPjin hang le jian ding ,ran hou ji yu jian ding dao de SNPjin hang le ji tong jin hua shu gou jian 、zhu cheng fen fen xi yi ji wei chuan jie gou fen xi 。100fen gu cha shu cai liao gong huo de 548597ge gao zhi liang SNP,bing dui zhe xie SNPjin hang le bian yi lei xing zhu shi 。ji tong jin hua shu 、zhu cheng fen fen xi yi ji wei chuan jie gou fen xi de jie guo gao du yi zhi ,jie guo biao ming tong yi ou yu nei de cai liao jian qin yuan guan ji jiao jin ;100fen zi yuan ke yi fen wei 3ge lei qun ;gu cha yuan (G)de cai liao yu ji ta 4ge ou yu de cai liao wei chuan bei jing cha yi jiao da ,zhe 4ge ou yu de zi yuan ke neng you xiang tong de qin ben lai yuan 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自植物遗传资源学报的郭燕,乔大河,杨春,李燕,陈正武,陈娟,发表于刊物植物遗传资源学报2019年01期论文,是一篇关于古茶树论文,遗传结构论文,进化关系论文,植物遗传资源学报2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自植物遗传资源学报2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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