导读:本文包含了完全基因组论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:水稻,不完全双列杂交,表型,配合力
完全基因组论文文献综述
王欣,马莹,胡中立,徐辰武[1]（2019）在《基于不完全双列杂交设计的水稻农艺性状配合力基因组预测》一文中研究指出【目的】在亲本一般配合力的基础上优选特殊配合力高的杂交种,是水稻杂种育种的关键。基因组选择基于覆盖全基因组的分子标记和样本的表型数据建立预测模型,实现对品种更加可靠的选择。【方法】本研究利用一组基于不完全双列杂交(NCII设计)的水稻数据集,考查其多个农艺性状配合力的基因组预测能力。并比较了不同训练群体构建方法对杂交种表型预测能力的影响。【结果】8个农艺性状一般配合力的预测能力由其遗传率主导,从0.3888到0.7367。杂交种特殊配合力的预测能力较低,但是直接预测杂交种的表型可以获得较高的预测能力。【结论】基因组预测水稻亲本一般配合力是有效的,能够帮助育种家实现对亲本的科学选择。如果要选配杂交种,直接预测杂交种表型是最有效的手段。此时让更多的亲本均衡地参与杂交种训练集的组配,有利于获得更高的预测能力。(本文来源于《中国水稻科学》期刊2019年04期）
钟一姿[2]（2018）在《中国科学家揭示天麻与蜜环菌的共生机制》一文中研究指出天麻作为一种名贵中药材，最早记载于《神农本草经》，列为上品。天麻的人工栽培一度被认为是世界性难题，20世纪60年代，我国科学家徐锦堂先生利用蜜环菌首次伴栽天麻成功，结束了天麻不能人工栽培的历史。半个世纪过去了，天麻的生产正面临着品种改良、技术更新、品质提(本文来源于《中国中医药报》期刊2018-04-26）
李强,左光宏,郝柏林[3]（2014）在《从完全基因组出发建立原核生物亲缘关系和分类系统时遇到的数学问题》一文中研究指出我们课题组近10年所发展的组分矢量(CVTree)方法,已经成为从完全基因组出发而不使用序列联配来构建细菌亲缘关系的有效手段.在整个生物分类学日益后继乏人的背景下,组分矢量(CVTree)方法伴随着基因组时代的发展,成为人人可以方便使用的微生物分类的定义性工具.本综述不讨论CVTree的生物学结果,而着重从非线性科学的角度,介绍我们在研究过程中所提出和解决的数学问题.这将涉及组合学、图论、形式语言学等离散数学的篇章.我们特别希望,本文所列举的一些尚未解决的数学问题能引发新的研究工作,使CVTree方法的理论基础更为坚实.(本文来源于《中国科学:物理学 力学 天文学》期刊2014年12期）
陈小苏[4]（2011）在《基于完全基因组的亲缘分析方法中各种距离和非相似度的比较》一文中研究指出本文首先介绍无序列比对亲缘分析方法中常用的距离和非相似度,并讨论了它们是否是严格数学意义下的距离。我们发现有很多虽然被称之为距离,但是实际上并不是数学意义下的距离。接着对随机背景下的无序列比对亲缘分析方法中提出使用叁种新的非相似度。在动力学语言亲缘分析方法中,我们提出用新的相似系数替代原来的夹角余弦系数。我们用叁组基因组数据对以上的方法从生物学角度进行评价。从生物学角度评价,基于随机背景下的非相似度或者距离用于亲缘分析有一定的局限性。在无序列比对方法中消除噪声背景是有必要的。我们使用的迪斯系数并不会比夹角余弦系数构造的亲缘树更好,同样也证明了动力学语言去噪过程是必须的。(本文来源于《湘潭大学》期刊2011-04-18）
艾米莉·辛格[5]（2010）在《用完全基因组测序查找病源》一文中研究指出两项研究表明,完整的基因组测序能够识别致病基因。詹姆斯·鲁普斯基(James Lupski)是一位医生兼科学家,他患有一种神经系统紊乱性疾病,腓骨肌萎缩症。过去的25年里,他一直在寻找自己疾病的遗传原因。2009年底,他终于找到了,因为他做了自己整个基因组的测序。(本文来源于《科技创业》期刊2010年08期）
战晓文[6]（2010）在《基于完全基因组且无序列比对的用于亲缘分析的严格距离度量》一文中研究指出大多数基于完全基因组且无序列比对的用于亲缘分析的距离方法中存在个不足之处，就足这些距离在数学意义下并不足严格的距离。本文首先介绍基于完全基因组的四种建树的字符串距离方法，这些距离基于原始的基因组序列得到的字，并小需要进行序列比对的过程。接着提出了两种新的距离，弦距离和分段距离，来替代以前在我们动力学语言方法中的距离。我们用四个基因组数据对这种替换从生物学角度进行评价。我们发现这两种严格的距离度量所产生的亲缘树与用旧的距离所产生的亲缘树相同或相似，并且用16sRNA所产生的树存大多数分支上是一致的。因此，本文所提出的两个严格距离故良了我们的动力学语言构建亲缘树的方法(本文来源于《湘潭大学》期刊2010-04-18）
毛志[7]（2009）在《构建叁维参数空间区分完全基因组中的编码和非编码序列》一文中研究指出发现编码序列和非编码序列中有明显的尺度联系的存在性会给弄清DNA序列带来新的前景,这就促使我们去寻找新的方法来描述和区分编码和非编码序列。在这篇文章中,首先采用数值序列来表示DNA序列,然后以多重仿射性分析和Hlder指数形式来得到叁个指数,并以此构建参数空间。每个编码或非编码序列就被表示为这个叁维参数空间之中的一个点。在这个参数空间中,完全基因组中的编码序列和非编码序列被粗略地分开到两个不同的区域。(本文来源于《铜仁学院学报》期刊2009年06期）
夏庆友,郭一然,张泽,李东,玄兆伶[8]（2009）在《40个基因组完全重测序揭示蚕的驯化事件及其相关基因》一文中研究指出我国家蚕基因组研究再获重大突破,研究成果再登《science》杂志,影响广泛。本刊特设专栏刊发该论文中文译文以及相关评述,以满足广大读者的需求。(本文来源于《蚕学通讯》期刊2009年03期）
夏庆友,郭一然,张泽,李东,玄兆伶[9]（2009）在《《40个基因组完全重测序揭示蚕的驯化事件及其相关基因》在线支撑材料》一文中研究指出此文件包括以下内容:材料与方法支撑材料正文图S1至S7表S1至S10支撑参考文献和注释1材料与方法1.1样品收集为了囊括全世界实验室所保存的主要的蚕系统,我们收集了各种的地理区域的品系,如中国、日本、欧洲和热带地区(主要是东南亚:印度,柬埔寨和老挝),和(本文来源于《蚕学通讯》期刊2009年03期）
李博[10]（2009）在《线粒体完全基因组混沌游戏表示的Markov模型模拟》一文中研究指出作为核外遗传信息系统和其具有的遗传特点,线粒体完全基因组已成为研究真核生物分子的遗传学,发育生物学和分子系统进化的一种重要的模式体系。作为基因组序列分析的一种统计方法,混沌游戏表示(CGR)图形方法表示基因组序列具有直观,不受序列长程相关性的影响,不依赖于序列尺度以及计算速度快等优点。而作为CGR的一种经典的数值模拟方法,马尔科夫链模型利用寡核苷酸频率得出转移概率矩阵进行序列的重构,具备计算快速简单,准确率高等特点。我们在NCBI收集了64种生物的线粒体完全基因组序列,并建立了一阶和二阶的马尔科夫模型并利用这两个模型对64种线粒体序列全部进行了模拟,为了判别拟合的效果,我们又引入了测度概念,把CGR图形划分为64×64和128×128的网格,进行测度比对。同时又引入测度的相对标准误差概念,对拟合的图形做了进一步的量化判别,在大量的对比中我们发现所有这些生物的序列寡核苷酸CG出现的频率都比较低,哺乳动物序列的寡核苷酸TA出现的频率较高而鸟类序列的CC现的频率较高。在相对误差的比较当中我们也发现在128×128的网格上,其测度的相对误差都控制在0.7左右,在64×64的相对误差都控制在0.3左右。而且二阶模型的误差要比一阶的小。(本文来源于《湘潭大学》期刊2009-04-10）
完全基因组论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
天麻作为一种名贵中药材，最早记载于《神农本草经》，列为上品。天麻的人工栽培一度被认为是世界性难题，20世纪60年代，我国科学家徐锦堂先生利用蜜环菌首次伴栽天麻成功，结束了天麻不能人工栽培的历史。半个世纪过去了，天麻的生产正面临着品种改良、技术更新、品质提
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
完全基因组论文参考文献
[1].王欣,马莹,胡中立,徐辰武.基于不完全双列杂交设计的水稻农艺性状配合力基因组预测[J].中国水稻科学.2019
[2].钟一姿.中国科学家揭示天麻与蜜环菌的共生机制[N].中国中医药报.2018
[3].李强,左光宏,郝柏林.从完全基因组出发建立原核生物亲缘关系和分类系统时遇到的数学问题[J].中国科学:物理学力学天文学.2014
[4].陈小苏.基于完全基因组的亲缘分析方法中各种距离和非相似度的比较[D].湘潭大学.2011
[5].艾米莉·辛格.用完全基因组测序查找病源[J].科技创业.2010
[6].战晓文.基于完全基因组且无序列比对的用于亲缘分析的严格距离度量[D].湘潭大学.2010
[7].毛志.构建叁维参数空间区分完全基因组中的编码和非编码序列[J].铜仁学院学报.2009
[8].夏庆友,郭一然,张泽,李东,玄兆伶.40个基因组完全重测序揭示蚕的驯化事件及其相关基因[J].蚕学通讯.2009
[9].夏庆友,郭一然,张泽,李东,玄兆伶.《40个基因组完全重测序揭示蚕的驯化事件及其相关基因》在线支撑材料[J].蚕学通讯.2009
[10].李博.线粒体完全基因组混沌游戏表示的Markov模型模拟[D].湘潭大学.2009