方泽蘅:盐胁迫下的3代白木香离体根的转录因子表达分析论文

方泽蘅:盐胁迫下的3代白木香离体根的转录因子表达分析论文

本文主要研究内容

作者方泽蘅,李文月,马新业,詹若挺(2019)在《盐胁迫下的3代白木香离体根的转录因子表达分析》一文中研究指出:目的研究3代白木香Aquilaria sinensis离体根在盐胁迫条件下的转录因子表达模式差异,对响应盐胁迫的各代转录因子家族差异基因的变化规律进行分析。方法以组织培养的白木香离体根为材料,采用IlluminaHiseq4000双端PE150测序方法,将所有白木香Unigene序列与植物转录因子数据库(PlantTFDB)进行比对,对盐胁迫组与对照组间的3代差异转录因子进行重点分析。结果 3代白木香离体根转录组测序片段经de novo拼接共获得48 286条Unigene序列,含有1 156个潜在的白木香转录因子,分布于54个转录因子家族。其中bHLH、ERF、NAC家族是富集最多的3个家族。在第1、2、3代盐胁迫白木香根中分别筛选出290、277、349个差异表达转录因子,NAC、MYB以及WRKY家族上调表达的差异表达基因(DEG)数量随胁迫代数增加而增多,而GRAS家族上调表达的DEG数量随胁迫代数增加而减少。3代共有的差异转录因子有70个,其中8个基因的下调表达倍数随盐胁迫代数增加而递增。结论盐胁迫对白木香转录因子表达影响主要以下调为主。盐胁迫组与对照组的差异转录因子数量随着盐胁迫代数增加而增加。不同转录因子家族基因受盐胁迫诱导表达情况不同,一些基因可能参与了胁迫记忆的传递。该研究有助于在整体水平加深了解白木香转录因子表达特性,为进一步研究白木香胁迫记忆及白木香盐胁迫响应分子机制提供参考。

Abstract

mu de yan jiu 3dai bai mu xiang Aquilaria sinensisli ti gen zai yan xie pai tiao jian xia de zhuai lu yin zi biao da mo shi cha yi ,dui xiang ying yan xie pai de ge dai zhuai lu yin zi jia zu cha yi ji yin de bian hua gui lv jin hang fen xi 。fang fa yi zu zhi pei yang de bai mu xiang li ti gen wei cai liao ,cai yong IlluminaHiseq4000shuang duan PE150ce xu fang fa ,jiang suo you bai mu xiang Unigenexu lie yu zhi wu zhuai lu yin zi shu ju ku (PlantTFDB)jin hang bi dui ,dui yan xie pai zu yu dui zhao zu jian de 3dai cha yi zhuai lu yin zi jin hang chong dian fen xi 。jie guo 3dai bai mu xiang li ti gen zhuai lu zu ce xu pian duan jing de novopin jie gong huo de 48 286tiao Unigenexu lie ,han you 1 156ge qian zai de bai mu xiang zhuai lu yin zi ,fen bu yu 54ge zhuai lu yin zi jia zu 。ji zhong bHLH、ERF、NACjia zu shi fu ji zui duo de 3ge jia zu 。zai di 1、2、3dai yan xie pai bai mu xiang gen zhong fen bie shai shua chu 290、277、349ge cha yi biao da zhuai lu yin zi ,NAC、MYByi ji WRKYjia zu shang diao biao da de cha yi biao da ji yin (DEG)shu liang sui xie pai dai shu zeng jia er zeng duo ,er GRASjia zu shang diao biao da de DEGshu liang sui xie pai dai shu zeng jia er jian shao 。3dai gong you de cha yi zhuai lu yin zi you 70ge ,ji zhong 8ge ji yin de xia diao biao da bei shu sui yan xie pai dai shu zeng jia er di zeng 。jie lun yan xie pai dui bai mu xiang zhuai lu yin zi biao da ying xiang zhu yao yi xia diao wei zhu 。yan xie pai zu yu dui zhao zu de cha yi zhuai lu yin zi shu liang sui zhao yan xie pai dai shu zeng jia er zeng jia 。bu tong zhuai lu yin zi jia zu ji yin shou yan xie pai you dao biao da qing kuang bu tong ,yi xie ji yin ke neng can yu le xie pai ji yi de chuan di 。gai yan jiu you zhu yu zai zheng ti shui ping jia shen le jie bai mu xiang zhuai lu yin zi biao da te xing ,wei jin yi bu yan jiu bai mu xiang xie pai ji yi ji bai mu xiang yan xie pai xiang ying fen zi ji zhi di gong can kao 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中草药的方泽蘅,李文月,马新业,詹若挺,发表于刊物中草药2019年10期论文,是一篇关于盐胁迫论文,白木香论文,转录因子论文,离体根论文,转录组论文,中草药2019年10期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中草药2019年10期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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