进化分化论文-方梦超

进化分化论文-方梦超

导读:本文包含了进化分化论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:生态位模型,生态位一致性检验,背景检验,地理分布区

进化分化论文文献综述

方梦超[1](2019)在《生态位进化在两种鬣蜥科蜥蜴谱系分化中的作用》一文中研究指出在谱系分化过程中生态位是趋于保守或是分化一直存在较大争议。谱系分化初期生态位保守性的研究对深入了解这一过程至关重要。本研究结合生态位模型和物种遗传信息,以鬣蜥科的两个物种(蜡皮蜥Leiolepis reevesii和变色树蜥Calotes versicolor)为研究对象,评估了生态位进化对物种谱系分化的影响。本研究基于物种已有的谱系信息,构建生态位模型模拟各谱系的生态位空间,研究每个物种内谱系间的生态位差异(用Schoener’s D值和Hellinger’s I值估算)和地理分布区差异(用地理重迭指数和相互预测指数估算)。Schoener’s D值和Hellinger’s I值用两种方法来计算:生态位一致性检验和背景检验。结果显示蜡皮蜥的两个谱系之间存在部分相似的生态位空间,而变色树蜥谱系间的生态位空间存在显着差异。地理重迭指数和相互预测指数的计算结果表明,蜡皮蜥和变色树蜥A支的潜在分布区均包含了B支的潜在分布区。蜡皮蜥A支的潜在分布区覆盖面积广,包括北部湾沿岸的部分地区、雷州半岛、海南和越南等地区,B支的潜在分布区域仅局限于五指山和鹦哥岭山脉以南的沿海地区。变色树蜥A支的潜在分布区覆盖了整个研究区域的全部沿海地区,B支的潜在分布区仅分布于海南省的中部和南部。本项研究结果支持生态位空间差异导致异域物种形成的假说,即物种的遗传分化过程中伴随着生态位的分化。研究结果还表明,气候环境特化在推动蜡皮蜥和变色树蜥谱系分化和生态位分化的过程中发挥了重要作用。通过结合物种遗传信息,生态位模型使物种进化的分析得以实现。(本文来源于《杭州师范大学》期刊2019-05-01)

程琳,薛亚杰,付觉民,刘旭阳,曲骁冲[2](2019)在《大豆bHLH转录因子家族成员的进化及功能分化研究》一文中研究指出碱性螺旋-环-螺旋蛋白(basic Helix-Loop-Hleix,bHLH)转录因子家族是动植物中最大的转录因子家族之一,主要由碱性氨基酸区域和螺旋-环-螺旋区域组成,在动植物生长发育和胁迫应答反应中发挥着重要作用.本研究通过对大豆全基因组生物信息学分析和分子生物学研究手段,深入研究了大豆bHLH基因家族的进化机制,同时探讨了该基因家族在大豆中的功能分化.结果表明,大豆中含有340个非冗余的bHLH基因家族成员,通过对这些成员的Pfam蛋白结构域、Motif组成和系统进化关系的分析,将这些成员分为15组共24个亚家族,在大豆20条染色体上呈现不均匀分布.bHLH理化性质差异较大,编码的大豆氨基酸数量为91~815aa,相对分子量为10 273.88~91 300.38,理论等电点为4.56~10.40;碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件.多数成员在大豆根以及花发育的5个时期中具有组织表达特异性,不同基因表达量差异较大.(本文来源于《信阳师范学院学报(自然科学版)》期刊2019年01期)

黄恒学[3](2018)在《公私关系的分化、进化与变化》一文中研究指出公私关系是一种最基本和最重要的社会关系。在公私关系及其分化过程中,既打下了人与人之间社会关系的烙印,又记录了人类社会文明进步的历程。正确认识当代社会生活中的公私分化及其变化规律,有利于我们正确看待和处理公私关系,适度推进公私分化,合理划分公私界限,树立正确的世界观、价值观、人生观和公私观。(本文来源于《人民论坛》期刊2018年19期)

陈茹佳[4](2018)在《陆生植物GH5_11类型纤维素酶基因的起源、进化和功能分化分析》一文中研究指出纤维素酶是降解纤维素链中β-1,4糖苷键的一类酶的总称。根据催化水解纤维素的作用方式不同,通常将纤维素酶分为叁类:内切葡聚糖酶,外切葡聚糖酶和β-葡萄糖苷酶。在植物中,纤维素酶由多种糖苷水解酶家族(GH)基因编码,并在植物生长发育和许多重要的生理过程中起着至关重要的作用。植物GH5_11类基因编码一种水解酶,属于糖苷水解酶家族5超级基因家族的一个亚族,在陆生植物中广泛存在。尽管该基因亚族的生物学功能还没有得到详细阐释,但很多数据库将该基因亚族编码的酶注释为纤维素酶(cellulase)。此外,陆生植物GH5_11基因的起源和进化模式尚不清楚。为阐明陆生植物GH5_11基因的起源和进化模式,并初步揭示其在植物生长发育中的作用,本文采用生物信息学与实验生物学相结合的方法,对该基因亚族在植物中的起源和进化模式进行了探讨,并基于水稻和拟南芥中同源基因的表达模式分析,结合对拟南芥突变体的表型鉴定,初步探究了陆生植物GH5_11基因的功能。主要结果包括:(1)GH_11基因在水生的绿藻中不具有同源基因,在绿色植物中最早出现在苔藓植物中,并在大部分已测序陆生植物中具有同源基因。在陆生植物的进化中,该基因亚族经历了多次基因丢失和基因复制事件。在蕨类植物江南卷柏(Selaginella moellendorffii)和基础被子植物无油樟(Amborella trichopoda)中没有GH5_11的同源基因,这可能是由基因丢失现象引起的。该基因亚族的复制则表现出物种特异性或系谱特异性的特征,本文发现十字花科和禾本科植物的祖先物种均只具有一个GH5_11,并且基因家族的特异性扩张导致不同陆生植物基因组所包含的GH5_11基因数目有所差异。(2)陆生植物GH5_11的同源基因广泛存在于细菌和真菌中,系统发育分析发现陆生植物的GH5_11基因形成一个分枝,表明该基因家族为单次起源。陆生植物GH5_11基因与其在真菌中的同源基因具有最高的同源性,并且陆生植物分枝位于真菌分枝的内部,表明陆生植物的祖先物种通过一次水平基因转移从真菌获得了GH5_11基因。(3)适应性进化分析发现陆生植物GH5_11基因在水平转移起源后的最初阶段经历了明显的正选择作用,而在主要陆生植物分化之后,则主要选择压力为纯化选择,表明该基因在陆生植物通过水平转移获得之后,经历了功能的适应性进化。(4)模式植物拟南芥和水稻中分别具有5个和4个GH5_11基因,表达分析发现拟南芥和水稻GH5_11基因具有不同的组织表达模式,表明该基因在基因重复后具有明显的功能分化。此外,多个水稻和拟南芥的GH5_11基因表达受到干旱、高温、盐害和ABA等非生物逆境的调控,表明陆生植物的GH5_11可能与逆境响应有关。(5)为初步阐释陆生植物GH5_11基因的生物学功能,本文对3个拟南芥GH5_11基因的突变体进行了分析,结果发现atgh5_11a和atgh5_11c突变体表现为莲座叶叶面积增大,并且atgh5_11c突变体在短日照条件下开花时间显着延迟,而AtGH5_11d基因的突变体则没有明显的表型变化。3个基因的突变体植株中总纤维素酶活性显着降低,并且纤维素酶的叁种类型中只有内切葡聚糖酶在3个基因的突变体材料中含量显着降低。3个基因突变体中的纤维素和木质素含量升高,atgh5_11a和atgh5_11c突变体中的葡萄糖和蔗糖含量均显着下降,果糖含量上升;而atgh5_11d突变体3种寡糖含量没有显着的变化。这些结果表明拟南芥GH5_11可能编码一种新的纤维素酶,并且作用方式属于内切葡聚糖酶。本文阐明了陆生植物祖先通过水平转移的方式从真菌获得了GH5_11基因,并且在陆生植物的演化中经历了多次基因重复和丢失;基于对水稻和拟南芥目的基因的表达分析和拟南芥3个GH5_11基因的突变体分析,揭示了复制形成的同源基因之间发生了功能分化;基于对拟南芥GH5_11基因的分析,初步证明了 GH5_11基因可能编码纤维素酶,并属于内切葡聚糖酶。研究结果不仅对揭示陆生植物起源和进化的分子机理具有重要的理论价值,还对进一步揭示相关基因的功能提供了参考。(本文来源于《扬州大学》期刊2018-05-01)

莫凡[5](2018)在《KRP基因的进化历史及其在作物中功能分化研究》一文中研究指出细胞周期蛋白依赖性激酶(CDK),在真核细胞的细胞周期调控中起着极其重要的作用。CDK抑制因子(CKI/KRP)是指一类能通过与CDK复合体的结合而抑制CDK活性的蛋白。该基因被发现存在于所有的被子植物中,说明该基因对于植物的正常发育是相当重要的。早先的研究表明,过量的表达该基因,会导致植物的形态出现一系列变化,例如体型变小,叶片形状改变,细胞数量减少细胞变大等。本次实验的目的是搞清楚该基因在作物中的分布和表达,从而分析该基因家族在作物中所扮演的角色。本次实验选取了包括水稻,玉米,大豆,油菜等作物,将这些作物与其他的一些模式植物一起构建出系统发育树,并与模体、选择压力、表达分析相结合,根据结果预测CKI/KRP基因家族对这些作物的具体影响。分析所用的蛋白序列数据主要来自于Phytozome数据库,表达数据则来自于多个已发表的测算结果。使用了 MEME、EasyCodeML、R等分析工具。分析结果表明,从系统发育上来看,CKI/KRP基因家族可以分为两大类,文章中将这两大类命名为Clade1和Clade2。这两大类均包括了双子叶和单子叶植物,因此这些作物的基因在这两大类里均有出现。此外,我们将属于双子叶植物的大豆,油菜和单子叶的水稻和玉米等作物则在这两大类中均有更进一步的分析。从模体分析来看,Clade2分支中的基因模体相较Clade1中基因的模体有了较大的变化,而外显子-内含子结构也有不同,说明在这两类中的基因在功能上可能出现了一定程度的变化;之后的选择压力分析表明Clade1相较于Clade2更加的保守,并且存在着显着变化的位点,进一步表明了这两类基因功能分化存在的可能性。从基因表达来看,这些作物的基因的表达量在不同的组织中有明显的区别,对于在油菜和大豆中存在多拷贝,这些多拷贝表达存互补趋势,显示功能发生亚功能化。本次实验结果首先给出了KRP基因在被子植物的进化历史和模型,并对大豆,油菜,水稻和玉米种的KRP基因做了详细分析结果显示这些作物的KRP基因的可能的功能以及分化。本研究详细分析了 KRP基因的进化,为进一步研究KRP基因进化和功能鉴定打好了基础。(本文来源于《福建农林大学》期刊2018-04-01)

廖世奇,袁红霞[6](2017)在《论干细胞异常分化进化形成肿瘤》一文中研究指出随着肿瘤干细胞的发现,需要进一步探索肿瘤干细胞和成体组织干细胞的关系以及肿瘤的形成机制,这对肿瘤的诊断、预防和治疗具有重要意义。在骨髓间充质干细胞异常分化进化形成异质细胞簇的基础实验上,得出肿瘤是组织中成体干细胞异常分化进化形成的(简称干细胞成瘤论),并将干细胞成瘤论与基因突变成瘤论在肿瘤标志特征以及产生机制上进行比较分析,初步论证了干细胞成瘤理论能更真实地表达肿瘤发生发展的过程。通过正确认识肿瘤的发病机制,从而完善肿瘤的诊断、预防和治疗方法。(本文来源于《甘肃医药》期刊2017年12期)

[7](2017)在《2017第十一届中国医院院长年会 分化与进化:解构新医疗经济》一文中研究指出出品:卓信医学传媒集团主办:《中国医院院长》杂志社中国医院院长网联合主办:广东省医院协会时间:2017年11月3日~5日地点:珠海国际会展中心大会网址:www.h-ceo.com(本文来源于《中国医院院长》期刊2017年19期)

郭锦辉[8](2017)在《分化与进化:企业如何寻找新动能》一文中研究指出新技术不断改变着行业竞争的要素。在互联网背景下,尤其是面对新经济和机器智能,企业的竞争格局遇到哪些挑战?企业在战略和管理上要有哪些应对?企业该如何转型升级?该往哪里转?4月22日到24日,在中国企业家俱乐部主办的2017中国绿公司年会上,企业家们纷纷解析(本文来源于《中国经济时报》期刊2017-04-26)

南琼[9](2017)在《植物微丝解聚因子ADF在进化过程中功能发生分化的分子机制研究》一文中研究指出同源基因功能的分化为生物进化提供了遗传材料和动力。在生物体中,基因发生复制后,子基因在自然选择压力下会经历假基因化,亚功能化和新功能化叁种不同的功能分化命运,然而由于分子进化的驱动模式和过程难于重建,子基因功能分化命运模型依然存在争议,因此研究基因家族的功能分化对于揭示生物分子进化过程有重要意义。微丝解聚因子(Actin-depolymerizing factors,ADFs)是一类重要的微丝结合蛋白,在真核生物中广泛存在。ADFs具有保守的剪切和解聚微丝的功能,并参与生物细胞中微丝骨架的动态调节。在植物中,actin和ADFs发生了共进化,在此过程中ADF家族基因的数目增多,并且生化功能发生了分化。然而,植物ADFs的生化功能和进化过程中的功能分化的分子机制依然未知。本文对模式植物拟南芥ADF基因家族的所有11个成员的生化功能进行了研究,并取得了以下研究结果:(1)揭示了拟南芥ADF基因家族的生化功能发生了分化,并形成两种类型,即成束型功能(B-type)和解聚型功能(D-type)。(2)研究发现属于第叁亚家族的AtADF5和AtADF9从保守的微丝剪切和解聚功能进化成了微丝成束功能,并且成束微丝的能力受pH调控。(3)研究表明第一亚家族AtADF1、AtADF2、AtADF3和AtADF 4剪切和解聚微丝的能力有所增强。(4)通过对该家族祖先基因的重建和生化功能的分析,发现一些关键氨基酸残基的突变对拟南芥和其他物种的ADFs生化功能有重要影响。揭示了ADFs生化功能的分化在被子植物进化中是相对保守的。(5)研究发现植物ADFs第叁亚家族成员N端氨基酸序列由于内含子滑动出现延伸,说明该过程对于ADFs解聚型功能和成束型功能的分化是必不可少的。综上所述,植物ADFs基因家族的生化功能从一种典型的解聚型功能分化出了另一种成束型功能,并且ADFs氨基酸序列N端的延长和一些保守功能位点的形成对该家族基因功能的分化具有重要意义。(本文来源于《兰州大学》期刊2017-03-01)

史军艳,段守富,韩培杰,白逢彦[10](2016)在《酿酒酵母菌群体分化和适应性进化机制研究》一文中研究指出近年来本实验室关于国内酿酒酵母菌(Saccharomyces cerevisiae)的研究结果发现该种在自然界存在遗传分化显着的野生和驯养群体,不同群体在糖类利用和抗逆性的方面也具有显着差异,因此是研究物种初始分化和形成以及适应性进化的良好材料。有研究表明酿酒酵母驯养群体存在杂种优势现象{1},通过对国内大量酿酒酵母进行全基因组分析发现驯养群体杂合率明显高于野生群体,相较于野生群体,本研究发现驯养群体的产孢率及孢子成活率普遍较低,很有可能与驯养群体维持高杂合率有关。选取不同谱系生理生化性状不同的代表驯养菌株并获得单孢菌株,单孢菌株可自动二倍体化形成纯合二倍体菌株。通过比较驯养亲本菌株与其单孢来源二倍体菌株在麦芽糖,高温梯度,高乙醇梯度下的生长状况发现,在高温,高乙醇浓度下,驯养菌株性状总体优于纯合二倍体菌株,驯养菌株表现出杂种优势,且在一定范围内,随着高温及高乙醇胁迫的增大驯养菌株的杂种优势现象更加明显。随后模拟杂种优势的发生过程,发现基因型互补单孢菌株杂交产生的杂合二倍体后代在高温,高乙醇条件下性状优于亲本单孢菌株形成的纯合二倍体菌株,甚至接近于驯养菌株,而在葡萄糖条件下试验菌株差异不明显,从而进一步证明驯养菌株具有明显的杂种优势现象,并且很可能主要表现在抗逆性方面。(本文来源于《中国菌物学会2016年学术年会论文摘要集》期刊2016-08-19)

进化分化论文开题报告

(1)论文研究背景及目的

此处内容要求:

首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。

写法范例:

碱性螺旋-环-螺旋蛋白(basic Helix-Loop-Hleix,bHLH)转录因子家族是动植物中最大的转录因子家族之一,主要由碱性氨基酸区域和螺旋-环-螺旋区域组成,在动植物生长发育和胁迫应答反应中发挥着重要作用.本研究通过对大豆全基因组生物信息学分析和分子生物学研究手段,深入研究了大豆bHLH基因家族的进化机制,同时探讨了该基因家族在大豆中的功能分化.结果表明,大豆中含有340个非冗余的bHLH基因家族成员,通过对这些成员的Pfam蛋白结构域、Motif组成和系统进化关系的分析,将这些成员分为15组共24个亚家族,在大豆20条染色体上呈现不均匀分布.bHLH理化性质差异较大,编码的大豆氨基酸数量为91~815aa,相对分子量为10 273.88~91 300.38,理论等电点为4.56~10.40;碱性氨基酸区含有His5-Glu9-Arg13保守序列,与靶基因结合有关,HLH区含有Arg23和Arg55,与形成二聚体有关,同时含有5种保守元件.多数成员在大豆根以及花发育的5个时期中具有组织表达特异性,不同基因表达量差异较大.

(2)本文研究方法

调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。

观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。

实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。

文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。

实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。

定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。

定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。

跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。

功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。

模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。

进化分化论文参考文献

[1].方梦超.生态位进化在两种鬣蜥科蜥蜴谱系分化中的作用[D].杭州师范大学.2019

[2].程琳,薛亚杰,付觉民,刘旭阳,曲骁冲.大豆bHLH转录因子家族成员的进化及功能分化研究[J].信阳师范学院学报(自然科学版).2019

[3].黄恒学.公私关系的分化、进化与变化[J].人民论坛.2018

[4].陈茹佳.陆生植物GH5_11类型纤维素酶基因的起源、进化和功能分化分析[D].扬州大学.2018

[5].莫凡.KRP基因的进化历史及其在作物中功能分化研究[D].福建农林大学.2018

[6].廖世奇,袁红霞.论干细胞异常分化进化形成肿瘤[J].甘肃医药.2017

[7]..2017第十一届中国医院院长年会分化与进化:解构新医疗经济[J].中国医院院长.2017

[8].郭锦辉.分化与进化:企业如何寻找新动能[N].中国经济时报.2017

[9].南琼.植物微丝解聚因子ADF在进化过程中功能发生分化的分子机制研究[D].兰州大学.2017

[10].史军艳,段守富,韩培杰,白逢彦.酿酒酵母菌群体分化和适应性进化机制研究[C].中国菌物学会2016年学术年会论文摘要集.2016

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