本文主要研究内容
作者王莉,李昌荣,李发根,周长品,翁启杰,吕佳斌,陈健波,陈剑成,甘四明（2019）在《大花序桉群体适应性相关的SSR位点》一文中研究指出：【目的】检测大花序桉群体与环境适应性相关的基因组位点,为种质资源保护和利用提供分子生物学信息。【方法】利用84个SSR标记（包括29个基因组SSR和55个EST-SSR）分析引种到广西,来源于澳大利亚昆土兰州北部和南部各7个大花序桉群体,通过Mantel检验确定群体间是否存在地理隔离;检测群体间分化系数(Fst)离群值的受选择位点;并基于空间分析法检测与群体气候因子显著相关的等位片段,将显著相关位点的序列与NCBI数据库比对进行功能注释。【结果】大花序桉北部与南部群体间存在地理隔离,基于19个气候因子的聚类分析将北方与南方群体分为独立的组,这表明气候因子亦驱动了群体的分化。共检测到Fst离群值的受选择SSR位点39个（46.4%）,其中,LOSITAN软件检测到12个正向选择位点和17个平衡选择位点。5个Fst离群值位点的6个等位片段与1个或多个气候因子显著相关（P<0.001）,其等位频率在北部与南部群体间差异明显,其中,Embra6-118 bp与最冷月最低气温(Tmcm)显著相关,位点DNA序列的功能注释为碱性螺旋-环-螺旋（basic helix-loop-helix, bHLH）转录因子bHLH155;Embra20-121 bp与最暖季度降水量(Pwq)显著相关,位点的功能注释为蔗糖转运蛋白（sucrose transporters）;EUCeSSR676-168 bp与Tmcm、Pwq、年均气温(Tma)和最暖月最高气温(Tmwm)均显著相关,位点的功能注释为光系统Ⅱ稳定性/组装因子HCF136 （photosystem II stability/assembly factor HCF136）;另外两个显著相关位点EUCeSSR298和EUCeSSR1009的功能未知。【结论】大花序桉北部与南部群体的显著分化受长期气候的影响,在第四纪大冰期可能存在北部和南部避难所。与气候因子显著相关的SSR位点在北部和南部群体间的等位频率差异为基于正向选择的气候适应性提供了分子证据。
Abstract
【mu de 】jian ce da hua xu an qun ti yu huan jing kuo ying xing xiang guan de ji yin zu wei dian ,wei chong zhi zi yuan bao hu he li yong di gong fen zi sheng wu xue xin xi 。【fang fa 】li yong 84ge SSRbiao ji （bao gua 29ge ji yin zu SSRhe 55ge EST-SSR）fen xi yin chong dao an xi ,lai yuan yu ao da li ya kun tu lan zhou bei bu he na bu ge 7ge da hua xu an qun ti ,tong guo Manteljian yan que ding qun ti jian shi fou cun zai de li ge li ;jian ce qun ti jian fen hua ji shu (Fst)li qun zhi de shou shua ze wei dian ;bing ji yu kong jian fen xi fa jian ce yu qun ti qi hou yin zi xian zhe xiang guan de deng wei pian duan ,jiang xian zhe xiang guan wei dian de xu lie yu NCBIshu ju ku bi dui jin hang gong neng zhu shi 。【jie guo 】da hua xu an bei bu yu na bu qun ti jian cun zai de li ge li ,ji yu 19ge qi hou yin zi de ju lei fen xi jiang bei fang yu na fang qun ti fen wei du li de zu ,zhe biao ming qi hou yin zi yi qu dong le qun ti de fen hua 。gong jian ce dao Fstli qun zhi de shou shua ze SSRwei dian 39ge （46.4%）,ji zhong ,LOSITANruan jian jian ce dao 12ge zheng xiang shua ze wei dian he 17ge ping heng shua ze wei dian 。5ge Fstli qun zhi wei dian de 6ge deng wei pian duan yu 1ge huo duo ge qi hou yin zi xian zhe xiang guan （P<0.001）,ji deng wei pin lv zai bei bu yu na bu qun ti jian cha yi ming xian ,ji zhong ,Embra6-118 bpyu zui leng yue zui di qi wen (Tmcm)xian zhe xiang guan ,wei dian DNAxu lie de gong neng zhu shi wei jian xing luo xuan -huan -luo xuan （basic helix-loop-helix, bHLH）zhuai lu yin zi bHLH155;Embra20-121 bpyu zui nuan ji du jiang shui liang (Pwq)xian zhe xiang guan ,wei dian de gong neng zhu shi wei zhe tang zhuai yun dan bai （sucrose transporters）;EUCeSSR676-168 bpyu Tmcm、Pwq、nian jun qi wen (Tma)he zui nuan yue zui gao qi wen (Tmwm)jun xian zhe xiang guan ,wei dian de gong neng zhu shi wei guang ji tong Ⅱwen ding xing /zu zhuang yin zi HCF136 （photosystem II stability/assembly factor HCF136）;ling wai liang ge xian zhe xiang guan wei dian EUCeSSR298he EUCeSSR1009de gong neng wei zhi 。【jie lun 】da hua xu an bei bu yu na bu qun ti de xian zhe fen hua shou chang ji qi hou de ying xiang ,zai di si ji da bing ji ke neng cun zai bei bu he na bu bi nan suo 。yu qi hou yin zi xian zhe xiang guan de SSRwei dian zai bei bu he na bu qun ti jian de deng wei pin lv cha yi wei ji yu zheng xiang shua ze de qi hou kuo ying xing di gong le fen zi zheng ju 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自南京林业大学学报(自然科学版)的王莉,李昌荣,李发根,周长品,翁启杰,吕佳斌,陈健波,陈剑成,甘四明，发表于刊物南京林业大学学报(自然科学版)2019年05期论文，是一篇关于大花序桉论文,标记论文,气候因子论文,正向选择论文,群体适应性论文,地理隔离论文,南京林业大学学报(自然科学版)2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自南京林业大学学报(自然科学版)2019年05期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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