导读:本文包含了大卫绢蛱蝶论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:鳞翅目,大卫绢蛱蝶,线粒体基因组,tRNA二级结构
大卫绢蛱蝶论文文献综述
夏靖,胡静,朱国萍,朱朝东,郝家胜[1](2011)在《大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析》一文中研究指出目前有关蝶类线粒体基因组全序列及其分子进化的研究报道还不多见。本文利用long PCR和引物步移法得到大卫绢蛱蝶Calinaga davidis的线粒体基因组全序列,同时就其基因组成和结构特点作了初步分析。结果显示:其基因组全长为15 267 bp(GenBank登录号为HQ658143),包括13个蛋白质编码基因(ATP6,ATP8,COI-III,ND1-6,ND4L,Cytb)、22个tRNA基因、2个rRNA基因(16S和12S)以及非编码的控制区。与其他鳞翅目昆虫相一致,其基因组未出现基因重排现象。基因组共包含11个基因间隔区,总长度为130 bp,间隔长度1~46 bp,最大间隔在tRNAGln与ND2基因之间;基因间共存在13处重迭,总长度为66 bp,重迭碱基数1~35 bp,最长的重迭区位于COII与tRNALys基因。lrRNA和srRNA基因长度分别为1 337 bp和773 bp;除tRNASer(AGN)缺少二氢尿嘧啶臂(DHUstem),在相应的位置上只形成一个简单环外,其余的tRNA基因都能形成典型的叁叶草结构。13个蛋白编码基因总长度为11 247 bp,共有3 737个密码子,它们的碱基组成和密码子的使用具有明显的偏倚性;除COI外(起始密码子TTG),其余的12个蛋白质编码基因都以标准的ATN作为起始密码子;COI基因终止密码子为不完全T,ND4基因终止密码子为不完全TA,其余基因都以TAA为终止密码子。A+T丰富区全长为389 bp,A+T含量高达92.0%,其中存在2段类似微卫星的重复序列(TA)6和(AAT)4。本文的研究结果为探讨绢蛱蝶亚科在蛱蝶科中的系统学地位及其与其他亚科间的系统发生关系等问题提供了重要的分子生物学数据。(本文来源于《昆虫学报》期刊2011年05期)
胡静[2](2010)在《苎麻珍蝶(蛱蝶科:釉蛱蝶亚科)与大卫绢蛱蝶(蛱蝶科:绢蛱蝶亚科)线粒体基因组比较研究》一文中研究指出与核DNA相比,线粒体DNA(mtDNA)具有母系遗传,无重组及突变率比较高的特性,因此被广泛的应用于生物系统发生学,比较基因组学,进化基因组学,种群遗传学和分子进化的研究。随着PCR技术以及long PCR实验技术的发展,基因组序列扩增和DNA测序技术的不断完善,动物线粒体基因组全序列的研究已成为分子系统学研究的热点之一。本文利用long PCR和分子克隆相结合的方法得到苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶的线粒体基因组全序列。苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶环状分子全长分别为15,245bp和15,267bp,都包括13个蛋白质编码基因(ATP6, ATP8,COI-III,ND1-6, ND4L, Cytb)、22个tRNA基因、2个rRNA基因(16S和12S)以及非编码的控制区;此外,苎麻珍蝶基因组D-loop区中多一个tRNAIle(AUR)b。苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶线粒体基因组基因排列顺序和方向与其他鳞翅目昆虫相一致,未出现基因重排或基因缺失现象。在苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶线粒体基因组中,除COI外,其余的12个蛋白质编码基因都以ATN作为标准的起始密码子,COI基因没有标准的起始密码子ATN,而是以GCG(R)作为其起始密码子,以单个残基T终止,不完全终止密码子可能通过mRNA加工过程中的多聚腺苷酸化形成完整的终止密码子TAA;除tRNASer(AGN)缺少DHU臂而形成了一个简单的环外,其它tRNA都形成标准的叁叶草结构;控制区都不含有明显的大片段重复结构,但存在一些微卫星样的结构,如(TA)n等以及polyA和polyT结构。为了探讨苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶的系统分类地位,本研究基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因全序列,使用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建了7种蝴蝶的NJ树,使用采用最大似然法(maximum-likelihood, ML)构建了ML树;又结合COI基因全序列构建了23种蛱蝶的NJ树和ML树。实验结果显示:珍蝶类应归入釉蛱蝶亚科珍蝶族;珍蝶族与釉蛱蝶族的亲缘关系较豹蛱蝶族近;绢蛱蝶科与螯蛱蝶科构成姊妹类群。(本文来源于《安徽师范大学》期刊2010-05-01)
大卫绢蛱蝶论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
与核DNA相比,线粒体DNA(mtDNA)具有母系遗传,无重组及突变率比较高的特性,因此被广泛的应用于生物系统发生学,比较基因组学,进化基因组学,种群遗传学和分子进化的研究。随着PCR技术以及long PCR实验技术的发展,基因组序列扩增和DNA测序技术的不断完善,动物线粒体基因组全序列的研究已成为分子系统学研究的热点之一。本文利用long PCR和分子克隆相结合的方法得到苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶的线粒体基因组全序列。苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶环状分子全长分别为15,245bp和15,267bp,都包括13个蛋白质编码基因(ATP6, ATP8,COI-III,ND1-6, ND4L, Cytb)、22个tRNA基因、2个rRNA基因(16S和12S)以及非编码的控制区;此外,苎麻珍蝶基因组D-loop区中多一个tRNAIle(AUR)b。苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶线粒体基因组基因排列顺序和方向与其他鳞翅目昆虫相一致,未出现基因重排或基因缺失现象。在苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶线粒体基因组中,除COI外,其余的12个蛋白质编码基因都以ATN作为标准的起始密码子,COI基因没有标准的起始密码子ATN,而是以GCG(R)作为其起始密码子,以单个残基T终止,不完全终止密码子可能通过mRNA加工过程中的多聚腺苷酸化形成完整的终止密码子TAA;除tRNASer(AGN)缺少DHU臂而形成了一个简单的环外,其它tRNA都形成标准的叁叶草结构;控制区都不含有明显的大片段重复结构,但存在一些微卫星样的结构,如(TA)n等以及polyA和polyT结构。为了探讨苎麻珍蝶和大卫绢蛱蝶的系统分类地位,本研究基于线粒体基因组13个蛋白质编码基因全序列,使用邻接法(neighbor-joining,NJ)构建了7种蝴蝶的NJ树,使用采用最大似然法(maximum-likelihood, ML)构建了ML树;又结合COI基因全序列构建了23种蛱蝶的NJ树和ML树。实验结果显示:珍蝶类应归入釉蛱蝶亚科珍蝶族;珍蝶族与釉蛱蝶族的亲缘关系较豹蛱蝶族近;绢蛱蝶科与螯蛱蝶科构成姊妹类群。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
大卫绢蛱蝶论文参考文献
[1].夏靖,胡静,朱国萍,朱朝东,郝家胜.大卫绢蛱蝶线粒体基因组全序列测定和分析[J].昆虫学报.2011
[2].胡静.苎麻珍蝶(蛱蝶科:釉蛱蝶亚科)与大卫绢蛱蝶(蛱蝶科:绢蛱蝶亚科)线粒体基因组比较研究[D].安徽师范大学.2010