导读:本文包含了日本蛇根草论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:日本蛇根草(Ophiorrhiza,japonica),Oj3GT1,基因克隆,生物信息学分析
日本蛇根草论文文献综述
孙威,马玲,徐僡,申欢,鞠志刚[1](2019)在《日本蛇根草Oj3GT1基因的克隆与生物信息学分析》一文中研究指出类黄酮3-O-葡萄糖基转移酶(3GT)是花色苷合成途径中首个修饰酶,在花色苷合成与积累过程中起关键作用。本研究以日本蛇根草作为材料,依据其转录组信息设计Oj3GT1基因特异性引物,通过RT-PCR等分子生物学方法,分离并获得Oj3GT1基因的完整cDNA序列,并对Oj3GT1的信号肽、功能结构域、理化参数、亲/疏水性和二级结构等进行了生物信息学分析。根据分析结果可知,Oj3GT1基因的完整CDS长度为1 377 bp,蛋白分子量为50.922 kD,等电点为6.20,属于亲水性蛋白质,不含有信号肽。同时二级结构分析结果显示,Oj3GT1的蛋白二级结构主要是以不规则卷曲为主。综上所述,Oj3GT1基因的克隆与生物信息学分析,将为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据,同时也为通过基因工程方法调控和改变日本蛇根草花色苷的合成提供理论支撑。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年18期)
孙威,徐僡,林建,马玲,申欢[2](2018)在《日本蛇根草Actin基因片段的克隆及其序列分析》一文中研究指出为研究日本蛇根草功能基因的表达提供内参基因,笔者参照GenBank中桔梗的肌动蛋白基因(Actin)序列设计引物,以日本蛇根草的cDNA为模板,通过RT-PCR方法成功克隆获得日本蛇根草Actin基因片段,并将其命名为OjActin(OjActin片段长469 bp)。功能保守域分析显示OjActin归属于Actin超家族,与其他植物Actin的氨基酸序列同源性达94%以上;系统进化树分析显示,OjActin与咖啡的亲缘关系最近。(本文来源于《贵州师范大学学报(自然科学版)》期刊2018年06期)
徐小蓉,林建,马玲,申欢,鞠志刚[3](2019)在《日本蛇根草OjGT2基因的克隆与序列分析》一文中研究指出糖基转移酶是广泛存在于内质网和高尔基体内的一大类酶,参与体内重要生物活性物质如糖蛋白和糖脂中糖链的形成。本实验以日本蛇根草为研究材料,根据转录组测得的OjGT2基因序列设计引物,通过分子生物学方法克隆获得日本蛇根草OjGT2基因的cDNA序列,并完成了该基因及其编码蛋白质的生物信息学分析。分析显示,OjGT2基因的c DNA长度为1 041 bp,共编码346个AA,预测蛋白相对分子质量为52.37 kD,等电点为5.07,归属于糖基转移酶GTB超家族,含有多个糖基转移酶功能保守域,与其它植物糖基转移酶具有很高的同源性。研究结果将为该基因功能的解析及日本蛇根草糖基化代谢产物的研究提供参考。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年09期)
申欢,林建,李欲轲,潘蓉蓉,彭贵[4](2018)在《日本蛇根草CHI基因原核表达载体的构建及重组蛋白的纯化》一文中研究指出在克隆得到日本蛇根草查尔酮异构酶基因(OjCHI 702 bp)的基础上,完成OjCHI原核表达载体p ET32aCHI的构建,并对OjCHI可溶性重组蛋白的诱导表达条件进行摸索。结果显示,OjCHI可溶性重组蛋白的诱导表达条件为:IPTG浓度0.35 mmol/L,30℃下诱导10 h。按照上述条件制备并纯化获得大量符合预期大小(45.018KD)的OjCHI可溶性重组蛋白,该结果为后续研究OjCHI基因的生物学功能奠定了基础。(本文来源于《贵州师范大学学报(自然科学版)》期刊2018年04期)
孙威,林建,申欢,马玲,鞠志刚[5](2019)在《日本蛇根草糖基转移酶基因Oj GT1的克隆与生物信息学分析》一文中研究指出糖基转移酶(GTs)是花色苷合成过程中最重要的修饰酶之一,其在花色苷合成过程中发挥重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,依据其转录组测序结果,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到OjGT1基因完整的cDNA序列,随后对OjGT1的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽,二级结构等进行生物信息学分析。分析结果显示,OjGT1基因完整的CDS长度为1 413 bp,翻译形成蛋白的分子量为52.087 kD,等电点为5.12,编码形成亲水性蛋白质,不含信号肽。同时二级结构与叁级结构分析显示,OjGT1蛋白结构主要以不规则卷曲为主,其次是α螺旋,延伸链所占比重最小。OjGT1基因的成功克隆与生物信息学分析,将为后续研究茜草目其它植物糖基转移酶提供参考,同时也为日本蛇根草花色苷的生物合成研究提供科学依据。(本文来源于《分子植物育种》期刊2019年02期)
孙威,申欢,陈婷,彭贵,潘蓉蓉[6](2019)在《日本蛇根草花青素还原酶基因的克隆及其生物信息学分析》一文中研究指出花青素还原酶(anthocyanidin reductase, ANR)是原花青素合成途径中的关键酶,同时花青素还原酶对植物花色苷的积累也发挥着重要作用。本研究以日本蛇根草为材料,以其转录组测序结果为基础,设计引物通过RT-PCR方法成功克隆得到日本蛇根草ANR基因完整的cDNA序列,利用生物信息学方法和工具对日本蛇根草ANR基因的功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽、二级结构等进行预测和分析。结果表明,该基因cDNA全长为1 020 bp,编码339个氨基酸,预测其蛋白分子量为36.37 kD,等电点为5.92,为亲水蛋白,不含信号肽序列。综上,本研究成功克隆获得日本蛇根草ANR基因并完成其生物信息学分析,研究结果将为解析该基因的功能奠定基础。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2019年01期)
张宇斌,潘蓉蓉,彭贵,陈婷,申欢[7](2018)在《日本蛇根草无色花青素双加氧酶基因的克隆及其序列分析》一文中研究指出无色花青素双加氧酶(LDOX)是花青素合成途径末端的一个关键酶,在该酶的催化作用下,能将无色花色素转变为有色花色素。本研究采用RT-PCR方法成功克隆出日本蛇根草LDOX基因的cDNA序列后,并对其进行了生物信息学分析。分析结果显示,日本蛇根草LDOX基因的cDNA全长为1 041 bp,编码346个氨基酸,理论等电点为5.50,预测其蛋白分子量为38.63 k D,LDOX蛋白为不稳定蛋白,不存在信号肽,很可能定位在细胞质中。二级结构分析显示,其无规则卷曲的含量最高,与叁级结构预测结果相符合。日本蛇根草LDOX基因的克隆与生物信息学分析对于进一步研究该类酶的结构和功能以及植物花青素的生物合成具有重要意义。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2018年06期)
张宇斌,彭贵,潘蓉蓉,陈婷,申欢[8](2018)在《日本蛇根草黄酮醇合成酶基因的克隆及其序列分析》一文中研究指出黄酮醇合成酶(FLS)是黄酮醇生物合成途径中的重要调控酶,在黄酮醇生物合成过程中发挥着非常重要的作用。为了更好的认识日本蛇根草黄酮醇合成酶基因的结构特征,本研究以日本蛇根草为研究材料,以其转录组测序结果为基础、通过RT-PCR等方法成功克隆得到日本蛇根草FLS基因的完整c DNA序列,并采用生物信息学方法对日本蛇根草的FLS基因序列进行功能结构域、生理和化学参数、亲/疏水性、信号肽、二级结构等预测分析。分析结果表明,该基因序列全长1 008 bp,编码335个氨基酸,预测其蛋白分子量为38.342 k D,等电点为5.87,为亲水性蛋白质,不含有信号肽。(本文来源于《基因组学与应用生物学》期刊2018年07期)
熊辉,徐梦菲,刘艳红,张晓燕[9](2015)在《HPLC法测定日本蛇根草不同组织器官中绿原酸的含量》一文中研究指出目的:测定日本蛇根草不同组织器官及发育周期中绿原酸的含量。方法:建立高效液相色谱法。色谱柱ODS Phenomenex Gemini C18柱(250 mm×4.6 mm,5μm),流动相乙腈:0.4%磷酸溶液(1∶9),流速:1.0 ml·min-1,检测波长:327 nm;柱温:30℃。结果:绿原酸在0.022~1.320μg(r=0.999 9)范围内线性关系良好。2月花期采收的日本蛇根草根、茎、叶、花中绿原酸的含量分别为7.076 7,1.030 7,10.609 5,24.110 3 mg·g-1,其全草与四月果期的全草绿原酸含量分别为18.600 4,14.082 6 mg·g-1。结论:日本蛇根草不同组织器官绿原酸含量差异较大,其中花的含量最高。不同发育周期绿原酸的含量也不同,花期含量明显高于果期。(本文来源于《中国药师》期刊2015年09期)
林永慧,何兴兵,田启建,胡文勇,陈玲[10](2010)在《日本蛇根草生物群落种间的联结性》一文中研究指出对日本蛇根草群落进行野外调查,运用种间联结指数及2×2列联表的χ2统计量,分别测定了日本蛇根草群落中物种总体关联性和群落中主要植物物种对间的联结性。结果表明,群落物种总体表现出一定程度的正关联,群落处于比较稳定的阶段。群落中13种主要植物物种的78个种对中,有37个种对表现出正关联,有40个种对表现出负关联,一个种对表现为相互独立的关系,正负关联种对比例接近1∶1。而日本蛇根草与其它12个物种之间有8对表现为正联结,有4对表现为负联结,但均未达到显着水平。(本文来源于《贵州农业科学》期刊2010年12期)
日本蛇根草论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
为研究日本蛇根草功能基因的表达提供内参基因,笔者参照GenBank中桔梗的肌动蛋白基因(Actin)序列设计引物,以日本蛇根草的cDNA为模板,通过RT-PCR方法成功克隆获得日本蛇根草Actin基因片段,并将其命名为OjActin(OjActin片段长469 bp)。功能保守域分析显示OjActin归属于Actin超家族,与其他植物Actin的氨基酸序列同源性达94%以上;系统进化树分析显示,OjActin与咖啡的亲缘关系最近。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
日本蛇根草论文参考文献
[1].孙威,马玲,徐僡,申欢,鞠志刚.日本蛇根草Oj3GT1基因的克隆与生物信息学分析[J].分子植物育种.2019
[2].孙威,徐僡,林建,马玲,申欢.日本蛇根草Actin基因片段的克隆及其序列分析[J].贵州师范大学学报(自然科学版).2018
[3].徐小蓉,林建,马玲,申欢,鞠志刚.日本蛇根草OjGT2基因的克隆与序列分析[J].分子植物育种.2019
[4].申欢,林建,李欲轲,潘蓉蓉,彭贵.日本蛇根草CHI基因原核表达载体的构建及重组蛋白的纯化[J].贵州师范大学学报(自然科学版).2018
[5].孙威,林建,申欢,马玲,鞠志刚.日本蛇根草糖基转移酶基因OjGT1的克隆与生物信息学分析[J].分子植物育种.2019
[6].孙威,申欢,陈婷,彭贵,潘蓉蓉.日本蛇根草花青素还原酶基因的克隆及其生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学.2019
[7].张宇斌,潘蓉蓉,彭贵,陈婷,申欢.日本蛇根草无色花青素双加氧酶基因的克隆及其序列分析[J].基因组学与应用生物学.2018
[8].张宇斌,彭贵,潘蓉蓉,陈婷,申欢.日本蛇根草黄酮醇合成酶基因的克隆及其序列分析[J].基因组学与应用生物学.2018
[9].熊辉,徐梦菲,刘艳红,张晓燕.HPLC法测定日本蛇根草不同组织器官中绿原酸的含量[J].中国药师.2015
[10].林永慧,何兴兵,田启建,胡文勇,陈玲.日本蛇根草生物群落种间的联结性[J].贵州农业科学.2010
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