本文主要研究内容
作者叶侃(2019)在《米象磷化氢抗性相关基因的表达分析》一文中研究指出:米象是一种重要的贮藏害虫,对世界粮食产量产生威胁,由于熏蒸剂磷化铝的使用,米象产生了一定的PH3抗性。本文通过转录组技术,分析了米象几种代谢解毒相关基因谷胱甘肽硫转移酶,细胞色素P450和酯酶的表达;获得了米象基因遗传信息。目前,随着生物技术的进步,尤其是基因组学的广泛应用,可以在转录组水平研究米象基因的表达情况,进而从本质上全面揭示米象的磷化氢抗性。采用Illumina测序技术,米象敏感品系转录组测序共获得reads是22,128,957和6,562,957,738个核苷酸,PH3熏蒸品系转录组测序共获得reads是27,306,829和8,093,178,954个核苷酸。将转录组数据通过组装,将这些transcripts拼接成为42,173个unigenes。将得到Unigene提交蛋白质数据库(Nr)进行比对,共有16,610个返回有效结果。同时还将Unigene提交至其它数据库进行注释,共有17,335个Unigene得到成功注释。44.45%的Unigene与中欧山松大小蠹的相关基因同源性最高。26.96%的Unigene与赤拟谷盗的相关基因具有同源性。通过筛选,从米象转录组数据中共鉴定出323个与解毒代谢抗性相关的Unigene。主要编码包括谷胱甘肽硫转移酶28个、酯酶58个、细胞色素P450基因68个。克隆并测定了米象13个编码GSTs基因的cDNA全长序列,其中Epsilon家族6个、Sigma家族4个、Theta家族2个和Delta家族1个。米象GSTs基因中共鉴定出6个Epsilon家族的基因。获得米象P450基因11个。将其中的3个基因归类于CYP4家族,6个基因归类于CYP3家族,另归类于CYP mito家族2个。获得米象EST基因6个,分属3个不同的家族。米象敏感品系和磷化氢熏蒸后的品系差异表达基因中,米象磷化氢熏蒸后基因上调315个,下调535个。对识别到的差异表达基因进行功能注释。将得到的差异表达Unigene提交NCBI蛋白质数据库,共有687个返回有效结果。这些差异表达基因中的Unigene在GO分类中被划分到“biological process”、“cellular component”和“molecular function”的61个功能组中。COG分类注释了221个差异表达基因Unigene。同时对差异表达基因结果按照KEGG中通路类型进行分类。米象敏感品系经磷化氢不同浓度熏蒸和不同时间熏蒸处理。两个基因经LC30浓度的显著高于其它两个浓度;四个GSTs基因经LC50浓度的磷化氢熏蒸的相对表达量显著高于对照组和LC30、LC10处理组;三个基因相对表达量均显著低于对照组。7个GSTs基因随着熏蒸时间的增加,相对表达量逐渐升高。米象GSTs基因在不同发育阶段的相对表达模式中,SoGSTd1基因在四龄幼虫阶段的相对表达量最高;SoGSTe1基因在成虫阶段的相对表达量最高;SoGSTe2和SoGSTe5基因在四龄幼虫阶段的相对表达量最大,SoGSTe6基因的相对表达量在三龄幼虫阶段最大。米象13个GSTs基因在不同组织部位的相对表达模式中。米象13个GSTs基因中的11个在中肠、脂肪体或马氏管中的相对表达量均显著高于头部和表皮中的表达量。在EST基因中,随着磷化氢熏蒸浓度的增加,SoEST1基因的相对表达量也增加,SoEST2和SoEST5基因经磷化氢LC30熏蒸的相对表达量显著高于对照组。6个EST基因在不同发育阶段分析中。SoEST1在成虫和蛹期的相对表达量均显著较高;SoEST3基因在成虫阶段的相对表达量最高。在不同组织中,SoEST1基因在马氏管中的相对表达量最高;SoEST3基因在中肠中的相对表达量最高;SoEST5基因在脂肪体中的相对表达量最高;SoEST6基因在中肠中的相对表达量最高。在米象P450基因中,经LC30浓度的磷化氢熏蒸24h后,基因的相对表达量显著高于对照。米象7个P450基因的相对表达量随着磷化氢熏蒸时间的增加而逐渐增大。在不同发育阶段,5个P450基因在成虫和四龄幼虫阶段的相对表达量均显著偏高;4个基因在成虫阶段的最高。在不同组织部位中,4个P450基因在中肠的相对表达量最高,3个基因在马氏管中的最高。
Abstract
mi xiang shi yi chong chong yao de zhu cang hai chong ,dui shi jie liang shi chan liang chan sheng wei xie ,you yu xun zheng ji lin hua lv de shi yong ,mi xiang chan sheng le yi ding de PH3kang xing 。ben wen tong guo zhuai lu zu ji shu ,fen xi le mi xiang ji chong dai xie jie du xiang guan ji yin gu guang gan tai liu zhuai yi mei ,xi bao se su P450he zhi mei de biao da ;huo de le mi xiang ji yin wei chuan xin xi 。mu qian ,sui zhao sheng wu ji shu de jin bu ,you ji shi ji yin zu xue de an fan ying yong ,ke yi zai zhuai lu zu shui ping yan jiu mi xiang ji yin de biao da qing kuang ,jin er cong ben zhi shang quan mian jie shi mi xiang de lin hua qing kang xing 。cai yong Illuminace xu ji shu ,mi xiang min gan pin ji zhuai lu zu ce xu gong huo de readsshi 22,128,957he 6,562,957,738ge he gan suan ,PH3xun zheng pin ji zhuai lu zu ce xu gong huo de readsshi 27,306,829he 8,093,178,954ge he gan suan 。jiang zhuai lu zu shu ju tong guo zu zhuang ,jiang zhe xie transcriptspin jie cheng wei 42,173ge unigenes。jiang de dao Unigenedi jiao dan bai zhi shu ju ku (Nr)jin hang bi dui ,gong you 16,610ge fan hui you xiao jie guo 。tong shi hai jiang Unigenedi jiao zhi ji ta shu ju ku jin hang zhu shi ,gong you 17,335ge Unigenede dao cheng gong zhu shi 。44.45%de Unigeneyu zhong ou shan song da xiao du de xiang guan ji yin tong yuan xing zui gao 。26.96%de Unigeneyu chi ni gu dao de xiang guan ji yin ju you tong yuan xing 。tong guo shai shua ,cong mi xiang zhuai lu zu shu ju zhong gong jian ding chu 323ge yu jie du dai xie kang xing xiang guan de Unigene。zhu yao bian ma bao gua gu guang gan tai liu zhuai yi mei 28ge 、zhi mei 58ge 、xi bao se su P450ji yin 68ge 。ke long bing ce ding le mi xiang 13ge bian ma GSTsji yin de cDNAquan chang xu lie ,ji zhong Epsilonjia zu 6ge 、Sigmajia zu 4ge 、Thetajia zu 2ge he Deltajia zu 1ge 。mi xiang GSTsji yin zhong gong jian ding chu 6ge Epsilonjia zu de ji yin 。huo de mi xiang P450ji yin 11ge 。jiang ji zhong de 3ge ji yin gui lei yu CYP4jia zu ,6ge ji yin gui lei yu CYP3jia zu ,ling gui lei yu CYP mitojia zu 2ge 。huo de mi xiang ESTji yin 6ge ,fen shu 3ge bu tong de jia zu 。mi xiang min gan pin ji he lin hua qing xun zheng hou de pin ji cha yi biao da ji yin zhong ,mi xiang lin hua qing xun zheng hou ji yin shang diao 315ge ,xia diao 535ge 。dui shi bie dao de cha yi biao da ji yin jin hang gong neng zhu shi 。jiang de dao de cha yi biao da Unigenedi jiao NCBIdan bai zhi shu ju ku ,gong you 687ge fan hui you xiao jie guo 。zhe xie cha yi biao da ji yin zhong de Unigenezai GOfen lei zhong bei hua fen dao “biological process”、“cellular component”he “molecular function”de 61ge gong neng zu zhong 。COGfen lei zhu shi le 221ge cha yi biao da ji yin Unigene。tong shi dui cha yi biao da ji yin jie guo an zhao KEGGzhong tong lu lei xing jin hang fen lei 。mi xiang min gan pin ji jing lin hua qing bu tong nong du xun zheng he bu tong shi jian xun zheng chu li 。liang ge ji yin jing LC30nong du de xian zhe gao yu ji ta liang ge nong du ;si ge GSTsji yin jing LC50nong du de lin hua qing xun zheng de xiang dui biao da liang xian zhe gao yu dui zhao zu he LC30、LC10chu li zu ;san ge ji yin xiang dui biao da liang jun xian zhe di yu dui zhao zu 。7ge GSTsji yin sui zhao xun zheng shi jian de zeng jia ,xiang dui biao da liang zhu jian sheng gao 。mi xiang GSTsji yin zai bu tong fa yo jie duan de xiang dui biao da mo shi zhong ,SoGSTd1ji yin zai si ling you chong jie duan de xiang dui biao da liang zui gao ;SoGSTe1ji yin zai cheng chong jie duan de xiang dui biao da liang zui gao ;SoGSTe2he SoGSTe5ji yin zai si ling you chong jie duan de xiang dui biao da liang zui da ,SoGSTe6ji yin de xiang dui biao da liang zai san ling you chong jie duan zui da 。mi xiang 13ge GSTsji yin zai bu tong zu zhi bu wei de xiang dui biao da mo shi zhong 。mi xiang 13ge GSTsji yin zhong de 11ge zai zhong chang 、zhi fang ti huo ma shi guan zhong de xiang dui biao da liang jun xian zhe gao yu tou bu he biao pi zhong de biao da liang 。zai ESTji yin zhong ,sui zhao lin hua qing xun zheng nong du de zeng jia ,SoEST1ji yin de xiang dui biao da liang ye zeng jia ,SoEST2he SoEST5ji yin jing lin hua qing LC30xun zheng de xiang dui biao da liang xian zhe gao yu dui zhao zu 。6ge ESTji yin zai bu tong fa yo jie duan fen xi zhong 。SoEST1zai cheng chong he yong ji de xiang dui biao da liang jun xian zhe jiao gao ;SoEST3ji yin zai cheng chong jie duan de xiang dui biao da liang zui gao 。zai bu tong zu zhi zhong ,SoEST1ji yin zai ma shi guan zhong de xiang dui biao da liang zui gao ;SoEST3ji yin zai zhong chang zhong de xiang dui biao da liang zui gao ;SoEST5ji yin zai zhi fang ti zhong de xiang dui biao da liang zui gao ;SoEST6ji yin zai zhong chang zhong de xiang dui biao da liang zui gao 。zai mi xiang P450ji yin zhong ,jing LC30nong du de lin hua qing xun zheng 24hhou ,ji yin de xiang dui biao da liang xian zhe gao yu dui zhao 。mi xiang 7ge P450ji yin de xiang dui biao da liang sui zhao lin hua qing xun zheng shi jian de zeng jia er zhu jian zeng da 。zai bu tong fa yo jie duan ,5ge P450ji yin zai cheng chong he si ling you chong jie duan de xiang dui biao da liang jun xian zhe pian gao ;4ge ji yin zai cheng chong jie duan de zui gao 。zai bu tong zu zhi bu wei zhong ,4ge P450ji yin zai zhong chang de xiang dui biao da liang zui gao ,3ge ji yin zai ma shi guan zhong de zui gao 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自合肥工业大学的叶侃,发表于刊物合肥工业大学2019-09-20论文,是一篇关于米象论文,磷化氢论文,谷胱甘肽硫转移酶论文,细胞色素论文,酯酶论文,合肥工业大学2019-09-20论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自合肥工业大学2019-09-20论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。
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