比较分子力场分析法论文-冯长君,何红梅,李靖

比较分子力场分析法论文-冯长君,何红梅,李靖

导读:本文包含了比较分子力场分析法论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:叁唑并噻二唑衍生物,PTP1B,抑制活性,比较分子力场分析

比较分子力场分析法论文文献综述

冯长君,何红梅,李靖[1](2019)在《新型叁唑并噻二唑衍生物对PTP1B的抑制活性的比较分子力场分析研究》一文中研究指出基于比较分子力场分析(CoMFA)方法建立21种新型叁唑并噻二唑衍生物对蛋白酪氨酸磷酸酯酶1B(PTP1B)的抑制活性(pM_P)的叁维定量构效关系(3D-QSAR)。训练集中17个化合物用于建立预测模型,测试集5个化合物作为模型验证。已建立的CoMFA模型的交叉验证系数(R_(cv)~2)、非交叉验证系数(R~2)分别为0. 432、0. 975,说明所建模型具有较强的稳定性和良好的预测能力。该模型中立体场、静电场贡献率依次为59. 2%、40. 8%,表明影响抑制活性(pM_P)的主要因素是取代基的空间位阻及疏水性,其次是取代基的氢键及配位作用。基于此研究结果,设计了3个具有较高抑制活性的新化合物,有待医学实验验证。(本文来源于《化学通报》期刊2019年10期)

牟佳佳,徐文方,尹文刚[2](2015)在《L-精氨酸类氨肽酶N抑制剂的比较分子力场分析》一文中研究指出氨肽酶N(aminopeptidase N,APN)在肿瘤细胞的生长、侵袭、转移和新血管生成等过程中发挥着关键作用,是抗肿瘤药物的重要靶点。本文应用比较分子力场分析法(Co MFA)对52个L-精氨酸类APN抑制剂进行了叁维定量构效关系分析,得到的模型q2=0.532,最佳主成分数为4,回归相关系数r2=0.907,F=82.479,SEE=0.196,立体场和静电场对构效方程的贡献分别为64.3%和35.7%,结果表明模型有较好的预测能力。最后,用模型的系数等势图解释了分子结构与活性的关系,为进一步对L-精氨酸衍生物进行结构修饰提供依据。(本文来源于《计算机与应用化学》期刊2015年10期)

王勤金,班树荣,李青山[3](2014)在《磺酰脲类乙酰羟基酸合成酶抑制剂的拓扑物比较分子力场分析》一文中研究指出磺酰脲类除草剂是一类高选择性、广谱、低毒的化合物,在世界范围内得到了广泛的应用。本文采用拓扑物比较分子力场分析(Topomer-CoMFA)对75个磺酰脲类化合物与植物源野生型拟南芥AHAS酶的离体相互作用进行了叁维定量构效关系研究,构建了Topomer CoMFA模型,该模型具有较强的预测能力(交叉验证相关系数q2为0.890,非交叉验证相关系数r2为0.967)。此模型对测试集的10个化合物的pKi值进行预测,其预测值与实际值基本一致。(本文来源于《化学通报》期刊2014年06期)

张瀛,张立伟,李嘉宾[4](2010)在《二氢嘧啶酮类α_(1A)-肾上腺素受体拮抗剂的比较分子力场分析》一文中研究指出采用比较分子力场分析(CoMFA)构建了二氢嘧啶酮类α1A-肾上腺素受体拮抗剂的叁维定量构效关系模型。交叉验证相关系数(q2)、非交叉验证相关系数(r2)和标准偏差(SEE)分别为0.604、0.987和0.105,研究结果显示静电场对活性的影响大于立体场。所构建的模型具有一定的预测能力,可用于指导设计新的二氢嘧啶酮类α1A-肾上腺素受体拮抗剂,为该类化合物的结构优化提供理论依据。(本文来源于《中国药科大学学报》期刊2010年03期)

肖爱婧,安丽英,胡远东,张卓勇[5](2007)在《比较分子力场分析法研究3-芳基喹唑啉酮衍生物的定量构效关系研究》一文中研究指出运用比较分子力场分析(CoMFA)方法对45个3-芳基喹唑啉酮衍生物进行了叁维定量构效关系研究.考察了不同的步长、探针原子以及电荷的计算方法等对构建模型的影响.建立的最佳模型交叉验证相关系数(q2)为0.662,非交叉验证相关系数(R2)为0.963,标准偏差(s)为0.203.该模型的建立为选择性雌激素受体β亚型调节剂的结构优化提供了理论支持.(本文来源于《首都师范大学学报(自然科学版)》期刊2007年05期)

杨伟华,冯长君,沐来龙[6](2006)在《应用比较分子力场分析法研究氯代苯酚化合物结构与活性的相关性(英文)》一文中研究指出苯酚是一类对水生生物有严重危害作用的工业化合物。通过比较分子力场分析(CoMFA)法建立标题化合物对发光菌和浮萍活性的叁维定量结构-活性关系(3D-QSAR)模型。其中,对发光菌的研究结果为:交叉验证系数q2=0.921,传统的相关系数(非交叉验证系数)R2=0.990。对浮萍的研究结果为:交叉验证系数q2=0.931,传统的相关系数(非交叉验证系数)R2= 0.995。取得优于文献的结果。(本文来源于《计算机与应用化学》期刊2006年12期)

王涛,祝晨蔯,陈传兵[7](2006)在《比较分子力场分析法在天然药物成分研究中的应用》一文中研究指出目的综述了比较分子力场分析法(CoMFA法)的主要原理、优缺点及其在天然药物成分研究中的应用进展。方法利用天然药物成分结构不同进行分类,分别对各类天然药物成分叁维构效研究的国内外现状进行归纳、分析。结果CoMFA法在各类天然药物成分的构效研究中均可获得预测能力强的定量构效关系(QSAR)模型。结论CoMFA法具有很好的应用前景。(本文来源于《中国药学杂志》期刊2006年24期)

尹文刚,徐文方,李亚林[8](2005)在《吡咯烷类基质金属蛋白酶-2抑制剂的比较分子力场分析》一文中研究指出目的通过CoMFA方法来获得吡咯烷类基质金属蛋白酶-2(MMP-2)抑制剂的叁维定量构效关系。方法应用FlexX对接方法与构象系统搜索程序来确定MMP-2抑制剂的可能活性构象,并以此活性构象为模板构建28个小分子化合物的叁维结构,最后运用CoMFA方法对MMP-2进行定量构效关系研究。结果CoMFA方法建立了定量构效关系模型,交叉验证系数q2=0.803,回归系数r2=0.989,F=293.663,SEE=0.076。结论该模型具有可靠性和可预测性,该模型的建立为吡咯烷类基质金属蛋白酶抑制剂的结构优化提供了理论支持。(本文来源于《中国药物化学杂志》期刊2005年05期)

习保民,赵文娜,邹建卫,倪沛洲[9](2004)在《α_1-AR拮抗剂DDPH类似物的比较分子力场分析》一文中研究指出利用比较分子力场分析(CoMFA)方法, 建立苯(氧)烷胺类α1-肾上腺素受体拮抗剂DDPH及其类似物的叁维定量构效关系模型。交叉验证回归系数q2、非交叉验证回归系数r2和标准偏差SEE分别为0.457, 0.953, 0.208,研究结果显示立体场比静电场对活性的影响更大。所得模型具有一定的预测能力,可用来指导设计新的苯氧烷胺类α1-肾上腺素受体拮抗剂 ,并为以后进一步的工作提供依据。(本文来源于《结构化学》期刊2004年08期)

郑剑斌,闻韧,罗小民,蒋华良[10](2004)在《3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物的叁维定量构效关系(比较分子力场分析)研究(英文)》一文中研究指出目的研究 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物结构和对γ 氨基丁酸摄取抑制活性之间的关系。方法使用叁维定量构效关系 (3D QSAR)———比较分子场分析 (CoMFA)方法进行构效关系研究。结果交叉验证系数q2和非交叉验证系数r2 分别为 0 72 6和 0 986 ,方差比F为 117 5 6 2 ,标准估计误差 (SEE)为 0 0 6 2。结论这些数值表明所得的CoMFA模型有实际意义 ,并且对 3 哌啶甲酸和四氢烟酸的 4 ,4 二芳基 3 丁烯衍生物抑制活性具有较好的预测能力。(本文来源于《中国药物化学杂志》期刊2004年04期)

比较分子力场分析法论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

氨肽酶N(aminopeptidase N,APN)在肿瘤细胞的生长、侵袭、转移和新血管生成等过程中发挥着关键作用,是抗肿瘤药物的重要靶点。本文应用比较分子力场分析法(Co MFA)对52个L-精氨酸类APN抑制剂进行了叁维定量构效关系分析,得到的模型q2=0.532,最佳主成分数为4,回归相关系数r2=0.907,F=82.479,SEE=0.196,立体场和静电场对构效方程的贡献分别为64.3%和35.7%,结果表明模型有较好的预测能力。最后,用模型的系数等势图解释了分子结构与活性的关系,为进一步对L-精氨酸衍生物进行结构修饰提供依据。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

比较分子力场分析法论文参考文献

[1].冯长君,何红梅,李靖.新型叁唑并噻二唑衍生物对PTP1B的抑制活性的比较分子力场分析研究[J].化学通报.2019

[2].牟佳佳,徐文方,尹文刚.L-精氨酸类氨肽酶N抑制剂的比较分子力场分析[J].计算机与应用化学.2015

[3].王勤金,班树荣,李青山.磺酰脲类乙酰羟基酸合成酶抑制剂的拓扑物比较分子力场分析[J].化学通报.2014

[4].张瀛,张立伟,李嘉宾.二氢嘧啶酮类α_(1A)-肾上腺素受体拮抗剂的比较分子力场分析[J].中国药科大学学报.2010

[5].肖爱婧,安丽英,胡远东,张卓勇.比较分子力场分析法研究3-芳基喹唑啉酮衍生物的定量构效关系研究[J].首都师范大学学报(自然科学版).2007

[6].杨伟华,冯长君,沐来龙.应用比较分子力场分析法研究氯代苯酚化合物结构与活性的相关性(英文)[J].计算机与应用化学.2006

[7].王涛,祝晨蔯,陈传兵.比较分子力场分析法在天然药物成分研究中的应用[J].中国药学杂志.2006

[8].尹文刚,徐文方,李亚林.吡咯烷类基质金属蛋白酶-2抑制剂的比较分子力场分析[J].中国药物化学杂志.2005

[9].习保民,赵文娜,邹建卫,倪沛洲.α_1-AR拮抗剂DDPH类似物的比较分子力场分析[J].结构化学.2004

[10].郑剑斌,闻韧,罗小民,蒋华良.3-哌啶甲酸和四氢烟酸的4,4-二芳基-3-丁烯衍生物的叁维定量构效关系(比较分子力场分析)研究(英文)[J].中国药物化学杂志.2004

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