导读:本文包含了北京基因型菌株论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:分枝杆菌,结核,抗药性,多种,细菌,基因型,因果律
北京基因型菌株论文文献综述
董文竹,王政,文舒安,张婷婷,霍凤敏[1]（2018）在《耐多药及广泛耐药MTB菌株对SQ109的耐药性及其与北京基因型的关系》一文中研究指出目的评价耐多药(MDR)及广泛耐药(XDR)MTB菌株对抗结核新药乙胺丁醇(EMB)类似物SQ109的耐药性,为SQ109的临床应用提供依据。方法收集首都医科大学附属北京胸科医院2014年7月至2016年12月临床分离培养阳性的MTB菌株,共计223株,包括MDR菌株109株,XDR菌株114株。采用微孔板阿尔玛蓝显色法检测SQ109对菌株的最低抑菌浓度(MIC),确定流行病学界值(ECOFF值);采用RD207基因作为北京基因型和非北京基因型的分离标准进行基因型鉴别,并比较不同基因型菌株耐药情况;根据临床药物敏感性试验(简称"药敏试验")结果将菌株对EMB的耐药情况进行分类,并比较EMB耐药菌株和敏感菌株对SQ109耐药率的差异。结果根据临床菌株对于SQ109的MIC值频数分布情况,确定ECOFF值为1.000 mg/L。XDR菌株耐药率为4.4%(5/114),MDR菌株中无耐药菌株,两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,P> 0.05)。109株MDR菌株中有8株非北京基因型,114株XDR中有10株非北京基因型。北京基因型菌株对SQ109耐药率为2.4%(5/205),非北京基因型菌株中未发现耐药菌株,两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,P> 0.05)。223株菌株中共有138株EMB敏感菌株和85株EMB耐药菌株。EMB敏感菌株对SQ109耐药菌株数为1株,耐药率为0.7%(1/138);EMB耐药菌株对SQ109耐药菌株数为4株,耐药率为4.7%(4/85),两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法检验,P> 0.05)。结论 SQ109在体外药敏试验中表现出对MDR和XDR菌株具有良好的抑菌效果。北京基因型菌株与SQ109耐药性无相关性。菌株对EMB的耐药性与对SQ109的耐药性无相关性。(本文来源于《耐药结核病临床诊治难点与热点问题专题研讨会资料汇编》期刊2018-08-25）
董文竹,王政,文舒安,张婷婷,霍凤敏[2]（2018）在《耐多药及广泛耐药MTB菌株对SQ109的耐药性及其与北京基因型的关系》一文中研究指出目的评价耐多药(MDR)及广泛耐药(XDR)MTB菌株对抗结核新药乙胺丁醇(EMB)类似物SQ109的耐药性,为SQ109的临床应用提供依据。方法收集首都医科大学附属北京胸科医院2014年7月至2016年12月临床分离培养阳性的MTB菌株,共计223株,包括MDR菌株109株,XDR菌株114株。采用微孔板阿尔玛蓝显色法检测SQ109对菌株的最低抑菌浓度(MIC),确定流行病学界值(ECOFF值);采用RD207基因作为北京基因型和非北京基因型的分离标准进行基因型鉴别,并比较不同基因型菌株耐药情况;根据临床药物敏感性试验(简称"药敏试验")结果将菌株对EMB的耐药情况进行分类,并比较EMB耐药菌株和敏感菌株对SQ109耐药率的差异。结果根据临床菌株对于SQ109的MIC值频数分布情况,确定ECOFF值为1.000 mg/L。XDR菌株耐药率为4.4%(5/114),MDR菌株中无耐药菌株,两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,P> 0.05)。109株MDR菌株中有8株非北京基因型,114株XDR中有10株非北京基因型。北京基因型菌株对SQ109耐药率为2.4%(5/205),非北京基因型菌株中未发现耐药菌株,两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,P> 0.05)。223株菌株中共有138株EMB敏感菌株和85株EMB耐药菌株。EMB敏感菌株对SQ109耐药菌株数为1株,耐药率为0.7%(1/138);EMB耐药菌株对SQ109耐药菌株数为4株,耐药率为4.7%(4/85),两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法检验,P> 0.05)。结论 SQ109在体外药敏试验中表现出对MDR和XDR菌株具有良好的抑菌效果。北京基因型菌株与SQ109耐药性无相关性。菌株对EMB的耐药性与对SQ109的耐药性无相关性。(本文来源于《全国结核病诊疗与防控暨第叁届中西医结合治疗基础与临床新进展研讨会、中国医促会结核病分会基础和临床学组第叁届学术年会资料汇编》期刊2018-08-03）
谢彤,孙蕊,巨韩芳,王春花,穆成[3]（2018）在《结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段的多态性研究》一文中研究指出目的揭示结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)北京基因型菌株的进化路径,在进化过程中产生的各个进化分支,以及每个分支的北京基因型菌株在人群中的流行情况。方法收集2014年1月至2016年4月天津地区临床分离的567株MTB菌株,首先采用多重PCR试验分析菌株基因组中差异片段207(RD207)的缺失情况,以鉴定收集的菌株是否为北京基因型;然后分析所有的北京基因型MTB菌株基因组中差异区域(region of difference,RD)105、RD181、RD150和RD142的缺失情况,以及菌株基因组NTF(noise transfer function)区中插入序列6110(IS6110)的存在情况。结果 567株临床分离的MTB菌株中,517株(91.2%)为北京基因型菌株。所有北京基因型菌株中,447株(86.5%)为NTF区含有IS6110的北京基因型现代株;70株(13.5%)为NTF区不含IS6110的北京基因型古代株。基于大片段的多态性分析,北京基因型菌株被分为5个亚型,其中RD181(+)的北京基因型菌株为22株(4.3%),且全部为北京基因型古代株。RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的北京基因型古代株分别为41株(7.9%)和7株(1.4%)。447株现代菌株中,RD181(-)/RD150(+)和RD181(-)/RD150(-)的分别为404株(78.1%)和43株(8.3%)。结论 MTB北京基因型中的现代株是天津地区的主要流行株;北京基因型MTB在人群传播流行中已经进化出5个分支,其中RD181(-)/RD150(+)的北京基因型现代株为主要的流行分支。(本文来源于《全国结核病诊疗与防控暨第叁届中西医结合治疗基础与临床新进展研讨会、中国医促会结核病分会基础和临床学组第叁届学术年会资料汇编》期刊2018-08-03）
李雨晴[4]（2017）在《中国北方四省（区）结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及耐药性分析》一文中研究指出目的了解中国北方甘肃、内蒙古、西藏和新疆四省(自治区)的结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及其对4种一线抗结核药物链霉素、利福平、异烟肼和乙胺丁醇的耐药状况,分析其耐药的影响因素、北京基因型与耐药性间的相关性,为我国北方地区结核病防治提供基础科学依据。方法从北方四省(自治区)选取了662株结核分枝杆菌,采用比例法药敏试验进行药物敏感性检测,运用Spoligotyping进行基因分型,BioNumerics 5.1软件聚类分析。采用IBM SPSS Statistics 21.0软件进行?~2检验和非条件二分类Logistic回归分析,P(27)0.05为差异有统计学意义。结果Spoligotyping基因分型发现662株结核分枝杆菌呈87种基因型,基因多态性为13.14%,北京基因型占82.18%;西藏、内蒙古、甘肃和新疆的北京基因型所占比例分别为91.41%、84.77%、79.55%和63.30%,新疆和西藏存在CAS家族。662株结核分枝杆菌的总耐药率为41.84%,复治耐药率(68.56%)高于初始耐药率(27.77%);西藏、甘肃、新疆和内蒙古的耐药率分别为64.42%、50.00%、40.37%和27.81%;单耐药率为12.24%,耐多药率为20.69%,复治耐多药率(42.79%)高于初始耐多药率(9.01%);对链霉素、异烟肼、利福平和乙胺丁醇的耐药率分别为29.00%、28.55%、28.10%和8.46%;初治患者对链霉素的耐药率(18.94%)最高,而复治患者对利福平的耐药率(53.28%)最高。多因素Logistic回归分析结果显示,患者类型对耐药和耐多药结核病的产生有正效应(P(27)0.05),复治患者发生耐药和耐多药的危险性分别是是初治患者的4.876倍(95%CI 3.387?7.020)和7.398倍(95%CI4.703?11.637),西藏耐药和耐多药发生的危险性在四个地区中最高。不同性别、年龄的结核病患者分离的结核分枝杆菌耐药性差异无统计学意义,北京基因型与结核分枝杆菌耐药性无明显相关性(P﹥0.05)。结论我国北方四省(区)结核分枝杆菌以北京基因型为主要流行型,并在西藏和新疆发现独特的CAS基因型;耐多药结核病流行情况较严重,特别是西藏,复治是产生耐药和耐多药结核病的主要危险因素。(本文来源于《南华大学》期刊2017-05-01）
孙高翔,李迪[5]（2015）在《结核分枝杆菌北京基因型菌株流行的可能机制》一文中研究指出北京基因型菌株是结核分枝杆菌的一个进化支,通过分子流行病学、实验和临床研究调查,基于其传播和引起疾病能力的增强及遗传同质性,可能比其他结核分枝杆菌菌株更有选择性优势。不同的细胞实验和动物模型证明,相比其他基因型菌株,北京基因型菌株毒力更强,引起更严重的组织病理学改变,加速疾病的进程同时增加死亡率,抑制宿主免疫反应。文献报道显示,北京基因型菌株具有独特的基因型,其超毒力可以通过与宿主免疫系统的相互作用来说明。本文综述近年北京基因型菌株流行及菌株毒力方面的研究成果。(本文来源于《中国微生态学杂志》期刊2015年04期）
陈志,陈佳,先德强,岳蕴瑶,江智辉[6]（2012）在《绵阳地区结核分支杆菌北京基因型菌株的鉴定和感染因素分析》一文中研究指出目的鉴定MTB北京基因型,了解北京基因型菌株在绵阳地区的分布特征,为本地结核病的防治和分子流行病学研究提供科学依据。方法随机选取绵阳涪城和江油两个区县的结核分支杆菌临床分离菌株,收集患者流行病学资料。菌株常规培养,收集菌体,提取基因组DNA,采用RD105缺失基因检测法鉴定北京基因型菌株。药物敏感性试验采用比例法。率的比较采用χ2检验。结果共对79株结核分支杆菌了进行北京基因型鉴定,北京基因型菌株33株,占41.77%;非北京基因型菌株46株,占58.23%。北京基因型菌株耐药率(36.36%)明显高于非北京基因型菌株耐药率(10.87%),差异有统计学意义(χ2=7.395,P=0.007)。患者性别、年龄组、所在地区和治疗史与感染北京基因型菌株无关。结论北京基因型菌株在绵阳地区呈一般流行趋势。北京基因型菌株感染与耐药相关,与患者性别、年龄、所在地区和治疗史无关。(本文来源于《现代预防医学》期刊2012年12期）
赵秀芹,董海燕,刘志广,吕冰,蒋毅[7]（2012）在《中国部分地区结核分枝杆菌北京基因型菌株分布初步分析》一文中研究指出目的初步了解结核分枝杆菌北京基因型菌株在中国不同地区的分布情况。方法采用间隔区寡核苷酸分型(spacer oligonucleotide typing,Spoligotyping)方法对1 603株分离自7个省、市、自治区的结核分枝杆菌进行分型分析,确定北京基因型菌株在不同地区所占的比例。结果根据Spoligotyping分型结果及北京基因型菌株的定义,1 603株结核分枝杆菌中1 158株为北京基因型菌株,占72.24%。北京地区北京基因型菌株所占的比例最高为92.59%,其后依次为西藏(90.38%),吉林(89.88%),陕西(80.00%),新疆(65.36%),广西(55.29%),福建(54.50%)。结论北京基因型菌株为主要的流行菌株,但是不同地区北京基因型菌株所占的比例并不相同,北方地区北京基因型菌株的比例高于南方地区。(本文来源于《实用预防医学》期刊2012年05期）
刘海灿[8]（2011）在《两株结核分枝杆菌北京基因型菌株全基因组测序和初步分析》一文中研究指出目的对两株结核分枝杆菌北京基因型临床分离菌株(CCDC5079和CCDC5180)进行全基因组测序,通过与其它8株已经完成全基因组测序的结核分枝杆菌复合群(Mycobacterium tuberculosis complex, MTBC)菌株数据进行比对分析,了解结核分枝杆菌北京基因型菌株的基因组分子特征,并结合菌株的药物敏感性信息,分析可能与耐药相关的基因组差异,为进一步研究提供基础。方法收集培养临床分离的结核分枝杆菌菌株,进行药物敏感性检测和分子分型鉴定,选取两株典型的北京基因型菌株,包括对叁种一线抗结核药物(异烟肼、利福平和链霉素)全敏感和全耐药菌株各1株；在改良罗氏培养基上传代培养,收集菌体,用CTAB法提取全基因组DNA；用Roche454GS FLX测序仪进行全基因组高通量测序。测序结果用随测序仪提供的拼接软件进行初始序列的拼装,得到测序重迭群(contigs),与参考序列进行blast比对后,确定其位置关系和测序未覆盖区(gaps)的大小。测序未覆盖区和测序低值区,经特异性PCR扩增后,用ABI3730测序仪进行测序。基因组全长序列用Phred、Phrap和Consed软件包进行拼装和碱基修正,最终得到CCDC5079和CCDC5180两株的全基因组序列数据,与从NCBI genome网站下载的结核分枝杆菌复合群菌株的全基因组数据,在基因组水平进行比对、分析。结果经临床标本的分离培养、菌种鉴定、药物敏感性检测和分子分型等,确认两株典型结核分枝杆菌北京基因型临床分离菌株CCDC5079和CCDC5180,其中,CCDC5079对所有叁种抗结核一线药物均敏感,CCDC5180为全耐药。测序得到CCDC5079和CCDC5180两株的全基因组大小分别为4414324bp和4414344bp,其基因组测序数据的准确度分别为99.9996%和99.9988%,预测的蛋白质编码序列(predicted protein coding sequences, CDSs)分别为4158个和4161个,CDSs平均大小分别为971bp和970bp。通过与已完成全基因组测序的MTBC菌株的全基因组数据的比对分析发现,在全基因组水平,存在结核分枝杆菌北京基因型特异性的609个单核苷酸多态性(Single-nucleotide polymorphism, SNP)位点和84个插入和缺失序列(Insertion and Deletion, Indel)位点;可能与结核分枝杆菌药相关的156个SNP位点,以及其它分子特征。结论成功完成了两株结核分枝杆菌北京基因型菌株的全基因组测序工作,为进一步研究结核分枝杆菌北京基因型菌株的基因结构特征和其分子进化提供了全基因组序列数据。对全基因组数据的初步分析发现,结核分枝杆菌北京基因型菌株基因组序列具有某些特异性的SNP、 Indel及其它分子生物学特征,这些分子生物学特征将为结核分枝杆菌北京基因型的快速鉴定、菌株耐药性检测及其耐药和致病机制研究等多个方面提供良好基础。并将促进对结核分枝杆菌北京基因型及结核分枝杆菌生物学本质的认识,对于最终实现控制结核病的目标具有重要意义。(本文来源于《中国疾病预防控制中心》期刊2011-05-01）
乔可,王辉,杨崇广,罗涛,梅建[9]（2010）在《可变数目串联重复序列在上海崇明岛地区结核分枝杆菌北京基因型菌株微进化研究中的应用》一文中研究指出本文通过对上海市疾病预防控制中心收集并保存的、来源于上海崇明岛地区痰培养阳性肺结核患者的135株结核分枝杆菌北京基因型菌株进行可变数目串联重复序列(VNTR)和单核苷酸多态性(SNP)基因分型,并构建最小生成树(MST),来寻找适合研究北京基因型菌株微进化的VNTR组合及区分不同亚型的分子标志。结果显示,16位点VNTR与SNP的分型结果最匹配,适合于研究该地区北京基因型菌株的微进化;SNP单倍型主要集中在ST10(42.2%)、ST19(30.4%)、ST22(14.1%)3个类型;4个VNTR位点(Mtub21、QUB26、MIRU16和QUB4156)可能是区分北京基因型菌株不同亚型的分子标志。(本文来源于《微生物与感染》期刊2010年04期）
彭哲,朱朝敏,幸琳琳,刘芮汐[10]（2010）在《结核分枝杆菌北京基因型菌株与重庆地区结核患儿耐药表型的相关分析》一文中研究指出目的研究结核分枝杆菌北京基因型菌株与结核患儿耐药表型及其相关因素。方法采用定向缺失多重酶链聚合反应技术(deletion-targeted multiplex PCR,DTM-PCR)对从143例患儿分离得到的结核分枝杆菌进行北京基因型菌株鉴定,并使用绝对浓度法进行药敏实验。收集患者的性别、年龄、居住地、卡介苗接种史和结核性脑膜炎病史等相关因素资料。采用χ2检验和Fisher确切概率法分析北京基因型与相关因素以及耐药表型之间的关系。结果在143株结核分枝杆菌中,91株为北京基因型,占63.6%,北京基因型菌株与年龄、性别、居住地、卡介苗接种和结核性脑膜炎无关(P>0.05)。北京基因型菌株在耐链霉素菌株(16.5%,15/91)和耐异烟肼菌株(15.4%,14/91)中的比例显着高于非北京基因型(3.8%,2/52;3.8%,2/52)(P<0.05)。结论北京基因型菌株是重庆地区儿童结核患者中流行的优势菌群,患儿的年龄、性别、居住地、是否接种卡介苗和是否为结核性脑膜炎与北京基因型菌株无关,感染北京基因型菌株的结核患儿更易出现链霉素和异烟肼耐药。(本文来源于《第叁军医大学学报》期刊2010年23期）
北京基因型菌株论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的评价耐多药(MDR)及广泛耐药(XDR)MTB菌株对抗结核新药乙胺丁醇(EMB)类似物SQ109的耐药性,为SQ109的临床应用提供依据。方法收集首都医科大学附属北京胸科医院2014年7月至2016年12月临床分离培养阳性的MTB菌株,共计223株,包括MDR菌株109株,XDR菌株114株。采用微孔板阿尔玛蓝显色法检测SQ109对菌株的最低抑菌浓度(MIC),确定流行病学界值(ECOFF值);采用RD207基因作为北京基因型和非北京基因型的分离标准进行基因型鉴别,并比较不同基因型菌株耐药情况;根据临床药物敏感性试验(简称"药敏试验")结果将菌株对EMB的耐药情况进行分类,并比较EMB耐药菌株和敏感菌株对SQ109耐药率的差异。结果根据临床菌株对于SQ109的MIC值频数分布情况,确定ECOFF值为1.000 mg/L。XDR菌株耐药率为4.4%(5/114),MDR菌株中无耐药菌株,两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,P> 0.05)。109株MDR菌株中有8株非北京基因型,114株XDR中有10株非北京基因型。北京基因型菌株对SQ109耐药率为2.4%(5/205),非北京基因型菌株中未发现耐药菌株,两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法,P> 0.05)。223株菌株中共有138株EMB敏感菌株和85株EMB耐药菌株。EMB敏感菌株对SQ109耐药菌株数为1株,耐药率为0.7%(1/138);EMB耐药菌株对SQ109耐药菌株数为4株,耐药率为4.7%(4/85),两者耐药率差异无统计学意义(Fisher精确概率法检验,P> 0.05)。结论 SQ109在体外药敏试验中表现出对MDR和XDR菌株具有良好的抑菌效果。北京基因型菌株与SQ109耐药性无相关性。菌株对EMB的耐药性与对SQ109的耐药性无相关性。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
北京基因型菌株论文参考文献
[1].董文竹,王政,文舒安,张婷婷,霍凤敏.耐多药及广泛耐药MTB菌株对SQ109的耐药性及其与北京基因型的关系[C].耐药结核病临床诊治难点与热点问题专题研讨会资料汇编.2018
[2].董文竹,王政,文舒安,张婷婷,霍凤敏.耐多药及广泛耐药MTB菌株对SQ109的耐药性及其与北京基因型的关系[C].全国结核病诊疗与防控暨第叁届中西医结合治疗基础与临床新进展研讨会、中国医促会结核病分会基础和临床学组第叁届学术年会资料汇编.2018
[3].谢彤,孙蕊,巨韩芳,王春花,穆成.结核分枝杆菌北京基因型菌株大片段的多态性研究[C].全国结核病诊疗与防控暨第叁届中西医结合治疗基础与临床新进展研讨会、中国医促会结核病分会基础和临床学组第叁届学术年会资料汇编.2018
[4].李雨晴.中国北方四省（区）结核分枝杆菌北京基因型菌株的流行特征及耐药性分析[D].南华大学.2017
[5].孙高翔,李迪.结核分枝杆菌北京基因型菌株流行的可能机制[J].中国微生态学杂志.2015
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[8].刘海灿.两株结核分枝杆菌北京基因型菌株全基因组测序和初步分析[D].中国疾病预防控制中心.2011
[9].乔可,王辉,杨崇广,罗涛,梅建.可变数目串联重复序列在上海崇明岛地区结核分枝杆菌北京基因型菌株微进化研究中的应用[J].微生物与感染.2010
[10].彭哲,朱朝敏,幸琳琳,刘芮汐.结核分枝杆菌北京基因型菌株与重庆地区结核患儿耐药表型的相关分析[J].第叁军医大学学报.2010