导读:本文包含了内部转录间隔区论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:四季青,DNA条形码,冬青属,第二内部转录间隔区(ITS2)
内部转录间隔区论文文献综述
王丽丽,焦文静,陈晓辰,廖保生,王晓玥[1]（2015）在《基于核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2)序列鉴定四季青及其近缘种和混伪品》一文中研究指出中药材四季青(Ilicis Chinensis Folium)的基原植物冬青(Ilex chinensis)是重要的园林观赏物种。利用DNA条形码技术可以快速、准确鉴定四季青及其近缘种和混伪品。本研究以冬青、铁冬青(Ilex rotunda)、秤星树(Ilex asprella)、枸骨(Ilex cornuta)和女贞(Ligustrum lucium)等37份植物样本为实验材料,提取全基因组DNA,扩增核糖体DNA第二内部转录间隔区(internal transcribed spacer 2,ITS2)序列并进行双向测序。测序结果利用Codon Code Aligner 4.2.7进行序列拼接,获得高质量ITS2序列。同时从Gen Bank中获得28条冬青的同属近缘种以及混伪品女贞、四川山矾(Symplocos setchuensis)的ITS2序列。基于隐马尔科夫模型(hidden Markov model,HMM)注释5.8S和28S,获得完整的ITS2区域,进而应用MEGA6.0(molecular evolutionary genetics analysis)进行冬青种间和种内序列分析,计算种内种间K2P(Kimura 2-parameter)遗传距离,构建邻接树(neighbor-joining tree,NJ tree)。结果表明,琼脂糖凝胶电泳得到清晰明亮的均一条带,说明利用通用的ITS2引物可以成功扩增到用于测序的PCR产物。通过PCR产物测序、数据处理和序列分析可知,冬青种内ITS2长度经过比对后为239 bp,全部样品的种间ITS2比对后长度为269 bp。冬青种内有4个变异位点以及6个单倍型,种间有143个变异位点,远远多于其种内变异位点。MEGA6.0分析结果表明,种间最小K2P遗传距离(0.094)大于种内最大K2P遗传距离(0.013)。邻接树显示,女贞和四川山矾分别以100%的自展支持率分别聚类,表现出良好的单系性,冬青属物种聚为一大支。冬青在冬青属下可以单独聚为一支,可以进行区分。冬青属其他物种以同一亚属聚为一支。研究结果表明,作为一种快速、准确、简便的分子生物学鉴定方法,ITS2可以应用于冬青及其近缘种和混伪品的鉴定,同时对于准确鉴定冬青属物种亦有巨大潜力,可为冬青属植物在临床上的用药安全和开发应用提供科学依据。(本文来源于《农业生物技术学报》期刊2015年05期）
Naomi,C.Kirkpatrick,Genevieve,M,Morris,Amir,H.Noorrnohammadi,徐福洲[2]（2007）在《利用高通量毛细管电泳和高分辩力熔解曲线分析核糖体DNA的2型内部转录间隔区对鸡艾美耳球虫分类的研究》一文中研究指出球虫病是由艾美耳球虫引起的一种世界范围内分布并造成较大经济损失的寄生虫病。艾美耳球虫在鸡肠道内增殖并引起组织损伤,出现食欲下降、脱水、贫血等。艾美耳球虫的种属鉴定对该病的诊断和(本文来源于《第15届世界禽病大会、中国畜牧兽医学会2007年学术年会论文集》期刊2007-09-01）
古小彬,杨光友,郝桂英,张晓谦,贾小勇[3]（2006）在《疥螨第二内部转录间隔区基因的分子系统学研究》一文中研究指出疥螨病是由疥螨(Sarcoptes scabiei)寄生于人和其他哺乳动物皮肤表皮内,引起称为疥癣的一种顽固性、传染性皮肤病,严重威胁畜牧业的发展。本研究利用PCR技术扩增疥螨的ITS2基因,从而探讨几种动物疥螨的亲缘关系和疥螨的分类地位。试验以分离自四川雅安和自贡兔体的兔疥螨(S．scabiei var．cuniculi)、四川荥经猪只的猪疥蠕(S． scabiei var．suis)和四川简阳山羊的山羊疥螨(S．scabiei var．caprae)为材料,对这4株疥螨分离株进行了分子系统学研究。本研究设计一对引物M1／M2,通过PCR的方法成功地扩增了4株中国地方疥螨分离株ITS2(本文来源于《中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第九次学术研讨会论文摘要集》期刊2006-08-01）
古小彬[4]（2006）在《疥螨第二内部转录间隔区基因的分子系统学研究》一文中研究指出疥螨病是由疥螨(Sarcoptes scabiei)寄生于人和其他哺乳动物皮肤表皮内，引起称为疥癣的一种顽固性、传染性皮肤病，严重威胁畜牧业的发展。本研究利用PCR技术扩增疥螨的ITS2基因，从而探讨几种动物疥螨的亲缘关系和疥螨的分类地位。 试验以分离自四川雅安和自贡兔疥螨分离株、四川荥经猪疥螨分离株和四川简阳山羊疥螨分离株为材料，对这4株疥螨分离株进行了分子系统学研究。本研究设计一对引物M1／M2，通过PCR的方法成功地扩增了4株中国疥螨分离株ITS2基因的目的片断，并通过克隆、序列测定获得了4株疥螨分离株ITS2基因的核苷酸序列，4株疥螨分离株ITS2基因全长均为361bp。对ITS2基因核苷酸序列进行了比较，结果表明：这4株疥螨分离株彼此间的核苷酸同源性为93.9％～98.3％，序列间不存在碱基插入或缺失；4株疥螨分离株的AT含量都明显高于GC含量，分别为61.10％和38.90％。通过MEGA2.0软件分析，分析结果表明疥螨ITS2基因的碱基替代方式存在转换T←→C的偏倚。 基于ITS2基因序列，以背肛螨属的猫背肛螨为外群，用距离法和最大简约法构建了分子系统树，所构建四种树的拓扑结构存在较大的相似性，因而得到的系统树比较可靠。自贡兔疥螨和雅安兔疥螨分离株在每种系统树上都相聚在一起，且自举值都比较高；此外，中国的猪疥螨分离株和西班牙的猪疥螨分离株在四种系统树上也始终聚居在一起，而山羊疥螨分离株在不同系统树上的位置则有所变动。 通过DNAstar软件分析4株疥螨分离株的同源性以及用MEGA2.0软件分析碱基组成和构建系统树，分析结果表明：自贡和雅安兔疥螨分离株、简阳羊疥螨分离株和荥经猪疥螨分离株属于同一个种，从而从分子水平上为以形态学分类为基础的疥螨传统分类系统提供了佐证，同时可为疥螨的临床医学、免疫学、流行病学监控以及防治策略的制定等方面的研究提供参考。(本文来源于《四川农业大学》期刊2006-06-01）
内部转录间隔区论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
球虫病是由艾美耳球虫引起的一种世界范围内分布并造成较大经济损失的寄生虫病。艾美耳球虫在鸡肠道内增殖并引起组织损伤,出现食欲下降、脱水、贫血等。艾美耳球虫的种属鉴定对该病的诊断和
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
内部转录间隔区论文参考文献
[1].王丽丽,焦文静,陈晓辰,廖保生,王晓玥.基于核糖体DNA第二内部转录间隔区(ITS2)序列鉴定四季青及其近缘种和混伪品[J].农业生物技术学报.2015
[2].Naomi,C.Kirkpatrick,Genevieve,M,Morris,Amir,H.Noorrnohammadi,徐福洲.利用高通量毛细管电泳和高分辩力熔解曲线分析核糖体DNA的2型内部转录间隔区对鸡艾美耳球虫分类的研究[C].第15届世界禽病大会、中国畜牧兽医学会2007年学术年会论文集.2007
[3].古小彬,杨光友,郝桂英,张晓谦,贾小勇.疥螨第二内部转录间隔区基因的分子系统学研究[C].中国畜牧兽医学会家畜寄生虫学分会第九次学术研讨会论文摘要集.2006
[4].古小彬.疥螨第二内部转录间隔区基因的分子系统学研究[D].四川农业大学.2006
标签：四季青; DNA条形码; 冬青属; 第二内部转录间隔区(ITS2);