群落结构多样性论文-吕嘉枥,晁倩文,刘秉坤,罗潇

群落结构多样性论文-吕嘉枥,晁倩文,刘秉坤,罗潇

导读:本文包含了群落结构多样性论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:益生菌,发酵泡菜,ITS,群落结构多样性

群落结构多样性论文文献综述

吕嘉枥,晁倩文,刘秉坤,罗潇[1](2019)在《传统老坛自然发酵泡菜中真菌群落结构多样性分析》一文中研究指出传统自然发酵泡菜的菌群较多,对其风味品质影响较大,目前对泡菜中菌群结构多样性研究较多的是以细菌为主,而对其中的真菌群落结构研究较少.本研究采用Illumina Miseq高通量测序技术,针对ITS1(ITS1-ITS2)区基因片段进行扩增,分析研究了陕西省西安地区具有代表性的传统老坛自然发酵泡菜样品(HBZ1、HBZ2、LHL2、LHL5、LHL6)的真菌群落结构多样性.试验结果表明,共鉴定出178属的真菌,其中Saccharomyces(酿酒酵母属)在HBZ1、LHL2、LHL5、LHL6中的丰度分别为29.82%、27.04%、27.79%、51.95%;Dipodascus(双足囊菌属)在LHL2、LHL5中的丰度分别为5.79%、28.67%;Issatchenki(伊萨酵母属)在LHL2、LHL5、LHL6中的丰度分别为30.73%、0.91%、4.30%;Pichia(毕赤氏酵母属)在HBZ1、HBZ2中的丰度分别为6.02%、26.37%;Candida(念珠菌属)在LHL5中的丰度为24.79%;Fusarium(镰刀菌属)在HBZ1、HBZ2中的丰度分别为6.88%、7.33%;Tomentella(革菌属)在各样品中的丰度分别为5.65%、1.78%、4.63%、2.00%、15.85%.可见样品不同,其中的真菌群落结构差异显着.(本文来源于《陕西科技大学学报》期刊2019年06期)

谢丹,刘晓燕,毕远林,宋明发,梁芳芳[2](2019)在《基于高通量测序分析刺梨果渣自然发酵过程中细菌群落结构及多样性》一文中研究指出为分析刺梨果渣自然发酵过程中各阶段的细菌群落结构及多样性,利用MiSeq高通量测序技术检测自然发酵刺梨果渣中细菌的16S rDNA基因V3~V4高变区序列,比较发酵6~60 d(每隔6 d取一次样)时细菌群落的差异。结果显示:10个不同发酵时期样本中共检测而出26个门类、40个纲类群、74个目类群、162个科类群、373个属类群。在整个发酵过程中,主要以葡糖杆菌属和醋酸杆菌属为主。发酵结束后,在门相对水平丰度值依次是变形菌门(Proteobacteria,99.85%)、厚壁菌门(Firmicutes,0.03%)、放线菌门(Actinobacteria,0.02%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,0.02%),在整个发酵过程中变形菌门占主要地位;在属相对水平丰度值排前面的葡糖杆菌属(Gluconobacter,65.37%)和醋酸杆菌属(Acetobacter,33.66%)为刺梨果渣发酵过程中绝对的优势菌;发酵后期细菌群落趋于稳定,表明刺梨果渣自然发酵过程中微生物群落结构变化是相对稳定的。(本文来源于《食品工业科技》期刊2019年22期)

黎玉莲,周少璐,陶宏兵,孙廷丽,谢小保[3](2019)在《16S rRNA基因高通量测序分析水性涂料微生物群落结构及多样性》一文中研究指出微生物对水性涂料产品的稳定性起着重要作用,本实验以广东省某涂料厂的水性涂料为研究对象,利用16S rRNA基因高通量测序技术检测其微生物群落结构及多样性。结果表明5个水性涂料样本在97%的相似水平下共获得有效序列总数224 801,涵盖了10门16纲30目46科59属的细菌;物种组成与相对多样性由高到低依次分别为A4、A5、A1、A2和A3;水性涂料样本A1、A2和A3微生物群落结构与聚集规律较为相似,优势菌群均为类芽孢杆菌门、芽胞乳杆菌属和固氮菌;水性涂料样本A5中相对丰度为57.3%的产己酸细菌属于特异菌群。本研究解析了水性涂料中微生物群落结构、相对丰度及多样性,为建立和完善水性涂料中微生物防控体系提供理论支撑。(本文来源于《工业微生物》期刊2019年05期)

曲红云,贲海燕,张军民,张雪岩,高永利[4](2019)在《茄子连作棚室氰氨化钙日光土壤消毒对微生物多样性及群落结构的影响》一文中研究指出氰氨化钙是一种高效能、无残留的土壤消毒剂,能有效灭杀土传病原微生物,但同时土壤中的非靶标微生物也必定会受到不同程度的影响。本试验前期研究发现氰氨化钙土壤消毒结合枯草芽孢菌剂灌根处理对茄子黄萎病有较好的防控效果,而土壤中微生态环境变化却不得而知。因此本试验采用IlluminaMiSeq测序等分子生物学手段,研究了氰氨化钙不同处理方式、不同处理时期对土壤微生物多样性及群落结构变化的影响。试验地点为黑龙江省农业科学院园艺分院连作茄子7年大棚,试验设4个处理,3次重复:(1)氰氨化钙土壤消毒处理(QA1);(2)氰氨化钙土壤消毒处理,并在定植茄苗后用500倍液枯草芽孢菌剂200m L灌根处理,间隔7d,共灌根3次(QB1);(3)嫁接处理(JJ);(4)对照(CK1)。2016年8月23日进行氰氨化钙土壤消毒处理,次年2017年4月21日进行揭膜、晾晒,5月4日定植‘龙杂茄10号’茄苗。各处理分别在处理前、揭膜期和门茄期进行土壤取样,提取DNA,以带有barcode的特异引物扩增16S rRNA V3-V4区域,进行Illumina MiSeq高通量测序,共获得1899801条序列片段,分属于43门,113纲,230目,473科,966属,1993种。土壤细菌多样性结果显示,氰氨化钙土壤消毒、揭膜后,处理QA1和QB1多样性指数Shannon,Chao和Ace显着降低,而嫁接和对照处理变化不大;随着定植茄苗,QB1多样性指数明显回升,此时QA1多样性指数未见恢复。不同样本独占和共享OTUs的比较显示,门茄期QA1样本拥有最少的独占OTUs,为343,而QB1、CK1的独占OTUs更接近,分别为530、545,这说明单纯使用氰氨化钙土壤消毒处理引起了土壤微生物多样性的长期下降,即使在种植作物后也未得到有效的缓解;而在消毒处理后及时补充枯草芽孢菌剂可使这种破坏得以恢复。土壤细菌群落结构分析表明,处理土壤共有16个优势细菌,主要菌属包括Acidobacteria(酸杆菌属)、Bacillus(芽孢杆菌属)、Streptomyces(链霉菌属)等。在门茄期,QB1枯草芽孢菌剂灌根处理,刺激土壤群落结构发生了明显的改变,出现了Stenotrophomonas(寡养单胞菌属)和Sphingobacterium(鞘氨醇杆菌属),均为降解污染物的有益细菌,这两种细菌是否与QB1对黄萎病防效有直接关系值得进一步探讨。此外,QA1土壤中具有解磷、反硝化作用的细菌planomicrobium(动性杆菌属)在各时期一直存在,可能是由于该物种具有利用氰氨化钙及其降解产物作为营养物质的能力,或者与去除氰氨化钙及其产物残留、减少散发等系列问题有关。(本文来源于《中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集》期刊2019-10-21)

王金兰,曹文侠,张德罡,李文,李小龙[5](2019)在《东祁连山高寒杜鹃灌丛群落结构和物种多样性对海拔梯度的响应》一文中研究指出以东祁连山不同海拔梯度(3 030~3 280 m)高寒杜鹃灌丛草地为研究对象,探讨高寒杜鹃灌丛灌下草本。灌木及其灌丛植物群落特征和物种多样性在垂直梯度上的变化规律。结果表明:高寒杜鹃灌丛灌木高度,密度和生物量均随海拔升高呈先增加后降低的单峰变化趋势,在海拔3 130 m达最高。灌下草本高度随海拔升高呈先增加后降低的单峰变化趋势,在海拔3 080 m处达最高。灌丛群落总地上生物量随海拔升高呈先显着增加后显着降低的变化趋势,在海拔3 130 m处达最高。灌下草本,灌木和灌丛群落的Shannon-Wiener多样性指数和丰富度指数均随海拔升高呈先增加后减小的变化趋势,最大值均出现在海拔3 080 m处。在调查海拔范围内,草本,灌木和灌丛群落的Shannon-Wiener指数,草本均匀度指数、灌丛群落丰富度指数均和海拔呈显着负相关,灌木丰富度指数和灌丛群落均匀度指数与海拔呈显着正相关,草本和灌丛群落Shannon-Wiener指数与地上生物量呈显着正相关。因此,中海拔区域(3 080~3 130 m)物种多样性丰富,生产力较高。(本文来源于《草原与草坪》期刊2019年05期)

张晓,刘世荣,黄永涛,傅声雷[6](2019)在《辽东栎林演替过程中的土壤细菌群落结构和多样性变化》一文中研究指出【目的】土壤微生物在维持森林生态系统功能中起着重要作用,研究辽东栎林演替过程中森林土壤微生物群落结构和多样性在演替过程中的变化规律,深入认识森林土壤细菌群落结构恢复和驱动机制。【方法】以太岳山地区皆伐后形成的30、80和150年生次生辽东栎林为对象,于2015年6月每个林型设置为20 m×20 m的森林动态监测样地20个,合计60个,用直径10 cm土钻采集0~10 cm表层土样,利用16S rRNA基因高通量测序技术,测定皆伐后自然恢复过程中森林土壤细菌群落的组成、结构和多样性变化。【结果】在辽东栎林自然恢复过程中,随演替阶段进行,变形菌门和绿弯菌门的相对丰度逐渐增加,而放线菌门和酸杆菌门的相对丰度逐渐降低,疣微菌门和浮霉菌门的相对丰度没有明显变化。拟杆菌门和厚壁菌门的相对丰度在80年生中龄林显着低于30年生幼龄林,而在150年生老龄林和80年生中龄林间却无显着差异。基于weighted Uni Frac距离的主坐标分析表明,幼龄林、中龄林和老龄林的细菌群落结构有显着差异。基于OTU水平的Bray-Curtis相似性进一步证明,幼龄林与老龄林的平均细菌群落相似性为37. 9%,中龄林与老龄林的相似性增加到47. 2%,表明皆伐后自然恢复过程中不同演替阶段的细菌群落结构表现出逐渐向老龄林恢复的趋势。土壤细菌物种丰富度和系统发育多样性在自然恢复过程中呈递减趋势,幼龄林的土壤细菌物种丰富度和系统发育多样性显着高于老龄林,而中龄林和老龄林的土壤细菌多样性差异并不显着。Chao1指数和种系型多度则表现为幼龄林和中龄林间差异不显着,老龄林则显着降低。方差分解表明,皆伐后不同演替阶段的细菌群落变化和土壤有机质、可溶性碳、土壤总氮和有效氮含量等土壤因子显着相关,其中土壤碳和氮含量对细菌群落结构变化的解释量分别为20. 2%和26. 3%,未解释的部分为43. 4%。【结论】皆伐后辽东栎林演替过程中不同恢复阶段土壤细菌群落结构具有显着差异,幼龄林和老龄林细菌群落结构差异最大,中龄林细菌群落结构与老龄林相似。土壤细菌多样性随着演替的进行呈逐步降低的趋势,幼龄林细菌多样性显着高于中龄林和老龄林,中林龄多样性则更加接近老龄林水平。这说明土壤细菌群落结构和多样性在次生演替过程中具有可预测性。(本文来源于《林业科学》期刊2019年10期)

邓鹏,戴伟,路秉翰,谢腾芳,王刚[7](2019)在《珠叁角地区林地土质边坡植物群落结构与多样性》一文中研究指出为了解珠叁角地区广泛分布的林地土质边坡植物群落结构、优势种群组成、物种多样性等特征,对广州、深圳、惠州、肇庆等地的林地边坡植物进行了典型样地调查,从而为该类地区近自然生态边坡的植被复绿提供理论支撑。研究共记录维管植物147种,隶属62科124属,优势科有禾本科、蝶形花科、大戟科和茜草科,分别占调查范围内所有种的8. 2%、6. 8%、6. 1%和5. 4%;频度大于0. 5的植物有木荷、芒萁、桉树、木姜子、九节和乌毛蕨均具有较高的重要值。各群落的Simpson优势度指数为0. 479~0. 893,Shannon-Wiener多样性指数为1. 311~2. 457,Pielou均匀度指数为0. 463~0. 820,3种指数的变化趋势较为一致;不同样地植物群落间相异性系数为0. 463~0. 833;不同植物群落多样性的差异主要受到边坡立地环境与优势种的影响。(本文来源于《浙江农业科学》期刊2019年10期)

侯玉洁,徐俊,王淑清,刘昌林,郭小泽[8](2019)在《牧草细胞壁降解菌的群落结构多样性研究》一文中研究指出本试验通过高通量测序法研究了吸附在牧草细胞壁降解菌的群落结构,分别将粉碎后的苜蓿、燕麦草、羊草和稻草茎秆3.0 g放入尼龙袋中,降解24 h全部取出,洗净后提取总DNA,根据高通量测序要求制样。结果表明:(1)吸附于不同牧草细胞壁中的细菌群落结构丰富度:燕麦草>苜蓿>稻草>羊草;(2)四组牧草样品共鉴定得到16个门,27个纲,37个目,63个科和91个属。门水平上,硬壁菌门、拟杆菌门、螺旋体门、纤维杆菌门和变形菌门为优势菌门。综上,不同牧草吸附的细菌种类和数量存在显着差异。(本文来源于《中国饲料》期刊2019年19期)

刘君,王宁,崔岱宗,卢磊,赵敏[9](2019)在《小兴安岭大亮子河国家森林公园不同生境下土壤细菌多样性和群落结构》一文中研究指出土壤细菌是森林生态系统的一个重要组成成分,是生态系统中物质循环和能量流动的重要参与者,细菌群落组成和生物多样性是反映土壤生态功能的重要指标。本文利用高通量测序技术分析了大亮子河国家森林公园内红松(Pinus koraiensis)林、落叶松(Larix gmelinii)林、蒙古栎(Quercus mongolica)林、枫桦(Betula costata)林、针阔混交林、灌木林和草甸等7种不同生境土壤细菌群落组成和多样性的差异性,探讨该地区土壤细菌群落对不同生境的响应,为地区森林生态系统的经营管理及生态系统稳定性的维护提供科学理论基础。在门的水平上,各生境的细菌群落组成基本一致,其中变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)和疣微菌门(Verrucomicrobia)在7种生境土壤中相对丰度均大于10.0%,是细菌中的优势菌门。在属的水平上,共测得245个菌属,各样地共有属118个,占总属数的48.2%,占总相对丰度的97.8%;优势菌属分别为Spartobacteria_genera_incertae_sedis、Gaiella、Gp16、Gp4,占总相对丰度的47.0%, Spartobacteria_genera_incertae_sedis在7种生境土壤中丰度均最高。7种生境下的土壤细菌多样性和土壤理化因子存在着显着的差异,红松林的土壤细菌群落多样性和丰富度均高于其他生境。土壤pH是大亮子河森林公园影响土壤细菌多样性的关键因子。(本文来源于《生物多样性》期刊2019年08期)

赵立君,刘云根,王妍,赵蓉,李波[10](2019)在《砷污染湖滨湿地底泥微生物群落结构及多样性》一文中研究指出为研究高原砷污染湖滨湿地底泥微生物群落结构及多样性特征,探寻底泥砷含量及砷形态与微生物之间的联系,采集云南省阳宗海东、西、南、北岸湖滨湿地底泥样品,利用16SrRNA高通量测序技术,研究了砷污染湖滨湿地底泥微生物丰富度特征,探讨了不同砷形态差异对微生物群落的影响.结果显示,底泥砷含量对微生物丰富度影响显着,砷含量高的南岸区域微生物的丰富度较高,OTU为1286~1473.而砷含量较低的西岸区域微生物丰富度也随之较低,OTU为693~1339.阳宗海湖滨湿地底泥微生物群落结构稳定,主要优势类群为Proteobacteria(变形菌门,15.6%~59.6%)、Chloroflexi(绿弯菌门,10.1%~44.9%)及少量的Actinobacteria(放线菌门)和Acidobacteria(酸杆菌门).底泥中砷形态主要以残渣态砷(F5)和无定型氧化物结合态砷(F3)为主,无定型氧化物结合态砷(F3)对底泥微生物类群影响最为显着.同时,底泥中生物有效态砷(非专性吸附态砷+专性吸附态砷+无定型氧化物结合态砷)占到19.3%~58.6%,存在环境释放风险.研究结果加深了对砷污染高原湖泊底泥中微生物群落的认识,为湖泊砷污染防治提供微生物治理的理论基础和科学依据.(本文来源于《中国环境科学》期刊2019年09期)

群落结构多样性论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

为分析刺梨果渣自然发酵过程中各阶段的细菌群落结构及多样性,利用MiSeq高通量测序技术检测自然发酵刺梨果渣中细菌的16S rDNA基因V3~V4高变区序列,比较发酵6~60 d(每隔6 d取一次样)时细菌群落的差异。结果显示:10个不同发酵时期样本中共检测而出26个门类、40个纲类群、74个目类群、162个科类群、373个属类群。在整个发酵过程中,主要以葡糖杆菌属和醋酸杆菌属为主。发酵结束后,在门相对水平丰度值依次是变形菌门(Proteobacteria,99.85%)、厚壁菌门(Firmicutes,0.03%)、放线菌门(Actinobacteria,0.02%)和拟杆菌门(Bacteroidetes,0.02%),在整个发酵过程中变形菌门占主要地位;在属相对水平丰度值排前面的葡糖杆菌属(Gluconobacter,65.37%)和醋酸杆菌属(Acetobacter,33.66%)为刺梨果渣发酵过程中绝对的优势菌;发酵后期细菌群落趋于稳定,表明刺梨果渣自然发酵过程中微生物群落结构变化是相对稳定的。

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

群落结构多样性论文参考文献

[1].吕嘉枥,晁倩文,刘秉坤,罗潇.传统老坛自然发酵泡菜中真菌群落结构多样性分析[J].陕西科技大学学报.2019

[2].谢丹,刘晓燕,毕远林,宋明发,梁芳芳.基于高通量测序分析刺梨果渣自然发酵过程中细菌群落结构及多样性[J].食品工业科技.2019

[3].黎玉莲,周少璐,陶宏兵,孙廷丽,谢小保.16SrRNA基因高通量测序分析水性涂料微生物群落结构及多样性[J].工业微生物.2019

[4].曲红云,贲海燕,张军民,张雪岩,高永利.茄子连作棚室氰氨化钙日光土壤消毒对微生物多样性及群落结构的影响[C].中国园艺学会2019年学术年会暨成立90周年纪念大会论文摘要集.2019

[5].王金兰,曹文侠,张德罡,李文,李小龙.东祁连山高寒杜鹃灌丛群落结构和物种多样性对海拔梯度的响应[J].草原与草坪.2019

[6].张晓,刘世荣,黄永涛,傅声雷.辽东栎林演替过程中的土壤细菌群落结构和多样性变化[J].林业科学.2019

[7].邓鹏,戴伟,路秉翰,谢腾芳,王刚.珠叁角地区林地土质边坡植物群落结构与多样性[J].浙江农业科学.2019

[8].侯玉洁,徐俊,王淑清,刘昌林,郭小泽.牧草细胞壁降解菌的群落结构多样性研究[J].中国饲料.2019

[9].刘君,王宁,崔岱宗,卢磊,赵敏.小兴安岭大亮子河国家森林公园不同生境下土壤细菌多样性和群落结构[J].生物多样性.2019

[10].赵立君,刘云根,王妍,赵蓉,李波.砷污染湖滨湿地底泥微生物群落结构及多样性[J].中国环境科学.2019

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