刘晓璇:番茄斑驳花叶病毒海南分离物全基因组序列分析论文

刘晓璇:番茄斑驳花叶病毒海南分离物全基因组序列分析论文

本文主要研究内容

作者刘晓璇,李威霖,张彤,周国辉(2019)在《番茄斑驳花叶病毒海南分离物全基因组序列分析》一文中研究指出:本研究采用小RNA深度测序及RT-PCR检测技术鉴定海南省陵水县冬种番茄(圣女果)病株受到烟草花叶病毒属的番茄斑驳花叶病毒(Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)侵染。通过机械摩擦接种,将该病原病毒保存于本生烟植株上,命名为番茄斑驳花叶病毒海南分离物(ToMMV-HN)。采用RT-PCR分段扩增获得了该病毒分离物的全基因组序列。测序结果表明,该病毒分离物基因组全长6399 nt,含有4个开放阅读框,编码4种蛋白,与已报道的ToMMV9个分离物核苷酸和编码产物氨基酸序列相似性分别为98.0%~100%和99.2%~100%;与同属的番茄花叶病毒(Tomato mosaic virus,ToMV)、番茄棕色皱果病毒(Tomato brown rugose fruit virus,TBRFV)和烟草花叶病毒(Tobacco mosaic virus,TMV)代表分离物核苷酸序列相似性分别为84.7%、80.7%和79.0%。系统进化分析结果表明,ToMMV-HN与该病毒中国西藏和云南辣椒分离物亲缘关系最近,与美国加州和南卡州番茄分离物次之,与西班牙和巴西番茄分离物亲缘关系相对较远。本研究为我国番茄病毒病诊断和防控,尤其是抗病品种选育提供了基础资料。

Abstract

ben yan jiu cai yong xiao RNAshen du ce xu ji RT-PCRjian ce ji shu jian ding hai na sheng ling shui xian dong chong fan jia (sheng nv guo )bing zhu shou dao yan cao hua xie bing du shu de fan jia ban bo hua xie bing du (Tomato mottle mosaic virus,ToMMV)qin ran 。tong guo ji xie ma ca jie chong ,jiang gai bing yuan bing du bao cun yu ben sheng yan zhi zhu shang ,ming ming wei fan jia ban bo hua xie bing du hai na fen li wu (ToMMV-HN)。cai yong RT-PCRfen duan kuo zeng huo de le gai bing du fen li wu de quan ji yin zu xu lie 。ce xu jie guo biao ming ,gai bing du fen li wu ji yin zu quan chang 6399 nt,han you 4ge kai fang yue dou kuang ,bian ma 4chong dan bai ,yu yi bao dao de ToMMV9ge fen li wu he gan suan he bian ma chan wu an ji suan xu lie xiang shi xing fen bie wei 98.0%~100%he 99.2%~100%;yu tong shu de fan jia hua xie bing du (Tomato mosaic virus,ToMV)、fan jia zong se zhou guo bing du (Tomato brown rugose fruit virus,TBRFV)he yan cao hua xie bing du (Tobacco mosaic virus,TMV)dai biao fen li wu he gan suan xu lie xiang shi xing fen bie wei 84.7%、80.7%he 79.0%。ji tong jin hua fen xi jie guo biao ming ,ToMMV-HNyu gai bing du zhong guo xi cang he yun na la jiao fen li wu qin yuan guan ji zui jin ,yu mei guo jia zhou he na ka zhou fan jia fen li wu ci zhi ,yu xi ban ya he ba xi fan jia fen li wu qin yuan guan ji xiang dui jiao yuan 。ben yan jiu wei wo guo fan jia bing du bing zhen duan he fang kong ,you ji shi kang bing pin chong shua yo di gong le ji chu zi liao 。

论文参考文献

  • [1].鸢尾重型花叶病毒泰安分离物全基因组的测定与分析[J]. 唐伟,李凡,高瑞,李洪刚,林彦茹,徐晓辉.  植物保护学报.2019(02)
  • [2].白草花叶病毒承德玉米分离物3’-cDNA片段序列分析[J]. 崔小雯,高波,许斐斐,李向东,张春庆,苗洪芹.  植物病理学报.2012(01)
  • [3].烟草丛顶病毒云南不同分离物全基因组序列测定与分析[J]. 吕婧,刘芳,谭冠林,魏薇,尹朝先,马龑,陈小姣,和理淮,陈海如,李凡.  云南农业大学学报(自然科学).2017(03)
  • [4].辣椒轻斑驳花叶病毒寿光分离物的RT-PCR检测及其序列分析[J]. 唐玉海,乔宁,孙晓辉.  北方园艺.2017(04)
  • [5].烟草花叶病毒山西番茄分离物的全基因组序列测定及分析[J]. 庞小静,赵慧琪,王德富,刘勇,牛颜冰.  中国蔬菜.2017(06)
  • [6].辣椒轻斑驳病毒湖南分离物的全基因序列测定及结构分析[J]. 刘湘宁,戴良英,李魏,董铮,唐前君.  植物保护.2017(02)
  • [7].油菜花叶病毒山西地黄分离物的全基因组序列测定与分析[J]. 王德富,张西梅,杨锋,牛颜冰.  植物病理学报.2016(05)
  • [8].黄瓜绿斑驳花叶病毒海南分离物基因组测定与毒源分析[J]. 王峰,任春梅,季英华,缪倩,姚恋秋,周益军,徐冬青,程兆榜.  植物保护.2014(06)
  • [9].甘蔗花叶病毒2个山东分离物的全基因组序列分析[J]. 程德杰,闫志勇,黄显德,田延平,原雪峰,李向东.  植物病理学报.2017(03)
  • [10].侵染丝瓜的黄瓜绿斑驳花叶病毒山东分离物分子鉴定[J]. 王云,辛志梅,赵黎明,竺晓平,王云祥.  山东农业科学.2014(08)
  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自热带作物学报的刘晓璇,李威霖,张彤,周国辉,发表于刊物热带作物学报2019年01期论文,是一篇关于番茄斑驳花叶病毒论文,小深度测序论文,病毒基因组序列论文,热带作物学报2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自热带作物学报2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

    标签:;  ;  ;  ;  

    刘晓璇:番茄斑驳花叶病毒海南分离物全基因组序列分析论文
    下载Doc文档

    猜你喜欢